FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3282, 714 aa 1>>>pF1KE3282 714 - 714 aa - 714 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.0048+/-0.000458; mu= -6.7703+/- 0.028 mean_var=450.5674+/-102.132, 0's: 0 Z-trim(121.3): 1988 B-trim: 880 in 1/53 Lambda= 0.060422 statistics sampled from 35186 (37767) to 35186 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.758), E-opt: 0.2 (0.443), width: 16 Scan time: 12.650 The best scores are: opt bits E(85289) NP_055401 (OMIM: 606532) hormonally up-regulated n ( 714) 4839 437.1 1.2e-121 XP_011527839 (OMIM: 606532) PREDICTED: hormonally ( 698) 2801 259.4 3.5e-68 XP_016876782 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 708) 744 80.1 3.3e-14 NP_001122392 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 713) 744 80.1 3.3e-14 XP_016876781 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 722) 744 80.1 3.4e-14 XP_016876780 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 728) 744 80.1 3.4e-14 XP_005267699 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 737) 744 80.1 3.4e-14 XP_005267700 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 643) 740 79.7 4e-14 NP_001273055 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 780) 741 79.9 4.2e-14 XP_005273191 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 781) 741 79.9 4.2e-14 XP_011507863 (OMIM: 606511) PREDICTED: serine/thre ( 788) 741 79.9 4.3e-14 XP_011541028 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre ( 660) 739 79.6 4.3e-14 NP_061120 (OMIM: 606511) serine/threonine-protein ( 795) 741 79.9 4.3e-14 NP_001273053 (OMIM: 606511) serine/threonine-prote ( 796) 741 79.9 4.3e-14 NP_002367 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affinity- ( 729) 740 79.8 4.3e-14 XP_005267698 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 738) 740 79.8 4.3e-14 XP_006720209 (OMIM: 602678) PREDICTED: MAP/microtu ( 739) 740 79.8 4.3e-14 NP_001122391 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 744) 740 79.8 4.4e-14 NP_059672 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 745) 740 79.8 4.4e-14 NP_001122390 (OMIM: 602678) MAP/microtubule affini ( 753) 740 79.8 4.4e-14 XP_016872799 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 763) 740 79.8 4.4e-14 XP_011543093 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 798) 740 79.8 4.6e-14 NP_001156769 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 709) 734 79.2 6.1e-14 NP_004945 (OMIM: 600526) serine/threonine-protein ( 724) 734 79.2 6.2e-14 XP_011543100 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 729) 734 79.2 6.2e-14 XP_016872800 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 738) 734 79.3 6.2e-14 XP_011543098 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 744) 734 79.3 6.3e-14 XP_011543096 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 753) 734 79.3 6.3e-14 XP_005271541 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1261) 739 79.9 6.6e-14 NP_113605 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affinity- ( 688) 732 79.0 6.7e-14 XP_011541024 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1309) 739 80.0 6.7e-14 NP_079440 (OMIM: 614776) serine/threonine-protein (1321) 739 80.0 6.8e-14 XP_005271538 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 739 80.0 7e-14 XP_011541023 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1369) 739 80.0 7e-14 NP_001186796 (OMIM: 606495) MAP/microtubule affini ( 752) 732 79.1 7.1e-14 NP_001156768 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 719) 727 78.6 9.4e-14 XP_011543099 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 739) 727 78.6 9.5e-14 XP_011543097 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 745) 727 78.6 9.6e-14 XP_011543095 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 784) 727 78.7 9.9e-14 NP_001034558 (OMIM: 600526) serine/threonine-prote ( 788) 727 78.7 9.9e-14 XP_011543094 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 793) 727 78.7 1e-13 XP_011543092 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 799) 727 78.7 1e-13 XP_011543091 (OMIM: 600526) PREDICTED: serine/thre ( 808) 727 78.7 1e-13 NP_006243 (OMIM: 600497) 5'-AMP-activated protein ( 552) 715 77.5 1.6e-13 NP_006242 (OMIM: 602739) 5'-AMP-activated protein ( 559) 705 76.6 3e-13 XP_016872913 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1213) 706 77.1 4.7e-13 NP_001268678 (OMIM: 614776) serine/threonine-prote (1261) 706 77.1 4.8e-13 XP_005271539 (OMIM: 614776) PREDICTED: serine/thre (1321) 706 77.1 5e-13 XP_011516388 (OMIM: 607025) PREDICTED: maternal em ( 373) 686 74.7 7.2e-13 XP_011516381 (OMIM: 607025) PREDICTED: maternal em ( 651) 690 75.4 8.2e-13 >>NP_055401 (OMIM: 606532) hormonally up-regulated neu t (714 aa) initn: 4839 init1: 4839 opt: 4839 Z-score: 2305.2 bits: 437.1 E(85289): 1.2e-121 Smith-Waterman score: 4839; 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