FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4125, 513 aa 1>>>pF1KE4125 513 - 513 aa - 513 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4573+/-0.000885; mu= 17.4985+/- 0.053 mean_var=79.8927+/-15.843, 0's: 0 Z-trim(107.3): 74 B-trim: 69 in 1/49 Lambda= 0.143490 statistics sampled from 9435 (9512) to 9435 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 2.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 3431 720.2 1.4e-207 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 1882 399.5 4.6e-111 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 1286 276.1 5.9e-74 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 1116 240.9 2.2e-63 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 983 213.4 4.2e-55 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 965 209.7 6.2e-54 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 960 208.6 1.2e-53 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 926 201.7 1.8e-51 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 820 179.9 1.1e-44 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 816 179.0 1.8e-44 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 625 139.4 1.2e-32 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 615 137.3 4.7e-32 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 611 136.4 7.2e-32 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 605 135.2 1.7e-31 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 605 135.2 1.9e-31 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 599 133.9 3.7e-31 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 594 132.9 8.4e-31 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 573 128.6 1.8e-29 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 570 127.9 2.6e-29 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 447 102.5 1.2e-21 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 397 92.2 1.7e-18 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 397 92.2 1.8e-18 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 397 92.2 1.8e-18 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 397 92.2 1.8e-18 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 397 92.2 1.9e-18 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 397 92.2 1.9e-18 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 386 89.9 9e-18 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 385 89.7 1.1e-17 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 384 89.5 1.2e-17 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 384 89.5 1.2e-17 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 357 83.8 4.8e-16 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 309 73.9 4.8e-13 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 309 73.9 5.4e-13 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 287 69.5 1.5e-11 >>CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 (513 aa) initn: 3431 init1: 3431 opt: 3431 Z-score: 3840.5 bits: 720.2 E(32554): 1.4e-207 Smith-Waterman score: 3431; 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CCDS10 SRDGGLHPRHHHYGSHSPWSQLLSSPMETPSIKGLYYRRVRKVGALDA-----SPVDLKK 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 RIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGA .:.::::: .: :::.:::.:::.::..:. : ....:...::::: .::::::.:.: CCDS10 EILINVGGRRYLLPWSTLDRFPLSRLSKLRLCRSYEEIVQLCDDYDEDSQEFFFDRSPSA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 FGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVERE ::.:..:: :::: ::.::::::::::: :::: : ::. :: :. :.:.::. :... . CCDS10 FGVIVSFLAAGKLVLLQEMCALSFQEELAYWGIEEAHLERCCLRKLLRKLEELEELAKLH 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 EEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVN .:: . . :... :: .: : :: :::.::: :.::::::::::::.:::..:::. CCDS10 RED--VLRQQRETRRPASHSSRWGLCMNRLREMVENPQSGLPGKVFACLSILFVATTAVS 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 LSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTL : :::.:.:: ::.::.::. :. .::::..::.:::::: ::..:: .: :...::.. CCDS10 LCVSTMPDLRAEEDQGECSRKCYYIFIVETICVAWFSLEFCLRFVQAQDKCQFFQGPLNI 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 IDLVAILPYYITLLV--DGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSL ::..:: :::..: : . :.: : .:.:::.::::::::::::::::::::::::: CCDS10 IDILAISPYYVSLAVSEEPPEDGER-P-SGSSYLEKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 GLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVIT ::::::::.:::::::::::::: :::.::.::.:: :.: . ::::::: ::::.:. CCDS10 GLQTLGLTVRRCTREFGLLLLFLAVAITLFSPLVYVAEKESGRVLEFTSIPASYWWAIIS 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 MTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRR :::::::::::::.:::.:::::::::::.::::.::::::::.::::::.:::... : CCDS10 MTTVGYGDMVPRSVPGQMVALSSILSGILIMAFPATSIFHTFSHSYLELKKEQEQLQARL 420 430 440 450 460 470 490 500 510 pF1KE4 AQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN CCDS10 RHLQNTGPASECELLDPHVASEHELMNDVNDLILEGPALPIMHM 480 490 500 510 >>CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 (466 aa) initn: 1714 init1: 763 opt: 1286 Z-score: 1441.3 bits: 276.1 E(32554): 5.9e-74 Smith-Waterman score: 1730; 58.5% identity (79.0% similar) in 467 aa overlap (51-513:2-456) 30 40 50 60 70 pF1KE4 DASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPED----RRRRIIINVGGIKYSL :: :.: : :..:::::: . : CCDS12 MEP-WPCSPGGGGGTRARHVIINVGGCRVRL 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 PWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKL :..: . ::.:: .:.:: . ::.: :::::::. .::::::.: :: .:...:::::: CCDS12 AWAALARCPLARLERLRACRGHDDLLRVCDDYDVSRDEFFFDRSPCAFRAIVALLRAGKL 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 RLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS :::: :::.:..:: :::: : .:. :: :: .. :: :: : : : .: . CCDS12 RLLRGPCALAFRDELAYWGIDEARLERCCLRRLRRREEEAAEARAGPTERGAQGSPAR-A 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 EGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEE :: .::: : :::::.:. ::::: ::.:::.:: ::.::::.: .::.:..: :: CCDS12 LGP---RGRLQRGRRRLRDVVDNPHSGLAGKLFACVSVSFVAVTAVGLCLSTMPDIRAEE 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 EQGHCSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITL :.:.:: :...:..:.:::.:::.::::: .:: :: ::::.::..::..:.::.:..: CCDS12 ERGECSPKCRSLFVLETVCVAWFSFEFLLRSLQAESKCAFLRAPLNIIDILALLPFYVSL 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 LVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTRE :. : ::: :: :.. :...:::::.:::::.:::::::::::::..:::: :::.:: CCDS12 LL-GLAAG---PG-GTKLLERAGLVLRLLRALRVLYVMRLARHSLGLRSLGLTMRRCARE 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 FGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTP :::::::::::.::::::... : :.. .:.:.:: ::::::.::::::::::::: : CCDS12 FGLLLLFLCVAMALFAPLVHLAERELGARRDFSSVPASYWWAVISMTTVGYGDMVPRSLP 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 GQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQ ::::::::::::::::::::::::::::::: :::..:.:. . . . . .... CCDS12 GQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYSELKEQQQRAASPEPALQEDSTHSATATE 390 400 410 420 430 440 500 510 pF1KE4 DSDILFGSASSDTRDNN ::. : :. :.. CCDS12 DSSQ--GPDSAGLADDSADALWVRAGR 450 460 >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 939 init1: 318 opt: 1116 Z-score: 1251.5 bits: 240.9 E(32554): 2.2e-63 Smith-Waterman score: 1116; 42.0% identity (71.6% similar) in 426 aa overlap (65-476:11-425) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA ...:::: .::: : .::: :...:.. CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRA-GKLRLLREMCALSFQEELLY : . :.:.:::::: ::.::::. ::: :: ..:. ::::. .:: ::: .:..: CCDS18 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 WGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRC-MRR ::. ::. ::.:: ... . . .: .: ::: :. .:. .: ..: CCDS18 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSD-TYTFYSADEPGVL---GRDEARPGGAEAAPSRRWLER 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 pF1KE4 LRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHC----SQMCHN- .: :.: :.: ....: .::.:: :. : : .::::. :. ... :.. . CCDS18 MRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNRSLDDRSRYSAGP 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 ----VFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA :.:..:.:::. : ..:.: . .: :.. ::..:::.:: ::::..:. . . CCDS18 GREPSGIIEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMT-VFT 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF :. :: :...:..::::: .::..:..:::: .:::::::: .:: ::. .::.: CCDS18 GE------NSQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVF 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LCVAIALFAPLLYVIENEM---ADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVV .:::.:.:. : ..:. . ... .:::::: ::..:.::::::::: : ..::... CCDS18 ICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRIL 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 ALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDI . ..:::.:.:.:.: :.:.: . : ::: .. : CCDS18 GGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 390 400 410 420 430 510 pF1KE4 LFGSASSDTRDNN >>CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (425 aa) initn: 1104 init1: 265 opt: 983 Z-score: 1102.8 bits: 213.4 E(32554): 4.2e-55 Smith-Waterman score: 1136; 42.7% identity (72.7% similar) in 417 aa overlap (65-476:11-414) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA ...:::: .::: : .::: :...:.. CCDS42 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRRVSRLHG 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRA-GKLRLLREMCALSFQEELLY : . :.:.:::::: ::.::::. ::: :: ..:. ::::. .:: ::: .:..: CCDS42 CRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSFYNEMIY 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 pF1KE4 WGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRC-MRR ::. ::. ::.:: ... . . .: .: ::: :. .:. .: ..: CCDS42 WGLEGAHLEYCCQRRLDDRMSD-TYTFYSADEPGVL---GRDEARPGGAEAAPSRRWLER 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KE4 LRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQMCHNVFIVE .: :.: :.: ....: .::.:: :. : : .::::. :. ... .. :.: CCDS42 MRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDWRNAAADNR--SLDDRSRIIE 160 170 180 190 200 210 280 290 300 310 320 330 pF1KE4 SVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGN ..:.:::. : ..:.: . .: :.. ::..:::.:: ::::..:. . .:. : CCDS42 AICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKRPLNIIDLLAITPYYISVLMT-VFTGE------N 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KE4 SYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFA : :...:..::::: .::..:..:::: .:::::::: .:: ::. .::.:.:::.:.:. CCDS42 SQLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQTLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFS 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 pF1KE4 PLLYVIENEM---ADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGI : ..:. . ... .:::::: ::..:.::::::::: : ..::.... ..::: CCDS42 ALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIISMTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGI 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 LLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDT .:.:.:.: :.:.: . : ::: .. : CCDS42 VLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSLSTEFLN 390 400 410 420 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 981 init1: 381 opt: 965 Z-score: 1081.8 bits: 209.7 E(32554): 6.2e-54 Smith-Waterman score: 965; 38.5% identity (69.1% similar) in 421 aa overlap (57-471:9-417) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 AFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPL .: . .. . .::::.: :. .:: .:: CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPH 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 TRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALS ::::.: .: . . ::..::::.:. .:..:::::. : .:.: .:::....:.:..: CCDS16 TRLGKLLTCHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFS 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 FQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEM-VEREEEDDALDSEGRDS---EGPAEG : .:. :::: : .:.::. :: .. :: : ... .: . :: ..: : : CCDS16 FCQEIEYWGINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVSTDSSFEESSLFEKELEK 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 EG--RLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGH :.:. ... .: : : .:..: :. : .. : . : .. ...:. :. CCDS16 FDTLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQNED--GE 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 CSQMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDG .. . :: .:..::. :. .:: :: . : ..::..::.:.:.:.: :: :: CCDS16 VDDPV--LEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIPFYATLAVD- 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 AAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLL : ... ....: :...:: .::. ...:::::.::..:: : :. .: ::: CCDS16 -----TKEEESED-IENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHEVGLL 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVV :::: :.:..:. :.: .:.. : .:::: :.:::.:.:::::::: : . :... CCDS16 LLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSS-LTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAGKLI 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 ALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDI : . :. :::..:.:.: ::. ::. : . : CCDS16 ASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDIYAQ 390 400 410 420 430 440 510 pF1KE4 LFGSASSDTRDNN CCDS16 RMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK 450 460 470 480 490 >>CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 (477 aa) initn: 855 init1: 351 opt: 960 Z-score: 1076.4 bits: 208.6 E(32554): 1.2e-53 Smith-Waterman score: 960; 39.4% identity (69.2% similar) in 419 aa overlap (65-472:19-422) 40 50 60 70 80 90 pF1KE4 IKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKA : :::::.: : :: .:: ::::.: CCDS62 MTGQSLWDVSEANVEDGEIRINVGGFKRRLRSHTLLRFPETRLGRLLL 10 20 30 40 100 110 120 130 140 150 pF1KE4 CTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYW : . . ::..::::: . ::.::::: : .: : ..:::... :.:..::..:. :: CCDS62 CHSREAILELCDDYDDVQREFYFDRNPELFPYVLHFYHTGKLHVMAELCVFSFSQEIEYW 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 pF1KE4 GIAEDHLDGCCKRRYL-QKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDS---------EGPAEGEG :: : .:.::. : .:.: :.:. :. :.:. : . .. .: CCDS62 GINEFFIDSCCSYSYHGRKVEP-----EQEKWDEQSDQESTTSSFDEILAFYNDASKFDG 110 120 130 140 150 160 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 R-LGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGHCSQ . :: :.: .. : .. ..::. ::.: : . ... ...::... . ::. .. CCDS62 QPLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQGNPGE 170 180 190 200 210 220 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 MCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAA ::: ..::..:.. :. ::. . :... :.::::..:.:.::::.:. .. CCDS62 D-PRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFYITLVVNLVVE 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 GRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLF . : .: .: : .::: .::. ...::::: ::..:: : . .: :::::. CCDS62 ST--PTLAN-----LGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVGLLLLY 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 LCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALS : :.:..:. . :.::.: .. ...::::.:::...::::::::.:: .: :...: . CCDS62 LSVGISIFSVVAYTIEKE--ENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLTASA 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 SILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFG ::.:::....:.: ::. ::. : . :: CCDS62 CILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCDFGDGMKEVPSVNLRDYYAHKVK 400 410 420 430 440 450 >>CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 (545 aa) initn: 594 init1: 594 opt: 926 Z-score: 1037.5 bits: 201.7 E(32554): 1.8e-51 Smith-Waterman score: 926; 34.6% identity (66.0% similar) in 465 aa overlap (51-513:85-545) 30 40 50 60 70 80 pF1KE4 DASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVGGIKYSLPWTT .:. .: . .:::: .:.: . CCDS64 IEEDEDGEEEDQWKDDLAEEDQQAGEVTTAKPEGPSDPPALLSTLNVNVGGHSYQLDYCE 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE4 LDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTFLRAGKLRLLR : :: ::::.: . :. . :..::::. .:.::::.:..: . .: .: : .: CCDS64 LAGFPKTRLGRLATSTSRSRQLSLCDDYEEQTDEYFFDRDPAVFQLVYNFYLSGVLLVLD 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 EMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALDSEGRDSEGPA .: : ::: :::. . ::. . .. .:..: .. ..: : ... ...: CCDS64 GLCPRRFLEELGYWGVRLKYTPRCCRICFEERRDELSERLKIQHELRA-QAQVEEAEELF 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 EGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLPSLREEEEQGH . : ::: ...:.: :.. .:... : :: :..: :...:. .... ::. CCDS64 RDMRFYGPQRRRLWNLMEKPFSSVAAKAIGVASSTFVLVSVVALALNTVEEMQQHSGQGE 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KE4 CSQMCHNVFI-VESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLVAILPYYITLLVD . . .. :: .:.:.:.::.:::: ..:. : :: :.:.::::::: :. ::.. CCDS64 GGPDLRPILEHVEMLCMGFFTLEYLLRLASTPDLRRFARSALNLVDLVAILPLYLQLLLE 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 GAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLGLTARRCTREFGL .. .. : . . ::: ::::.: .::. ...::::: ::...:.: :.: .. : CCDS64 CFTGEGHQRGQTVGSVGKVGQVLRVMRLMRIFRILKLARHSTGLRAFGFTLRQCYQQVGC 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 LLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGYGDMVPRSTPGQV ::::. ..: :. .: .:... : .::.:: .:::.....::::::: :.. :. CCDS64 LLLFIAMGIFTFSAAVYSVEHDVP-STNFTTIPHSWWWAAVSISTVGYGDMYPETHLGRF 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 VALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSD :. : ::.: ..:.. ... :: : .:: : . .:: . .. : . .. .. CCDS64 FAFLCIAFGIILNGMPISILYNKFSDYYSKLKA-YEYTTIRRERGEVNFM-QRARKKIAE 480 490 500 510 520 530 500 510 pF1KE4 ILFGSASSDT-RDNN :.:: . : :..: CCDS64 CLLGSNPQLTPRQEN 540 >>CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 (911 aa) initn: 1239 init1: 494 opt: 820 Z-score: 915.8 bits: 179.9 E(32554): 1.1e-44 Smith-Waterman score: 1228; 41.8% identity (74.4% similar) in 457 aa overlap (41-494:15-449) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 YDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPEDRRRRIIINVG : . : : :: . . . ::. :::: CCDS62 MAEKAPPGLNRKTSRSTLSLPP--EPVDIIRSKTCSRRVKINVG 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 GIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRNPGAFGTILTF :... . : :::..: ::::.:. :.. ...:.:::::... ::.::::.:::: .::.: CCDS62 GLNHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHESLLEVCDDYNLNENEYFFDRHPGAFTSILNF 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 LRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMVEREEEDDALD :.:::....::::::: .:: :::: : .:..::. :: :: :.. : ..:: : . CCDS62 YRTGKLHMMEEMCALSFGQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEELRREAET-MRE 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 SEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVTAVNLSVSTLP ::.. .. . : ..: :..:.:.:.. .:..: .:.::...... ::..::: CCDS62 REGEEFDNTCCPDKR-----KKLWDLLEKPNSSVAAKILAIVSILFIVLSTIALSLNTLP 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 pF1KE4 SLREEEEQGHCS---QMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFLRSPLTLIDLV :.: .: :. . :. : ::.::..::..:.:::....:.:. :...::..:::. CCDS62 ELQETDEFGQLNDNRQLAH----VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPNKWKFFKGPLNVIDLL 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 AILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLARHSLGLQTLG ::::::.:... . . . ...: :....: .::: ...::::: :::.:: CCDS62 AILPYYVTIFLTESNKSVLQ-------FQNVRRVVQIFRIMRILRILKLARHSTGLQSLG 280 290 300 310 320 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 LTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWWAVITMTTVGY .: :: :.:::.::: ..: .:. :.. :.. :. .:::::: .:::.:::::::: CCDS62 FTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKD-EDATKFTSIPASFWWATITMTTVGY 330 340 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 GDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERVMFRRAQFLIK ::. :.. :..:. ..:.:..:.:. : ..::. : : :. ::... :: . : . CCDS62 GDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKR-QEKAIKRR-EALER 390 400 410 420 430 440 490 500 510 pF1KE4 TKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN .: . :. CCDS62 AKRNGSIVSMNLKDAFARSMELIDVAVEKAGESANTKDSADDNHLSPSRWKWARKALSET 450 460 470 480 490 500 >>CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 (858 aa) initn: 1130 init1: 494 opt: 816 Z-score: 911.7 bits: 179.0 E(32554): 1.8e-44 Smith-Waterman score: 1217; 40.5% identity (73.6% similar) in 469 aa overlap (29-494:1-445) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MTLLPGDNSDYDYSALSCTSDASFHPAFLPQRQAIKGAFYRRAQRLRPQDEPRQGCQPED .: .. .:. : .. : : :: . . . CCDS13 MPAGMTKHGS--RSTSSLPP--EPMEIVRSKA 10 20 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 RRRRIIINVGGIKYSLPWTTLDEFPLTRLGQLKACTNFDDILNVCDDYDVTCNEFFFDRN ::. .::::. . . : :::..: ::::.:. :.. :..:.:::::.. ::.::::. CCDS13 CSRRVRLNVGGLAHEVLWRTLDRLPRTRLGKLRDCNTHDSLLEVCDDYSLDDNEYFFDRH 30 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 PGAFGTILTFLRAGKLRLLREMCALSFQEELLYWGIAEDHLDGCCKRRYLQKIEEFAEMV :::: .::.: :.:.:....:::::::..:: :::: : .:..::. :: :: :.. : . CCDS13 PGAFTSILNFYRTGRLHMMEEMCALSFSQELDYWGIDEIYLESCCQARYHQKKEQMNEEL 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 EREEEDDALDSEGRDSEGPAEGEGRLGRCMRRLRDMVERPHSGLPGKVFACLSVLFVTVT .:: : . ::.. .. .: : ..: :..:.:.:.. .:..: .:..:.... CCDS13 KREAET-LREREGEEFDNTCCAEKR-----KKLWDLLEKPNSSVAAKILAIISIMFIVLS 150 160 170 180 190 200 250 260 270 280 290 pF1KE4 AVNLSVSTLPSLREEEEQGHCS---QMCHNVFIVESVCVGWFSLEFLLRLIQAPSKFAFL .. ::..::: :. .: :. . :. : ::.::..::..:.:::....:.:. :. CCDS13 TIALSLNTLPELQSLDEFGQSTDNPQLAH----VEAVCIAWFTMEYLLRFLSSPKKWKFF 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 RSPLTLIDLVAILPYYITLLVDGAAAGRRKPGAGNSYLDKVGLVLRVLRALRILYVMRLA ..::. :::.::::::.:... . . . ...: :....: .::: ...:: CCDS13 KGPLNAIDLLAILPYYVTIFLT-------ESNKSVLQFQNVRRVVQIFRIMRILRILKLA 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 RHSLGLQTLGLTARRCTREFGLLLLFLCVAIALFAPLLYVIENEMADSPEFTSIPACYWW ::: :::.::.: :: :.:::.::: ..: .:. :.. :.. :. .: :::: .:: CCDS13 RHSTGLQSLGFTLRRSYNELGLLILFLAMGIMIFSSLVFFAEKD-EDDTKFKSIPASFWW 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 AVITMTTVGYGDMVPRSTPGQVVALSSILSGILLMAFPVTSIFHTFSRSYLELKQEQERV :.::::::::::. :.. :..:. ..:.:..:.:. : ..::. : : :. ::.. CCDS13 ATITMTTVGYGDIYPKTLLGKIVGGLCCIAGVLVIALPIPIIVNNFSEFYKEQKR-QEKA 380 390 400 410 420 480 490 500 510 pF1KE4 MFRRAQFLIKTKSQLSVSQDSDILFGSASSDTRDNN . :: . : ..: . :. CCDS13 IKRR-EALERAKRNGSIVSMNMKDAFARSIEMMDIVVEKNGENMGKKDKVQDNHLSPNKW 430 440 450 460 470 480 513 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:52:54 2016 done: Sun Nov 6 01:52:55 2016 Total Scan time: 2.790 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]