FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6464, 541 aa 1>>>pF1KE6464 541 - 541 aa - 541 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1790+/-0.000891; mu= 11.4972+/- 0.053 mean_var=141.8261+/-28.569, 0's: 0 Z-trim(111.0): 37 B-trim: 650 in 1/52 Lambda= 0.107695 statistics sampled from 12041 (12075) to 12041 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.712), E-opt: 0.2 (0.371), width: 16 Scan time: 3.850 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13402.1 SLC2A10 gene_id:81031|Hs108|chr20 ( 541) 3563 565.2 6.8e-161 CCDS5169.1 SLC2A12 gene_id:154091|Hs108|chr6 ( 617) 536 94.9 2.9e-19 CCDS65138.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 ( 411) 416 76.2 8.6e-14 CCDS8736.2 SLC2A13 gene_id:114134|Hs108|chr12 ( 648) 402 74.1 5.5e-13 >>CCDS13402.1 SLC2A10 gene_id:81031|Hs108|chr20 (541 aa) initn: 3563 init1: 3563 opt: 3563 Z-score: 3002.0 bits: 565.2 E(32554): 6.8e-161 Smith-Waterman score: 3563; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLDFGLSCLEQEFLVGSLLLGALL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLDFGLSCLEQEFLVGSLLLGALL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 ASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSLAWLVLGRAVVGFAISLSSMACC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 ASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSLAWLVLGRAVVGFAISLSSMACC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 IYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYALNYALAGTPWGWRHMFGWATAPAVLQSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 IYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYALNYALAGTPWGWRHMFGWATAPAVLQSL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 SLLFLPAGTDETATHKDLIPLQGGEAPKLGPGRPRYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SLLFLPAGTDETATHKDLIPLQGGEAPKLGPGRPRYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 FQQLTGQPNVLCYASTIFSSVGFHGGSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 FQQLTGQPNVLCYASTIFSSVGFHGGSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 LAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMDSGPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 LAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMDSGPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 EDQREPILSTAKKTKPHPRSGDPSAPPRLALSSALPGPPLPARGHALLRWTALLCLMVFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 EDQREPILSTAKKTKPHPRSGDPSAPPRLALSSALPGPPLPARGHALLRWTALLCLMVFV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 SAFSFGFGPVTWLVLSEIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGLSWTFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 SAFSFGFGPVTWLVLSEIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGLSWTFL 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 LYGLTAVLGLGFIYLFVPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRIEISAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS13 LYGLTAVLGLGFIYLFVPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRIEISAA 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 S : CCDS13 S >>CCDS5169.1 SLC2A12 gene_id:154091|Hs108|chr6 (617 aa) initn: 1197 init1: 536 opt: 536 Z-score: 459.4 bits: 94.9 E(32554): 2.9e-19 Smith-Waterman score: 1188; 41.1% identity (68.9% similar) in 528 aa overlap (10-514:42-566) 10 20 30 pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLD : . .. ..:: ::::..:::::: .. 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CCDS51 VIKSSLKDEYQYSFWDLFRSKDNMRTRIMIGLTLVFFVQITGQPNILFYASTVLKSVGFQ 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 GGSSAVLASVGLGAVKVAATLTAMGLVDRAGRRALLLAGCALMALSVSGIGLVSFAVPMD .. .: :::.:.:.::: .:. : :::..: ...: : ..:: :. .:.:.. . :. CCDS51 SNEAASLASTGVGVVKVISTIPATLLVDHVGSKTFLCIGSSVMAASLVTMGIVNLNIHMN 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KE6 SGPSCLAVPNATGQTGLPGDSGLLQDSSLPPIPRTNEDQREPILSTAKKT-KPHPRSGDP : . :. .:. .: . ..: : .:. . : : .... : . : CCDS51 FTHICRS-HNSINQS--LDESVIYGPGNLSTNNNTLRDHFKGISSHSRSSLMPLRNDVDK 380 390 400 410 420 390 400 410 420 430 pF1KE6 SAPPRLA--LSSALPGPPL-----PARGHALLRWTALLCLMVFVSAFSFGFGPVTWLVLS . : :...: :. :.:.: .: :.:.:.:::.:.::. ::::: CCDS51 RGETTSASLLNAGLSHTEYQIVTDPGDVPAFLKWLSLASLLVYVAAFSIGLGPMPWLVLS 430 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 EIYPVEIRGRAFAFCNSFNWAANLFISLSFLDLIGTIGLSWTFLLYGLTAVLGLGFIYLF ::.: :::::.:. .:.::. ::.:::.:: . ::: :. ..: . .. .: :. .: CCDS51 EIFPGGIRGRAMALTSSMNWGINLLISLTFLTVTDLIGLPWVCFIYTIMSLASLLFVVMF 490 500 510 520 530 540 500 510 520 530 540 pF1KE6 VPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRIEISAAS .::::: :: .:.... : CCDS51 IPETKGCSLEQISMELAKVNYVKNNICFMSHHQEELVPKQPQKRKPQEQLLECNKLCGRG 550 560 570 580 590 600 >>CCDS65138.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 (411 aa) initn: 323 init1: 197 opt: 416 Z-score: 361.1 bits: 76.2 E(32554): 8.6e-14 Smith-Waterman score: 416; 32.2% identity (60.1% similar) in 323 aa overlap (10-315:28-337) 10 20 30 40 pF1KE6 MGHSPPVLPLCASVSLLGGLTFGYELAVISGALLPLQLDFG- : : .. :: :.::. :. : :. :: CCDS65 MTPEDPEETQPLLGPPGGSAPRGRRVFLAAFAAALGPLSFGFALGYSSPAIPSLQRAAPP 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE6 ---LSCLEQEFLVGSLLLGALLASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLGLAGSL :. .. . . ::: ....::.:.: ::: ..: .. ..:: ... :.. 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CCDS87 SSTSLQSAGAGGGGVGDLERAARRQFQQDETPAFVYVVAVFSALGGFLFGYDTGVVSGAM 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 LPLQLDFGLSCLEQEFLVGSLLLGALLASLVGGFLIDCYGRKQAILGSNLVLLAGSLTLG : :. ...:. : ::.::.: . .: ...:.:: : .::. ::: .. .. ::: .:. CCDS87 LLLKRQLSLDALWQELLVSSTVGAAAVSALAGGALNGVFGRRAAILLASALFTAGSAVLA 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 LAGSLAWLVLGRAVVGFAISLSSMACCIYVSELVGPRQRGVLVSLYEAGITVGILLSYAL :.. :. :: :::..:...::. .:..:. : :: ::.. :: : ... .. CCDS87 AANNKETLLAGRLVVGLGIGIASMTVPVYIAEVSPPNLRGRLVTINTLFITGGQFFASVV 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 pF1KE6 NYALAGTPW-GWRHMFGWATAPAVLQSLSLLFLPAGT----DETATHKD---LIPLQGG- . :.. :::.:.: :..:::.: ...:::: . .. :.: : ..:. CCDS87 DGAFSYLQKDGWRYMLGLAAVPAVIQFFGFLFLPESPRWLIQKGQTQKARRILSQMRGNQ 230 240 250 260 270 280 210 220 230 240 pF1KE6 ---------------EAPKLGPGRPRYSFLDLFRARDNMRGRTTVGLGLVLFQQLTGQPN : ..: . : . . : :: :: .::::.: . 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CCDS87 LILYLVFFAPGMGPMPWTVNSEIYPLWARSTGNACSSGINWIFNVLVSLTFLHTAEYLTY 520 530 540 550 560 570 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SWTFLLYGLTAVLGLGFIYLFVPETKGQSLAEIDQQFQKRRFTLSFGHRQNSTGIPYSRI .:.::. :..:: ::: .:::::..: ::.. :..: : . . ... : : :. CCDS87 YGAFFLYAGFAAVGLLFIYGCLPETKGKKLEEIESLFDNRLCTCGTSDSDEGRYIEYIRV 580 590 600 610 620 630 540 pF1KE6 EISAAS . : CCDS87 KGSNYHLSDNDASDVE 640 541 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 13:33:02 2016 done: Tue Nov 8 13:33:03 2016 Total Scan time: 3.850 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]