FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4128, 526 aa 1>>>pF1KE4128 526 - 526 aa - 526 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3784+/-0.000779; mu= 17.9817+/- 0.047 mean_var=76.5271+/-15.652, 0's: 0 Z-trim(108.8): 94 B-trim: 53 in 1/49 Lambda= 0.146611 statistics sampled from 10348 (10471) to 10348 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.693), E-opt: 0.2 (0.322), width: 16 Scan time: 3.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 3519 753.9 9.9e-218 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 945 209.5 7.2e-54 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 878 195.3 1.2e-49 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 733 164.6 2.3e-40 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 688 155.1 1.8e-37 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 686 154.7 2.3e-37 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 642 145.4 1.4e-34 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 628 142.4 1.1e-33 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 629 142.7 1.1e-33 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 622 141.2 2.7e-33 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 618 140.4 5.8e-33 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 614 139.5 8.8e-33 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 610 138.6 1.5e-32 CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 610 138.7 2e-32 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 570 130.1 4.9e-30 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 512 118.0 3.3e-26 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 495 114.4 4.1e-25 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 490 113.3 8.4e-25 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 490 113.3 8.6e-25 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 480 111.1 3.2e-24 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 447 104.2 3.9e-22 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 443 103.5 1.1e-21 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 419 98.4 3.5e-20 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 400 94.2 3.9e-19 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 400 94.2 4e-19 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 398 93.9 6e-19 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 398 93.9 6.1e-19 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 362 86.2 1.1e-16 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 362 86.2 1.1e-16 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 362 86.2 1.2e-16 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 362 86.2 1.2e-16 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 362 86.2 1.2e-16 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 362 86.2 1.2e-16 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 297 72.5 1.9e-12 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 286 70.1 6.9e-12 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 286 70.1 7.7e-12 CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 271 66.8 4.7e-11 >>CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 (526 aa) initn: 3519 init1: 3519 opt: 3519 Z-score: 4022.4 bits: 753.9 E(32554): 9.9e-218 Smith-Waterman score: 3519; 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CCDS62 EYWGINEFFIDSCCSYSYHGRKVEPEQEKWDEQSDQESTTSSF-DEILAFYNDASKFDGQ 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 RCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAV : .::.:::...:::::. :..:: .:: ::..:: .::..:::..: .. . CCDS62 PLGNFRRQLWLALDNPGYSVLSRVFSILSILVVMGSIITMCLNSLPDFQIPDSQG----- 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 AAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFY .: : .:: .. .:.: ::::.::. .:. .::. .:: . :::::..:..::: CCDS62 ----NP-G--EDPRFEIVEHFGIAWFTFELVARFAVAPDFLKFFKNALNLIDLMSIVPFY 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 LTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVG .::...... .. ...::.:.::.:::::::.::::::::::::::::::.::.::: CCDS62 ITLVVNLVV--ESTPTLANLGRVAQVLRLMRIFRILKLARHSTGLRSLGATLKYSYKEVG 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 ILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDVGFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLA .:::::.::.:.:: :::: ::::. :. ::::::::.:::::::::::::: :.::::. CCDS62 LLLLYLSVGISIFSVVAYTIEKEENEGLATIPACWWWATVSMTTVGYGDVVPGTTAGKLT 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 ASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSEASL ::.:::.:::::.::::.::::::::::::: ::.:.:. . : : .. : .:. . CCDS62 ASACILAGILVVVLPITLIFNKFSHFYRRQKQLESAMRSCD---FGDGMKEVPSVNLRDY 400 410 420 430 440 500 510 520 pF1KE4 ETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY . . : .. ... ..::: CCDS62 YAHKVKSLMASLTNMSRSSPSELSLNDSLR 450 460 470 >>CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 (436 aa) initn: 751 init1: 239 opt: 878 Z-score: 1004.6 bits: 195.3 E(32554): 1.2e-49 Smith-Waterman score: 878; 35.5% identity (64.8% similar) in 454 aa overlap (46-482:5-434) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 SKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTR : . .. .::::.: .:: . : :: : CCDS18 MTFGRSGAASVVLNVGGARYSLSRELLKDFPLRR 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 LGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRT-GHLHVLDELCVFAF ..::.. ::... ..:::::. :..:::: : .: . : :.:. ..: ..: CCDS18 VSRLHGCRSERDVLEVCDDYDRERNEYFFDRHSEAFGFILLYVRGHGKLRFAPRMCELSF 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 GQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARY .: :::: : :: .::: :. ::: . . :: . . :. :: CCDS18 YNEMIYWGLEGAHLEYCC-----QRRLD-----DRMSDTYTFYS--ADEPGVLGRDEARP 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 GAARCGRLRR---RLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAA :.:. . :: :. :.:.: :: ..... ::. :..:....: .::.. :.:: CCDS18 GGAEAAPSRRWLERMRRTFEEPTSSLAAQILASVSVVFVIVSMVVLCASTLPDW--RNAA 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 pF1KE4 A--------AVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCH : . ... :: : :. .: .::.::. : :.... . .: . CCDS18 ADNRSLDDRSRYSAGPGREPSGI--------IEAICIGWFTAECIVRFIVSKNKCEFVKR 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLR :::.::.... :.:...: : :... .. . : ...:.:.:::: :.::::: ::. CCDS18 PLNIIDLLAITPYYISVLMTVFTGENS--QLQRAGVTLRVLRMMRIFWVIKLARHFIGLQ 260 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 pF1KE4 SLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDV-----GFNTIPACWWWGTVS .:: :::. :::. .::... :....::... :. :. :..::: :: .: CCDS18 TLGLTLKRCYREMVMLLVFICVAMAIFSALSQLLEHGLDLETSNKDFTSIPAACWWVIIS 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 MTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSN ::::::::. :.:: :.. .. :...::...:::::.:...: . :.. : : : CCDS18 MTTVGYGDMYPITVPGRILGGVCVVSGIVLLALPITFIYHSFVQCYHELKFRSARYSRSL 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 pF1KE4 HQEFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY :: CCDS18 STEFLN >>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa) initn: 778 init1: 251 opt: 733 Z-score: 838.0 bits: 164.6 E(32554): 2.3e-40 Smith-Waterman score: 810; 31.6% identity (63.4% similar) in 500 aa overlap (22-506:2-456) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPG-PDTGIRWRRSD-------EAL : ..:.... .: :: :. : :..: : . CCDS85 MTVMSGENVDE-ASAAPGHPQDGSYPRQADHDDHECCERV 10 20 30 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 RVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFL .:..:.: . . ..::.::.: :: ... : .: :..:::. : CCDS85 VINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLGN-----PKKRMRY----FDPLRNEYFFDRNRPSFD 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 SLLHFYRTG-HLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDS ..:..:..: .:. .. . :..: .. :::.:. ... . ... .. CCDS85 AILYYYQSGGRLRRPVNVPLDMFSEEIKFYELGEEAM----------EKFREDEGFIKEE 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVL . : :.. . .:..:: .: : : :..... ::. :.: CCDS85 ERP-----LPEK-----------------EYQRQVWLLFEYPESSGPARVIAIVSVMVIL 150 160 170 240 250 260 270 280 pF1KE4 ASIAAMCIHSLPEYQA-REAAAAVAAVAAGRS--PEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVS ::. .:...::: . .. ...: . .. :: . .: .:: :::::. CCDS85 ISIVIFCLETLPELKDDKDFTGTVHRIDNTTVIYNSNIFTDPFFI-VETLCIIWFSFELV 180 190 200 210 220 230 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 SRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVAL--GDQGGKEFGHLGKVVQVFRL :.. :: .:: . .:.::::...:...:: . .: :.: :.. :. ...:.:: CCDS85 VRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPYFITLGTEIAEQEGNQKGEQATSLA-ILRVIRL 240 250 260 270 280 290 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 MRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE-DVGF .:.::..::.::: ::. :: ::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: :: . : CCDS85 VRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEEAESHF 300 310 320 330 340 350 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 NTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYR ..:: .::..::::::::::. :::..::...: : ..:.:..:::. .: ..:..::. CCDS85 SSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYH 360 370 380 390 400 410 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 RQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQM :. : .. : .: :. : ..: :. .: CCDS85 RETEGEEQAQ-LLHVSSPNLASDSDLSRRSSSTMSKSEYMEIEEDMNNSIAHYRQVNIRT 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 Y CCDS85 ANCTTANQNCVNKSKLLTDV 480 490 >>CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 (511 aa) initn: 677 init1: 357 opt: 688 Z-score: 786.4 bits: 155.1 E(32554): 1.8e-37 Smith-Waterman score: 765; 29.7% identity (63.7% similar) in 474 aa overlap (37-504:74-501) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 RGTHYENLRSKVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSAR :::. . .... . .:..:.: . . : CCDS82 SSFSNGKILISESTNHETAFSKLPGDYADPPGPEP-VVLNEGNQRVIINIAGLRFETQLR 50 60 70 80 90 100 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 ALARFPGTRLGRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTG-HLHV .:..:: : :: .. .:. . .: :..:::. : ..:..:..: ... CCDS82 TLSQFPETLLG--------DREKRM-QFFDSMRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGKIRR 110 120 130 140 150 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 LDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEIS .. . :..: ... :: .:. .. . ... .: : .. : : CCDS82 PANVPIDIFADEISFYELGSEAMD----------QFREDEGFIKD---PETLLPTND--- 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 DVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEY ..:..:: .: : : .. . ::. ::. ::. .:...:::. CCDS82 ----------------IHRQFWLLFEYPESSSAARAVAVVSVLVVVISITIFCLETLPEF 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 QAREAAAAVAAVAAGRSP----EGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFF . . .: . : . . :: . .: ::.::.::. :... :: .:: CCDS82 REDRELKVVRDPNLNMSKTVLSQTMFTDPFFM-VESTCIVWFTFELVLRFVVCPSKTDFF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 CHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTG . .:.:::.:..:.. ::.. .. . . . . .....::.:.::..::.::: : CCDS82 RNIMNIIDIISIIPYFATLITELVQETEPSAQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 LRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE-DVGFNTIPACWWWGTVSMT :. :: ::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: .: . :..:: .::..:.:: CCDS82 LQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTMT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 TVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQ ::::::. :.: .::.... : ..:.:..:::. .: ..:..::.:. : ... CCDS82 TVGYGDMCPTTPGGKIVGTLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRET--ENEEKQNIPG 430 440 450 460 470 490 500 510 520 pF1KE4 EFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY :.: .:.:: : .: .. .:. CCDS82 EIERILNSV-GSRMGSTDSLNKTNGGCSTEKSRK 480 490 500 510 >>CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 (500 aa) initn: 845 init1: 429 opt: 686 Z-score: 784.3 bits: 154.7 E(32554): 2.3e-37 Smith-Waterman score: 1061; 39.9% identity (64.9% similar) in 476 aa overlap (17-475:6-446) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MLMLLVRGTHYENLRSKVVLPTPLGGRS-----TETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVN ...: .:: . : . .: :: : .. . . :: CCDS63 MPSSGRALLDSPLDSGSLTSLDSSVFCSEGEGEPLAL-----GDCFTVN 10 20 30 40 60 70 80 90 100 pF1KE4 VGGVRRQLSARALARFPGTRLGRLQ----------AAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFD ::: : :: .::. :: ::::.: : :. . .:::: . . :..:: CCDS63 VGGSRFVLSQQALSCFPHTRLGKLAVVVASYRRPGALAAVPSPLELCDDANPVDNEYFFD 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 RHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQEADYWGLGENALAACCRARYLERR-LTQP : : .::.::::.:::...::...: :: .:::. : .. .::: ::..:. :.. CCDS63 RSSQAFRYVLHYYRTGRLHVMEQLCALSFLQEIQYWGIDELSIDSCCRDRYFRRKELSET 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 HAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSC . .:.. :. :. . : .. . : .:..:: .:.:: : ...:. CCDS63 LDFKKDTE---------DQESQHESE-QDFSQGPCPTVRQKLWNILEKPGSSTAARIFGV 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 VSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFS .:: :..:: : . : : .. . : .:. ::: ::.::. CCDS63 ISIIFVVVSIINMALMS----------AELSWL----------DLQLLEILEYVCISWFT 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 FEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVF : :.: . . :. . :.::....::::.:::. :.: .:. ..:..:::. CCDS63 GEFVLRFLCVRDRCRFLRKVPNIIDLLAILPFYITLLVESLSGSQTTQELENVGRIVQVL 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 RLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKE-EDV ::.: .:.:::.:::::::::: :. . :.:::.:::.:.::.:.:: : : ::. :. CCDS63 RLLRALRMLKLGRHSTGLRSLGMTITQCYEEVGLLLLFLSVGISIFSTVEYFAEQSIPDT 320 330 340 350 360 370 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 GFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHF :...: :::.:.:::::::::. : :..::..: :::.::::.::::.:: ..:: CCDS63 TFTSVPCAWWWATTSMTTVGYGDIRPDTTTGKIVAFMCILSGILVLALPIAIINDRFSAC 380 390 400 410 420 430 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 YRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHP : : ::::: CCDS63 YFTLKLKEAAVRQREALKKLTKNIATDSYISVNLRDVYARSIMEMLRLKGRERASTRSSG 440 450 460 470 480 490 >>CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 (491 aa) initn: 1450 init1: 617 opt: 642 Z-score: 734.1 bits: 145.4 E(32554): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 1443; 50.8% identity (77.3% similar) in 427 aa overlap (47-471:12-420) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 KVVLPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRL ...: . .:::: ..... .: ::: ::: CCDS16 MVFGEFFHRPGQDEELVNLNVGGFKQSVDQSTLLRFPHTRL 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 GRLQAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTGHLHVLDELCVFAFGQ :.: . ::: .:::::. : .:.::::.:..: .:.:: ::.:::..:::::.: : CCDS16 GKLLTCHSEEAILELCDDYSVADKEYYFDRNPSLFRYVLNFYYTGKLHVMEELCVFSFCQ 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 EADYWGLGENALAACCRARYLERRL-TQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYG : .:::..: . .:: :: ::. .. . ::. : :. : .: : ..:: .. CCDS16 EIEYWGINELFIDSCCSNRYQERKEENHEKDWDQKSHDVST-DSSFEESSLFEKELEKFD 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 AARCGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVA . : :.::...:. ::::.: : .::.. :.:::::::.:::.::. :.: CCDS16 TLRFGQLRKKIWIRMENPAYCLSAKLIAISSLSVVLASIVAMCVHSMSEFQ--------- 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 AVAAGRSPEGVRDDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDIVSVLP . .: :::::. .: :::::. :.. :: :: ..:. .:::.::.::..: CCDS16 ------NEDGEVDDPVLEGVEIACIAWFTGELAVRLAAAPCQKKFWKNPLNIIDFVSIIP 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 FYLTLLAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGATLKHSYRE :: :: .: .. .... ..:::::..:::::::.:::::::.:::::::::.:::.: CCDS16 FYATL--AVDTKEEESEDIENMGKVVQILRLMRIFRILKLARHSVGLRSLGATLRHSYHE 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 VGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDVG-FNTIPACWWWGTVSMTTVGYGDVVPVTVAG ::.:::.:.::.:.:: . :..::.. .. ...:: ::::.:.:::::::::. :::.:: CCDS16 VGLLLLFLSVGISIFSVLIYSVEKDDHTSSLTSIPICWWWATISMTTVGYGDTHPVTLAG 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 KLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLLSSVDGVSE :: :: ::. :::::::::::::::::..:..:: .. CCDS16 KLIASTCIICGILVVALPITIIFNKFSKYYQKQKDIDVDQCSEDAPEKCHELPYFNIRDI 390 400 410 420 430 440 500 510 520 pF1KE4 ASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY CCDS16 YAQRMHTFITSLSSVGIVVSDPDSTDASSIEDNEDICNTTSLENCTAK 450 460 470 480 490 >>CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 (456 aa) initn: 798 init1: 344 opt: 628 Z-score: 718.5 bits: 142.4 E(32554): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 870; 38.4% identity (66.1% similar) in 443 aa overlap (50-473:13-410) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 LPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRL : : .::.:.: . ::.:.::: : :: CCDS12 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG-- 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 QAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTG-HLHVLDELCVFAFGQEA . ::: ::.: ::..:::: : ..:..:..: .:. .. . .: .:. CCDS12 ------DPARR-GRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEV 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 DYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAAR ..::: ::: : : :: : : : .: : : . :: CCDS12 AFYGLGAAALA---RLR-------------EDEGCP--VPP--------ERPLPRRAFAR 100 110 120 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 CGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQA-REAAAAVAAV .::: .: : : ..... ::. :.:.::...:...::... :.... .::. CCDS12 ------QLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVVFCLETLPDFRDDRDGTGLAAAA 130 140 150 160 170 180 260 270 280 290 300 pF1KE4 AAGRSPEGVR--------------DDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCH ::: : . .:: . .: .:: :::::. :::. :: :: . CCDS12 AAGPFPAPLNGSSQMPGNPPRLPFNDPFFV-VETLCICWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKN 190 200 210 220 230 240 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 PLNLIDIVSVLPFYLTLLAGVALGDQ-G-GKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTG .::::.:..::....: :. :. : : :.. :. ...:.::.:.::..::.::: : CCDS12 VMNLIDFVAILPYFVAL--GTELARQRGVGQQAMSLA-ILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKG 250 260 270 280 290 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 LRSLGATLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE-DVGFNTIPACWWWGTVSMT :. :: ::. :.::.:.:...: .:: .::...: :: .. : :..:: .::..:.:: CCDS12 LQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFAEVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMT 300 310 320 330 340 350 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 TVGYGDVVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQ ::::::..::::.::...: : ..:.:...::. .: ..::.::.:. : : CCDS12 TVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVIVSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVD 360 370 380 390 400 410 490 500 510 520 pF1KE4 EFEDLLSSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY CCDS12 MQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLVTEV 420 430 440 450 >>CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 (575 aa) initn: 455 init1: 344 opt: 629 Z-score: 718.2 bits: 142.7 E(32554): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 795; 32.6% identity (63.1% similar) in 469 aa overlap (50-505:104-528) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 LPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRL : . .:..:.: . . ..: .:: : :: CCDS82 PQGGCGGGGCDRYEPLPPSLPAAGEQDCCGERVVINISGLRFETQLKTLCQFPETLLG-- 80 90 100 110 120 130 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 QAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTG-HLHVLDELCVFAFGQEA . ::. .: :..:::. : ..:..:..: ... .. . :..: CCDS82 ------DPKRRM-RYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRIRRPVNVPIDIFSEEI 140 150 160 170 180 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 DYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAAR .. :::.:. .. : :: . . .: : : CCDS82 RFYQLGEEAME-----KFRE---------DEGF------------LREEERPLPRRD--- 190 200 210 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 CGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREAAAAVAAV- ..:..:: .: : : :.. .. ::. :.: ::. .:...:::.. .. : .. CCDS82 ---FQRQVWLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDEKDYPASTSQD 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 pF1KE4 ---AAGRSPEGVR------DDPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLI ::: : : : .:: . .: .:: :::::. :.. :: .: . .::: CCDS82 SFEAAGNSTSGSRAGASSFSDPFFV-VETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLI 280 290 300 310 320 330 310 320 330 340 350 360 pF1KE4 DIVSVLPFYLTLLAGVALGD-QGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGA :::...:...:: :. :.. ::. . . ...:.::.:.::..::.::: ::. :: CCDS82 DIVAIIPYFITL--GTELAERQGNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQ 340 350 360 370 380 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 TLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEEDV-GFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGD ::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: .. . ::..:: .::..:.:::::::: CCDS82 TLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGD 390 400 410 420 430 440 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 VVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLL . :::..::...: : ..:.:..:::. .: ..:..::.:. : . . . : CCDS82 MHPVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQYMHVGSCQHLS 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 pF1KE4 SSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY ::.. . .: ... :. CCDS82 SSAEELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIK 510 520 530 540 550 560 >>CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (499 aa) initn: 579 init1: 273 opt: 622 Z-score: 711.1 bits: 141.2 E(32554): 2.7e-33 Smith-Waterman score: 776; 31.9% identity (62.8% similar) in 479 aa overlap (50-515:33-462) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 LPTPLGGRSTETFVSEFPGPDTGIRWRRSDEALRVNVGGVRRQLSARALARFPGTRLGRL : . .:..:.: . . ..::.:: : :: CCDS82 VATGDPADEAAALPGHPQDTYDPEADHECCERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLG-- 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 QAAASEEQARRLCDDYDEAAREFYFDRHPGFFLSLLHFYRTG-HLHVLDELCVFAFGQEA . .:. .: :..:::. : ..:..:..: .:. .. . :..: CCDS82 ------DPKKRM-RYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLRRPVNVPLDIFSEEI 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE4 DYWGLGENALAACCRARYLERRLTQPHAWDEDSDTPSSVDPCPDEISDVQRELARYGAAR .. :::.:. : . . .:. : :.. CCDS82 RFYELGEEAMEMF--------REDEGYIKEEER-------PLPEN--------------- 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KE4 CGRLRRRLWLTMENPGYSLPSKLFSCVSISVVLASIAAMCIHSLPEYQAREA---AAAVA ...:..:: .: : : :..... ::. :.: ::...:...:: .. .. ...:. CCDS82 --EFQRQVWLLFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENEDMHGSGVT 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE4 AVAAGRSPEGVRD-----DPVLRRLEYFCIAWFSFEVSSRLLLAPSTRNFFCHPLNLIDI . . : : .. :: . .: .:: ::::: :.. :: .:: . .:.::: CCDS82 FHTYSNSTIGYQQSTSFTDPFFI-VETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDI 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 pF1KE4 VSVLPFYLTL---LAGVALGDQGGKEFGHLGKVVQVFRLMRIFRVLKLARHSTGLRSLGA :...:...:: :: : :.. :. ...:.::.:.::..::.::: ::. :: CCDS82 VAIIPYFITLGTELAEKPEDAQQGQQAMSLA-ILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQ 270 280 290 300 310 370 380 390 400 410 420 pF1KE4 TLKHSYREVGILLLYLAVGVSVFSGVAYTAEKEE-DVGFNTIPACWWWGTVSMTTVGYGD ::: :.::.:.:...: .:: .::...: :: .: . : .:: .::..:::::::::: CCDS82 TLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERESQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGD 320 330 340 350 360 370 430 440 450 460 470 480 pF1KE4 VVPVTVAGKLAASGCILGGILVVALPITIIFNKFSHFYRRQKALEAAVRNSNHQEFEDLL .::.:..::...: : ..:.:..:::. .: ..:..::.:. : .. .. .. CCDS82 MVPTTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGE------EQAQYLQVT 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 pF1KE4 SSVDGVSEASLETSRETSQEGQSADLESQAPSEPPHPQMY : : .:. :: .: ..: .: : CCDS82 SCPKIPSSPDLKKSRSASTISKSDYMEIQEGVNNSNEDFREENLKTANCTLANTNYVNIT 440 450 460 470 480 490 526 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:52:16 2016 done: Sun Nov 6 01:52:16 2016 Total Scan time: 3.440 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]