FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2074, 737 aa 1>>>pF1KE2074 737 - 737 aa - 737 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4849+/-0.000376; mu= 10.3521+/- 0.024 mean_var=128.1546+/-25.933, 0's: 0 Z-trim(116.6): 5 B-trim: 371 in 1/53 Lambda= 0.113294 statistics sampled from 27951 (27956) to 27951 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.672), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16 Scan time: 11.490 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002094 (OMIM: 138570,611556) glycogen [starch] ( 737) 5013 831.1 0 NP_001155059 (OMIM: 138570,611556) glycogen [starc ( 673) 3879 645.7 1.8e-184 NP_068776 (OMIM: 138571,240600) glycogen [starch] ( 703) 3543 590.8 6.2e-168 XP_006719126 (OMIM: 138571,240600) PREDICTED: glyc ( 626) 3149 526.4 1.4e-148 XP_016874734 (OMIM: 138571,240600) PREDICTED: glyc ( 392) 1976 334.6 4.8e-91 >>NP_002094 (OMIM: 138570,611556) glycogen [starch] synt (737 aa) initn: 5013 init1: 5013 opt: 5013 Z-score: 4434.1 bits: 831.1 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5013; 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