FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2609, 265 aa 1>>>pF1KE2609 265 - 265 aa - 265 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9414+/-0.000916; mu= 11.1620+/- 0.055 mean_var=100.0577+/-20.086, 0's: 0 Z-trim(106.9): 119 B-trim: 2 in 1/50 Lambda= 0.128218 statistics sampled from 9107 (9242) to 9107 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.666), E-opt: 0.2 (0.284), width: 16 Scan time: 1.880 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12583.1 CEACAM7 gene_id:1087|Hs108|chr19 ( 265) 1761 336.3 1.3e-92 CCDS54272.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 368) 1111 216.2 2.7e-56 CCDS54273.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 430) 1111 216.2 3e-56 CCDS54274.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 461) 1111 216.3 3.2e-56 CCDS46089.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 464) 1111 216.3 3.2e-56 CCDS12609.1 CEACAM1 gene_id:634|Hs108|chr19 ( 526) 1111 216.3 3.5e-56 CCDS12585.1 CEACAM6 gene_id:4680|Hs108|chr19 ( 344) 1065 207.6 9.2e-54 CCDS77302.1 CEACAM5 gene_id:1048|Hs108|chr19 ( 701) 1064 207.7 1.8e-53 CCDS12584.1 CEACAM5 gene_id:1048|Hs108|chr19 ( 702) 1064 207.7 1.8e-53 CCDS12610.1 CEACAM8 gene_id:1088|Hs108|chr19 ( 349) 1056 206.0 3e-53 CCDS12617.1 PSG5 gene_id:5673|Hs108|chr19 ( 335) 823 162.9 2.7e-40 CCDS82360.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 326) 815 161.4 7.4e-40 CCDS77314.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 333) 803 159.2 3.5e-39 CCDS12618.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 426) 803 159.3 4.2e-39 CCDS33038.1 PSG6 gene_id:5675|Hs108|chr19 ( 424) 799 158.5 7e-39 CCDS12613.1 PSG6 gene_id:5675|Hs108|chr19 ( 435) 799 158.5 7.2e-39 CCDS62695.1 PSG4 gene_id:5672|Hs108|chr19 ( 326) 797 158.1 7.4e-39 CCDS12614.2 PSG11 gene_id:5680|Hs108|chr19 ( 335) 793 157.3 1.3e-38 CCDS12616.1 PSG2 gene_id:5670|Hs108|chr19 ( 335) 792 157.1 1.4e-38 CCDS33039.1 PSG4 gene_id:5672|Hs108|chr19 ( 326) 791 156.9 1.6e-38 CCDS77312.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 333) 789 156.6 2.1e-38 CCDS46087.1 CEACAM21 gene_id:90273|Hs108|chr19 ( 292) 716 143.0 2.2e-34 CCDS46086.1 CEACAM21 gene_id:90273|Hs108|chr19 ( 293) 705 141.0 9.1e-34 CCDS62685.1 CEACAM3 gene_id:1084|Hs108|chr19 ( 212) 628 126.6 1.4e-29 CCDS12586.2 CEACAM3 gene_id:1084|Hs108|chr19 ( 252) 628 126.7 1.6e-29 CCDS77311.1 PSG9 gene_id:5678|Hs108|chr19 ( 240) 499 102.8 2.3e-22 CCDS33033.1 CEACAM4 gene_id:1089|Hs108|chr19 ( 244) 454 94.5 7.5e-20 CCDS54278.1 CEACAM16 gene_id:388551|Hs108|chr19 ( 425) 445 93.0 3.6e-19 CCDS59392.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 417) 399 84.5 1.3e-16 CCDS54275.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 419) 399 84.5 1.3e-16 CCDS12612.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 426) 399 84.5 1.3e-16 CCDS74380.1 PSG1 gene_id:5669|Hs108|chr19 ( 428) 399 84.5 1.3e-16 CCDS77310.1 PSG7 gene_id:5676|Hs108|chr19 ( 297) 396 83.8 1.5e-16 CCDS12611.1 PSG3 gene_id:5671|Hs108|chr19 ( 428) 391 83.0 3.7e-16 CCDS46090.1 PSG8 gene_id:440533|Hs108|chr19 ( 297) 388 82.4 4.1e-16 CCDS46091.1 PSG8 gene_id:440533|Hs108|chr19 ( 419) 388 82.5 5.4e-16 CCDS33037.1 PSG8 gene_id:440533|Hs108|chr19 ( 426) 388 82.5 5.4e-16 CCDS46093.1 PSG4 gene_id:5672|Hs108|chr19 ( 419) 385 81.9 7.9e-16 CCDS12615.2 PSG11 gene_id:5680|Hs108|chr19 ( 213) 368 78.5 4.2e-15 >>CCDS12583.1 CEACAM7 gene_id:1087|Hs108|chr19 (265 aa) initn: 1761 init1: 1761 opt: 1761 Z-score: 1776.0 bits: 336.3 E(32554): 1.3e-92 Smith-Waterman score: 1761; 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