FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4201, 707 aa 1>>>pF1KE4201 707 - 707 aa - 707 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7856+/-0.000332; mu= 8.8359+/- 0.021 mean_var=138.4973+/-27.750, 0's: 0 Z-trim(120.2): 77 B-trim: 803 in 1/54 Lambda= 0.108982 statistics sampled from 35115 (35194) to 35115 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.735), E-opt: 0.2 (0.413), width: 16 Scan time: 12.810 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001306223 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-contain ( 813) 2798 451.6 5.7e-126 NP_057205 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing ( 815) 2795 451.1 7.9e-126 NP_001306224 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-contain ( 711) 2319 376.2 2.4e-103 XP_005273215 (OMIM: 613272) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 713) 2316 375.8 3.3e-103 NP_001269615 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain- ( 220) 280 55.4 2.8e-07 NP_001269614 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain- ( 225) 280 55.4 2.9e-07 XP_011528679 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 249) 280 55.4 3.1e-07 NP_078957 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain-con ( 297) 280 55.5 3.6e-07 XP_005261801 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 315) 280 55.5 3.8e-07 NP_001269613 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain- ( 321) 280 55.5 3.9e-07 XP_005261800 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 328) 280 55.5 3.9e-07 XP_005261799 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 352) 280 55.5 4.2e-07 XP_005261798 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 352) 280 55.5 4.2e-07 XP_011528676 (OMIM: 616386,616398) PREDICTED: BTB/ ( 370) 280 55.5 4.4e-07 XP_011522877 (OMIM: 613422) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 226) 268 53.5 1.1e-06 NP_056168 (OMIM: 613422) BTB/POZ domain-containing ( 263) 268 53.5 1.2e-06 NP_061865 (OMIM: 611285) BTB/POZ domain-containing ( 234) 248 50.4 9.7e-06 NP_001161433 (OMIM: 611725,611726) BTB/POZ domain- ( 288) 236 48.5 4.3e-05 NP_694578 (OMIM: 611725,611726) BTB/POZ domain-con ( 289) 236 48.5 4.3e-05 NP_076981 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-containing ( 234) 218 45.7 0.00025 NP_001123466 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-contain ( 283) 218 45.7 0.0003 XP_011525600 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 218 45.7 0.0003 XP_011525599 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 218 45.7 0.0003 NP_001123467 (OMIM: 615240) BTB/POZ domain-contain ( 283) 218 45.7 0.0003 XP_016882772 (OMIM: 615240) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 283) 218 45.7 0.0003 XP_016884999 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 405) 204 43.6 0.0019 NP_004970 (OMIM: 300281) potassium voltage-gated c ( 647) 204 43.7 0.0028 XP_011542212 (OMIM: 300281) PREDICTED: potassium v ( 647) 204 43.7 0.0028 NP_955751 (OMIM: 607947) potassium channel regulat ( 229) 195 42.0 0.0031 XP_016878594 (OMIM: 608947) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 175) 192 41.5 0.0034 NP_775876 (OMIM: 607947) potassium channel regulat ( 272) 195 42.1 0.0036 XP_011544085 (OMIM: 608947) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 347) 196 42.3 0.0039 XP_016878595 (OMIM: 608947) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 173) 189 41.0 0.0047 NP_001304328 (OMIM: 613421) BTB/POZ domain-contain ( 290) 192 41.6 0.0052 NP_114160 (OMIM: 613421) BTB/POZ domain-containing ( 313) 192 41.6 0.0055 NP_001304324 (OMIM: 613421) BTB/POZ domain-contain ( 314) 192 41.6 0.0056 NP_612453 (OMIM: 610521) BTB/POZ domain-containing ( 325) 192 41.6 0.0057 XP_016881197 (OMIM: 181270,613420) PREDICTED: BTB/ ( 257) 190 41.3 0.0058 NP_945342 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain-con ( 257) 190 41.3 0.0058 NP_001129677 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 257) 190 41.3 0.0058 NP_001245150 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 257) 190 41.3 0.0058 NP_001245151 (OMIM: 181270,613420) BTB/POZ domain- ( 265) 190 41.3 0.006 XP_011539729 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369) 191 41.5 0.0071 XP_011539730 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 369) 191 41.5 0.0071 XP_006710695 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 375) 191 41.5 0.0072 XP_011539728 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 387) 191 41.5 0.0074 XP_016856734 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407) 191 41.5 0.0077 XP_011539727 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 407) 191 41.5 0.0077 XP_006710694 (OMIM: 605411,607346,616399) PREDICTE ( 510) 191 41.6 0.0094 NP_849194 (OMIM: 608947) BTB/POZ domain-containing ( 329) 187 40.9 0.01 >>NP_001306223 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing (813 aa) initn: 2817 init1: 2101 opt: 2798 Z-score: 2382.6 bits: 451.6 E(85289): 5.7e-126 Smith-Waterman score: 2813; 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NP_057 CGSVLFHGYLPPPGIPSRKINNTVRSADSRNGLNSTEGEARGNGTQPVLSGTGEETVRL- 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 DEKTPPSPSGQPEEPGMVRLVCGHHNWIAVAYTQFLVCYRLKEASGWQLVFSSPRLDWPI : : .: : .: ::::::..::..: ::::.::.:::: ::.:: ::: : NP_057 ---------GFPVDPRKVLIVAGHHNWIVAAYAHFAVCYRIKESSGWQQVFTSPYLDWTI 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 ERLALTARVHGGALGEHDKMVAAATGSEILLWALQAEGGGSEIGVFHLGVPVEALFFVGN ::.::.:.: :: :..:::::.:. : :.::..: :.::::::: :::::.::::.:: NP_057 ERVALNAKVVGGPHGDKDKMVAVASESSIILWSVQDGGSGSEIGVFSLGVPVDALFFIGN 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 QLIATSHTGRIGVWNAVTKHWQVQEVQPITSYDAAGSFLLLGCNNGSIYYVDVQKFPLRM ::.::::::..:::::::.:::::.: ::::::.::::::::::::::::.:.::::::: NP_057 QLVATSHTGKVGVWNAVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRM 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 KDNDLLVSELYRDPAEDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGS :::::::.:::.::..:..:::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::: NP_057 KDNDLLVTELYHDPSNDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGS 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 GPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFK :::::::::::::::::::::::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::: NP_057 GPQLFQTFTVHRSPVTKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFK 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 ILALESADGHGGCSAGNDIGPYGERDDQQVFIQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVD ::.:: ...::. :.::::::.::::::::::::::: ...:::::::::.:.: ...:: NP_057 ILSLEETESHGSYSSGNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVD 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GSPTTAFTVLECEGSRRLGSRPRRYLLTGQANGSLAMWDLTTAMDGLGQAP---AGGLTE . ..::: ::::: :.::::::::.::..:::. ::::::::: .... .:: :: NP_057 CTTISSFTVRECEGSSRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSEDKDVGGPTE 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 pF1KE4 QELMEQLEHCELAPP---APS-APSWGCLPSPSPRISLTSL--------HSASSNTSLSG .::.. :..:.:. .:. .:. . . : : .:: : :.. :. NP_057 EELLKLLDQCDLSTSRCATPNISPATSVVQHSHLRESNSSLQLQHHDTTHEAATYGSMRP 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE4 HRGSPSPPQAEARRRGGGSFVERCQELVRSGPDLRRPPTPAPWPSSGLGTPLTPPKMKLN .: :: :.::: NP_057 YR--ESPLLARARRTESFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGNLGPIQAEVKGATGECNIS 650 660 670 680 690 700 >>NP_001306224 (OMIM: 613272) BTB/POZ domain-containing (711 aa) initn: 2338 init1: 2101 opt: 2319 Z-score: 1976.5 bits: 376.2 E(85289): 2.4e-103 Smith-Waterman score: 2334; 63.9% identity (81.5% similar) in 568 aa overlap (106-657:3-557) 80 90 100 110 120 130 pF1KE4 LNFLRTKELDPRGVHGSSLLHEAQFYGLTPLVRRLQLREELDRSSCGNVLFNGYLPPPVF ::::: : :::.:::::.:::.:::::: . 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NP_001 AVTQHWQVQDVVPITSYDTAGSFLLLGCNNGSIYYIDMQKFPLRMKDNDLLVTELYHDPS 210 220 230 240 250 260 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 EDGVTALSVYLTPKTSDSGNWIEIAYGTSSGGVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPV .:..:::::::::::: ::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::: NP_001 NDAITALSVYLTPKTSVSGNWIEIAYGTSSGAVRVIVQHPETVGSGPQLFQTFTVHRSPV 270 280 290 300 310 320 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 TKIMLSEKHLISVCADNNHVRTWSVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILALESADGHGGCSA ::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ...::. :. 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XP_005 TKIMLSEKHLVSVCADNNHVRTWTVTRFRGMISTQPGSTPLASFKILSLEETESHGSYSS 330 340 350 360 370 380 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 GNDIGPYGERDDQQVFIQKVVPSASQLFVRLSSTGQRVCSVRSVDGSPTTAFTVLECEGS ::::::.::::::::::::::: ...:::::::::.:.: ...:: . ..::: ::::: XP_005 GNDIGPFGERDDQQVFIQKVVPITNKLFVRLSSTGKRICEIQAVDCTTISSFTVRECEGS 390 400 410 420 430 440 560 570 580 590 600 pF1KE4 RRLGSRPRRYLLTGQANGSLAMWDLTTAMDGLGQAP---AGGLTEQELMEQLEHCEL--- :.::::::::.::..:::. ::::::::: .... .:: ::.::.. :..:.: XP_005 SRMGSRPRRYLFTGHTNGSIQMWDLTTAMDMVNKSEDKDVGGPTEEELLKLLDQCDLSTS 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 pF1KE4 --APPAPSAPSWGCLPSPSPRISLTSL--------HSASSNTSLSGHRGSPSPPQAEARR : : : :. . . : : .:: : :.. :. .: :: :.::: XP_005 RCATPNIS-PATSVVQHSHLRESNSSLQLQHHDTTHEAATYGSMRPYR--ESPLLARARR 510 520 530 540 550 660 670 680 690 700 pF1KE4 RGGGSFVERCQELVRSGPDLRRPPTPAPWPSSGLGTPLTPPKMKLNETSF XP_005 TESFHSYRDFQTINLNRNVERAVPENGNLGPIQAEVKGATGECNISERKSPGVEIKSLRE 560 570 580 590 600 610 >>NP_001269615 (OMIM: 616386,616398) BTB/POZ domain-cont (220 aa) initn: 273 init1: 131 opt: 280 Z-score: 251.6 bits: 55.4 E(85289): 2.8e-07 Smith-Waterman score: 280; 45.0% identity (68.3% similar) in 120 aa overlap (3-119:15-134) 10 20 30 40 pF1KE4 MAAAATAAEGVPSRGPPGEVIHLNVGGKRFSTSRQTLTWIPDSFFSSL :: :. : . : :. ..::::: : :.:::: ::.: : NP_001 MQTPRPAMRMEAGEAAPPAGAGGRAAGGWGKWVRLNVGGTVFLTTRQTLCREQKSFLSRL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 LSGR-ISTLKDETGAIFIDRDPTVFAPILNFLRTKELD-PRGVHGSSLLHEAQFYGLTPL .:. ... .::::: .:::::: :.::::::: .: . . ..:.::.::.. :: NP_001 CQGEELQSDRDETGAYLIDRDPTYFGPILNFLRHGKLVLDKDMAEEGVLEEAEFYNIGPL 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 VRRLQLR-EELDRSSCGNVLFNGYLPPPVFPVKRRNRHSLVGPQQLGGRPAPVRRSNTMP .: .. : :: : . 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NP_001 IRIIKDRMEEKDYTVTQVPPKHVYRVLQCQEEELTQMVSTMSDGWRFEQLVNIGSSYNYG 130 140 150 160 170 180 707 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 01:30:57 2016 done: Sun Nov 6 01:30:59 2016 Total Scan time: 12.810 Total Display time: 0.060 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]