FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9559, 351 aa 1>>>pF1KE9559 351 - 351 aa - 351 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6848+/-0.00105; mu= 14.1324+/- 0.061 mean_var=127.1502+/-42.847, 0's: 0 Z-trim(104.9): 176 B-trim: 1007 in 2/48 Lambda= 0.113741 statistics sampled from 7869 (8155) to 7869 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.606), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16 Scan time: 2.440 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 ( 351) 2307 390.5 1.1e-108 CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 ( 364) 1225 213.0 3.2e-55 CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 ( 353) 1119 195.6 5.4e-50 CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 ( 382) 727 131.3 1.3e-30 CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 ( 378) 666 121.3 1.3e-27 CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 ( 398) 639 116.9 3e-26 CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 ( 384) 622 114.1 2e-25 CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 ( 353) 532 99.3 5.3e-21 CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 ( 330) 478 90.4 2.4e-18 CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 362) 457 87.0 2.7e-17 CCDS69172.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 ( 377) 457 87.0 2.8e-17 CCDS9319.1 GPR12 gene_id:2835|Hs108|chr13 ( 334) 443 84.6 1.3e-16 CCDS11868.1 MC5R gene_id:4161|Hs108|chr18 ( 325) 394 76.6 3.3e-14 CCDS13449.2 MC3R gene_id:4159|Hs108|chr20 ( 323) 369 72.5 5.7e-13 CCDS11976.1 MC4R gene_id:4160|Hs108|chr18 ( 332) 369 72.5 5.8e-13 CCDS245.1 CNR2 gene_id:1269|Hs108|chr1 ( 360) 357 70.5 2.4e-12 >>CCDS12407.1 LPAR2 gene_id:9170|Hs108|chr19 (351 aa) initn: 2307 init1: 2307 opt: 2307 Z-score: 2064.6 bits: 390.5 E(32554): 1.1e-108 Smith-Waterman score: 2307; 100.0% identity (100.0% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIASN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIASN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 RRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASVA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 TLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCSR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 TLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCSR 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 MAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSLV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 KTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRDA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 KTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRDA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 EMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 EMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL 310 320 330 340 350 >>CCDS6777.1 LPAR1 gene_id:1902|Hs108|chr9 (364 aa) initn: 1043 init1: 1043 opt: 1225 Z-score: 1104.9 bits: 213.0 E(32554): 3.2e-55 Smith-Waterman score: 1225; 57.3% identity (83.7% similar) in 307 aa overlap (6-312:23-328) 10 20 30 40 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVS ::.:::.:.:::: :::.:...: . .:..::.:: CCDS67 MAAISTSIPVISQPQFTAMNEPQCFYNESIAFFYNRSGKHLATEWNTVSKLVMGLGITVC 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 VLVLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEG ....:.::::..:: ::::: :::::..::::::.:::.::..:::.::: : ::.. CCDS67 IFIMLANLLVMVAIYVNRRFHFPIYYLMANLAAADFFAGLAYFYLMFNTGPNTRRLTVST 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 WFLRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGL :.:::::.:::::::::.:::::.::: .:. .:::.:. :::..:: .:. :. .: CCDS67 WLLRQGLIDTSLTASVANLLAIAIERHITVFRMQLHTRMSNRRVVVVIVVIWTMAIVMGA 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 LPAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA .:. .:.:.: .. :: :::: : :::. ::. .:..:..::..:..:: :::.:..::. CCDS67 IPSVGWNCICDIENCSNMAPLYSDSYLVFWAIFNLVTFVVMVVLYAHIFGYVRQRTMRMS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 EHVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLL .: : : :.: .::.:::::.::::..::::: :.:::: . : .:.::: ::.:::: CCDS67 RHSSGPRRNRDTMMSLLKTVVIVLGAFIICWTPGLVLLLLD-VCCPQCDVLAYEKFFLLL 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 AEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENG :: :: .: .:: :: :: :::..::: CCDS67 AEFNSAMNPIIYSYRDKEMSATFRQILCCQRSENPTGPTEGSDRSASSLNHTILAGVHSN 300 310 320 330 340 350 >>CCDS700.1 LPAR3 gene_id:23566|Hs108|chr1 (353 aa) initn: 1063 init1: 1030 opt: 1119 Z-score: 1011.0 bits: 195.6 E(32554): 5.4e-50 Smith-Waterman score: 1119; 48.0% identity (78.7% similar) in 333 aa overlap (4-335:1-333) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWR-PKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS :..:.:.. . :::: :. . . : : :.:. .: ......: :::::. . CCDS70 MNECHYDKHMDFFYNRSNTDTVDDWTGTKLVIVLCVGTFFCLFIFFSNSLVIAAVIK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASV ::.:: :.::::.::::::.:::.::.::::.::: . :... :::::::::.:::::. CCDS70 NRKFHFPFYYLLANLAAADFFAGIAYVFLMFNTGPVSKTLTVNRWFLRQGLLDSSLTASL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCS ..::.:::::: :.: ...:: : . ::..::. ::. :. .: .:. .:.::: .. :: CCDS70 TNLLVIAVERHMSIMRMRVHSNLTKKRVTLLILLVWAIAIFMGAVPTLGWNCLCNISACS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 RMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLSL .::. :::::. :..:.:..::.::.:: ::. ::.:... .. :.: :.: ..: CCDS70 SLAPIYSRSYLVFWTVSNLMAFLIMVVVYLRIYVYVKRKTNVLSPHTSGSISRRRTPMKL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 VKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYSCRD .:::. .::::::::::: ::::::::.:..:.: :...::::: ::.:: .:: .: CCDS70 MKTVMTVLGAFVVCWTPGLVVLLLDGLNCRQCGVQHVKRWFLLLALLNSVVNPIIYSYKD 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 AEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL .: :.....:: .. :. . :.. . ..: CCDS70 EDMYGTMKKMICCFSQENPERRPSRIPSTVLSRSDTGSQYIEDSISQGAVCNKSTS 300 310 320 330 340 350 >>CCDS777.1 S1PR1 gene_id:1901|Hs108|chr1 (382 aa) initn: 589 init1: 468 opt: 727 Z-score: 663.0 bits: 131.3 E(32554): 1.3e-30 Smith-Waterman score: 727; 37.8% identity (69.7% similar) in 304 aa overlap (17-314:29-331) 10 20 30 40 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGK-ELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVL :: .:: ..:. . . .. .. . . ... CCDS77 MGPTSVPLVKAHRSSVSDYVNYDIIVRHYNYTGKLNISADKENSIKLTSVVFILICCFII 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 LTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLR : :..:. .: ....::.:.::..:::: .::.::::: .. .: : .:. :::: CCDS77 LENIFVLLTIWKTKKFHRPMYYFIGNLALSDLLAGVAYTANLLLSGATTYKLTPAQWFLR 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 QGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAH .: . ..:.::: .:::::.::. ... ..::. :. .:: . :: .: :: :: CCDS77 EGSMFVALSASVFSLLAIAIERYITMLKMKLHNGSNNFRLFLLISACWVISLILGGLPIM 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 SWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMA--EH .:.:. ::. :: . :: . :. . :..: .: .: ::. :: : .:.. .. CCDS77 GWNCISALSSCSTVLPLYHKHYILFCTTVFTLLLLSIVILYCRIYSLVRTRSRRLTFRKN 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 VSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCE--SCNVLAVEKYFLLL .: : : .:.:.:::.:.:..:..::.: ..:::: .::. .:..: .:::.: CCDS77 ISKASRSSEKSLALLKTVIIVLSVFIACWAPLFILLLLD-VGCKVKTCDILFRAEYFLVL 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 AEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLL-CCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPEN : :: .: .:. . ::::.: :.. :: : CCDS77 AVLNSGTNPIIYTLTNKEMRRAFIRIMSCCKCPSGDSAGKFKRPIIAGMEFSRSKSDNSS 300 310 320 330 340 350 350 pF1KE9 GHPLMDSTL CCDS77 HPQKDEGDNPETIMSSGNVNSSS 360 370 380 >>CCDS6680.1 S1PR3 gene_id:1903|Hs108|chr9 (378 aa) initn: 611 init1: 440 opt: 666 Z-score: 609.0 bits: 121.3 E(32554): 1.3e-27 Smith-Waterman score: 666; 36.1% identity (68.7% similar) in 313 aa overlap (10-315:15-317) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKD---VVVVALGLTVSVLVLLTNLL :::. :. :: :... . . .....: :.. ...: ::. CCDS66 MATALPPRLQPVRGNETLREHYQYVGK-LAGRLKEASEGSTLTTVLFLVICSFIVLENLM 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 VIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLD :. :: .: .::. .:...:::: ::.::.:: .. .: .: :: ::::.: . CCDS66 VLIAIWKNNKFHNRMYFFIGNLALCDLLAGIAYKVNILMSGKKTFSLSPTVWFLREGSMF 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 TSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCL ..: ::. .:::::.::: ... .. .. : :: .:: :. :. :: :: .:.:: CCDS66 VALGASTCSLLAIAIERHLTMIKMRPYDANKRHRVFLLIGMCWLIAFTLGALPILGWNCL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 CALDRCSRMAPLLSRSYLA--VWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHP : :: . :: :..:.: . ....:: .: .:.::.: :. ...:.: . CCDS66 HNLPDCSTILPLYSKKYIAFCISIFTAILV--TIVILYARIYFLVKSSSRKVANHNNS-- 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 RYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGC--ESCNVLAVEKYFLLLAEANS : ...:..::::....:..::.: ...:.: ..: ..: .: ..:..:: :: CCDS66 ---ERSMALLRTVVIVVSVFIACWSPLFILFLID-VACRVQACPILFKAQWFIVLAVLNS 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 LVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMD .: ..:. . ::::.: ::.: :: CCDS66 AMNPVIYTLASKEMRRAFFRLVC-NCLVRGRGARASPIQPALDPSRSKSSSSNNSSHSPK 300 310 320 330 340 350 >>CCDS12240.1 S1PR5 gene_id:53637|Hs108|chr19 (398 aa) initn: 643 init1: 419 opt: 639 Z-score: 584.8 bits: 116.9 E(32554): 3e-26 Smith-Waterman score: 657; 35.2% identity (65.4% similar) in 358 aa overlap (10-351:12-360) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRP-----KDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLV .:.: . :: .:: .....: :.:: :.: ....: :: : CCDS12 MESGLLRPAPVSEVIVLHYNYTGKLRGARYQPGAGLRADAVVC---LAVCAFIVLENLAV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 IAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDT . ... . ::: :.. :::.:. .::.::.:: .. .:: : .:: :: :.: . . CCDS12 LLVLGRHPRFHAPMFLLLGSLTLSDLLAGAAYAANILLSGPLTLKLSPALWFAREGGVFV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 SLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLC .::::: .:::::.:: .. :::.. . ...: ..: :::::: .:.:: CCDS12 ALTASVLSLLAIALERSLTMARRGPAPVSSRGRTLAMAAAAWGVSLLLGLLPALGWNCLG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 ALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRM------AEHVS :: :: . :: ...:. .:. . .. . :.:.::. :: ..:. : .: CCDS12 RLDACSTVLPLYAKAYVLFCVLAFVGILAAICALYARIYCQVRANARRLPARPGTAGTTS 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 CHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGC--ESCNVLAVEKYFLLLAE . : . .:.:..:. ..: :::.:: : ..:::: ..: ..: :: :: :: CCDS12 TRARRKPRSLALLRTLSVVLLAFVACWGPLFLLLLLD-VACPARTCPVLLQADPFLGLAM 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 ANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCC---ACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPEN ::::.: .:. . ..:... ::.:: .: :. . : . .:.:..... : :: CCDS12 ANSLLNPIIYTLTNRDLRHALLRLVCCGRHSCGRDPSG-SQQSASAAEASGGLRRCLP-- 300 310 320 330 340 350 350 pF1KE9 GHPLMDSTL : .:... CCDS12 --PGLDGSFSGSERSSPQRDGLDTSGSTGSPGAPTAARTLVSEPAAD 360 370 380 390 >>CCDS12105.1 S1PR4 gene_id:8698|Hs108|chr19 (384 aa) initn: 588 init1: 233 opt: 622 Z-score: 569.9 bits: 114.1 E(32554): 2e-25 Smith-Waterman score: 622; 38.4% identity (64.9% similar) in 336 aa overlap (9-335:21-350) 10 20 30 40 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVAL-GLTV--SVL ... : . ::.::. :... :.: . :: ::.: : : CCDS12 MNATGTPVAPESCQQLAAGGHSRLIVLHYNHSGR-LAGRGGPEDGGLGALRGLSVAASCL 10 20 30 40 50 50 60 70 80 90 100 pF1KE9 VLLTNLLVIAAIASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWF :.: ::::.:::.:. : .. .:: : :.. .::..:.::: .. .: :: ::. :: CCDS12 VVLENLLVLAAITSHMRSRRWVYYCLVNITLSDLLTGAAYLANVLLSGARTFRLAPAQWF 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE9 LRQGLLDTSLTASVATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGV-WVAALGLGLL ::.::: :.:.::. .:: : :: ... .: . :. ..:. :. : ::.: CCDS12 LREGLLFTALAASTFSLLFTAGERFATMVRPVAESGATKTSRVYGFIGLCWLLAALLGML 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE9 PAHSWHCLCALDRCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAE : .:.::::.:::: . :: :. :. : :..: ..:. .. . : :: .. CCDS12 PLLGWNCLCAFDRCSSLLPLYSKRYI----LFCLVIFAGVLATIMGLYGAIFRLVQASGQ 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE9 HVSCHPRYRETTLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCE--SCNVLAVEKYFLL .. .: :. . :.:::..:: ::.::: : .:: : .: . . . : ..: CCDS12 KAP-RPAARRKARRLLKTVLMILLAFLVCWGPLFGLLLADVFGSNLWAQEYLRGMDWILA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE9 LAEANSLVNAAVYSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTR---ESVHYTSSAQGGASTRIML :: :: :: .:: :. :. :. .:::.::: . : . . . :..:::: CCDS12 LAVLNSAVNPIIYSFRSREVCRAVLSFLCCGCLRLGMRGPGDCLARAVEAHSGASTTDSS 300 310 320 330 340 350 340 350 pF1KE9 PENGHPLMDSTL CCDS12 LRPRDSFRGSRSLSFRMREPLSSISSVRSI 360 370 380 >>CCDS12229.1 S1PR2 gene_id:9294|Hs108|chr19 (353 aa) initn: 629 init1: 437 opt: 532 Z-score: 490.5 bits: 99.3 E(32554): 5.3e-21 Smith-Waterman score: 648; 37.3% identity (63.3% similar) in 327 aa overlap (17-340:18-327) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS :: . . : .. . :. :. . . ... ::::. :.: CCDS12 MGSLYSEYLNPNKVQEHYNYTKETLETQETTSRQVASAFIVILCCAIVVENLLVLIAVAR 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTASV : .::. .: .::::::.::.::::.. . .: : ::. :: :.: .:.::: CCDS12 NSKFHSAMYLFLGNLAASDLLAGVAFVANTLLSGSVTLRLTPVQWFAREGSAFITLSASV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 ATLLAIAVERHRSVMAVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDRCS .:::::.::: .. :.:.. :...:: . :. .: :: :: .:.:: :. :: CCDS12 FSLLAIAIERHVAIAKVKLYGSDKSCRMLLLIGASWLISLVLGGLPILGWNCLGHLEACS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 RMAPLLSRSY-LAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHPRYRETTLS . :: .. : : : .. :. ..: .::.:.::. :: :: :. ::. CCDS12 TVLPLYAKHYVLCVVTIFSI-ILLAIVALYVRIYCVVRSSHADMAA-----PQ----TLA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGC--ESCNVLAVEKYFLLLAEANSLVNAAVYS :.:::.:.::.:.::: :. .:::: .: .:: .: .::. .. :::.: ..:. CCDS12 LLKTVTIVLGVFIVCWLPAFSILLLD-YACPVHSCPILYKAHYFFAVSTLNSLLNPVIYT 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 CRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL :. ..:: : : : : .: . .::. . .:: CCDS12 WRSRDLRREVLRPLQCW------RPGVGVQGRRRGGTPGHHLLPLRSSSSLERGMHMPTS 290 300 310 320 330 340 CCDS12 PTFLEGNTVV 350 >>CCDS303.1 GPR3 gene_id:2827|Hs108|chr1 (330 aa) initn: 380 init1: 175 opt: 478 Z-score: 442.9 bits: 90.4 E(32554): 2.4e-18 Smith-Waterman score: 478; 34.1% identity (64.1% similar) in 290 aa overlap (30-314:40-315) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPK--DVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAI :: :::. : :: : ::.: : CCDS30 AWLSAGSGNVNVSSVGPAEGPTGPAAPLPSPKAWDVVLCISGTLVSC----ENALVVAII 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 ASNRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAYLFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTA ... :. :.. :.:.::.:::.:: : :..: . : : .. :.: ..:: CCDS30 VGTPAFRAPMFLLVGSLAVADLLAG---LGLVLHFAAVFCIGSAEMSLVLVGVLAMAFTA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 SVATLLAIAVERHRSVM-AVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALD :...::::.:.:. :.. :. .:. :. .... :: .::::::::. .:.:: .: CCDS30 SIGSLLAITVDRYLSLYNALTYYSETTVTRTYVMLALVWGGALGLGLLPVLAWNCLDGLT 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 RCSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSCHP-RYRET :. . :: :...:.: :.. ..:: .:. .:..: : :..:..: . : . . CCDS30 TCGVVYPL-SKNHLVVLAIAFFMVFGIMLQLYAQICRIVCRHAQQIALQRHLLPASHYVA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 TLSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLL-AEANSLVNAAV : . . :....::::..:: : : :: . . . :. :: : ::..: . CCDS30 TRKGIATLAVVLGAFAACWLPFTVYCLLG-----DAHSPPLYTYLTLLPATYNSMINPII 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 YSCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL :. :. ...... . :: : CCDS30 YAFRNQDVQKVLWAV-CCCCSSSKIPFRSRSPSDV 300 310 320 330 >>CCDS5079.1 GPR6 gene_id:2830|Hs108|chr6 (362 aa) initn: 286 init1: 124 opt: 457 Z-score: 423.8 bits: 87.0 E(32554): 2.7e-17 Smith-Waterman score: 457; 34.0% identity (64.9% similar) in 291 aa overlap (30-316:74-349) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MVIMGQCYYNETIGFFYNNSGKELSSHWRPKDVVVVALGLTVSVLVLLTNLLVIAAIAS : ::.. . : ... : ::.: ::: CCDS50 LGAGGGANGSLELSSQLSAGPPGLLLPAVNPWDVLLCVSGTVIAG----ENALVVALIAS 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 NRRFHQPIYYLLGNLAAADLFAGVAY-LFLMFHTGPRTARLSLEGWFLRQGLLDTSLTAS . .. :.. :.:.::.:::.:: . : ..:. . .:: : :.: .:..:: CCDS50 TPALRTPMFVLVGSLATADLLAGCGLILHFVFQYLVPSETVSL----LTVGFLVASFAAS 100 110 120 130 140 150 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 VATLLAIAVERHRSVM-AVQLHSRLPRGRVVMLIVGVWVAALGLGLLPAHSWHCLCALDR :..::::.:.:. :.. :. .:: : .:....:...:::::::. .:.:: CCDS50 VSSLLAITVDRYLSLYNALTYYSRRTLLGVHLLLAATWTVSLGLGLLPVLGWNCLAERAA 160 170 180 190 200 210 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 CSRMAPLLSRSYLAVWALSSLLVFLLMVAVYTRIFFYVRRRVQRMAEHVSC-HPRYRETT :: . :: .::..:. . . ..:: .:. .:.:: : :.....: . : : . .: CCDS50 CSVVRPL-ARSHVALLSAAFFMVFGIMLHLYVRICQVVWRHAHQIALQQHCLAPPHLAAT 220 230 240 250 260 270 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LSLVKTVVIILGAFVVCWTPGQVVLLLDGLGCESCNVLAVEKYFLLL-AEANSLVNAAVY . : :....::.: . : : . .. : . :: : :: : ::..: .: CCDS50 RKGVGTLAVVLGTFGASWLPFAIYCVVG-----SHEDPAVYTYATLLPATYNSMINPIIY 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 SCRDAEMRRTFRRLLCCACLRQSTRESVHYTSSAQGGASTRIMLPENGHPLMDSTL . :. :..:.. :: :.:.. CCDS50 AFRNQEIQRALW-LLLCGCFQSKVPFRSRSPSEV 330 340 350 360 351 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 13:23:20 2016 done: Sun Nov 6 13:23:21 2016 Total Scan time: 2.440 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]