Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1735
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1735, 242 aa
1>>>pF1KE1735 242 - 242 aa - 242 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8112+/-0.000858; mu= 12.0524+/- 0.051
mean_var=72.1032+/-14.442, 0's: 0 Z-trim(106.7): 40 B-trim: 112 in 1/49
Lambda= 0.151042
statistics sampled from 9084 (9122) to 9084 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.28), width: 16
Scan time: 2.240
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19 ( 242) 1580 353.2 8.9e-98
CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4 ( 277) 356 86.5 2e-17
CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 278) 345 84.1 1e-16
CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 303) 345 84.1 1.1e-16
CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 336) 345 84.2 1.2e-16
CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 ( 388) 345 84.2 1.4e-16
CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 479) 320 78.8 7.3e-15
CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 522) 320 78.8 7.8e-15
CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 464) 315 77.7 1.5e-14
CCDS2342.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 479) 315 77.7 1.5e-14
CCDS42799.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 496) 315 77.7 1.6e-14
CCDS42798.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 ( 538) 315 77.7 1.7e-14
CCDS56159.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 455) 291 72.5 5.6e-13
CCDS56160.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 478) 288 71.8 9.1e-13
CCDS2338.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 ( 521) 288 71.8 9.8e-13
CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 278 69.6 3.9e-12
CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 266 66.9 1.7e-11
CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 266 67.0 2.1e-11
CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 266 67.0 2.2e-11
>>CCDS12323.1 CASP14 gene_id:23581|Hs108|chr19 (242 aa)
initn: 1580 init1: 1580 opt: 1580 Z-score: 1868.9 bits: 353.2 E(32554): 8.9e-98
Smith-Waterman score: 1580; 100.0% identity (100.0% similar) in 242 aa overlap (1-242:1-242)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTAEQ
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CCDS12 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTAEQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 FQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEGYIAYRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEGYIAYRH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DQKGSCFIQTLVDVFTKRKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEGKARKTNPEIQSTLRKRLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DQKGSCFIQTLVDVFTKRKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEGKARKTNPEIQSTLRKRLY
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LQ
::
CCDS12 LQ
>>CCDS3836.1 CASP3 gene_id:836|Hs108|chr4 (277 aa)
initn: 224 init1: 104 opt: 356 Z-score: 426.5 bits: 86.5 E(32554): 2e-17
Smith-Waterman score: 356; 34.5% identity (64.6% similar) in 223 aa overlap (28-241:63-275)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPT
.: :.. : :.. ::.:..: : : :
CCDS38 LDNSYKMDYPEMGLCIIINNKNFHKSTGMTSRSGTDVDAANLRETFRNLKYEVRNKNDLT
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 AEQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDG--EMVKLENLFEALNNK
:.. : .. .. :... : ::..::.::.. : .: .. :. :.:. .
CCDS38 REEIVELMRDVSKEDHSKRSSFVC---VLLSHGEEGIIFGTNGPVDLKKITNFFR---GD
100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NCQALRAKPKVYIIQACRGEQRDPG-ETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEG
:..: .:::..::::::: . : : :: .: . :. . ::. .: :..:::. :
CCDS38 RCRSLTGKPKLFIIQACRGTELDCGIETDSGVDDDMAC----HKIPVEADFLYAYSTAPG
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220
pF1KE1 YIAYRHDQKGSCFIQTLVDVFTKR--KGHILELLTEVTRRMA-EAELVQEG---KARKTN
: ..:... :: :::.: .. . : .....::.:.:..: : : . .:.:
CCDS38 YYSWRNSKDGSWFIQSLCAMLKQYADKLEFMHILTRVNRKVATEFESFSFDATFHAKKQI
210 220 230 240 250 260
230 240
pF1KE1 PEIQSTLRKRLYLQ
: : : : :.::.
CCDS38 PCIVSMLTKELYFYH
270
>>CCDS58096.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (278 aa)
initn: 210 init1: 163 opt: 345 Z-score: 413.5 bits: 84.1 E(32554): 1e-16
Smith-Waterman score: 345; 30.6% identity (61.6% similar) in 219 aa overlap (29-241:62-276)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTA
:.:...: .:: . ::.: :. . : .
CCDS58 TYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNGTDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSC
40 50 60 70 80 90
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQ
..:. :.: : . . ..: .:..::.:. . :.:: .. ...: . . :.
CCDS58 AKMQDLLKK---ASEEDHTNAACFACILLSHGEENVIYGKDG-VTPIKDLTAHFRGDRCK
100 110 120 130 140
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEGYIAY
.: :::...:::::: . : : . . : . . ::. .: : .:::: :: ..
CCDS58 TLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANPRYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSW
150 160 170 180 190 200
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RHDQKGSCFIQTLVDVFTK--RKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEG----KARKTNPEIQ
: .:: :.:.: ... . . .:...::.:. :.:. : . .: : .
CCDS58 RSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVV
210 220 230 240 250 260
240
pF1KE1 STLRKRLYLQ
: : :.::.
CCDS58 SMLTKELYFSQ
270
>>CCDS7581.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (303 aa)
initn: 210 init1: 163 opt: 345 Z-score: 412.9 bits: 84.1 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 345; 30.6% identity (61.6% similar) in 219 aa overlap (29-241:87-301)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTA
:.:...: .:: . ::.: :. . : .
CCDS75 TYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNGTDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSC
60 70 80 90 100 110
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQ
..:. :.: : . . ..: .:..::.:. . :.:: .. ...: . . :.
CCDS75 AKMQDLLKK---ASEEDHTNAACFACILLSHGEENVIYGKDG-VTPIKDLTAHFRGDRCK
120 130 140 150 160 170
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEGYIAY
.: :::...:::::: . : : . . : . . ::. .: : .:::: :: ..
CCDS75 TLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANPRYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSW
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RHDQKGSCFIQTLVDVFTK--RKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEG----KARKTNPEIQ
: .:: :.:.: ... . . .:...::.:. :.:. : . .: : .
CCDS75 RSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVV
240 250 260 270 280 290
240
pF1KE1 STLRKRLYLQ
: : :.::.
CCDS75 SMLTKELYFSQ
300
>>CCDS7580.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (336 aa)
initn: 210 init1: 163 opt: 345 Z-score: 412.2 bits: 84.2 E(32554): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 345; 30.6% identity (61.6% similar) in 219 aa overlap (29-241:120-334)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTA
:.:...: .:: . ::.: :. . : .
CCDS75 TYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNGTDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSC
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQ
..:. :.: : . . ..: .:..::.:. . :.:: .. ...: . . :.
CCDS75 AKMQDLLKK---ASEEDHTNAACFACILLSHGEENVIYGKDG-VTPIKDLTAHFRGDRCK
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEGYIAY
.: :::...:::::: . : : . . : . . ::. .: : .:::: :: ..
CCDS75 TLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANPRYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSW
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RHDQKGSCFIQTLVDVFTK--RKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEG----KARKTNPEIQ
: .:: :.:.: ... . . .:...::.:. :.:. : . .: : .
CCDS75 RSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVV
270 280 290 300 310 320
240
pF1KE1 STLRKRLYLQ
: : :.::.
CCDS75 SMLTKELYFSQ
330
>>CCDS73200.1 CASP7 gene_id:840|Hs108|chr10 (388 aa)
initn: 210 init1: 163 opt: 345 Z-score: 411.2 bits: 84.2 E(32554): 1.4e-16
Smith-Waterman score: 345; 30.6% identity (61.6% similar) in 219 aa overlap (29-241:172-386)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTA
:.:...: .:: . ::.: :. . : .
CCDS73 TYQYNMNFEKLGKCIIINNKNFDKVTGMGVRNGTDKDAEALFKCFRSLGFDVIVYNDCSC
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 EQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQ
..:. :.: : . . ..: .:..::.:. . :.:: .. ...: . . :.
CCDS73 AKMQDLLKK---ASEEDHTNAACFACILLSHGEENVIYGKDG-VTPIKDLTAHFRGDRCK
210 220 230 240 250
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSPQTIPTYTDALHVYSTVEGYIAY
.: :::...:::::: . : : . . : . . ::. .: : .:::: :: ..
CCDS73 TLLEKPKLFFIQACRGTELDDGIQADSGPINDTDANPRYKIPVEADFLFAYSTVPGYYSW
260 270 280 290 300 310
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RHDQKGSCFIQTLVDVFTK--RKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEG----KARKTNPEIQ
: .:: :.:.: ... . . .:...::.:. :.:. : . .: : .
CCDS73 RSPGRGSWFVQALCSILEEHGKDLEIMQILTRVNDRVARHFESQSDDPHFHEKKQIPCVV
320 330 340 350 360 370
240
pF1KE1 STLRKRLYLQ
: : :.::.
CCDS73 SMLTKELYFSQ
380
>>CCDS2339.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (479 aa)
initn: 220 init1: 134 opt: 320 Z-score: 380.3 bits: 78.8 E(32554): 7.3e-15
Smith-Waterman score: 320; 29.1% identity (62.7% similar) in 220 aa overlap (27-239:255-468)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDP
: :.:...: . : :.:. : : .. .
CCDS23 EALPRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNV
230 240 250 260 270 280
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TAEQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKN
: ... :.: :. .. : .: ...::: : . . : .. ..... .. .
CCDS23 TKVEMEMVLQK-QKCNPAHADG-DCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQ
290 300 310 320 330 340
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 CQALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSP----QTIPTYTDALHVYSTV
: : :::...::::.::. .:. .. .: .. ...: ..::. .: : .::
CCDS23 CPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEAD--ALNPEQAPTSLQDSIPAEADFLLGLATV
350 360 370 380 390 400
180 190 200 210 220
pF1KE1 EGYIAYRHDQKGSCFIQTLVDVFTK---RKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEGKARKTNP
::...:: ..:: .::.: . . : :. :: .:: :. ... :.. ..: :
CCDS23 PGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVSRR--VDKQGTKKQMP
410 420 430 440 450
230 240
pF1KE1 EIQSTLRKRLYLQ
. ::::.:
CCDS23 QPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
460 470
>>CCDS2340.1 CASP10 gene_id:843|Hs108|chr2 (522 aa)
initn: 220 init1: 134 opt: 320 Z-score: 379.8 bits: 78.8 E(32554): 7.8e-15
Smith-Waterman score: 320; 29.1% identity (62.7% similar) in 220 aa overlap (27-239:298-511)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSNPRSLEEEKYDMSGARLALILCVTKAREGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDP
: :.:...: . : :.:. : : .. .
CCDS23 TSTKRAAVYRMNRNHRGLCVIVNNHSFTSLKDRQGTHKDAEILSHVFQWLGFTVHIHNNV
270 280 290 300 310 320
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TAEQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMAHGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKN
: ... :.: :. .. : .: ...::: : . . : .. ..... .. .
CCDS23 TKVEMEMVLQK-QKCNPAHADG-DCFVFCILTHGRFGAVYSSDEALIPIREIMSHFTALQ
330 340 350 360 370 380
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 CQALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGDEIVMVIKDSP----QTIPTYTDALHVYSTV
: : :::...::::.::. .:. .. .: .. ...: ..::. .: : .::
CCDS23 CPRLAEKPKLFFIQACQGEEIQPSVSIEAD--ALNPEQAPTSLQDSIPAEADFLLGLATV
390 400 410 420 430 440
180 190 200 210 220
pF1KE1 EGYIAYRHDQKGSCFIQTLVDVFTK---RKGHILELLTEVTRRMAEAELVQEGKARKTNP
::...:: ..:: .::.: . . : :. :: .:: :. ... :.. ..: :
CCDS23 PGYVSFRHVEEGSWYIQSLCNHLKKLVPRHEDILSILTAVNDDVSRR--VDKQGTKKQMP
450 460 470 480 490 500
230 240
pF1KE1 EIQSTLRKRLYLQ
. ::::.:
CCDS23 QPAFTLRKKLVFPVPLDALSL
510 520
>>CCDS2343.1 CASP8 gene_id:841|Hs108|chr2 (464 aa)
initn: 274 init1: 140 opt: 315 Z-score: 374.7 bits: 77.7 E(32554): 1.5e-14
Smith-Waterman score: 329; 32.0% identity (61.6% similar) in 250 aa overlap (2-239:215-459)
10 20
pF1KE1 MSNPRS--LEEEKYDMSGARLALI-LCVTKA
:.::. : ...... :: . : .
CCDS23 EELCGVMTISDSPREQDSESQTLDKVYQMKSKPRGYCLIINNHNFAKAREKVPKLHSIRD
190 200 210 220 230 240
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 REGSEEDLDALEHMFRQLRFESTMKRDPTAEQFQEELEKFQQAIDSREDPVSCAFVVLMA
:.:.. : :: :..:.:: . : :.::. : :. .: : : : . ...
CCDS23 RNGTHLDAGALTTTFEELHFEIKPHDDCTVEQIYEILKIYQLMDHSNMD---CFICCILS
250 260 270 280 290 300
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 HGREGFLKGEDGEMVKLENLFEALNNKNCQALRAKPKVYIIQACRGEQRDPGETVGGD--
:: .:.. : ::. . . .: ... .: .: .::::..::::.:.. . : : :
CCDS23 HGDKGIIYGTDGQEAPIYELTSQFTGLKCPSLAGKPKVFFIQACQGDNYQKGIPVETDSE
310 320 330 340 350 360
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 EIVMVIKD--SPQT--IPTYTDALHVYSTVEGYIAYRHDQKGSCFIQTLVDVFTKR--KG
: .. : :::: :: .: : ..::.. ..::. .:. .::.: . . .: .:
CCDS23 EQPYLEMDLSSPQTRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRERCPRG
370 380 390 400 410 420
210 220 230 240
pF1KE1 H-ILELLTEVTRRMAEAELVQEGKARKTNPEIQSTLRKRLYLQ
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CCDS23 DDILTILTEVNYEVSNKD--DKKNMGKQMPQPTFTLRKKLVFPSD
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10 20
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