Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7056
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7056, 584 aa
  1>>>pF1KB7056 584 - 584 aa - 584 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9008+/-0.000952; mu= 5.3800+/- 0.057
 mean_var=288.9508+/-60.061, 0's: 0 Z-trim(115.6): 928  B-trim: 0 in 0/52
 Lambda= 0.075451
 statistics sampled from 15108 (16139) to 15108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.787), E-opt: 0.2 (0.496), width:  16
 Scan time:  3.290

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19       ( 584) 4022 451.3 1.6e-126
CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18      ( 619)  802 100.8 5.4e-21
CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1         ( 539)  751 95.2 2.3e-19
CCDS58030.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1        ( 573)  751 95.2 2.4e-19


>>CCDS12119.1 ZBTB7A gene_id:51341|Hs108|chr19            (584 aa)
 initn: 4022 init1: 4022 opt: 4022  Z-score: 2385.0  bits: 451.3 E(32554): 1.6e-126
Smith-Waterman score: 4022; 100.0% identity (100.0% similar) in 584 aa overlap (1-584:1-584)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KLFTSGAVVDQQNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGDILSAARLLEIPAVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KLFTSGAVVDQQNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGDILSAARLLEIPAVS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 HVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 ASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPAERPPTGDGDEGDSN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPAERPPTGDGDEGDSN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASLSEAAPEPGDSPGFLSGA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASLSEAAPEPGDSPGFLSGA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 AEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEESRADDKGVMDYYLKYFSGAH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEESRADDKGVMDYYLKYFSGAH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 DGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECNICKVRFT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECNICKVRFT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 RQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCKTFVRSDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCKTFVRSDH
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 LHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATPGAPAQPSSPDARRNGQEKHFKD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATPGAPAQPSSPDARRNGQEKHFKD
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580    
pF1KB7 EDEDEDVASPDGLGRLNVAGAGGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EDEDEDVASPDGLGRLNVAGAGGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA
              550       560       570       580    

>>CCDS32830.1 ZBTB7C gene_id:201501|Hs108|chr18           (619 aa)
 initn: 1322 init1: 790 opt: 802  Z-score: 490.5  bits: 100.8 E(32554): 5.4e-21
Smith-Waterman score: 1249; 41.3% identity (64.3% similar) in 535 aa overlap (1-520:1-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
       ::. .:  ::::::.:::..: .::::: .::::::...:. .:. ::::::::::.:::
CCDS32 MANDIDELIGIPFPNHSSEVLCSLNEQRHDGLLCDVLLVVQEQEYRTHRSVLAACSKYFK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 KLFTSGAVVDQQNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGDILSAARLLEIPAVS
       ::::.:....:  :::::::. :::.:...::::.:::....::  ::.:::.:::  . 
CCDS32 KLFTAGTLASQPYVYEIDFVQPEALAAILEFAYTSTLTITAGNVKHILNAARMLEIQCIV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 HVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQSNPMNSLPPAAAAAA
       .:: ....    ..:.: .  . :  :. :. .    .:  :  ...  ..   :     
CCDS32 NVCLEIMEP---GGDGGEEDDKEDDDDDEDDDDEEDEEEEEEEEEDDDDDTEDFADQENL
                 130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230          
pF1KB7 ASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPAERPPTGDGD-EGDS
        .    .   : .  :   :       : .    .  : .  : :..     : . :.  
CCDS32 PDPQDISCHQSPSKTDHLTEK------AYSDTPRDFPDSFQAGSPGHLGVIRDFSIESLL
       180       190             200       210       220       230 

     240         250       260       270       280       290       
pF1KB7 NPGLWPERD--EDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASLSEAAPEPGDSPGFL
         .:.:. .  .  :. . : :   :       :   :     :.: :   . :     .
CCDS32 RENLYPKANIPDRRPSLSPFAPDFFP-------HLWPGDFGAFAQLPEQPMDSGPLDLVI
             240       250              260       270       280    

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB7 SG----AAEGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEESRADDKGVMDYYL
       ..      : :.   :    .  . ....:. ..   :.  :    :   .: :.   ::
CCDS32 KNRKIKEEEKEELPPPPPPPFP-NDFFKDMFPDL--PGGPLGPIKAE---NDYGA---YL
          290       300        310         320          330        

           360       370       380       390       400       410   
pF1KB7 KYFSGAHDGDVYPAWSQKVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPRHIRTHTGEKPYECN
       ...:..: : ..: :    :.:.. :: :.::::.:::.::::::::.::::::::: :.
CCDS32 NFLSATHLGGLFPPWPLVEERKLKPKASQQCPICHKVIMGAGKLPRHMRTHTGEKPYMCT
         340       350       360       370       380       390     

           420       430       440       450       460       470   
pF1KB7 ICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRVHTGLRPYQCDSCCK
       ::.::::::::::.::::::::.:::: .:.: :.::::::::::.:::.:::::. : :
CCDS32 ICEVRFTRQDKLKIHMRKHTGERPYLCIHCNAKFVHNYDLKNHMRIHTGVRPYQCEFCYK
         400       410       420       430       440       450     

           480       490       500               510       520     
pF1KB7 TFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRV-RG-------GAPDPSPGATATPGAPAQPS
       .:.::::::::.:...:  .  :::::: . :.       :.: :. .: . : :     
CCDS32 SFTRSDHLHRHIKRQSCRMARPRRGRKPAAWRAASLLFGPGGPAPDKAAFVMPPALGEVG
         460       470       480       490       500       510     

         530       540       550       560       570       580     
pF1KB7 SPDARRNGQEKHFKDEDEDEDVASPDGLGRLNVAGAGGGGDSGGGPGAATDGNFTAGLA 
                                                                   
CCDS32 GHLGGAAVCLPGPSPAKHFLAAPKGALSLQELERQFEETQMKLFGRAQLEAERNAGGLLA
         520       530       540       550       560       570     

>>CCDS1081.1 ZBTB7B gene_id:51043|Hs108|chr1              (539 aa)
 initn: 1448 init1: 627 opt: 751  Z-score: 461.2  bits: 95.2 E(32554): 2.3e-19
Smith-Waterman score: 1095; 40.0% identity (59.8% similar) in 540 aa overlap (1-519:1-483)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAGGVDGPIGIPFPDHSSDILSGLNEQRTQGLLCDVVILVEGREFPTHRSVLAACSQYFK
       :..  :  ::::::::::..:: :::::  : :::..: ..: :. :::.::::::.:::
CCDS10 MGSPEDDLIGIPFPDHSSELLSCLNEQRQLGHLCDLTIRTQGLEYRTHRAVLAACSHYFK
               10        20        30        40        50        60

                  70                   80        90       100      
pF1KB7 KLFT---SGAVVDQ-----------QNVYEIDFVSAEALTALMDFAYTATLTVSTANVGD
       ::::   .:::.              .: :.:::. ::: ::..::::::::.:.::.  
CCDS10 KLFTEGGGGAVMGAGGSGTATGGAGAGVCELDFVGPEALGALLEFAYTATLTTSSANMPA
               70        80        90       100       110       120

        110       120       130       140       150       160      
pF1KB7 ILSAARLLEIPAVSHVCADLLDRQILAADAGADAGQLDLVDQIDQRNLLRAKEYLEFFQS
       .:.:::::::: :  .: ..:. . : : .             :. .  ::..::: :  
CCDS10 VLQAARLLEIPCVIAACMEILQGSGLEAPSP------------DEDDCERARQYLEAF--
              130       140       150                   160        

        170       180       190       200       210       220      
pF1KB7 NPMNSLPPAAAAAAASFPWSAFGASDDDLDATKEAVAAAVAAVAAGDCNGLDFYGPGPPA
                :.:.:.. :        .  :.  ..                    : :: 
CCDS10 ---------ATATASGVP--------NGEDSPPQV--------------------PLPPP
                 170               180                             

        230       240       250       260       270       280      
pF1KB7 ERPPTGDGDEGDSNPGLWPERDEDAPTGGLFPPPVAPPAATQNGHYGRGGEEEAASL--S
         ::     . . .:     :     : :     ..: . :  .:     :::.:.   :
CCDS10 PPPPPRPVARRSRKP-----RKAFLQTKGARANHLVPEVPTVPAHPLTYEEEEVAGRVGS
     190       200            210       220       230       240    

          290       300          310       320       330       340 
pF1KB7 EAAPEPGDSPGFLSGAA---EGEDGDGPDVDGLAASTLLQQMMSSVGRAGAAAGDSDEES
        ..  :::: .  .:.:   :: ..  :         :.     .....:.    : :: 
CCDS10 SGGSGPGDSYSPPTGTASPPEGPQSYEPYEGEEEEEELVYPPAYGLAQGGGPPL-SPEEL
          250       260       270       280       290        300   

             350       360        370        380       390         
pF1KB7 RADDKGVMDYYLKYFSGAHDGDVYPAW-SQ-KVEKKIRAKAFQKCPICEKVIQGAGKLPR
        .:. ..    . :.:. :. .. :.  :: :. .: :..  :.::.:.:.:.:::::::
CCDS10 GSDEDAIDPDLMAYLSSLHQDNLAPGLDSQDKLVRKRRSQMPQECPVCHKIIHGAGKLPR
           310       320       330       340       350       360   

     400       410       420       430       440       450         
pF1KB7 HIRTHTGEKPYECNICKVRFTRQDKLKVHMRKHTGEKPYLCQQCGAAFAHNYDLKNHMRV
       :.::::::::. :..: :::::.::::.::::::::.:: : .: : : :.:::::::..
CCDS10 HMRTHTGEKPFACEVCGVRFTRNDKLKIHMRKHTGERPYSCPHCPARFLHSYDLKNHMHL
           370       380       390       400       410       420   

     460       470       480       490       500       510         
pF1KB7 HTGLRPYQCDSCCKTFVRSDHLHRHLKKDGCNGVPSRRGRKPRVRGGAPDPSPGATATPG
       ::: :::.:  : :.:.. :::.:::: ..:  : .:: ::  .    : :: .:..  :
CCDS10 HTGDRPYECHLCHKAFAKEDHLQRHLKGQNCLEVRTRRRRKDDAPPHYPPPSTAAASPAG
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