FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5684, 575 aa 1>>>pF1KE5684 575 - 575 aa - 575 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9417+/-0.000351; mu= -2.4912+/- 0.022 mean_var=278.8092+/-56.797, 0's: 0 Z-trim(122.1): 47 B-trim: 0 in 0/57 Lambda= 0.076811 statistics sampled from 39578 (39631) to 39578 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16 Scan time: 9.960 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004877 (OMIM: 604262) amyloid beta A4 precursor ( 575) 3901 445.8 1.7e-124 XP_006723013 (OMIM: 604262) PREDICTED: amyloid bet ( 650) 3455 396.5 1.4e-109 XP_006723014 (OMIM: 604262) PREDICTED: amyloid bet ( 408) 1756 208.0 4.8e-53 XP_005252025 (OMIM: 602414) PREDICTED: amyloid bet ( 826) 1196 146.2 3.9e-34 XP_016870159 (OMIM: 602414) PREDICTED: amyloid bet ( 837) 1160 142.2 6.3e-33 NP_001154 (OMIM: 602414) amyloid beta A4 precursor ( 837) 1160 142.2 6.3e-33 XP_011516919 (OMIM: 602414) PREDICTED: amyloid bet ( 837) 1160 142.2 6.3e-33 XP_011519798 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 441) 1131 138.8 3.6e-32 XP_011519797 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 453) 1131 138.8 3.7e-32 XP_016877604 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 737) 1131 139.0 5.3e-32 XP_016877606 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 737) 1131 139.0 5.3e-32 XP_016877603 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 737) 1131 139.0 5.3e-32 XP_016877602 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 737) 1131 139.0 5.3e-32 XP_016877605 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 737) 1131 139.0 5.3e-32 NP_001123886 (OMIM: 602712) amyloid beta A4 precur ( 737) 1131 139.0 5.3e-32 XP_011519795 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 739) 1131 139.0 5.3e-32 XP_016877601 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_011519792 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877597 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877596 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_011519790 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877595 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877591 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_011519791 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877593 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877594 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877600 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_011519793 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877590 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877598 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877599 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 NP_005494 (OMIM: 602712) amyloid beta A4 precursor ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_016877592 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_011519794 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 749) 1131 139.0 5.4e-32 XP_011519796 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid bet ( 702) 768 98.7 6.6e-20 >>NP_004877 (OMIM: 604262) amyloid beta A4 precursor pro (575 aa) initn: 3901 init1: 3901 opt: 3901 Z-score: 2355.9 bits: 445.8 E(85289): 1.7e-124 Smith-Waterman score: 3901; 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XP_005 IGNIVVLMARRRMPRSNSQENVEASHPSQDGKRQYKMICHVFESEDAQLIAQSIGQAFSV 540 550 560 570 580 590 360 370 380 390 400 pF1KE5 AYSQFLRESGIDP---SQVGVHPSPGACHLHNGDLDHFSNSDNCREVHLEKRRGEGLGVA ::..::: .::.: :: .. ..: :: :::.:.::..: .::..:: :::. XP_005 AYQEFLRANGINPEDLSQKEYSDLLNTQDMYNDDLIHFSKSENCKDVFIEKQKGEILGVV 600 610 620 630 640 650 410 420 430 440 450 460 pF1KE5 LVESGWGSLLPTAVIANLLHGGPAERSGALSIGDRLTAINGTSLVGLPLAACQAAVRETK .:::::::.:::..:::..::::::.:: :.:::.. .:::::::::::..::. .. : XP_005 IVESGWGSILPTVIIANMMHGGPAEKSGKLNIGDQIMSINGTSLVGLPLSTCQSIIKGLK 660 670 680 690 700 710 470 480 490 500 510 520 pF1KE5 SQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHRPHAREQLGFCVEDGIICSLLRGGIAERGGIRVGHRIIE .:. : :.::.::::::..:.:: : :::: :..::::::.:::::::::.:::::::: XP_005 NQSRVKLNIVRCPPVTTVLIRRPDLRYQLGFSVQNGIICSLMRGGIAERGGVRVGHRIIE 720 730 740 750 760 770 530 540 550 560 570 pF1KE5 INGQSVVATPHARIIELLTEAYGEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL ::::::::::: .:...:..: ::.:.:::::: :::::.::::::. XP_005 INGQSVVATPHEKIVHILSNAVGEIHMKTMPAAMYRLLTAQEQPVYI 780 790 800 810 820 >>XP_016870159 (OMIM: 602414) PREDICTED: amyloid beta A4 (837 aa) initn: 1486 init1: 958 opt: 1160 Z-score: 712.1 bits: 142.2 E(85289): 6.3e-33 Smith-Waterman score: 1746; 51.8% identity (73.8% similar) in 568 aa overlap (46-575:280-837) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 MDLEGPRDILVPSEDLTPDSQWDPMPGGPGSLSRMELDESS--LQELVQQFEALPGDLVG :.: . ::... . : :..: : : XP_016 EKEAEFAPYPRMDSYEQEEDIDQIVAEVKQSMSSQSLDKAAEDMPEAEQDLERPPTPAGG 250 260 270 280 290 300 80 90 100 110 120 pF1KE5 -P-SPG-GAPCPLHIATGH---GLASQEIADAHGLLSAEAGRDDLLGLLHCE-ECPPSQT : ::: :: . :.: : :.:. . . . : .: .. . . . : XP_016 RPDSPGLQAPAGQQRAVGPAGGGEAGQRYSKEKRDAISLAIKDIKEAIEEVKTRTIRSPY 310 320 330 340 350 360 130 140 150 160 170 pF1KE5 GPEEPLEPAPRLLQ---PPEDPDE----DSDSPEWVEGASAEQEGSRSSSSSPEPWLETV :.:: :: . : : .: :. :.::: :.:. :..:::.: .: XP_016 TPDEPKEPIWVMRQDISPTRDCDDQRPMDGDSPS--PGSSSPL-GAESSSTSLHP----- 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PLVTPEEPPAGAQSPETLASYPAPQEVPGPCDHEDLLDGVIFGARYLGSTQLVSERNPPT : : .. .: ..:::.:. ::::::: :::.::.::.: :::::::.:...: XP_016 --SDPVEASTNKESRKSLASFPTYVEVPGPCDPEDLIDGIIFAANYLGSTQLLSDKTPSK 430 440 450 460 470 240 250 260 270 280 pF1KE5 STRMAQAREAMDRVK-----------APDGETQPMTEVDLFVSTKRIKVLTADSQEAMMD ..:: ::.::..:.: ::.::.:::::::::.::.:::::.::.::.::: XP_016 NVRMMQAQEAVSRIKMAQKLAKSRKKAPEGESQPMTEVDLFISTQRIKVLNADTQETMMD 480 490 500 510 520 530 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 HALHTISYTADIGCVLVLMARRRLARRPA--------PQDHGRRLYKMLCHVFYAEDAQL : :.:::: :::: ..:::::::. : . :.. :.: :::.:::: .::::: XP_016 HPLRTISYIADIGNIVVLMARRRMPRSNSQENVEASHPSQDGKRQYKMICHVFESEDAQL 540 550 560 570 580 590 350 360 370 380 390 pF1KE5 IAQAIGQAFAAAYSQFLRESGIDP---SQVGVHPSPGACHLHNGDLDHFSNSDNCREVHL :::.:::::..::..::: .::.: :: .. ..: :: :::.:.::..: . XP_016 IAQSIGQAFSVAYQEFLRANGINPEDLSQKEYSDLLNTQDMYNDDLIHFSKSENCKDVFI 600 610 620 630 640 650 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 EKRRGEGLGVALVESGWGSLLPTAVIANLLHGGPAERSGALSIGDRLTAINGTSLVGLPL ::..:: :::..:::::::.:::..:::..::::::.:: :.:::.. .::::::::::: XP_016 EKQKGEILGVVIVESGWGSILPTVIIANMMHGGPAEKSGKLNIGDQIMSINGTSLVGLPL 660 670 680 690 700 710 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 AACQAAVRETKSQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHRPHAREQLGFCVEDGIICSLLRGGIAER ..::. .. :.:. : :.::.::::::..:.:: : :::: :..::::::.::::::: XP_016 STCQSIIKGLKNQSRVKLNIVRCPPVTTVLIRRPDLRYQLGFSVQNGIICSLMRGGIAER 720 730 740 750 760 770 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 GGIRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAYGEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL ::.::::::::::::::::::: .:...:..: ::.:.:::::: :::::.::::::. XP_016 GGVRVGHRIIEINGQSVVATPHEKIVHILSNAVGEIHMKTMPAAMYRLLTAQEQPVYI 780 790 800 810 820 830 >>NP_001154 (OMIM: 602414) amyloid beta A4 precursor pro (837 aa) initn: 1486 init1: 958 opt: 1160 Z-score: 712.1 bits: 142.2 E(85289): 6.3e-33 Smith-Waterman score: 1746; 51.8% identity (73.8% similar) in 568 aa overlap (46-575:280-837) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 MDLEGPRDILVPSEDLTPDSQWDPMPGGPGSLSRMELDESS--LQELVQQFEALPGDLVG :.: . ::... . : :..: : : NP_001 EKEAEFAPYPRMDSYEQEEDIDQIVAEVKQSMSSQSLDKAAEDMPEAEQDLERPPTPAGG 250 260 270 280 290 300 80 90 100 110 120 pF1KE5 -P-SPG-GAPCPLHIATGH---GLASQEIADAHGLLSAEAGRDDLLGLLHCE-ECPPSQT : ::: :: . :.: : :.:. . . . : .: .. . . . : NP_001 RPDSPGLQAPAGQQRAVGPAGGGEAGQRYSKEKRDAISLAIKDIKEAIEEVKTRTIRSPY 310 320 330 340 350 360 130 140 150 160 170 pF1KE5 GPEEPLEPAPRLLQ---PPEDPDE----DSDSPEWVEGASAEQEGSRSSSSSPEPWLETV :.:: :: . : : .: :. :.::: :.:. :..:::.: .: NP_001 TPDEPKEPIWVMRQDISPTRDCDDQRPMDGDSPS--PGSSSPL-GAESSSTSLHP----- 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PLVTPEEPPAGAQSPETLASYPAPQEVPGPCDHEDLLDGVIFGARYLGSTQLVSERNPPT : : .. .: ..:::.:. ::::::: :::.::.::.: :::::::.:...: NP_001 --SDPVEASTNKESRKSLASFPTYVEVPGPCDPEDLIDGIIFAANYLGSTQLLSDKTPSK 430 440 450 460 470 240 250 260 270 280 pF1KE5 STRMAQAREAMDRVK-----------APDGETQPMTEVDLFVSTKRIKVLTADSQEAMMD ..:: ::.::..:.: ::.::.:::::::::.::.:::::.::.::.::: NP_001 NVRMMQAQEAVSRIKMAQKLAKSRKKAPEGESQPMTEVDLFISTQRIKVLNADTQETMMD 480 490 500 510 520 530 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 HALHTISYTADIGCVLVLMARRRLARRPA--------PQDHGRRLYKMLCHVFYAEDAQL : :.:::: :::: ..:::::::. : . :.. :.: :::.:::: .::::: NP_001 HPLRTISYIADIGNIVVLMARRRMPRSNSQENVEASHPSQDGKRQYKMICHVFESEDAQL 540 550 560 570 580 590 350 360 370 380 390 pF1KE5 IAQAIGQAFAAAYSQFLRESGIDP---SQVGVHPSPGACHLHNGDLDHFSNSDNCREVHL :::.:::::..::..::: .::.: :: .. ..: :: :::.:.::..: . NP_001 IAQSIGQAFSVAYQEFLRANGINPEDLSQKEYSDLLNTQDMYNDDLIHFSKSENCKDVFI 600 610 620 630 640 650 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 EKRRGEGLGVALVESGWGSLLPTAVIANLLHGGPAERSGALSIGDRLTAINGTSLVGLPL ::..:: :::..:::::::.:::..:::..::::::.:: :.:::.. .::::::::::: NP_001 EKQKGEILGVVIVESGWGSILPTVIIANMMHGGPAEKSGKLNIGDQIMSINGTSLVGLPL 660 670 680 690 700 710 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 AACQAAVRETKSQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHRPHAREQLGFCVEDGIICSLLRGGIAER ..::. .. :.:. : :.::.::::::..:.:: : :::: :..::::::.::::::: NP_001 STCQSIIKGLKNQSRVKLNIVRCPPVTTVLIRRPDLRYQLGFSVQNGIICSLMRGGIAER 720 730 740 750 760 770 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 GGIRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAYGEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL ::.::::::::::::::::::: .:...:..: ::.:.:::::: :::::.::::::. NP_001 GGVRVGHRIIEINGQSVVATPHEKIVHILSNAVGEIHMKTMPAAMYRLLTAQEQPVYI 780 790 800 810 820 830 >>XP_011516919 (OMIM: 602414) PREDICTED: amyloid beta A4 (837 aa) initn: 1486 init1: 958 opt: 1160 Z-score: 712.1 bits: 142.2 E(85289): 6.3e-33 Smith-Waterman score: 1746; 51.8% identity (73.8% similar) in 568 aa overlap (46-575:280-837) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 MDLEGPRDILVPSEDLTPDSQWDPMPGGPGSLSRMELDESS--LQELVQQFEALPGDLVG :.: . ::... . : :..: : : XP_011 EKEAEFAPYPRMDSYEQEEDIDQIVAEVKQSMSSQSLDKAAEDMPEAEQDLERPPTPAGG 250 260 270 280 290 300 80 90 100 110 120 pF1KE5 -P-SPG-GAPCPLHIATGH---GLASQEIADAHGLLSAEAGRDDLLGLLHCE-ECPPSQT : ::: :: . :.: : :.:. . . . : .: .. . . . : XP_011 RPDSPGLQAPAGQQRAVGPAGGGEAGQRYSKEKRDAISLAIKDIKEAIEEVKTRTIRSPY 310 320 330 340 350 360 130 140 150 160 170 pF1KE5 GPEEPLEPAPRLLQ---PPEDPDE----DSDSPEWVEGASAEQEGSRSSSSSPEPWLETV :.:: :: . : : .: :. :.::: :.:. :..:::.: .: XP_011 TPDEPKEPIWVMRQDISPTRDCDDQRPMDGDSPS--PGSSSPL-GAESSSTSLHP----- 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 PLVTPEEPPAGAQSPETLASYPAPQEVPGPCDHEDLLDGVIFGARYLGSTQLVSERNPPT : : .. .: ..:::.:. ::::::: :::.::.::.: :::::::.:...: XP_011 --SDPVEASTNKESRKSLASFPTYVEVPGPCDPEDLIDGIIFAANYLGSTQLLSDKTPSK 430 440 450 460 470 240 250 260 270 280 pF1KE5 STRMAQAREAMDRVK-----------APDGETQPMTEVDLFVSTKRIKVLTADSQEAMMD ..:: ::.::..:.: ::.::.:::::::::.::.:::::.::.::.::: XP_011 NVRMMQAQEAVSRIKMAQKLAKSRKKAPEGESQPMTEVDLFISTQRIKVLNADTQETMMD 480 490 500 510 520 530 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 HALHTISYTADIGCVLVLMARRRLARRPA--------PQDHGRRLYKMLCHVFYAEDAQL : :.:::: :::: ..:::::::. : . :.. :.: :::.:::: .::::: XP_011 HPLRTISYIADIGNIVVLMARRRMPRSNSQENVEASHPSQDGKRQYKMICHVFESEDAQL 540 550 560 570 580 590 350 360 370 380 390 pF1KE5 IAQAIGQAFAAAYSQFLRESGIDP---SQVGVHPSPGACHLHNGDLDHFSNSDNCREVHL :::.:::::..::..::: .::.: :: .. ..: :: :::.:.::..: . XP_011 IAQSIGQAFSVAYQEFLRANGINPEDLSQKEYSDLLNTQDMYNDDLIHFSKSENCKDVFI 600 610 620 630 640 650 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 EKRRGEGLGVALVESGWGSLLPTAVIANLLHGGPAERSGALSIGDRLTAINGTSLVGLPL ::..:: :::..:::::::.:::..:::..::::::.:: :.:::.. .::::::::::: XP_011 EKQKGEILGVVIVESGWGSILPTVIIANMMHGGPAEKSGKLNIGDQIMSINGTSLVGLPL 660 670 680 690 700 710 460 470 480 490 500 510 pF1KE5 AACQAAVRETKSQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHRPHAREQLGFCVEDGIICSLLRGGIAER ..::. .. :.:. : :.::.::::::..:.:: : :::: :..::::::.::::::: XP_011 STCQSIIKGLKNQSRVKLNIVRCPPVTTVLIRRPDLRYQLGFSVQNGIICSLMRGGIAER 720 730 740 750 760 770 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 GGIRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAYGEVHIKTMPAATYRLLTGQEQPVYL ::.::::::::::::::::::: .:...:..: ::.:.:::::: :::::.::::::. XP_011 GGVRVGHRIIEINGQSVVATPHEKIVHILSNAVGEIHMKTMPAAMYRLLTAQEQPVYI 780 790 800 810 820 830 >>XP_011519798 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid beta A4 (441 aa) initn: 1676 init1: 934 opt: 1131 Z-score: 698.6 bits: 138.8 E(85289): 3.6e-32 Smith-Waterman score: 1639; 61.3% identity (83.1% similar) in 403 aa overlap (187-575:40-441) 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 GASAEQEGSRSSSSSPEPWLETVPLVTPEEPPAGAQSPET--LASYPAPQEVPGPCDHED : . . ::: .::.:. :::::. :: XP_011 KHPDYVDDGLSGVCNGLEQPRKQQRSDLNGPVDNNNIPETKKVASFPSFVAVPGPCEPED 10 20 30 40 50 60 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 LLDGVIFGARYLGSTQLVSERNPPTSTRMAQAREAMDRVKAPDGETQPMTEVDLFVSTKR :.::.::.: :::::::.::::: . :: ::.::..::: .:..: .::::::.::.: XP_011 LIDGIIFAANYLGSTQLLSERNPSKNIRMMQAQEAVSRVKNSEGDAQTLTEVDLFISTQR 70 80 90 100 110 120 280 290 300 310 320 pF1KE5 IKVLTADSQEAMMDHALHTISYTADIGCVLVLMARRRLARRPAPQD---------HGRRL ::::.::.::.::::::.:::: :::: ..:::::::. : : :: .:.. XP_011 IKVLNADTQETMMDHALRTISYIADIGNIVVLMARRRMPRS-ASQDCIETTPGAQEGKKQ 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KE5 YKMLCHVFYAEDAQLIAQAIGQAFAAAYSQFLRESGIDP---SQVGVHPSPGACHLHNGD :::.:::: .::::::::.:::::..::..::: .::.: :: .. ...: : XP_011 YKMICHVFESEDAQLIAQSIGQAFSVAYQEFLRANGINPEDLSQKEYSDIINTQEMYNDD 190 200 210 220 230 240 390 400 410 420 430 440 pF1KE5 LDHFSNSDNCREVHLEKRRGEGLGVALVESGWGSLLPTAVIANLLHGGPAERSGALSIGD : :::::.::.:..:::..:: :::..:::::::.:::...::...:::: ::: ::::: XP_011 LIHFSNSENCKELQLEKHKGEILGVVVVESGWGSILPTVILANMMNGGPAARSGKLSIGD 250 260 270 280 290 300 450 460 470 480 490 500 pF1KE5 RLTAINGTSLVGLPLAACQAAVRETKSQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHRPHAREQLGFCVE .. .::::::::::::.::. .. :.::.: :.:: ::::::..:.:: . :::: :. XP_011 QIMSINGTSLVGLPLATCQGIIKGLKNQTQVKLNIVSCPPVTTVLIKRPDLKYQLGFSVQ 310 320 330 340 350 360 510 520 530 540 550 560 pF1KE5 DGIICSLLRGGIAERGGIRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAYGEVHIKTMPAAT .::::::.:::::::::.::::::::::::::::: : .:.. :... ::.:.:::::: XP_011 NGIICSLMRGGIAERGGVRVGHRIIEINGQSVVATAHEKIVQALSNSVGEIHMKTMPAAM 370 380 390 400 410 420 570 pF1KE5 YRLLTGQEQPVYL .::::::: :.:. XP_011 FRLLTGQETPLYI 430 440 >>XP_011519797 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid beta A4 (453 aa) initn: 1644 init1: 934 opt: 1131 Z-score: 698.4 bits: 138.8 E(85289): 3.7e-32 Smith-Waterman score: 1605; 59.5% identity (80.7% similar) in 415 aa overlap (187-575:40-453) 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 GASAEQEGSRSSSSSPEPWLETVPLVTPEEPPAGAQSPET--LASYPAPQEVPGPCDHED : . . ::: .::.:. :::::. :: XP_011 KHPDYVDDGLSGVCNGLEQPRKQQRSDLNGPVDNNNIPETKKVASFPSFVAVPGPCEPED 10 20 30 40 50 60 220 230 240 250 260 pF1KE5 LLDGVIFGARYLGSTQLVSERNPPTSTRMAQAREAMDRVK------------APDGETQP :.::.::.: :::::::.::::: . :: ::.::..::: .:..: XP_011 LIDGIIFAANYLGSTQLLSERNPSKNIRMMQAQEAVSRVKRMQKAAKIKKKANSEGDAQT 70 80 90 100 110 120 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 MTEVDLFVSTKRIKVLTADSQEAMMDHALHTISYTADIGCVLVLMARRRLARRPAPQD-- .::::::.::.:::::.::.::.::::::.:::: :::: ..:::::::. : : :: XP_011 LTEVDLFISTQRIKVLNADTQETMMDHALRTISYIADIGNIVVLMARRRMPRS-ASQDCI 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 pF1KE5 -------HGRRLYKMLCHVFYAEDAQLIAQAIGQAFAAAYSQFLRESGIDP---SQVGVH .:.. :::.:::: .::::::::.:::::..::..::: .::.: :: XP_011 ETTPGAQEGKKQYKMICHVFESEDAQLIAQSIGQAFSVAYQEFLRANGINPEDLSQKEYS 190 200 210 220 230 240 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 PSPGACHLHNGDLDHFSNSDNCREVHLEKRRGEGLGVALVESGWGSLLPTAVIANLLHGG .. ...: :: :::::.::.:..:::..:: :::..:::::::.:::...::...:: XP_011 DIINTQEMYNDDLIHFSNSENCKELQLEKHKGEILGVVVVESGWGSILPTVILANMMNGG 250 260 270 280 290 300 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 PAERSGALSIGDRLTAINGTSLVGLPLAACQAAVRETKSQTSVTLSIVHCPPVTTAIIHR :: ::: :::::.. .::::::::::::.::. .. :.::.: :.:: ::::::..:.: XP_011 PAARSGKLSIGDQIMSINGTSLVGLPLATCQGIIKGLKNQTQVKLNIVSCPPVTTVLIKR 310 320 330 340 350 360 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 PHAREQLGFCVEDGIICSLLRGGIAERGGIRVGHRIIEINGQSVVATPHARIIELLTEAY : . :::: :..::::::.:::::::::.::::::::::::::::: : .:.. :... 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XP_011 GEIHMKTMPAAMFRLLTGQETPLYI 430 440 450 >>XP_016877604 (OMIM: 602712) PREDICTED: amyloid beta A4 (737 aa) initn: 1668 init1: 934 opt: 1131 Z-score: 695.5 bits: 139.0 E(85289): 5.3e-32 Smith-Waterman score: 1666; 47.7% identity (69.4% similar) in 614 aa overlap (5-575:142-737) 10 20 30 pF1KE5 MDFPTISRSPSGPPAMDLEGPRDILVPSEDLTPD : : .: : . . :: .: :: XP_016 EGMDCNGEEYLAHSAHPVDTDECQEAVEEWTDSAGPH-PHGHEAEGSQDY--------PD 120 130 140 150 160 40 50 60 70 80 pF1KE5 SQWDPMPGG-PGSLSRMELDES----SLQELVQQFEALPGDLVGPSPGGAPCPLHIATGH .: :.: :. : . .:. . .: :.. : . : . :: : .. : XP_016 GQL-PIPEDEPSVLEAHDQEEDGHYCASKEGYQDY--YPEEANGNT--GAS-PYRLRRGD 170 180 190 200 210 90 100 110 120 130 140 pF1KE5 G-LASQEIADAHGLLSAEAGRDDLLGLLHCEECPPS---QTGPEEPLEPAPRLLQPPEDP : : .:: : ... .. .. : : . :::. .: : . . .: XP_016 GDLEDQE-EDIDQIVAEIKMSLSMTSITSASEASPEHGPEPGPEDSVEACPPI-KASCSP 220 230 240 250 260 270 150 160 170 180 pF1KE5 DEDSDSPEWV------EGASAEQEGSRSSSSSPEPWL----ETV--PLVTPEE------- .. :. . . . :.: . .. .:: : : : : :.. 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