FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB6540, 391 aa 1>>>pF1KB6540 391 - 391 aa - 391 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2741+/-0.00045; mu= 11.6087+/- 0.028 mean_var=77.6805+/-15.429, 0's: 0 Z-trim(110.4): 131 B-trim: 51 in 1/54 Lambda= 0.145518 statistics sampled from 18595 (18731) to 18595 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.22), width: 16 Scan time: 8.220 The best scores are: opt bits E(85289) NP_036529 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 2 [Hom ( 391) 2531 541.3 1.5e-153 XP_011524331 (OMIM: 604445) PREDICTED: serpin B13 ( 390) 2514 537.7 1.7e-152 NP_001294852 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 1 [ ( 400) 2099 450.6 3e-126 XP_005266764 (OMIM: 604445) PREDICTED: serpin B13 ( 255) 1548 334.9 1.3e-91 NP_008850 (OMIM: 600517) serpin B3 [Homo sapiens] ( 390) 1521 329.3 9.9e-90 NP_002965 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 1 [Homo ( 390) 1507 326.3 7.6e-89 XP_011524440 (OMIM: 600518) PREDICTED: serpin B4 i ( 390) 1507 326.3 7.6e-89 XP_011524329 (OMIM: 602058) PREDICTED: serpin B10 ( 397) 1146 250.5 5.1e-66 NP_005015 (OMIM: 602058) serpin B10 [Homo sapiens] ( 397) 1146 250.5 5.1e-66 NP_536723 (OMIM: 615682) serpin B11 isoform a [Hom ( 392) 1083 237.3 4.8e-62 XP_011524553 (OMIM: 615682) PREDICTED: serpin B11 ( 392) 1083 237.3 4.8e-62 XP_011512637 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 330) 968 213.1 7.6e-55 NP_109591 (OMIM: 130135) leukocyte elastase inhibi ( 379) 968 213.2 8.6e-55 XP_011512635 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 379) 968 213.2 8.6e-55 XP_011512636 (OMIM: 130135) PREDICTED: leukocyte e ( 379) 968 213.2 8.6e-55 XP_011512978 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 332) 947 208.7 1.6e-53 XP_016866430 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 332) 947 208.7 1.6e-53 NP_001258753 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 947 208.7 1.8e-53 NP_001284629 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 947 208.7 1.8e-53 XP_011512975 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 947 208.7 1.8e-53 XP_011512976 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 376) 947 208.7 1.8e-53 NP_001258754 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 947 208.7 1.8e-53 NP_004559 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isoform ( 376) 947 208.7 1.8e-53 NP_001284628 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 376) 947 208.7 1.8e-53 NP_001182220 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 380) 947 208.8 1.8e-53 XP_016866429 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 380) 947 208.8 1.8e-53 NP_001258751 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 390) 947 208.8 1.9e-53 NP_001258752 (OMIM: 173321,613453) serpin B6 isofo ( 395) 947 208.8 1.9e-53 XP_011512974 (OMIM: 173321,613453) PREDICTED: serp ( 454) 947 208.8 2.2e-53 NP_536722 (OMIM: 615662) serpin B12 isoform 2 [Hom ( 405) 920 203.1 9.9e-52 XP_016881556 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 425) 918 202.7 1.4e-51 XP_011524550 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 425) 918 202.7 1.4e-51 NP_001294857 (OMIM: 615662) serpin B12 isoform 1 [ ( 425) 918 202.7 1.4e-51 XP_011524551 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 425) 918 202.7 1.4e-51 XP_011524548 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 432) 918 202.7 1.4e-51 XP_005266835 (OMIM: 615662) PREDICTED: serpin B12 ( 437) 918 202.7 1.4e-51 XP_016866431 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325) 916 202.2 1.4e-51 XP_016866432 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325) 916 202.2 1.4e-51 XP_011512980 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 325) 916 202.2 1.4e-51 NP_004146 (OMIM: 601799) serpin B9 [Homo sapiens] ( 376) 916 202.2 1.6e-51 XP_005249241 (OMIM: 601799) PREDICTED: serpin B9 i ( 376) 916 202.2 1.6e-51 NP_001035237 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 380) 916 202.2 1.7e-51 NP_001248759 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 380) 916 202.2 1.7e-51 NP_003775 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isoform ( 380) 916 202.2 1.7e-51 XP_011524330 (OMIM: 602058) PREDICTED: serpin B10 ( 268) 888 196.3 7.1e-50 NP_002566 (OMIM: 173390) plasminogen activator inh ( 415) 871 192.8 1.3e-48 NP_001137290 (OMIM: 173390) plasminogen activator ( 415) 871 192.8 1.3e-48 NP_942130 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 859 190.3 6.6e-48 NP_002631 (OMIM: 601697,617115) serpin B8 isoform ( 374) 859 190.3 6.6e-48 NP_001248760 (OMIM: 603357,615598) serpin B7 isofo ( 363) 812 180.4 6e-45 >>NP_036529 (OMIM: 604445) serpin B13 isoform 2 [Homo sa (391 aa) initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531 Z-score: 2877.8 bits: 541.3 E(85289): 1.5e-153 Smith-Waterman score: 2531; 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NP_008 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQIKKVLHFD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 KETKSSRIKAEEKEVIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGEKTYLFLQKY . :... :: .: . . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.:::::::::::.: NP_008 QVTENTTGKAATYHV-DRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYLFLQEY 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 LDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISSSTKLVLVNM :: ..:.:..:.: :::.:: .::::::::::::.::::::.:.:.:.:.:.: ::::: NP_008 LDAIKKFYQTSVESVDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLIPEGNIGSNTTLVLVNA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 VYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAKILGIPYKNN .::::::...:.::.::::::: ::.: ::.::: : :: :. :::.:::.: ::::.. NP_008 IYFKGQWEKKFNKEDTKEEKFWPNKNTYKSIQMMRQYTSFHFASLEDVQAKVLEIPYKGK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB6 DLSMFVLLPNDIDGLEKIIDKISPEKLVEWTSPGHMEERKVNLHLPRFEVEDSYDLEAVL ::::.:::::.::::.:. .:.. :::.:::: .:.: .:.::::::.::.::::. .: NP_008 DLSMIVLLPNEIDGLQKLEEKLTAEKLMEWTSLQNMRETRVDLHLPRFKVEESYDLKDTL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KB6 AAMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGI-GFTVTSAP .::: : :. :: :::... :: . ::..:: :::::.::::::.. :: . . NP_008 RTMGMVDIFN-GDADLSGMTGSRGLVLSGVLHKAFVEVTEEGAEAAAATAVVGFGSSPTS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 GHENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP .:. :::::::::::.:..:::::.:::::: NP_008 TNEEFHCNHPFLFFIRQNKTNSILFYGRFSSP 360 370 380 390 >>NP_002965 (OMIM: 600518) serpin B4 isoform 1 [Homo sap (390 aa) initn: 1164 init1: 1164 opt: 1507 Z-score: 1716.0 bits: 326.3 E(85289): 7.6e-89 Smith-Waterman score: 1507; 58.4% identity (85.5% similar) in 392 aa overlap (1-391:1-390) 10 20 30 40 50 60 pF1KB6 MDSLGAVSTRLGFDLFKELKKTNDGNIFFSPVGILTAIGMVLLGTRGATASQLEEVFHSE :.::. ..:.. ::::....:....:::.::..: .:.::::::.. ::.:. .:.: . NP_002 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHFD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 KETKSSRIKAEEKEVIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGEKTYLFLQKY . :... :: .: . . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.::::::: :::.: NP_002 QVTENTTEKAATYHV-DRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEY 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 LDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISSSTKLVLVNM :: ..:.:..:.: .::.:: .::::::::::::.::::::.:::::.:...: ::::: NP_002 LDAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 VYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAKILGIPYKNN .::::::. .:::::::::::: ::.: :::::: : .::.:..:::.:::.: ::::.. 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XP_011 MNSLSEANTKFMFDLFQQFRKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHFD 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB6 KETKSSRIKAEEKEVIENTEAVHQQFQKFLTEISKLTNDYELNITNRLFGEKTYLFLQKY . :... :: .: . . ::.::::.:::..: :. :::.:.:.::::::: :::.: XP_011 QVTENTTEKAATYHV-DRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEY 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB6 LDYVEKYYHASLEPVDFVNAADESRKKINSWVESKTNEKIKDLFPDGSISSSTKLVLVNM :: ..:.:..:.: .::.:: .::::::::::::.::::::.:::::.:...: ::::: XP_011 LDAIKKFYQTSVESTDFANAPEESRKKINSWVESQTNEKIKNLFPDGTIGNDTTLVLVNA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB6 VYFKGQWDREFKKENTKEEKFWMNKSTSKSVQMMTQSHSFSFTFLEDLQAKILGIPYKNN .::::::. .:::::::::::: ::.: :::::: : .::.:..:::.:::.: ::::.. 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NP_536 VNNKLSMIILLPVGIANLKQIEKQLNSGTFHEWTSSSNMMEREVEVHLPRFKLETKYELN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB6 AVLAAMGMGDAFSEHKADYSGMSSGSGLYAQKFLHSSFVAVTEEGTEAAAATGIGFTVTS ..: ..:. : :.. ::: :::: .::: .: .:.:.. :.::::::::::: ...: : NP_536 SLLKSLGVTDLFNQVKADLSGMSPTKGLYLSKAIHKSYLDVSEEGTEAAAATGDSIAVKS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB6 APGHENVHCNHPFLFFIRHNESNSILFFGRFSSP : . . . ::::::::::...:.::: :...:: NP_536 LPMRAQFKANHPFLFFIRHTHTNTILFCGKLASP 360 370 380 390 391 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 13:39:32 2016 done: Sun Nov 6 13:39:33 2016 Total Scan time: 8.220 Total Display time: 0.050 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]