FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2625, 446 aa 1>>>pF1KE2625 446 - 446 aa - 446 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8049+/-0.000955; mu= 14.7939+/- 0.057 mean_var=72.0835+/-14.178, 0's: 0 Z-trim(104.7): 51 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.151062 statistics sampled from 8027 (8061) to 8027 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 2.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11677.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17 ( 446) 2904 642.4 2.7e-184 CCDS82193.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17 ( 364) 2382 528.6 4e-150 CCDS34593.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 ( 436) 1612 360.8 1.5e-99 CCDS5339.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 ( 454) 1578 353.4 2.7e-97 CCDS47532.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 ( 425) 1566 350.8 1.6e-96 CCDS47531.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 ( 443) 1532 343.4 2.7e-94 CCDS47533.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 ( 384) 1424 319.8 3e-87 CCDS11815.2 WDR45B gene_id:56270|Hs108|chr17 ( 344) 428 102.7 5.9e-22 CCDS35250.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX ( 360) 356 87.1 3.3e-17 CCDS14318.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX ( 361) 356 87.1 3.3e-17 >>CCDS11677.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17 (446 aa) initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904 Z-score: 3422.2 bits: 642.4 E(32554): 2.7e-184 Smith-Waterman score: 2904; 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CCDS34 GSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSPTRLAYTDDLGAVGGACLEDEAS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 ATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS : . ::...: ::.:: CCDS34 A---LRLDEDSEHPPMILRTD 420 430 >>CCDS5339.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 (454 aa) initn: 1544 init1: 1503 opt: 1578 Z-score: 1860.2 bits: 353.4 E(32554): 2.7e-97 Smith-Waterman score: 1578; 58.9% identity (84.9% similar) in 411 aa overlap (28-434:44-451) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEI :::.:.:.:::.::::::..:.:.. .. CCDS53 QLLFANFNQDNTEVKGASRAAGLGRRAVVWSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDT 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCL :: :::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.::: CCDS53 EDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 EESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLK :::.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:. CCDS53 EESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLR 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISS .. : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: : CCDS53 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICS 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDM :.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..: CCDS53 LAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEM 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 MHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTH ..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : CCDS53 FNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQH 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPE : :: ::.: .. . : . :.:.:.... . . :. : .:..: ::. : . . CCDS53 RLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSPTRLAYTDDLGAVGGACLED 380 390 400 410 420 430 420 430 440 pF1KE2 HEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS . : . ::...: ::.:: CCDS53 EASA---LRLDEDSEHPPMILRTD 440 450 >>CCDS47532.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 (425 aa) initn: 1578 init1: 1537 opt: 1566 Z-score: 1846.6 bits: 350.8 E(32554): 1.6e-96 Smith-Waterman score: 1592; 58.8% identity (83.9% similar) in 417 aa overlap (21-434:19-422) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV .:::: ::::.:.:.:::.::::::..:.:.. .. :: CCDS47 MNLASQSGEAGAGQLLFANFNQDNTSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDTEDV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES :::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.:::::: CCDS47 CIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEES 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC .:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:... CCDS47 LYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAAN 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.: CCDS47 MIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAF 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ :::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..: CCDS47 SMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQ 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : : CCDS47 GRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLD 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 pF1KE2 GS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFA :: ::.: .. . : . :.:.:.... .:..: ::. : . .. : CCDS47 GSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDEASA 360 370 380 390 400 420 430 440 pF1KE2 TGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS . ::...: ::.:: CCDS47 ---LRLDEDSEHPPMILRTD 410 420 >>CCDS47531.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 (443 aa) initn: 1544 init1: 1503 opt: 1532 Z-score: 1806.2 bits: 343.4 E(32554): 2.7e-94 Smith-Waterman score: 1558; 58.5% identity (83.9% similar) in 410 aa overlap (28-434:44-440) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEI :::.:.:.:::.::::::..:.:.. .. CCDS47 QLLFANFNQDNTEVKGASRAAGLGRRAVVWSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDT 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCL :: :::::::::::..:: ::...: ::::::::::::::..::...::::::.::: CCDS47 EDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCL 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 EESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLK :::.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:. CCDS47 EESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLR 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISS .. : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: : CCDS47 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICS 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDM :.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..: CCDS47 LAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEM 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 MHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTH ..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : CCDS47 FNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQH 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEH : :: ::.: .. . : . :.:.:.... .:..: ::. : . .. CCDS47 RLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDE 380 390 400 410 420 420 430 440 pF1KE2 EFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS : . ::...: ::.:: CCDS47 ASA---LRLDEDSEHPPMILRTD 430 440 >>CCDS47533.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7 (384 aa) initn: 1436 init1: 1395 opt: 1424 Z-score: 1680.0 bits: 319.8 E(32554): 3e-87 Smith-Waterman score: 1450; 58.6% identity (83.1% similar) in 384 aa overlap (54-434:11-381) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 QDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQM : . :: :::::::::::..:: ::.. CCDS47 MFTHVLPFVISADTEDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKL 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 NVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPT .: ::::::::::::::..::...::::::.::::::.:::::.:::.:.:. . : ::. CCDS47 KVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPA 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 GLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLAS ::::::::..: ::::::: : ::. ..: .:... : ::.. :::..:.:::.:::. 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CCDS11 G-SQAANIYCINFNQDASLICVSSDHGTVHIFAAED--PKRNKQSS----------LASA 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 NYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVA-SSSGHLYMYNLDPQ ..:: :. .:. .. ::. ::...: : ..: ..: : . ..:. CCDS11 SFLPKYFSSKW----SFSKFQVP-SGSPCICAFGT---EPNAVIAICADGSYYKFLFNPK 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 DGGECVLIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGAL :::. CCDS11 --GECIRDVYAQFLEMTDDKL 330 340 >>CCDS35250.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX (360 aa) initn: 240 init1: 152 opt: 356 Z-score: 422.5 bits: 87.1 E(32554): 3.3e-17 Smith-Waterman score: 394; 29.7% identity (62.1% similar) in 269 aa overlap (17-268:9-273) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNE-IPD .. . :::: . . . ..: ..... . ... : ..: . . CCDS35 MTQQPLRGVTSLRFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPL--MEKGHLDHEQVGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 VYIVERLFSSSLVVVV---SHTKPRQMNVYHFKKGTE--------ICNYSYSSNILSIRL . .:: : :.:...: : : ...: . . : . ...... .::.:. CCDS35 MGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKEKLVLEFTFTKPVLSVRM 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 NRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEI ...... :.. ::.... : .: :: ::: : . .. :..:: : . CCDS35 RHDKIVIVLKNRIYVYSFPDNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGH-KCGSL 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 VLYDGNSLK-----TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLY : : : : . :: ::.. .: ...: :. .::::.:::.::.:.. . .:: CCDS35 QLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDIACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLV 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 EFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMF :.::: .:. . :: ::.::::::. ::::: :... .: CCDS35 ELRRGTDP-ATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIG 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 MAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNL CCDS35 QYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAF 290 300 310 320 330 340 >>CCDS14318.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX (361 aa) initn: 240 init1: 152 opt: 356 Z-score: 422.5 bits: 87.1 E(32554): 3.3e-17 Smith-Waterman score: 388; 28.9% identity (62.6% similar) in 270 aa overlap (17-268:9-274) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNE-IPD .. . :::: . . . ..: ..... . ... : ..: . . 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