Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2625
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2625, 446 aa
  1>>>pF1KE2625 446 - 446 aa - 446 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8049+/-0.000955; mu= 14.7939+/- 0.057
 mean_var=72.0835+/-14.178, 0's: 0 Z-trim(104.7): 51  B-trim: 0 in 0/49
 Lambda= 0.151062
 statistics sampled from 8027 (8061) to 8027 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.248), width:  16
 Scan time:  2.650

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11677.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17        ( 446) 2904 642.4 2.7e-184
CCDS82193.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17        ( 364) 2382 528.6  4e-150
CCDS34593.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7         ( 436) 1612 360.8 1.5e-99
CCDS5339.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7          ( 454) 1578 353.4 2.7e-97
CCDS47532.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7         ( 425) 1566 350.8 1.6e-96
CCDS47531.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7         ( 443) 1532 343.4 2.7e-94
CCDS47533.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7         ( 384) 1424 319.8   3e-87
CCDS11815.2 WDR45B gene_id:56270|Hs108|chr17       ( 344)  428 102.7 5.9e-22
CCDS35250.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX         ( 360)  356 87.1 3.3e-17
CCDS14318.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX         ( 361)  356 87.1 3.3e-17


>>CCDS11677.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17             (446 aa)
 initn: 2904 init1: 2904 opt: 2904  Z-score: 3422.2  bits: 642.4 E(32554): 2.7e-184
Smith-Waterman score: 2904; 99.8% identity (99.8% similar) in 446 aa overlap (1-446:1-446)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
       :::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLATGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 GSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGP
              370       380       390       400       410       420

              430       440      
pF1KE2 VCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
       ::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
              430       440      

>>CCDS82193.1 WIPI1 gene_id:55062|Hs108|chr17             (364 aa)
 initn: 2382 init1: 2382 opt: 2382  Z-score: 2808.7  bits: 528.6 E(32554): 4e-150
Smith-Waterman score: 2382; 100.0% identity (100.0% similar) in 364 aa overlap (83-446:1-364)

             60        70        80        90       100       110  
pF1KE2 GSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQR
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82                               MNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQR
                                             10        20        30

            120       130       140       150       160       170  
pF1KE2 LLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYD
               40        50        60        70        80        90

            180       190       200       210       220       230  
pF1KE2 GNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRY
              100       110       120       130       140       150

            240       250       260       270       280       290  
pF1KE2 VTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPT
              160       170       180       190       200       210

            300       310       320       330       340       350  
pF1KE2 QVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECV
              220       230       240       250       260       270

            360       370       380       390       400       410  
pF1KE2 LIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIP
              280       290       300       310       320       330

            420       430       440      
pF1KE2 EHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
              340       350       360    

>>CCDS34593.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7              (436 aa)
 initn: 1578 init1: 1537 opt: 1612  Z-score: 1900.6  bits: 360.8 E(32554): 1.5e-99
Smith-Waterman score: 1612; 59.1% identity (84.9% similar) in 418 aa overlap (21-434:19-433)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
                           .:::: ::::.:.:.:::.::::::..:.:..  ..  ::
CCDS34   MNLASQSGEAGAGQLLFANFNQDNTSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDTEDV
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
        :::::::::::..::   ::...: ::::::::::::::..::...::::::.::::::
CCDS34 CIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEES
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
       .:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..:  .:... 
CCDS34 LYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAAN
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
        : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.:
CCDS34 MIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAF
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
       :::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..:
CCDS34 SMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQ
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
        :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : : 
CCDS34 GRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLD
      300       310       320       330       340       350        

                 370       380        390       400       410      
pF1KE2 GS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEF
       ::  ::.:  .. .   : . :.:.:.... . . :. :  .:..: ::. :  . ..  
CCDS34 GSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSPTRLAYTDDLGAVGGACLEDEAS
      360       370       380       390       400       410        

        420       430       440      
pF1KE2 ATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
       :   . ::...: ::.::            
CCDS34 A---LRLDEDSEHPPMILRTD         
         420       430               

>>CCDS5339.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7               (454 aa)
 initn: 1544 init1: 1503 opt: 1578  Z-score: 1860.2  bits: 353.4 E(32554): 2.7e-97
Smith-Waterman score: 1578; 58.9% identity (84.9% similar) in 411 aa overlap (28-434:44-451)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE2    MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEI
                                     :::.:.:.:::.::::::..:.:..  .. 
CCDS53 QLLFANFNQDNTEVKGASRAAGLGRRAVVWSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDT
            20        30        40        50        60        70   

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCL
        :: :::::::::::..::   ::...: ::::::::::::::..::...::::::.:::
CCDS53 EDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCL
            80        90       100       110       120       130   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 EESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLK
       :::.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..:  .:.
CCDS53 EESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLR
           140       150       160       170       180       190   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISS
       ..  : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: :
CCDS53 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICS
           200       210       220       230       240       250   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 LVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDM
       :.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:
CCDS53 LAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEM
           260       270       280       290       300       310   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 MHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTH
       ..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: :
CCDS53 FNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQH
           320       330       340       350       360       370   

       360          370       380        390       400       410   
pF1KE2 SLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPS-ASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPE
        : ::  ::.:  .. .   : . :.:.:.... . . :. :  .:..: ::. :  . .
CCDS53 RLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGKGTYVPSSPTRLAYTDDLGAVGGACLED
           380       390       400       410       420       430   

           420       430       440      
pF1KE2 HEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
       .  :   . ::...: ::.::            
CCDS53 EASA---LRLDEDSEHPPMILRTD         
              440       450             

>>CCDS47532.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7              (425 aa)
 initn: 1578 init1: 1537 opt: 1566  Z-score: 1846.6  bits: 350.8 E(32554): 1.6e-96
Smith-Waterman score: 1592; 58.8% identity (83.9% similar) in 417 aa overlap (21-434:19-422)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDV
                           .:::: ::::.:.:.:::.::::::..:.:..  ..  ::
CCDS47   MNLASQSGEAGAGQLLFANFNQDNTSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDTEDV
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEES
        :::::::::::..::   ::...: ::::::::::::::..::...::::::.::::::
CCDS47 CIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEES
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 IYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVC
       .:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..:  .:... 
CCDS47 LYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAAN
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 TIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVF
        : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.:
CCDS47 MIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAF
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 SMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQ
       :::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..:
CCDS47 SMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQ
      240       250       260       270       280       290        

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 DRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLL
        :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : : 
CCDS47 GRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLD
      300       310       320       330       340       350        

                 370       380       390       400       410       
pF1KE2 GS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFA
       ::  ::.:  .. .   : . :.:.:....          .:..: ::. :  . ..  :
CCDS47 GSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDEASA
      360       370       380                 390       400        

       420       430       440      
pF1KE2 TGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
          . ::...: ::.::            
CCDS47 ---LRLDEDSEHPPMILRTD         
         410       420              

>>CCDS47531.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7              (443 aa)
 initn: 1544 init1: 1503 opt: 1532  Z-score: 1806.2  bits: 343.4 E(32554): 2.7e-94
Smith-Waterman score: 1558; 58.5% identity (83.9% similar) in 410 aa overlap (28-434:44-440)

                  10        20        30        40        50       
pF1KE2    MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEI
                                     :::.:.:.:::.::::::..:.:..  .. 
CCDS47 QLLFANFNQDNTEVKGASRAAGLGRRAVVWSLAVGSKSGYKFFSLSSVDKLEQIYECTDT
            20        30        40        50        60        70   

        60        70        80        90       100       110       
pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCL
        :: :::::::::::..::   ::...: ::::::::::::::..::...::::::.:::
CCDS47 EDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKLKVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCL
            80        90       100       110       120       130   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KE2 EESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLK
       :::.:::::.:::.:.:. . : ::.::::::::..: ::::::: : ::. ..:  .:.
CCDS47 EESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPAGLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLR
           140       150       160       170       180       190   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KE2 TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISS
       ..  : ::.. :::..:.:::.:::.::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: :
CCDS47 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLATASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICS
           200       210       220       230       240       250   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KE2 LVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDM
       :.::::..:: :::::::::::::: : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:
CCDS47 LAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLETVKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEM
           260       270       280       290       300       310   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KE2 MHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTH
       ..: :::::.:: : :..:::.:.::::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: :
CCDS47 FNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATIQKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQH
           320       330       340       350       360       370   

       360          370       380       390       400       410    
pF1KE2 SLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEH
        : ::  ::.:  .. .   : . :.:.:....          .:..: ::. :  . ..
CCDS47 RLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQTYGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDE
           380       390       400                 410       420   

          420       430       440      
pF1KE2 EFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQKGKTKQS
         :   . ::...: ::.::            
CCDS47 ASA---LRLDEDSEHPPMILRTD         
              430       440            

>>CCDS47533.1 WIPI2 gene_id:26100|Hs108|chr7              (384 aa)
 initn: 1436 init1: 1395 opt: 1424  Z-score: 1680.0  bits: 319.8 E(32554): 3e-87
Smith-Waterman score: 1450; 58.6% identity (83.1% similar) in 384 aa overlap (54-434:11-381)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KE2 QDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNEIPDVYIVERLFSSSLVVVVSHTKPRQM
                                     : .  :: :::::::::::..::   ::..
CCDS47                     MFTHVLPFVISADTEDVCIVERLFSSSLVAIVSLKAPRKL
                                   10        20        30        40

            90       100       110       120       130       140   
pF1KE2 NVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPT
       .: ::::::::::::::..::...::::::.::::::.:::::.:::.:.:. . : ::.
CCDS47 KVCHFKKGTEICNYSYSNTILAVKLNRQRLIVCLEESLYIHNIRDMKVLHTIRETPPNPA
               50        60        70        80        90       100

           150       160       170       180       190       200   
pF1KE2 GLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEIVLYDGNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLAS
       ::::::::..: ::::::: : ::. ..:  .:...  : ::.. :::..:.:::.:::.
CCDS47 GLCALSINNDNCYLAYPGSATIGEVQVFDTINLRAANMIPAHDSPLAALAFDASGTKLAT
              110       120       130       140       150       160

           210       220       230       240       250       260   
pF1KE2 ASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQ
       ::::::::::::.:.::::.:::::.:: :.: ::.::::..:: :::::::::::::: 
CCDS47 ASEKGTVIRVFSIPEGQKLFEFRRGVKRCVSICSLAFSMDGMFLSASSNTETVHIFKLET
              170       180       190       200       210       220

           270       280       290       300       310       320   
pF1KE2 VTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAATNYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTI
       : .. ::::.::.::.::..::.:.:::.::..:..: :::::.:: : :..:::.:.::
CCDS47 VKEKPPEEPTTWTGYFGKVLMASTSYLPSQVTEMFNQGRAFATVRLPFCGHKNICSLATI
              230       240       250       260       270       280

           330       340       350       360          370       380
pF1KE2 QKLPRLLVASSSGHLYMYNLDPQDGGECVLIKTHSLLGS-GTTEE--NKENDLRPSLPQS
       ::.:::::....:.:::::::::.::::.:.: : : ::  ::.:  .. .   : . :.
CCDS47 QKIPRLLVGAADGYLYMYNLDPQEGGECALMKQHRLDGSLETTNEILDSASHDCPLVTQT
              290       300       310       320       330       340

              390       400       410       420       430       440
pF1KE2 YAATVARPSASSASTVPGYSEDGGALRGEVIPEHEFATGPVCLDDENEFPPIILCRGNQK
       :.:....          .:..: ::. :  . ..  :   . ::...: ::.::      
CCDS47 YGAAAGK----------AYTDDLGAVGGACLEDEASA---LRLDEDSEHPPMILRTD   
                        350       360          370       380       

             
pF1KE2 GKTKQS

>>CCDS11815.2 WDR45B gene_id:56270|Hs108|chr17            (344 aa)
 initn: 279 init1: 250 opt: 428  Z-score: 507.6  bits: 102.7 E(32554): 5.9e-22
Smith-Waterman score: 450; 29.9% identity (61.4% similar) in 345 aa overlap (22-352:18-329)

               10        20        30        40           50       
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFS---LSSVEQLDQVHGSNEI
                            ::::   .: : . :.....   :.  :. . ..:.   
CCDS11     MNLLPCNPHGNGLLYAGFNQDHGCFACGMENGFRVYNTDPLKEKEKQEFLEGG---
                   10        20        30        40        50      

        60        70             80        90       100       110  
pF1KE2 PDVYIVERLFSSSLVVVVSHTK-----PRQMNVYHFKKGTEICNYSYSSNILSIRLNRQR
         :  :: ::  . ...:.  :     : .. ..   :   . .  .:... ...: :.:
CCDS11 --VGHVEMLFRCNYLALVGGGKKPKYPPNKVMIWDDLKKKTVIEIEFSTEVKAVKLRRDR
              60        70        80        90       100       110 

            120           130       140       150       160        
pF1KE2 LLVCLEESI----YIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEI
       ..: :.  :    . :: .......:      :: :::.:  : .:: ::.::. : :..
CCDS11 IVVVLDSMIKVFTFTHNPHQLHVFETCY----NPKGLCVLCPNSNNSLLAFPGTHT-GHV
             120       130           140       150       160       

      170        180       190       200       210       220       
pF1KE2 VLYD-GNSLKTVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLYEFRR
        : : ... :    : ::::.:. :..: .:...:.::::::.::.:.. .:. . :.::
CCDS11 QLVDLASTEKPPVDIPAHEGVLSCIALNLQGTRIATASEKGTLIRIFDTSSGHLIQELRR
        170       180       190       200       210       220      

       230       240       250       260       270       280       
pF1KE2 GMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKMFMAAT
       : .. ..:  . :..:....:.::.  :::::  :.   .: .. :          .:..
CCDS11 G-SQAANIYCINFNQDASLICVSSDHGTVHIFAAED--PKRNKQSS----------LASA
         230       240       250       260                   270   

       290       300       310       320       330        340      
pF1KE2 NYLPTQVSDMMHQDRAFATARLNFSGQRNICTLSTIQKLPRLLVA-SSSGHLYMYNLDPQ
       ..::   :.      .:.  ..  ::.  ::...:    :  ..:  ..:  : . ..:.
CCDS11 SFLPKYFSSKW----SFSKFQVP-SGSPCICAFGT---EPNAVIAICADGSYYKFLFNPK
           280           290        300          310       320     

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pF1KE2 DGGECVLIKTHSLLGSGTTEENKENDLRPSLPQSYAATVARPSASSASTVPGYSEDGGAL
         :::.                                                      
CCDS11 --GECIRDVYAQFLEMTDDKL                                       
           330       340                                           

>>CCDS35250.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX              (360 aa)
 initn: 240 init1: 152 opt: 356  Z-score: 422.5  bits: 87.1 E(32554): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 394; 29.7% identity (62.1% similar) in 269 aa overlap (17-268:9-273)

               10        20        30        40        50          
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                       .. . :::: . .  . ..: .....  .  ... : ..: . .
CCDS35         MTQQPLRGVTSLRFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPL--MEKGHLDHEQVGS
                       10        20        30          40        50

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pF1KE2 VYIVERLFSSSLVVVV---SHTKPRQMNVYHFKKGTE--------ICNYSYSSNILSIRL
       . .:: :  :.:...:   :  :  ...:  .  . :        . ...... .::.:.
CCDS35 MGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISVLIWDDAREGKDSKEKLVLEFTFTKPVLSVRM
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pF1KE2 NRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGEI
        ...... :.. ::.... :       .:   :: ::: :  .  .. :..::    : .
CCDS35 RHDKIVIVLKNRIYVYSFPDNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGH-KCGSL
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pF1KE2 VLYDGNSLK-----TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKLY
        : :  : :     .  :: ::.. .: ...:  :. .::::.:::.::.:.. . .:: 
CCDS35 QLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDIACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKLV
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       :.:::    .:.  . :: ::.::::::.  ::::: :...  .:               
CCDS35 ELRRGTDP-ATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMIG
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CCDS35 QYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREAF
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>>CCDS14318.1 WDR45 gene_id:11152|Hs108|chrX              (361 aa)
 initn: 240 init1: 152 opt: 356  Z-score: 422.5  bits: 87.1 E(32554): 3.3e-17
Smith-Waterman score: 388; 28.9% identity (62.6% similar) in 270 aa overlap (17-268:9-274)

               10        20        30        40        50          
pF1KE2 MEAEAADAPPGGVESALSCFSFNQDCTSLAIGTKAGYKLFSLSSVEQLDQVHGSNE-IPD
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CCDS14         MTQQPLRGVTSLRFNQDQSCFCCAMETGVRIYNVEPL--MEKGHLDHEQVGS
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       . .:: :  :.:...:.  ..:.  ..         ..: .     . ...... .::.:
CCDS14 MGLVEMLHRSNLLALVGGGSSPKFSEISAVLIWDDAREGKDSKEKLVLEFTFTKPVLSVR
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pF1KE2 LNRQRLLVCLEESIYIHNIKDMKLLKTLLDIPANPTGLCALSINHSNSYLAYPGSLTSGE
       . ...... :.. ::.... :       .:   :: ::: :  .  .. :..::    : 
CCDS14 MRHDKIVIVLKNRIYVYSFPDNPRKLFEFDTRDNPKGLCDLCPSLEKQLLVFPGH-KCGS
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pF1KE2 IVLYDGNSLK-----TVCTIAAHEGTLAAITFNASGSKLASASEKGTVIRVFSVPDGQKL
       . : :  : :     .  :: ::.. .: ...:  :. .::::.:::.::.:.. . .::
CCDS14 LQLVDLASTKPGTSSAPFTINAHQSDIACVSLNQPGTVVASASQKGTLIRLFDTQSKEKL
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pF1KE2 YEFRRGMKRYVTISSLVFSMDSQFLCASSNTETVHIFKLEQVTNSRPEEPSTWSGYMGKM
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CCDS14 VELRRGTDP-ATLYCINFSHDSSFLCASSDKGTVHIFALKDTRLNRRSALARVGKVGPMI
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CCDS14 GQYVDSQWSLASFTVPAESACICAFGRNTSKNVNSVIAICVDGTFHKYVFTPDGNCNREA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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