FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5785, 763 aa 1>>>pF1KE5785 763 - 763 aa - 763 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5716+/-0.000756; mu= 14.6443+/- 0.046 mean_var=87.5093+/-17.469, 0's: 0 Z-trim(110.4): 13 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.137103 statistics sampled from 11603 (11610) to 11603 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.703), E-opt: 0.2 (0.357), width: 16 Scan time: 3.990 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11444.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 763) 5275 1053.3 0 CCDS74071.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 634) 4335 867.4 0 CCDS11443.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 756) 3430 688.4 1.1e-197 CCDS45690.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 ( 729) 2672 538.5 1.5e-152 CCDS62198.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 ( 220) 1536 313.6 2.2e-85 CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 751) 1344 275.8 1.8e-73 CCDS64797.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 ( 770) 907 189.4 1.9e-47 >>CCDS11444.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 (763 aa) initn: 5275 init1: 5275 opt: 5275 Z-score: 5634.7 bits: 1053.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5275; 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100.0% identity (100.0% similar) in 629 aa overlap (1-629:1-629) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 MNQKTILVLLILAVITIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLF 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 ADLSREELTAVMRFLTQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPP 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 AREALAIVFFGRQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDID 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVW 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 AEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 AEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHP 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 RGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDF ::::::::::::::::::::::::::::: CCDS74 RGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERIWWPG 610 620 630 >>CCDS11443.1 AOC2 gene_id:314|Hs108|chr17 (756 aa) initn: 1817 init1: 1817 opt: 3430 Z-score: 3662.5 bits: 688.4 E(32554): 1.1e-197 Smith-Waterman score: 3430; 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CCDS11 AREALAIVLFGGQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLRAEFTQMW 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL . . . :::.: .: ... : .:... ..::::.:::::::..::.::::.:.:: CCDS11 RHLKEVELPKAPIFLSST--FNYNGSTLAAVHATPRGLRSGDRATWMALYHNISGVGLFL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW : ::::::..:.:::::.::.:.::: :.:: .:.::: .:..: ..:: .: .:. CCDS11 HPVGLELLLDHRALDPAHWTVQQVFYLGHYYADLGQLEREFKSGRLEVVRVPLPPPNGAS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV ::.: ::: ::::: ::: ..::::. :.::::.:.:: :.::: :::::::::::.. CCDS11 SLRSRNSPGPLPPLQFSPQGSQYSVQGNLVVSSLWSFTFGHGVFSGLRIFDVRFQGERIA 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ ::.:.:: ..:::..:: .: :::.:..::.:. . :.::::::: ::.:: :.:. . CCDS11 YEVSVQECVSIYGADSPKTMLTRYLDSSFGLGRNSRGLVRGVDCPYQATMVDIHILVGKG 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH : . . : ::::. :::::::::. : .:..:::: ..:::::.:.. ::::.:: :.. 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CCDS45 AREALAIVLFGGQPQPNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLRAEFTQMW 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 QMIFNRELPQASGLLHHCCFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFL . . . :::.: .: ... : .:... ..::::.:::::::..::.::::.:.:: CCDS45 RHLKEVELPKAPIFLSST--FNYNGSTLAAVHATPRGLRSGDRATWMALYHNISGVGLFL 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 HHVGLELLVNHKALDPARWTIQKVFYQGRYYDSLAQLEAQFEAGLVNVVLIPDNGTGGSW : ::::::..:.:::::.::.:.::: :.:: .:.::: .:..: ..:: .: .:. CCDS45 HPVGLELLLDHRALDPAHWTVQQVFYLGHYYADLGQLEREFKSGRLEVVRVPLPPPNGAS 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 SLKSPVPPGPAPPLQFYPQGPRFSVQGSRVASSLWTFSFGLGAFSGPRIFDVRFQGERLV ::.: ::: ::::: ::: ..::::. :.::::.:.:: :.::: :::::::::::.. CCDS45 SLRSRNSPGPLPPLQFSPQGSQYSVQGNLVVSSLWSFTFGHGVFSGLRIFDVRFQGERIA 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 YEISLQEALAIYGGNSPAAMTTRYVDGGFGMGKYTTPLTRGVDCPYLATYVDWHFLLESQ ::.:.:: ..:::..:: .: :::.:..::.:. . :.::::::: ::.:: :.:. . CCDS45 YEVSVQECVSIYGADSPKTMLTRYLDSSFGLGRNSRGLVRGVDCPYQATMVDIHILVGKG 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 APKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYSHYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVWDTVFH : . . : ::::. :::::::::. : .:..:::: ..:::::.:.. ::::.:: :.. CCDS45 AVQLLPGAVCVFEEAQGLPLRRHHNYLQNHFYGGLASSALVVRSVSSVGNYDYIWDFVLY 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 pF1KE5 PSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGK--YGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENW :.::.: : .:::::..::: :. .::.:.:..:::::::. :::.:::::::.:: CCDS45 PNGALEGRVHATGYINTAFLKGGEEGLLFGNRVGERVLGTVHTHAFHFKLDLDVAGLKNW 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 VWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWG : :::.:: :.:.::.::: ::: :.::..: :. .:: .:: :::::::::..: :: CCDS45 VVAEDVVFKPVAAPWNPEHWLQRPQLTRQVLGKEDLTAFSLGSPLPRYLYLASNQTNAWG 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 HPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLAVTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTV : ::: ::.:::::::: .:::...::: :.::: CCDS45 HQRGY---------------------------QLVVTQRKEEESQSSSIYHQNDIWTPTV 600 610 620 660 670 680 690 700 710 pF1KE5 DFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPNTVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFY :.:::::::. :.::::::::.:::::::::::::::.:: :::.::::::::::::.. CCDS45 TFADFINNETLLGEDLVAWVTASFLHIPHAEDIPNTVTLGNRVGFLLRPYNFFDEDPSIF 630 640 650 660 670 680 720 730 740 750 760 pF1KE5 SADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLPAFSHGGFSHN : :.::. :::: : .::.::::. :::.:::: ::. :: CCDS45 SPGSVYFEKGQDAGLCSINPVACLPDLAACVPDLPPFSYHGF 690 700 710 720 >>CCDS62198.1 AOC3 gene_id:8639|Hs108|chr17 (220 aa) initn: 1536 init1: 1536 opt: 1536 Z-score: 1646.5 bits: 313.6 E(32554): 2.2e-85 Smith-Waterman score: 1536; 100.0% identity (100.0% similar) in 220 aa overlap (544-763:1-220) 520 530 540 550 560 570 pF1KE5 HTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGLENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEE :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 MVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEE 10 20 30 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 QAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 QAAFLVGSATPRYLYLASNHSNKWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWERYQLA 40 50 60 70 80 90 640 650 660 670 680 690 pF1KE5 VTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 VTQRKEEEPSSSSVFNQNDPWAPTVDFSDFINNETIAGKDLVAWVTAGFLHIPHAEDIPN 100 110 120 130 140 150 700 710 720 730 740 750 pF1KE5 TVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS62 TVTVGNGVGFFLRPYNFFDEDPSFYSADSIYFRGDQDAGACEVNPLACLPQAAACAPDLP 160 170 180 190 200 210 760 pF1KE5 AFSHGGFSHN :::::::::: CCDS62 AFSHGGFSHN 220 >>CCDS43679.1 AOC1 gene_id:26|Hs108|chr7 (751 aa) initn: 1438 init1: 631 opt: 1344 Z-score: 1432.6 bits: 275.8 E(32554): 1.8e-73 Smith-Waterman score: 1850; 40.1% identity (66.0% similar) in 736 aa overlap (46-759:21-746) 20 30 40 50 60 70 pF1KE5 TIFALVCVLLVGRGGDGGEPSQLPHCPSVSPSAQPWTHPGQSQLFADLSREELTAVMRFL :: : : : .. .:.::: .:: :: :: CCDS43 MPALGWAVAAILMLQTAMAEPS--PGTLPRKAGVFSDLSNQELKAVHSFL 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE5 TQRLGPGLVDAAQARPSDNCVFSVELQLPPKAAALAHLDRGSPPPAREALAIVFFGRQPQ .. : .. . . : :: .:. :: : .: ::.: :.::: :..::: : . CCDS43 WSKKELRLQPSSTTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEH 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDIDQMIFNRELPQASGLL :::.:..::::: : ::: .. : : . ::. :: . . . . : . .: CCDS43 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 HHC--CFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFLHHVGLELLVNHKA . : . : :. .::::. ::.: .:. . . :.::: .::::::.: . 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CCDS64 WSKKELRLQPSSTTTMAKNTVFLIEMLLPKKYHVLRFLDKGERHPVREARAVIFFGDQEH 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 PNVSELVVGPLPHPSYMRDVTVERHGGPLPYHRRPVLFQEYLDIDQMIFNRELPQASGLL :::.:..::::: : ::: .. : : . ::. :: . . . . : . .: CCDS64 PNVTEFAVGPLPGPCYMRALS-PRPGYQSSWASRPISTAEYALLYHTLQEATKPLHQFFL 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 HHC--CFYKHRGRNLVTMTTAPRGLQSGDRATWFGLYYNISGAGFFLHHVGLELLVNHKA . : . : :. .::::. ::.: .:. . . :.::: .::::::.: . 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CCDS64 IAYEVSVQEAVALYGGHTPAGMQTKYLDVGWGLGSVTHELAPGIDCPETATFLDTFHYYD 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 470 pF1KE5 SQAPKTIRDAFCVFEQNQGLPLRRHHSDLYS---HYFGGLAETVLVVRSMSTLLNYDYVW .. : :.:.::. :.::::: .. .. ....:: :::.:. ::. ::::.: CCDS64 ADDPVHYPRALCLFEMPTGVPLRRHFNSNFKGGFNFYAGLKGQVLVLRTTSTVYNYDYIW 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 DTVFHPSGAIEIRFYATGYISSAFLFGATGKYGNQVSEHTLGTVHTHSAHFKVDLDVAGL : .:.:.:..: ...::::. ..: ..:... : .:..::: .:..::::::: CCDS64 DFIFYPNGVMEAKMHATGYVHATFYTPEGLRHGTRLHTHLIGNIHTHLVHYRVDLDVAGT 470 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 ENWVWAEDMVFVPMAVPWSPEHQLQRLQVTRKLLEMEEQAAFLVGSATPRYLYLASNHSN .: . .: . .. ::::.:.. . . . :.:::: :.:: ..: . : CCDS64 KNSFQTLQMKLENITNPWSPRHRVVQPTLEQTQYSWERQAAFRFKRKLPKYLLFTSPQEN 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 pF1KE5 KWGHPRGYRIQMLSFAGEPLPQNSSMARGFSWER-------------------YQLAVTQ ::: : ::.:. :.: . :: . . ....: : : ::::. 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