Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4202
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4202, 708 aa
1>>>pF1KE4202 708 - 708 aa - 708 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0574+/-0.000859; mu= 16.7308+/- 0.052
mean_var=96.6434+/-19.934, 0's: 0 Z-trim(108.7): 147 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.130463
statistics sampled from 10221 (10382) to 10221 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.319), width: 16
Scan time: 3.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 ( 708) 4805 915.2 0
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CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 ( 609) 585 120.8 5.9e-27
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CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 587) 580 119.9 1.1e-26
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 571) 573 118.6 2.7e-26
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14 ( 585) 573 118.6 2.7e-26
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 597) 568 117.6 5.3e-26
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 593) 567 117.5 6e-26
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3 ( 574) 566 117.3 6.7e-26
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17 ( 608) 559 116.0 1.7e-25
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CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1 ( 642) 540 112.4 2.2e-24
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CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 ( 505) 506 105.9 1.5e-22
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CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 505) 493 103.5 8.3e-22
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1 ( 568) 488 102.6 1.7e-21
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3 ( 621) 472 99.6 1.5e-20
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9 ( 617) 453 96.0 1.8e-19
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3 ( 600) 449 95.2 2.9e-19
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 613) 445 94.5 5e-19
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 639) 445 94.5 5.2e-19
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 655) 445 94.5 5.3e-19
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX ( 658) 445 94.5 5.3e-19
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5 ( 589) 444 94.3 5.6e-19
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4 ( 496) 438 93.1 1.1e-18
CCDS6599.1 CCIN gene_id:881|Hs108|chr9 ( 588) 435 92.6 1.8e-18
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 538) 421 89.9 1e-17
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7 ( 586) 421 90.0 1.1e-17
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15 ( 589) 421 90.0 1.1e-17
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 582) 409 87.7 5.3e-17
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1 ( 584) 409 87.7 5.3e-17
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 568) 407 87.3 6.8e-17
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 709) 407 87.4 8.1e-17
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 755) 407 87.4 8.5e-17
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11 ( 583) 400 86.0 1.7e-16
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2 ( 578) 393 84.7 4.3e-16
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16 ( 597) 390 84.1 6.5e-16
CCDS33848.2 KBTBD12 gene_id:166348|Hs108|chr3 ( 623) 388 83.8 8.7e-16
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4 ( 694) 376 81.5 4.5e-15
CCDS2234.1 KLHL41 gene_id:10324|Hs108|chr2 ( 606) 369 80.2 1e-14
CCDS34478.1 KLHL31 gene_id:401265|Hs108|chr6 ( 634) 369 80.2 1e-14
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 718) 368 80.1 1.3e-14
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX ( 720) 368 80.1 1.3e-14
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13 ( 748) 368 80.1 1.4e-14
CCDS69154.1 KLHL32 gene_id:114792|Hs108|chr6 ( 584) 361 78.7 2.8e-14
CCDS8334.1 KBTBD3 gene_id:143879|Hs108|chr11 ( 612) 360 78.5 3.3e-14
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22 ( 634) 360 78.5 3.4e-14
CCDS2236.1 KLHL23 gene_id:151230|Hs108|chr2 ( 558) 356 77.7 5.2e-14
>>CCDS11411.1 KLHL11 gene_id:55175|Hs108|chr17 (708 aa)
initn: 4805 init1: 4805 opt: 4805 Z-score: 4889.2 bits: 915.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4805; 100.0% identity (100.0% similar) in 708 aa overlap (1-708:1-708)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MAAAAVAAAAAAAAAASLQVLEMESMETAAAGSAGLAAEVRGSGTVDFGPGPGISAMEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAAAAVAAAAAAAAAASLQVLEMESMETAAAGSAGLAAEVRGSGTVDFGPGPGISAMEAS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 GGDPGPEAEDFECSSHCSELSWRQNEQRRQGLFCDITLCFGGAGGREFRAHRSVLAAATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGDPGPEAEDFECSSHCSELSWRQNEQRRQGLFCDITLCFGGAGGREFRAHRSVLAAATE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 YFTPLLSGQFSESRSGRVEMRKWSSEPGPEPDTVEAVIEYMYTGRIRVSTGSVHEVLELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YFTPLLSGQFSESRSGRVEMRKWSSEPGPEPDTVEAVIEYMYTGRIRVSTGSVHEVLELA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 DRFLLIRLKEFCGEFLKKKLHLSNCVAIHSLAHMYTLSQLALKAADMIRRNFHKVIQDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRFLLIRLKEFCGEFLKKKLHLSNCVAIHSLAHMYTLSQLALKAADMIRRNFHKVIQDEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FYTLPFHLIRDWLSDLEITVDSEEVLFETVLKWVQRNAEERERYFEELFKLLRLSQMKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FYTLPFHLIRDWLSDLEITVDSEEVLFETVLKWVQRNAEERERYFEELFKLLRLSQMKPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 YLTRHVKPERLVANNEVCVKLVADAVERHALRAENIQSGTCQHPTSHVSLLPRYGQNMDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YLTRHVKPERLVANNEVCVKLVADAVERHALRAENIQSGTCQHPTSHVSLLPRYGQNMDV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 IMVIGGVSEGGDYLSECVGYFVDEDRWVNLPHIHNHLDGHAVAVTESYVYVAGSMEPGFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IMVIGGVSEGGDYLSECVGYFVDEDRWVNLPHIHNHLDGHAVAVTESYVYVAGSMEPGFA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 KTVERYNPNLNTWEHVCSLMTRKHSFGLTEVKGKLYSIGGHGNFSPGFKDVTVYNPELDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KTVERYNPNLNTWEHVCSLMTRKHSFGLTEVKGKLYSIGGHGNFSPGFKDVTVYNPELDK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 WHNLESAPKILRDVKALAIEDRFVYIAARTPVDRDTEDGLKAVITCYDTETRQWQDVESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 WHNLESAPKILRDVKALAIEDRFVYIAARTPVDRDTEDGLKAVITCYDTETRQWQDVESL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 PLIDNYCFFQMSVVNSNFYQTASCCPKSYCLENEEAVRKIASQVSDEILESLPPEVLSIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 PLIDNYCFFQMSVVNSNFYQTASCCPKSYCLENEEAVRKIASQVSDEILESLPPEVLSIE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 GAAICYYKDDVFIIGGWKNSDDIDKQYRKEAYRYCAERKRWMLLPPMPQPRCRATACHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GAAICYYKDDVFIIGGWKNSDDIDKQYRKEAYRYCAERKRWMLLPPMPQPRCRATACHVR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KE4 IPYRYLHGTQRYPMPQNLMWQKDRIRQMQEIHRHALNMRRVPSSQIEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IPYRYLHGTQRYPMPQNLMWQKDRIRQMQEIHRHALNMRRVPSSQIEC
670 680 690 700
>>CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1 (597 aa)
initn: 639 init1: 182 opt: 599 Z-score: 611.8 bits: 123.5 E(32554): 9.3e-28
Smith-Waterman score: 660; 25.5% identity (55.3% similar) in 591 aa overlap (64-650:4-549)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 AGLAAEVRGSGTVDFGPGPGISAMEASGGDPGPEAE-DFECSSHCSELSWRQNEQRRQGL
:.: : : .: : .. : .
CCDS30 MERPAPLAVLPFSDPAHALSLLRGLSQLRAERK
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 FCDITLCFGGAGGREFRAHRSVLAAATEYFTPLLSGQFSESRSGRVEMRKWSSEPGPEPD
: :.:: .::::.: :::.:::::. :: ...::. :::. ::... : ::
CCDS30 FLDVTLE--AAGGRDFPAHRAVLAAASPYFRAMFAGQLRESRAERVRLH------GVPPD
40 50 60 70 80
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 TVEAVIEYMYTGRIRVSTGSVHEVLELADRFLLIRLKEFCGEFLKKKLHLSNCVAIHSLA
.. .... ::::. :: ... .:. :: . . .:: :: ::...: :.::. ....:
CCDS30 MLQLLLDFSYTGRVAVSGDNAEPLLRAADLLQFPAVKEACGAFLQQQLDLANCLDMQDFA
90 100 110 120 130 140
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 HMYTLSQLALKAADMIRRNFHKVIQDEEFYTLPFHLIRDWLSDLEITVDSEEVLFETVLK
. .. : :: : .: :. . . :.. ::. . .: : . : .::. .. .:.
CCDS30 EAFSCSGLASAAQRFILRHVGE-LGAEQLERLPLARLLRYLRDDGLCVPKEEAAYQLALR
150 160 170 180 190 200
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 WVQRNAEERERYFEELFKLLRLSQMKPTYLTRHVKPERLVANNEVCVKLVADAVERHALR
::. . .: .. .:.. .:: .. :: ::. : ::: :..:. .: . .: :
CCDS30 WVRADPPRRAAHWPQLLEAVRLPFVRRFYLLAHVEAEPLVARCPPCLRLLREARDFQAAR
210 220 230 240 250 260
340 350 360 370 380 390
pF1KE4 AENIQSGTCQHPTSHVSLLPRYGQNM-DVIMVIGGVSEGGDYLSECVGYFVDEDRWVNLP
. . : : . . :: . .. ......:: .. : : : . .: :
CCDS30 YDRHDRGPCPR------MRPRPSTGLAEILVLVGGCDQDCDELVTVDCYNPQTGQWRYLA
270 280 290 300 310
400 410 420 430 440
pF1KE4 HIHNHLDG-HAVAVTESYVYVAGSMEPG-FAKTVERYNPNLNTWEHVCSLMTRKHSFGLT
.. .:: : ..... . .::.:. . . . : ::: ..: : .: .. .. . .
CCDS30 EFPDHLGGGYSIVALGNDIYVTGGSDGSRLYDCVWRYNSSVNEWAEVAPMLKAREYHSSS
320 330 340 350 360 370
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 EVKGKLYSIGGHGNFSPGFKDVTVYNPELDKWHNLESAPKILRDVKALAIEDRFVYIAAR
. : :: ... .. :. :.:. :. . . .. : . :. :..
CCDS30 VLDGLLYVVAADSTER--------YDHTTDSWEALQPMTYPMDNCSTTACRGRLYAIGSL
380 390 400 410 420 430
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 TPVDRDTEDGLKAVITCYDTETRQWQDVESLPLIDNYCFFQMSVVNSNFYQTASCCPKSY
. ..: :. ::: .: :. :.: . : . .::. :
CCDS30 --AGKET-----MVMQCYDPDTDLWS------LVDCGQLPPWSFAP----KTATLNGLMY
440 450 460 470
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 CLENEEAVRKIASQVSDEILESLPPEVLSIEGAAICYYKDDVFIIGGWKNSDDIDKQYRK
.... : . . . .: ...: :... ... ::. :. ...
CCDS30 FVRDDSAEVDVYNPTRNE-WDKIPSMNQVHVGGSLAVLGGKLYVSGGYDNTFELSDVV--
480 490 500 510 520 530
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 EAYRYCAERKRWMLLPPMPQPRCRATACHVRIPYRYLHGTQRYPMPQNLMWQKDRIRQMQ
::: : . : .. .:.:
CCDS30 EAYD--PETRAWSVVGRLPEPTFWHGSVSIFRQFMPQTFSGGRGFELDSGSDDMDPGRPR
540 550 560 570 580
>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1 (609 aa)
initn: 573 init1: 271 opt: 585 Z-score: 597.5 bits: 120.8 E(32554): 5.9e-27
Smith-Waterman score: 618; 27.7% identity (60.0% similar) in 483 aa overlap (62-540:36-493)
40 50 60 70 80 90
pF1KE4 GSAGLAAEVRGSGTVDFGPGPGISAMEASGGDPGPEAEDFECSSHCSELSWRQNEQRRQG
: : : . ..: . : :..
CCDS13 MRRCTNIRPGETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHR
10 20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KE4 LFCDITLCFGGAGGREFRAHRSVLAAATEYFTPLLSGQFSESRSGRVEMRKWSSEPGPEP
.::..: .:.... ::: .:.: . :: ...:...:::. .: .: .
CCDS13 ELCDVVLV---VGAKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDI------DE
70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE4 DTVEAVIEYMYTGRIRVSTGSVHEVLELADRFLLIRLKEFCGEFLKKKLHLSNCVAIHSL
..: .:.. ::..: : :.:. .: : . : ...: : ::::..: :::..:...
CCDS13 RAMELLIDFAYTSQITVEEGNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAF
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 AHMYTLSQLALKAAD-MIRRNFHKVIQDEEFYTLPFHLIRDWLSDLEITVDSEEVLFETV
: .. .: :. :: . ..::..:...:::. :: . . : .:. :..: ::: .:..:
CCDS13 ADTHSCREL-LRIADKFTQHNFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAV
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 LKWVQRNAEERERYFEELFKLLRLSQMKPTYLTRHVKPERLVANNEVCVKLVADAVERHA
. ::. . .::. . .... .:: ..: .:. : . :. ..: : :: .: .
CCDS13 MAWVKYSIQERRPQLPQVLQHVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLL
240 250 260 270 280 290
340 350 360 370 380
pF1KE4 LRAEN-IQSGTCQHPTSHVSLLPRYGQNMDVIMVIGGVSEGGDYLSECVGYFVDEDRWVN
: : ...: .: . . : :. :....:: .:: .: : . ..:
CCDS13 LPQERPLMQGPRTRPRKPI----RCGE---VLFAVGGWC-SGDAISSVERYDPQTNEWRM
300 310 320 330 340
390 400 410 420 430 440
pF1KE4 LPHIHNHLDGHAVAVTESYVYVAGSME-PGFAKTVERYNPNLNTWEH-VCSLMTRKHSFG
. . .. : .:.: .. .:..:. . .. ..::::.:. : : : : . : :
CCDS13 VASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHDGSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVG
350 360 370 380 390 400
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pF1KE4 LTEVKGKLYSIGGHGNFSPGFKDVTVYNPELDKWHNLESAPKILRDVKALAIEDRFVYIA
.. . : ::..::. . : .. : :.:. .:: . : . : :.:. :.: .
CCDS13 VAVLGGFLYAVGGQDGVS-CLNIVERYDPKENKWTRVASM-STRRLGVAVAVLGGFLYAV
410 420 430 440 450 460
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pF1KE4 ARTPVDRDTEDGLKAVITCYDTETRQWQDVESLPLIDNYCFFQMSVVNSNFYQTASCCPK
. . : . :..: :. . .:. . .
CCDS13 GGS----DGTSPLNTVER-YNPQENRWHTIAPMGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTE
470 480 490 500 510 520
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 SYCLENEEAVRKIASQVSDEILESLPPEVLSIEGAAICYYKDDVFIIGGWKNSDDIDKQY
CCDS13 LSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVVNGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANT
530 540 550 560 570 580
>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5 (555 aa)
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.. :..:.:: . . :: : .:::: .. .. .. .:. ..::..:
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.:. . ..: . :: : .: . ..: .. ... ..:. ... :.
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:: : . :.::. . : :..::: :
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.:. . ..: . :: : .: . ..: .. ... ..:. ... :.
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: .: : .. . ..:.....: :.. .. ::: . .: : .
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CCDS41 MSTGRSYAGVAVIHKSL
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CCDS76 ATKYICQNFEAVCQTEEFFELTHADLDEIVSNDCLNVATEETVFYALESWIKYDVQERQK
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CCDS76 YLAQLLNSVRLPLLSVKFLTRLYEANHLIRDDRTCKHLLNEALKYHFMP---------EH
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CCDS76 GICVLDQKVYVIGGIATNVRPGVTIRKHENSVECWNPDTNTWTSLERMNESRSTLGVVVL
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CCDS76 AGELYALGGYDGQSY-LQSVEKYIPKIRKWQPV--APMTTTRSCFAAAVLDGMIYAIGGY
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:. .. . :: .:. : :. :. : ..:. . .. ... :.
CCDS76 GPAHMNS-------VERYDPSKDSWEMVASMA--DKRIHFGVGVMLGFIFVVGGHNGVSH
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CCDS76 -LSSIE--RYDPHQNQWTVCRPMKEPRTGV-GAAV--IDNYLYVVGGHSGSS-----YLN
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CCDS76 TVQKYDPISDTWLDSAGMIYCRCNFGLTAL
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CCDS54 VNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIV---AEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMS
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CCDS54 ESRAKRVRIKEVDGW------TLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKT
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CCDS54 LISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEAL
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CCDS54 AIRSVECYDF--KEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPV
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CCDS54 KDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDG-STGLSSVEAYNIKSNEWFHV--APM
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. :. .... ..: : : ... : ... ::.. : .: . .
CCDS54 NTRRSSVGVGVVGGLLY--AVGGYDGASRQCL-STVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAG
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