FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2411, 570 aa 1>>>pF1KE2411 570 - 570 aa - 570 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4174+/-0.000416; mu= 18.7096+/- 0.026 mean_var=79.5038+/-16.365, 0's: 0 Z-trim(112.2): 35 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.143840 statistics sampled from 21079 (21097) to 21079 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.247), width: 16 Scan time: 7.820 The best scores are: opt bits E(85289) NP_060712 (OMIM: 609832) multidrug and toxin extru ( 570) 3719 781.9 0 NP_001093116 (OMIM: 609833) multidrug and toxin ex ( 566) 1846 393.2 1.2e-108 NP_001243592 (OMIM: 609833) multidrug and toxin ex ( 580) 1269 273.5 1.3e-72 NP_690872 (OMIM: 609833) multidrug and toxin extru ( 602) 1116 241.7 4.9e-63 XP_016879715 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug a ( 351) 750 165.6 2.4e-40 XP_016879714 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug a ( 384) 750 165.7 2.5e-40 XP_016879713 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug a ( 415) 750 165.7 2.7e-40 XP_016879712 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug a ( 438) 750 165.7 2.8e-40 XP_016879710 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug a ( 616) 750 165.8 3.7e-40 XP_016879711 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug a ( 567) 680 151.3 8.1e-36 >>NP_060712 (OMIM: 609832) multidrug and toxin extrusion (570 aa) initn: 3719 init1: 3719 opt: 3719 Z-score: 4172.3 bits: 781.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 3719; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 VFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 QGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 HQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 HQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LAIIVYMVPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LAIIVYMVPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 VGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 VGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 LPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 LPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 PRSGNSALPQDPLHPGCPENLEGILTNDVGKTGEPQSDQQMRQEEPLPEHPQDGAKLSRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 PRSGNSALPQDPLHPGCPENLEGILTNDVGKTGEPQSDQQMRQEEPLPEHPQDGAKLSRK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 QLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ :::::::::::::::::::::::::::::: NP_060 QLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ 550 560 570 >>NP_001093116 (OMIM: 609833) multidrug and toxin extrus (566 aa) initn: 1814 init1: 1814 opt: 1846 Z-score: 2071.7 bits: 393.2 E(85289): 1.2e-108 Smith-Waterman score: 1846; 51.3% identity (78.1% similar) in 556 aa overlap (22-564:13-560) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: NP_001 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: NP_001 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . 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NP_001 AVIYEVATVTYMIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLIS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 SCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIG :...:.:::.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. :. ::::::.:.: :: ::.: NP_001 ILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAICCVYGGVLRGTGKQAFGAAVNAIT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 YYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANL ::..:::.:: : :.. . .:::: :.. :. . .. :... .:.:: : ..:. :.. NP_001 YYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLWLGMLACVFLATAAFVAYTARLDWKLAAEEAKKHSGR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 KVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPEN--LEGILTNDV-GKTGEPQSDQQMRQE---EPLPE . .. :. ..: .:: ::. : .. :.. : : : .. . . : NP_001 QQQQ--RAESTAT-----RPG-PEKAVLSSVATGSSPGITLTTYSRSECHVDFFRTPEEA 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 HPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ : .. ..:: ::::.::: : .. :.::. :: NP_001 HALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALGAASATLMVGLTVRILATRH 530 540 550 560 >>NP_001243592 (OMIM: 609833) multidrug and toxin extrus (580 aa) initn: 1319 init1: 1266 opt: 1269 Z-score: 1424.5 bits: 273.5 E(85289): 1.3e-72 Smith-Waterman score: 1808; 50.0% identity (76.1% similar) in 570 aa overlap (22-564:13-574) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: NP_001 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: NP_001 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . NP_001 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 KYLLNQGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYI ::: :: :. ::...::..: ::..::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.::: NP_001 KYLQNQKITWPQVLSGVVGNCVNGVANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LGKKLHQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQ . :::: ::.::: .:::::. :. ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.:: NP_001 VLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPFFSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SIVYELAIIVYM--------------VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLL ...::.: ..:: .: :.:... :::: ::::.: ::..:.. ..: NP_001 AVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHVTRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 ITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRG : .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. :. :::::: NP_001 SIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAICCVYGGVLRG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLN .:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .:::: :.. :. . .. :... .:. NP_001 TGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLWLGMLACVFLATAAFVAYTARLD 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 WKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPEN--LEGILTNDV-GKTGEPQSD :: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: ::. : .. :.. : : : NP_001 WKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PEKAVLSSVATGSSPGITLTTYSR 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 QQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ .. . . : : .. ..:: ::::.::: : .. :.::. :: NP_001 SECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALGAASATLMVGLTVRILATRH 530 540 550 560 570 580 >>NP_690872 (OMIM: 609833) multidrug and toxin extrusion (602 aa) initn: 1085 init1: 1085 opt: 1116 Z-score: 1252.6 bits: 241.7 E(85289): 4.9e-63 Smith-Waterman score: 1774; 48.3% identity (73.5% similar) in 592 aa overlap (22-564:13-596) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: NP_690 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: NP_690 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . NP_690 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA ::: ::: :. ::...::..: ::. NP_690 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : NP_690 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYMVPAGFSVAASVR . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..::.: :.:... :: NP_690 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMIPLGLSIGVCVR 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 VGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVV :: ::::.: ::..:.. ..: : .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::. NP_690 VGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVL 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 PIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLW :.:.: :.:::. :. ::::::.:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .:::: NP_690 PVYSVFHVFEAICCVYGGVLRGTGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLW 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 SGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPE :.. :. . .. :... .:.:: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: :: NP_690 LGMLACVFLATAAFVAYTARLDWKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PE 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 N--LEGILTNDV-GKTGEPQSDQQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLL . : .. :.. : : : .. . . : : .. ..:: ::::.::: : NP_690 KAVLSSVATGSSPGITLTTYSRSECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALG 530 540 550 560 570 580 560 570 pF1KE2 GVFLILLVGILVRFYVRIQ .. :.::. :: NP_690 AASATLMVGLTVRILATRH 590 600 >>XP_016879715 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug and t (351 aa) initn: 749 init1: 749 opt: 750 Z-score: 845.4 bits: 165.6 E(85289): 2.4e-40 Smith-Waterman score: 1195; 56.6% identity (76.1% similar) in 327 aa overlap (22-307:13-339) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: XP_016 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: XP_016 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . XP_016 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA ::: ::: :. ::...::..: ::. XP_016 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : XP_016 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYMVPAGFSVAASVR . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..:: XP_016 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMGAFLGLRPQSPL 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 VGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVV >>XP_016879714 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug and t (384 aa) initn: 1265 init1: 749 opt: 750 Z-score: 844.9 bits: 165.7 E(85289): 2.5e-40 Smith-Waterman score: 1205; 55.8% identity (75.2% similar) in 339 aa overlap (22-319:13-351) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: XP_016 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: XP_016 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . XP_016 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA ::: ::: :. ::...::..: ::. XP_016 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : XP_016 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYMVPAGFSVAASVR . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..:: : : : .:. XP_016 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMDPPRASRAHQVQ 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 VGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVV XP_016 TLLSLRQDSHTGAHNLTTKGDISLTDVGILKIN 360 370 380 >>XP_016879713 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug and t (415 aa) initn: 858 init1: 749 opt: 750 Z-score: 844.4 bits: 165.7 E(85289): 2.7e-40 Smith-Waterman score: 1309; 52.0% identity (74.1% similar) in 402 aa overlap (22-368:13-414) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: XP_016 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: XP_016 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . XP_016 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA ::: ::: :. ::...::..: ::. XP_016 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : XP_016 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYM------------ . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..:: XP_016 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHV 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 --VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIF .: :.:... :::: ::::.: ::..:.. ..: : .......:. :...:.:: XP_016 TRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIF 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 TTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGI :.: XP_016 TNDE >>XP_016879712 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug and t (438 aa) initn: 955 init1: 749 opt: 750 Z-score: 844.1 bits: 165.7 E(85289): 2.8e-40 Smith-Waterman score: 1407; 52.2% identity (74.9% similar) in 427 aa overlap (22-393:13-438) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: XP_016 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: XP_016 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . XP_016 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA ::: ::: :. ::...::..: ::. XP_016 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : XP_016 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYM------------ . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..:: XP_016 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHV 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 --VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIF .: :.:... :::: ::::.: ::..:.. ..: : .......:. :...:.:: XP_016 TRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIF 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 TTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGI :.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. : XP_016 TNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAI-C 420 430 >>XP_016879710 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug and t (616 aa) initn: 1284 init1: 749 opt: 750 Z-score: 842.0 bits: 165.8 E(85289): 3.7e-40 Smith-Waterman score: 1712; 47.5% identity (72.0% similar) in 592 aa overlap (22-550:13-596) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: XP_016 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: XP_016 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . 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XP_016 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : XP_016 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYM------------ . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..:: XP_016 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHV 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 --VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIF .: :.:... :::: ::::.: ::..:.. ..: : .......:. :...:.:: XP_016 TRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIF 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 TTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGI :.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. :. ::::::.:.: :: ::.: ::..:::.:: XP_016 TNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAICCVYGGVLRGTGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGI 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 ALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGN : :.. . .:::: :.. :. . .. :... .:.:: : ..:. :.. . .. :. . XP_016 LLTFVVRMRIMGLWLGMLACVFLATAAFVAYTARLDWKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAES 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 pF1KE2 SALPQDPLHPGCPEN--LEGILTNDV-GKTGEPQSDQQMRQE---EPLPEHPQDG--AKL .: .:: ::. : .. :.. : : : .. . . : : .. ..: XP_016 TAT-----RPG-PEKAVLSSVATGSSPGITLTTYSRSECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRL 530 540 550 560 570 580 540 550 560 570 pF1KE2 SRKQLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ : ::::.::: : XP_016 SVKQLVIRRGAALGAASATLMVGLTVRILATRH 590 600 610 >>XP_016879711 (OMIM: 609833) PREDICTED: multidrug and t (567 aa) initn: 1215 init1: 680 opt: 680 Z-score: 764.0 bits: 151.3 E(85289): 8.1e-36 Smith-Waterman score: 1642; 48.1% identity (72.4% similar) in 555 aa overlap (54-550:1-547) 30 40 50 60 70 80 pF1KE2 RCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINV .: ..:.::::::::.:: .::::.: .:: XP_016 MIYIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNV 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 TGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLL ::::: :::::::::.::..:: : :::::::::.::::::::.::::::::::::::: XP_016 CGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVILQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 pF1KE2 FRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLNQG--------------------- :::::::::::: :: ::::.::. ::: : .::: ::: XP_016 FRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLAKYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHP 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 pF1KE2 ---------------IVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTL :. ::...::..: ::..::: .. :.::: ::: ::.:::.. XP_016 SHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNGVANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQ 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 ALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGIL ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. :. ::.:::::.:.::::::.:::: :.: XP_016 TVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPFFSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLL 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 pF1KE2 GMVELGAQSIVYELAIIVYM--------------VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQAR ..:.:.::...::.: ..:: .: :.:... :::: ::::.: ::. XP_016 SVVDLSAQAVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHVTRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAK 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 KSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALAC .:.. ..: : .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. : XP_016 RSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAICC 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 TSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCF . ::::::.:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .:::: :.. :. . .. : XP_016 VYGGVLRGTGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLWLGMLACVFLATAAF 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 LGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPEN--LEGILTNDV-G ... .:.:: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: ::. : .. :.. : XP_016 VAYTARLDWKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PEKAVLSSVATGSSPG 460 470 480 490 500 520 530 540 550 560 pF1KE2 KTGEPQSDQQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRF : : .. . . : : .. ..:: ::::.::: : XP_016 ITLTTYSRSECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALGAASATLMVGLTVRI 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 YVRIQ XP_016 LATRH 570 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 19:44:42 2016 done: Sat Nov 5 19:44:44 2016 Total Scan time: 7.820 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]