FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2411, 570 aa 1>>>pF1KE2411 570 - 570 aa - 570 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6122+/-0.000924; mu= 17.5575+/- 0.055 mean_var=74.4044+/-15.401, 0's: 0 Z-trim(105.9): 24 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.148688 statistics sampled from 8670 (8676) to 8670 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.621), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16 Scan time: 2.420 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11209.1 SLC47A1 gene_id:55244|Hs108|chr17 ( 570) 3719 807.4 0 CCDS58530.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 ( 580) 1269 281.9 1.5e-75 CCDS11211.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 ( 602) 1116 249.1 1.2e-65 >>CCDS11209.1 SLC47A1 gene_id:55244|Hs108|chr17 (570 aa) initn: 3719 init1: 3719 opt: 3719 Z-score: 4310.2 bits: 807.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3719; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLSAFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLISFISS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVILQRSA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQVKYLLN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 QGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 HQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 HQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 LAIIVYMVPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LAIIVYMVPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDH 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 VGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 VGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 LPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 PRSGNSALPQDPLHPGCPENLEGILTNDVGKTGEPQSDQQMRQEEPLPEHPQDGAKLSRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 PRSGNSALPQDPLHPGCPENLEGILTNDVGKTGEPQSDQQMRQEEPLPEHPQDGAKLSRK 490 500 510 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 QLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 QLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ 550 560 570 >>CCDS58530.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 (580 aa) initn: 1319 init1: 1266 opt: 1269 Z-score: 1469.7 bits: 281.9 E(32554): 1.5e-75 Smith-Waterman score: 1808; 50.0% identity (76.1% similar) in 570 aa overlap (22-564:13-574) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: CCDS58 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: CCDS58 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . CCDS58 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 KYLLNQGIVLPQIVTGVAANLVNALANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYI ::: :: :. ::...::..: ::..::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.::: CCDS58 KYLQNQKITWPQVLSGVVGNCVNGVANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LGKKLHQATWGGWSLECLQDWASFLRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQ . :::: ::.::: .:::::. :. ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.:: CCDS58 VLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPFFSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 SIVYELAIIVYM--------------VPAGFSVAASVRVGNALGAGDMEQARKSSTVSLL ...::.: ..:: .: :.:... :::: ::::.: ::..:.. ..: CCDS58 AVIYEVATVTYMRHSHRLAYAAHVTRIPLGLSIGVCVRVGMALGAADTVQAKRSAVSGVL 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 ITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVVPIYAVSHLFEALACTSGGVLRG : .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::.:.:.: :.:::. :. :::::: CCDS58 SIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVLPVYSVFHVFEAICCVYGGVLRG 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLWSGIIICTVFQAVCFLGFIIQLN .:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .:::: :.. :. . .. :... .:. CCDS58 TGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLWLGMLACVFLATAAFVAYTARLD 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 WKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPEN--LEGILTNDV-GKTGEPQSD :: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: ::. : .. :.. : : : CCDS58 WKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PEKAVLSSVATGSSPGITLTTYSR 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 QQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLLGVFLILLVGILVRFYVRIQ .. . . : : .. ..:: ::::.::: : .. :.::. :: CCDS58 SECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALGAASATLMVGLTVRILATRH 530 540 550 560 570 580 >>CCDS11211.1 SLC47A2 gene_id:146802|Hs108|chr17 (602 aa) initn: 1085 init1: 1085 opt: 1116 Z-score: 1292.1 bits: 249.1 E(32554): 1.2e-65 Smith-Waterman score: 1774; 48.3% identity (73.5% similar) in 592 aa overlap (22-564:13-596) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEAPEEPAPVRGGPEATLEVRGSRCLRLS-----AFREELRALLVLAGPAFLVQLMVFLI :. : :: .: :. .:..:.:: :: :...:.: CCDS11 MDSLQDTVALDHGGCCPALSRLVPRGFGTEMWTLFALSGPLFLFQVLTFMI 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 SFISSVFCGHLGKLELDAVTLAIAVINVTGVSVGFGLSSACDTLISQTYGSQNLKHVGVI ..:.::::::::.:: .::::.: .:: ::::: :::::::::.::..:: : :::::: CCDS11 YIVSTVFCGHLGKVELASVTLAVAFVNVCGVSVGVGLSSACDTLMSQSFGSPNKKHVGVI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LQRSALVLLLCCFPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQTYVTIFIPALPATFLYMLQV :::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: ::::.::. ::: : . CCDS11 LQRGALVLLLCCLPCWALFLNTQHILLLFRQDPDVSRLTQDYVMIFIPGLPVIFLYNLLA 120 130 140 150 160 170 180 190 pF1KE2 KYLLNQG------------------------------------IVLPQIVTGVAANLVNA ::: ::: :. ::...::..: ::. CCDS11 KYLQNQGWLKGQEEESPFQTPGLSILHPSHSHLSRASFHLFQKITWPQVLSGVVGNCVNG 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 LANYLFLHQLHLGVIGSALANLISQYTLALLLFLYILGKKLHQATWGGWSLECLQDWASF .::: .. :.::: ::: ::.:::.. ...:.:::. :::: ::.::: .:::::. : CCDS11 VANYALVSVLNLGVRGSAYANIISQFAQTVFLLLYIVLKKLHLETWAGWSSQCLQDWGPF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 LRLAIPSMLMLCMEWWAYEVGSFLSGILGMVELGAQSIVYELAIIVYMVPAGFSVAASVR . ::.:::::.:.::::::.:::: :.:..:.:.::...::.: ..::.: :.:... :: CCDS11 FSLAVPSMLMICVEWWAYEIGSFLMGLLSVVDLSAQAVIYEVATVTYMIPLGLSIGVCVR 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 VGNALGAGDMEQARKSSTVSLLITVLFAVAFSVLLLSCKDHVGYIFTTDRDIINLVAQVV :: ::::.: ::..:.. ..: : .......:. :...:.:::.:.:.: ::.::. CCDS11 VGMALGAADTVQAKRSAVSGVLSIVGISLVLGTLISILKNQLGHIFTNDEDVIALVSQVL 360 370 380 390 400 410 380 390 400 410 420 430 pF1KE2 PIYAVSHLFEALACTSGGVLRGSGNQKVGAIVNTIGYYVVGLPIGIALMFATTLGVMGLW :.:.: :.:::. :. ::::::.:.: :: ::.: ::..:::.:: : :.. . .:::: CCDS11 PVYSVFHVFEAICCVYGGVLRGTGKQAFGAAVNAITYYIIGLPLGILLTFVVRMRIMGLW 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 480 490 pF1KE2 SGIIICTVFQAVCFLGFIIQLNWKKACQQAQVHANLKVNNVPRSGNSALPQDPLHPGCPE :.. :. . .. :... .:.:: : ..:. :.. . .. :. ..: .:: :: CCDS11 LGMLACVFLATAAFVAYTARLDWKLAAEEAKKHSGRQQQQ--RAESTAT-----RPG-PE 480 490 500 510 520 500 510 520 530 540 550 pF1KE2 N--LEGILTNDV-GKTGEPQSDQQMRQE---EPLPEHPQDG--AKLSRKQLVLRRGLLLL . : .. :.. : : : .. . . : : .. ..:: ::::.::: : CCDS11 KAVLSSVATGSSPGITLTTYSRSECHVDFFRTPEEAHALSAPTSRLSVKQLVIRRGAALG 530 540 550 560 570 580 560 570 pF1KE2 GVFLILLVGILVRFYVRIQ .. :.::. :: CCDS11 AASATLMVGLTVRILATRH 590 600 570 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 19:44:42 2016 done: Sat Nov 5 19:44:42 2016 Total Scan time: 2.420 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]