FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2059, 701 aa 1>>>pF1KE2059 701 - 701 aa - 701 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0005+/-0.000391; mu= 21.8435+/- 0.024 mean_var=67.1420+/-13.967, 0's: 0 Z-trim(112.0): 35 B-trim: 745 in 1/52 Lambda= 0.156523 statistics sampled from 20725 (20760) to 20725 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16 Scan time: 10.930 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001130 (OMIM: 242100,603741) arachidonate 12-li ( 701) 4840 1102.4 0 NP_067641 (OMIM: 242100,606545,607206) hydroperoxi ( 711) 2143 493.4 1.3e-138 NP_001159432 (OMIM: 242100,606545,607206) hydroper ( 843) 2143 493.4 1.5e-138 NP_001132 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxygen ( 676) 2005 462.2 3e-129 XP_016880410 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 615) 1615 374.1 8.9e-103 XP_016871501 (OMIM: 152390,600807) PREDICTED: arac ( 529) 1508 349.9 1.5e-95 NP_001307791 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 529) 1508 349.9 1.5e-95 NP_000689 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lip ( 674) 1509 350.2 1.5e-95 NP_000688 (OMIM: 152391) arachidonate 12-lipoxygen ( 663) 1375 319.9 2e-86 XP_016880411 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 563) 1311 305.4 3.9e-82 XP_016880412 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 539) 1307 304.5 7e-82 NP_001131 (OMIM: 152392) arachidonate 15-lipoxygen ( 662) 1227 286.5 2.2e-76 NP_001243083 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 617) 1195 279.3 3.2e-74 XP_011522082 (OMIM: 152391) PREDICTED: arachidonat ( 713) 1168 273.2 2.4e-72 XP_016880413 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 489) 1151 269.2 2.6e-71 XP_016880414 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 489) 1151 269.2 2.6e-71 NP_001034219 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxy ( 647) 983 231.4 8.5e-60 NP_001243082 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 642) 655 157.3 1.7e-37 NP_001307790 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 645) 655 157.3 1.7e-37 NP_001034220 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxy ( 602) 628 151.2 1.1e-35 NP_001138944 (OMIM: 613072,613079) lipoxygenase ho (1114) 149 43.2 0.0064 >>NP_001130 (OMIM: 242100,603741) arachidonate 12-lipoxy (701 aa) initn: 4840 init1: 4840 opt: 4840 Z-score: 5901.1 bits: 1102.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4840; 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NP_001 GESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAELGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVT 170 180 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 APNGRIYHFPAYQWMDGYETLALREATGKTTADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFL :.: . ::: :::..:: :. :: .:..: .::::.::.:: .:.::.:. :.:... NP_001 EPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTARTICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYA 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 pF1KE2 PGLPSYVHIPSYRPPVRRHR----------NPNRPEWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNL ::.: .: . :.. .. . . : :.::::. :.. . ... :. NP_001 PGFPCMVDVNSFQEMESDKKFALTKTTTCVDQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNV 290 300 310 320 330 340 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 RYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCKHSWKRLKDIRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAE ::: :: :.. : .:..:.::::: : :::.: :...:: .:. ...::.::: : NP_001 RYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLDRKGSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCE 350 360 370 380 390 400 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 DTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVAPFLGEGTCLQAELEKGNIYLADYRI : :::::::::::: ... . .:.:.:::.:::::.::. ::::.:::.:::.:::: : NP_001 DHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVTNDMVAPLLGQDTCLQTELERGNIFLADYWI 410 420 430 440 450 460 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 MEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGKMMPIAIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLL . :: :.::.:. :::::: ..:.: ..:.::::::::::: :::::.:::::::: NP_001 LAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGALVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEWDWLL 470 480 490 500 510 520 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 AKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALLRNLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSI :::::: .:: :: .:.: :::. ::: .: ::.::.:::.::::.::::::.:.:.: NP_001 AKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFAMATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTI 530 540 550 560 570 580 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 GRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSELTYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRD .::.::: :: . :.: .:. .: .:...:: .. ::... ::: .:.:.::: NP_001 ARATLLNPEGLVDQVTSIGRQGLIYLMSTGLAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRD 590 600 610 620 630 640 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 DSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQSWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTV :.: .: :.:..:.::. :::::::.:. : :::.:. ::: . .::::::::: : : NP_001 DGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSDASVQQDSELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTP 650 660 670 680 690 700 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 PELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNFPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLP :.....: .:..:::.:::::.:: .: ::::: :.:::.:: :::: :::.:..:::: NP_001 GEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQHDFGAWMPNAPSSMRQPPPQTKGTTTLKTYLDTLP 710 720 730 740 750 760 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 DVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVEEAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRN .:. .: .::..: .:.:: :.:::: .:: ::.:::::::: ::..:: :::.::..:: NP_001 EVNISCNNLLLFWLVSQEPKDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIAAFQSRLAQISRDIQERN 770 780 790 800 810 820 690 700 pF1KE2 KCLPIPYYYLDPVLIENSISI . : .:: :::: :::::.:: NP_001 QGLALPYTYLDPPLIENSVSI 830 840 >>NP_001132 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxygenase (676 aa) initn: 2202 init1: 1473 opt: 2005 Z-score: 2441.5 bits: 462.2 E(85289): 3e-129 Smith-Waterman score: 2329; 48.4% identity (75.2% similar) in 707 aa overlap (1-701:1-676) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD :: ..:::.:: . .:: :..:..::::.::: :...:..:..:: .. : :.: NP_001 MAEFRVRVSTGEAFGAGTWDKVSVSIVGTRGESPPLPLDNLGKEFTAGAEEDFQVTLPED 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LGELIIIRLHKERYAF-----FPKDPWYCNYVQICAPNGRIYHFPAYQWMDGYETLALRE .:.....:.:: .. . : :.: . :. : : :: :::..: ::.:.: NP_001 VGRVLLLRVHKAPPVLPLLGPLAPDAWFCRWFQLTPPRGGHLLFPCYQWLEGAGTLVLQE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 ATGKTTADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRP .:.:.. : ::: ..:.::..:.:..:.:.. NP_001 GTAKVSWADHHPVLQQQRQEELQARQEMYQWKA--------------------------- 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 EWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCKHSWKR : ::.: .. :... :.::..:: :.:.:... : .:..:::: : :. NP_001 ----YNPGWPHCLDEKTVEDLELNIKYSTAKNANFYLQAGSAFAEMKIKGLLDRKGLWRS 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 LKDIRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVTDDMVA :.....:: ... ..:.. ::: ::.::. :.:::.:: ::::: .: .::::: ::: NP_001 LNEMKRIFNFRRTPAAEHAFEHWQEDAFFASQFLNGLNPVLIRRCHYLPKNFPVTDAMVA 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 PFLGEGTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPE-GKMMPI :: :: ::::::::...:.:. :. :: : ..:. : ::. ::. .: : ..:. NP_001 SVLGPGTSLQAELEKGSLFLVDHGILSGIQTNVINGKPQFSAAPMTLLYQSPGCGPLLPL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 AIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFCLALL ::::::::::. :::::.:..::::::::::: ::: :::..:::..::. :.: :: : NP_001 AIQLSQTPGPNSPIFLPTDDKWDWLLAKTWVRNAEFSFHEALTHLLHSHLLPEVFTLATL 330 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 RNLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRALSEL :.:: ::::.::::::::::..::...: .:. : . .. ..:.:::. .. : ...: NP_001 RQLPHCHPLFKLLIPHTRYTLHINTLARELLIVPGQVVDRSTGIGIEGFSELIQRNMKQL 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 TYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGDPELQ .:. : ::.:. :::.:.::::::::.. .:.:.:..:.::: ::::: .:. : ::: NP_001 NYSLLCLPEDIRTRGVEDIPGYYYRDDGMQIWGAVERFVSEIIGIYYPSDESVQDDRELQ 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 SWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPN .::.:::.. .:..::::.: :.: :..:::.::.:::::::::..::.. ::::: NP_001 AWVREIFSKGFLNQESSGIPSSLETREALVQYVTMVIFTCSAKHAAVSAGQFDSCAWMPN 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 FPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFV .: ::. :: .:::.: : :. ::: :..:: ..:.:: ::.:: :.:::: .:: ::. NP_001 LPPSMQLPPPTSKGLATCEGFIATLPPVNATCDVILALWLLSKEPGDQRPLGTYPDEHFT 570 580 590 600 610 620 660 670 680 690 700 pF1KE2 EEAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRNKCLPIPYYYLDPVLIENSISI :::::::: .:..:: :::. :..::. : .:: :::: :::::.:: NP_001 EEAPRRSIATFQSRLAQISRGIQERNQGLVLPYTYLDPPLIENSVSI 630 640 650 660 670 >>XP_016880410 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTED: h (615 aa) initn: 2229 init1: 1615 opt: 1615 Z-score: 1966.1 bits: 374.1 E(85289): 8.9e-103 Smith-Waterman score: 2200; 52.3% identity (78.0% similar) in 595 aa overlap (1-585:1-595) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNHFGRDFATGAVGQYTVQCPQD ::.:.. :.:: : .:: :.::.:.::: ::: :: :...::::: :.: .: :.: . XP_016 MAVYRLCVTTGPYLRAGTLDNISVTLVGTCGESPKQRLDRMGRDFAPGSVQKYKVRCTAE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 LGELIIIRLHKERYAFFPKDPWYCNYVQICAPNGRIYHFPAYQWMDGYETLALREATGKT ::::...:.:::::::: :: :::. . . :.: . ::: :::..:: :. :: .:..: XP_016 LGELLLLRVHKERYAFFRKDSWYCSRICVTEPDGSVSHFPCYQWIEGYCTVELRPGTART 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 TADDSLPVLLEHRKEEIRAKQDFYHWRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHR---------- .::::.::.:: .:.::.:. :.:... ::.: .: . :.. .. XP_016 ICQDSLPLLLDHRTRELRARQECYRWKIYAPGFPCMVDVNSFQEMESDKKFALTKTTTCV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 NPNRPEWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFLKTASFFVRLGPMALAFKVRGLLDCK . . : :.::::. :.. . ... :.::: :: :.. : .:..:.::::: : XP_016 DQGDSSGNRYLPGFPMKIDIPSLMYMEPNVRYSATKTISLLFNAIPASLGMKLRGLLDRK 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 HSWKRLKDIRKIFPGKKSVVSEYVAEHWAEDTFFGYQYLNGVNPGLIRRCTRIPDKFPVT :::.: :...:: .:. ...::.::: :: :::::::::::: ... . .:.:.::: XP_016 GSWKKLDDMQNIFWCHKTFTTKYVTEHWCEDHFFGYQYLNGVNPVMLHCISSLPSKLPVT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 DDMVAPFLGEGTCLQAELEKGNIYLADYRIMEGIPTVELSGRKQHHCAPLCLLHFGPEGK .:::::.::. ::::.:::.:::.:::: :. :: :.::.:. :::::: ..:.: XP_016 NDMVAPLLGQDTCLQTELERGNIFLADYWILAEAPTHCLNGRQQYVAAPLCLLWLSPQGA 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 MMPIAIQLSQTPGPDCPIFLPSDSEWDWLLAKTWVRYAEFYSHEAIAHLLETHLIAEAFC ..:.::::::::::: :::::.:::::::::::::: .:: :: .:.: :::. ::: XP_016 LVPLAIQLSQTPGPDSPIFLPTDSEWDWLLAKTWVRNSEFLVHENNTHFLCTHLLCEAFA 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 LALLRNLPMCHPLYKLLIPHTRYTVQINSIGRAVLLNEGGLSAKGMSLGVEGFAGVMVRA .: ::.::.:::.::::.::::::.:.:.:.::.::: :: . :.: .:. .: . XP_016 MATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEGLVDQVTSIGRQGLIYLMSTG 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 LSELTYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGD :...:: .. ::... ::: .:.:.::::.: .: :.:..:.::. :::::::.:. : XP_016 LAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIESFVSEIVGYYYPSDASVQQD 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 PELQSWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTA :::.:. ::: . .::::::::: : : :.....: .:..:::.:::::.:: XP_016 SELQAWTGEIFAQAFLGRESSGFPSRLCTPGEMVKFLTAIIFNCSAQHAAVNSGQDGRGG 550 560 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 WMPNFPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLPDVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPD XP_016 IRDGEEGGDTPLLAN 610 >>XP_016871501 (OMIM: 152390,600807) PREDICTED: arachido (529 aa) initn: 1467 init1: 624 opt: 1508 Z-score: 1836.5 bits: 349.9 E(85289): 1.5e-95 Smith-Waterman score: 1508; 42.6% identity (72.1% similar) in 531 aa overlap (176-701:2-529) 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 WRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRPEWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFL ::: ::::. :. : : : ..... 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XP_016 DGLLVWEAIRTFTAEVVDIYYEGDQVVEEDPELQDFVNDVYVYGMRGRKSSGFPKSVKSR 330 340 350 360 370 380 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 PELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNFPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLP .: .:.:.::.: ::.::::: ::... .:.:: : .:: :: .::..:.: ..:::: XP_016 EQLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFGQYDWCSWIPNAPPTMRAPPPTAKGVVTIEQIVDTLP 390 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 DVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVEEAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRN : .: : ..:.::. ... :: .:. ::.:. .... ::. :. : : .:: XP_016 DRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLEAIVSVIAERN 450 460 470 480 490 500 690 700 pF1KE2 KCLPIPYYYLDPVLIENSISI : .:::::.: : ::..: XP_016 KKKQLPYYYLSPDRIPNSVAI 510 520 >>NP_001307791 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lipo (529 aa) initn: 1467 init1: 624 opt: 1508 Z-score: 1836.5 bits: 349.9 E(85289): 1.5e-95 Smith-Waterman score: 1508; 42.6% identity (72.1% similar) in 531 aa overlap (176-701:2-529) 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 WRVFLPGLPSYVHIPSYRPPVRRHRNPNRPEWNGYIPGFPILINFKATKFLNLNLRYSFL ::: ::::. :. : : : ..... 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NP_001 DGLLVWEAIRTFTAEVVDIYYEGDQVVEEDPELQDFVNDVYVYGMRGRKSSGFPKSVKSR 330 340 350 360 370 380 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 PELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTAWMPNFPASMRNPPIQTKGLTTLETFMDTLP .: .:.:.::.: ::.::::: ::... .:.:: : .:: :: .::..:.: ..:::: NP_001 EQLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFGQYDWCSWIPNAPPTMRAPPPTAKGVVTIEQIVDTLP 390 400 410 420 430 440 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 DVKTTCITLLVLWTLSREPDDRRPLGHFPDIHFVEEAPRRSIEAFRQRLNQISHDIRQRN : .: : ..:.::. ... :: .:. ::.:. .... ::. :. : : .:: NP_001 DRGRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLEAIVSVIAERN 450 460 470 480 490 500 690 700 pF1KE2 KCLPIPYYYLDPVLIENSISI : .:::::.: : ::..: NP_001 KKKQLPYYYLSPDRIPNSVAI 510 520 >>NP_000689 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lipoxyg (674 aa) initn: 1837 init1: 624 opt: 1509 Z-score: 1836.2 bits: 350.2 E(85289): 1.5e-95 Smith-Waterman score: 1820; 39.9% identity (69.0% similar) in 707 aa overlap (1-701:1-674) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MATYKVRVATGTDLLSGTRDSISLTIVGTQGESHKQLLNH-FGRDFATGAVGQYTVQCPQ : .: : ::::.. ..:: : : :..::. : :.:.::.. : :: ::: .: : . 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XP_016 MATLRQLPLCHPIYKLLLPHTRYTLQVNTIARATLLNPEGLVDQVTSIGRQGLIYLMSTG 430 440 450 460 470 480 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 LSELTYDSLYLPNDFVERGVQDLPGYYYRDDSLAVWNALEKYVTEIITYYYPSDAAVEGD :...:: .. ::... ::: .:.:.::::.: .: :.:.. XP_016 LAHFTYTNFCLPDSLRARGVLAIPNYHYRDDGLKIWAAIERFPKPAVHPRRDGEVPHCNH 490 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 PELQSWVQEIFKECLLGRESSGFPRCLRTVPELIRYVTIVIYTCSAKHAAVNTGQMEFTA XP_016 LQLLCPARCCQQWAGRQRWNQGW 550 560 701 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 13:55:56 2016 done: Sun Nov 6 13:55:57 2016 Total Scan time: 10.930 Total Display time: 0.150 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]