FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2045, 663 aa 1>>>pF1KE2045 663 - 663 aa - 663 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1219+/-0.000311; mu= 15.7709+/- 0.020 mean_var=82.6167+/-16.725, 0's: 0 Z-trim(117.1): 42 B-trim: 88 in 1/55 Lambda= 0.141104 statistics sampled from 28837 (28882) to 28837 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16 Scan time: 11.920 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000688 (OMIM: 152391) arachidonate 12-lipoxygen ( 663) 4613 948.9 0 NP_001131 (OMIM: 152392) arachidonate 15-lipoxygen ( 662) 3058 632.4 1.6e-180 XP_011522082 (OMIM: 152391) PREDICTED: arachidonat ( 713) 2859 591.9 2.7e-168 NP_000689 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lip ( 674) 1742 364.5 7.4e-100 NP_001132 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxygen ( 676) 1529 321.1 8.4e-87 NP_001243083 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 617) 1505 316.2 2.3e-85 NP_001307791 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 529) 1474 309.9 1.6e-83 XP_016871501 (OMIM: 152390,600807) PREDICTED: arac ( 529) 1474 309.9 1.6e-83 NP_067641 (OMIM: 242100,606545,607206) hydroperoxi ( 711) 1382 291.2 8.9e-78 NP_001159432 (OMIM: 242100,606545,607206) hydroper ( 843) 1382 291.2 1e-77 NP_001130 (OMIM: 242100,603741) arachidonate 12-li ( 701) 1375 289.8 2.4e-77 XP_016880410 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 615) 1059 225.4 4.9e-58 XP_016880411 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 563) 894 191.8 5.9e-48 XP_016880412 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 539) 869 186.7 1.9e-46 XP_016880413 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 489) 735 159.4 2.9e-38 XP_016880414 (OMIM: 242100,606545,607206) PREDICTE ( 489) 735 159.4 2.9e-38 NP_001034219 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxy ( 647) 663 144.8 9.4e-34 NP_001243082 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 642) 569 125.7 5.4e-28 NP_001307790 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5- ( 645) 566 125.0 8.3e-28 NP_001034220 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxy ( 602) 410 93.3 2.8e-18 >>NP_000688 (OMIM: 152391) arachidonate 12-lipoxygenase, (663 aa) initn: 4613 init1: 4613 opt: 4613 Z-score: 5072.5 bits: 948.9 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4613; 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NP_000 GRSCWHLGAVWALSQFQENELFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLEAIVSVIAERNKK 600 610 620 630 640 650 650 660 pF1KE2 LDWPYEYLKPSCIENSVTI . :: ::.:. : :::.: NP_000 KQLPYYYLSPDRIPNSVAI 660 670 >>NP_001132 (OMIM: 603697) arachidonate 15-lipoxygenase (676 aa) initn: 1561 init1: 1000 opt: 1529 Z-score: 1679.4 bits: 321.1 E(85289): 8.4e-87 Smith-Waterman score: 1631; 38.0% identity (66.1% similar) in 682 aa overlap (1-663:1-676) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGRYRIRVATGAWLFSGSYNRVQLWLVGTRGEAE---LE-LQLRPARGEEEEFDHDVAED :...:.::.:: . .:....:.. .::::::. :. : . . : ::.:. . :: NP_001 MAEFRVRVSTGEAFGAGTWDKVSVSIVGTRGESPPLPLDNLGKEFTAGAEEDFQVTLPED 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 pF1KE2 LGLLQFVRLRKHHW-------LVDDAWFCDRITVQGPGACAEVAFPCYRWVQGEDILSLP .: . ..:..: :. ::::: . . : . ... ::::.:..: : : NP_001 VGRVLLLRVHKAPPVLPLLGPLAPDAWFCRWFQLTPPRG-GHLLFPCYQWLEGAGTLVLQ 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 EGTARLPGDNALDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEE ::::.. . ..:..:..::. ::..: : ... : : . .:: :... NP_001 EGTAKVSWADHHPVLQQQRQEELQARQEMYQWKAYNPGWPHCLDEKTVEDLELNIKYSTA 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 KRLDFEWTLKAGAL--EMALKRVYTLLSSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDEL : .: :.::. :: .: . . : :... .:: ... ::.. . ::.: . 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NP_001 DDGMQIWGAVERFVSEIIGIYYPSDESVQDDRELQAWVREIFSKGFLNQESSGIPSSLET 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 QSQLCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSL . : ...:: .:::.:.:::.. ::.: ::.:: : .:..::::.: .: ...: NP_001 REALVQYVTMVIFTCSAKHAAVSAGQFDSCAWMPNLPPSMQLPPPTSKGLATCEGFIATL 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 PDVRQACLQMAISWHLSRRQPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITAR : : .: . : ::.. :. ::: . ...:. :. . :.. : .. . : : NP_001 PPVNATCDVILALWLLSKEPGDQRPLGTYPDEHFTEEAPRRSIATFQSRLAQISRGIQER 600 610 620 630 640 650 650 660 pF1KE2 NEQLDWPYEYLKPSCIENSVTI :. : :: :: : :::::.: NP_001 NQGLVLPYTYLDPPLIENSVSI 660 670 >>NP_001243083 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lipo (617 aa) initn: 1336 init1: 504 opt: 1505 Z-score: 1653.6 bits: 316.2 E(85289): 2.3e-85 Smith-Waterman score: 1505; 42.4% identity (68.6% similar) in 564 aa overlap (1-548:1-559) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MGRYRIRVATGAWLFSGSYNRVQLWLVGTRGEAELELQLRP-----ARGEEEEFDHDVAE : : . ::::. :.:. . . : :::. : .: .: .: :: . .: : : NP_001 MPSYTVTVATGSQWFAGTDDYIYLSLVGSAGCSEKHLLDKPFYNDFERGAVDSYDVTVDE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 DLGLLQFVRLRKH-HWLVDDAWFCDRITVQGPGACAEVAFPCYRWVQGEDILSLPEGTAR .:: .:.::..:. .:: :: :. ::.. : . . ::::::. :. . : .: :. NP_001 ELGEIQLVRIEKRKYWLNDD-WYLKYITLKTPHG-DYIEFPCYRWITGDVEVVLRDGRAK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 LPGDNALDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEEKRLDF : :. . ....::.:::. ::. : : :. :.::.: : . ::: ...: :: .:: NP_001 LARDDQIHILKQHRRKELETRQKQYRWMEWNPGFPLSIDAKCHKDLPRDIQFDSEKGVDF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 EWTLKAGALEMALKRVYTLL-SSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDELFSYQFL . . . .. ..: . .. :::: . ::..:: .....:.: . ::.: .:.:::: NP_001 VLNYSKAMENLFINRFMHMFQSSWNDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDLMFGYQFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 NGANPMLLRRSTSLPSRLVLPSGMEEL----QAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANVI :: ::.:.:: : :: .: . . : : : .::.:.:.:..: .:: ::::: :: NP_001 NGCNPVLIRRCTELPEKLPVTTEMVECSLERQLSLEQEVQQGNIFIVDFELLDGIDANKT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 RGEK-QYLAAPLVMLKMEPNGKLQPMVIQI-QPPNPSSPTPTLFLPSDPPLAWLLAKSWV :.::::. .: . .:. :..::. : :. .: .::::: ::::: :: NP_001 DPCTLQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQIPGDENP---IFLPSDAKYDWLLAKIWV 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 RNSDFQLHEIQYHLLNTHLVAEVIAVATMRCLPGLHPIFKFLIPHIRYTMEINTRARTQL :.:::..:. ::: ::::.::...: .: ::..:::::.:. :.:.:. :::.:: :: NP_001 RSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQL 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 ISDGGIFDKAVSTGGGGHVQLLRRAAAQLTYCSLCPPDDLADRGLLG---LPGALYAHDA : . :.:::: .::::::::...:: .::: ::: :. . ::. . .: .: :. NP_001 ICECGLFDKANATGGGGHVQMVQRAMKDLTYASLCFPEAIKARGMESKEDIPYYFYRDDG 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 LRLWEIIARYVEGIVHLFYQRDDIVKGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQSQSQ : .:: : .. .: ..:. :..:. ::::: . .. :. .. ::: : .:. : NP_001 LLVWEAIRTFTAEVVDIYYEGDQVVEEDPELQDFVNDVYVYGMRGRKSSGFPKSVKSREQ 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 LCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPDV : ..::. .:: .:::::.: ::: NP_001 LSEYLTVVIFTASAQHAAVNFGQLFLGMYPEEHFIEKPVKEAMARFRKNLEAIVSVIAER 540 550 560 570 580 590 >>NP_001307791 (OMIM: 152390,600807) arachidonate 5-lipo (529 aa) initn: 1322 init1: 542 opt: 1474 Z-score: 1620.5 bits: 309.9 E(85289): 1.6e-83 Smith-Waterman score: 1474; 43.2% identity (69.8% similar) in 530 aa overlap (144-663:3-529) 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RLPGDNALDMFQKHREKELKDRQQIYCWATWKEGLPLTIAADRKDDLPPNMRFHEEKRLD :. :.::.: : . ::: ...: :: .: NP_001 MEWNPGFPLSIDAKCHKDLPRDIQFDSEKGVD 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FEWTLKAGALEMALKRVYTLL-SSWNCLEDFDQIFWGQKSALAEKVRQCWQDDELFSYQF : . . . .. ..: . .. :::: . ::..:: .....:.: . ::.: .:.::: NP_001 FVLNYSKAMENLFINRFMHMFQSSWNDFADFEKIFVKISNTISERVMNHWQEDLMFGYQF 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 pF1KE2 LNGANPMLLRRSTSLPSRLVLPSGMEEL----QAQLEKELQNGSLFEADFILLDGIPANV ::: ::.:.:: : :: .: . . : : : .::.:.:.:..: .:: ::::: :: NP_001 LNGCNPVLIRRCTELPEKLPVTTEMVECSLERQLSLEQEVQQGNIFIVDFELLDGIDANK 100 110 120 130 140 150 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 IRGEK-QYLAAPLVMLKMEPNGKLQPMVIQI-QPPNPSSPTPTLFLPSDPPLAWLLAKSW :.::::. .: . .:. :..::. : :. .: .::::: ::::: : NP_001 TDPCTLQFLAAPICLLYKNLANKIVPIAIQLNQIPGDENP---IFLPSDAKYDWLLAKIW 160 170 180 190 200 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 VRNSDFQLHEIQYHLLNTHLVAEVIAVATMRCLPGLHPIFKFLIPHIRYTMEINTRARTQ ::.:::..:. ::: ::::.::...: .: ::..:::::.:. :.:.:. :::.:: : NP_001 VRSSDFHVHQTITHLLRTHLVSEVFGIAMYRQLPAVHPIFKLLVAHVRFTIAINTKAREQ 210 220 230 240 250 260 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LISDGGIFDKAVSTGGGGHVQLLRRAAAQLTYCSLCPPDDLADRGLLG---LPGALYAHD :: . :.:::: .::::::::...:: .::: ::: :. . ::. . .: .: : NP_001 LICECGLFDKANATGGGGHVQMVQRAMKDLTYASLCFPEAIKARGMESKEDIPYYFYRDD 270 280 290 300 310 320 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 ALRLWEIIARYVEGIVHLFYQRDDIVKGDPELQAWCREITEVGLCQAQDRGFPVSFQSQS .: .:: : .. .: ..:. :..:. ::::: . .. :. .. ::: : .:. 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XP_016 GLLVWEAIRTFTAEVVDIYYEGDQVVEEDPELQDFVNDVYVYGMRGRKSSGFPKSVKSRE 330 340 350 360 370 380 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 QLCHFLTMCVFTCTAQHAAINQGQLDWYAWVPNAPCTMRMPPPTTKEDVTMATVMGSLPD :: ..::. .:: .:::::.: :: :: .:.:::: ::: ::::.: ::. .. .::: XP_016 QLSEYLTVVIFTASAQHAAVNFGQYDWCSWIPNAPPTMRAPPPTAKGVVTIEQIVDTLPD 390 400 410 420 430 440 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 VRQACLQMAISWHLSRRQPDMVPLGHHKEKYFSGPKPKAVLNQFRTDLEKLEKEITARNE ..: ... : ::. : . . :: . :..: : .. .:: .:: . . :. ::. 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