FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4157, 597 aa 1>>>pF1KE4157 597 - 597 aa - 597 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5859+/-0.000444; mu= 17.1541+/- 0.028 mean_var=76.6476+/-15.670, 0's: 0 Z-trim(110.0): 356 B-trim: 14 in 1/50 Lambda= 0.146496 statistics sampled from 17867 (18259) to 17867 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16 Scan time: 9.190 The best scores are: opt bits E(85289) NP_071324 (OMIM: 256850,605379) gigaxonin [Homo sa ( 597) 4047 865.7 0 XP_016879223 (OMIM: 256850,605379) PREDICTED: giga ( 384) 2651 570.5 3.6e-162 NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 835 186.8 1.8e-46 NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 835 186.8 1.8e-46 XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 816 182.8 2.7e-45 XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 801 179.6 2.7e-44 NP_001290038 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 467) 794 178.1 5.9e-44 NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 795 178.3 6e-44 XP_011508139 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 522) 794 178.1 6.5e-44 NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 795 178.4 7.2e-44 NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 795 178.4 7.5e-44 XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 795 178.4 7.8e-44 XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 795 178.4 7.8e-44 XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 786 176.5 2.9e-43 XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 786 176.5 2.9e-43 XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 786 176.5 2.9e-43 NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 781 175.4 4.8e-43 XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 782 175.7 5.3e-43 XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 782 175.7 5.3e-43 XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 782 175.7 5.3e-43 NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 773 173.7 1.8e-42 NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 769 172.9 3.3e-42 XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 766 172.2 4.2e-42 NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 766 172.3 5.2e-42 NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 761 171.1 8.5e-42 NP_067646 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 iso ( 568) 752 169.2 3.3e-41 NP_001289980 (OMIM: 614522) kelch-like protein 12 ( 606) 752 169.3 3.4e-41 XP_011508137 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 623) 752 169.3 3.5e-41 NP_001154994 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 505) 743 167.3 1.1e-40 XP_016863165 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 505) 743 167.3 1.1e-40 NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 734 165.5 5.4e-40 XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 718 162.0 4.1e-39 XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 718 162.0 4.4e-39 NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 696 157.4 1.3e-37 XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 695 157.2 1.3e-37 XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_005247612 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 694 157.0 1.7e-37 NP_001244124 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 505) 693 156.7 1.7e-37 NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 690 156.2 3.3e-37 NP_001317953 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 496) 680 154.0 1.1e-36 XP_011529878 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 496) 680 154.0 1.1e-36 NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 679 153.8 1.5e-36 NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 679 153.9 1.6e-36 >>NP_071324 (OMIM: 256850,605379) gigaxonin [Homo sapien (597 aa) initn: 4047 init1: 4047 opt: 4047 Z-score: 4624.2 bits: 865.7 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4047; 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NP_001 MEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKN-SSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 -PRGYSECIVTVGGEERVSRKPTAAMRCMCPLYDPNRQLWIELAPLSMPRINHGVLSAEG : . . .:.:::. : : : :: ... : ..: : : :.. : NP_001 TPMNLPKLMVVVGGQA-----PKAIRSVEC--YDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAG 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KE4 FLFVFGGQDENKQTLSSGEKYDPDANTWTALPPMNEARHNFGIVEIDGMLYILGGEDGEK ..:. :: . .. . . ..::: . ::.. : . : ..: . ..:.:: .:: :: NP_001 LVFAVGGFN-GSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGST 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 ELISMECYDIYSKTWTKQPDLTMVRKIGCYAAMKKKIYAMGG--GSYGKLFESVECYDPR : :.: :.: :. : . .. :. ... .::.:: :. . . .::::. 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NP_001 MFT-SELSEKGKPY-VDIQGLTASTMEILLDFVYTETVHVTVENVQELLPAACLLQLKGV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 KTLCCEFLEGCIAAENCIGIRDFA-LHYCLHHVHYLATEYLETHFRDVSSTEEFLELSPQ : ::::::. . ::.:::::: : :. . : . . :: .: . :::. :: NP_001 KQACCEFLESQLDPSNCLGIRDFAETHNCVD-LMQAAEVFSQKHFPEVVQHEEFILLSQG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 KLKEVISLEKLNVGNERYVFEAVIRWIAHDTEIRKVHMKDVMSALWVSGLDSSYLREQML .....:. ....: .:. :::::: :. : . :. . .... . . : :. . . NP_001 EVEKLIKCDEIQVDSEEPVFEAVINWVKHAKKEREESLPNLLQYVRMPLLTPRYITDVID 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 NEPLVR------EIVKECSNIPLSQPQQGEAMLANFKPRGYSECIVTVGGEERVSRKPTA ::..: ..: : ... : .:. .... . . :. . : . :: . ::. :. NP_001 AEPFIRCSLQCRDLVDEAKKFHL-RPEL-RSQMQGPRTRARLDMIYVSGGFDG-SRRHTS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 AMRCMCPLYDPNRQLWIELAPLSMPRINHGVLSAEGFLFVFGGQDENKQTLSSGEKYDPD : :::: . : :. .. : . :.. : : .. .:: : . . :.: ::::: NP_001 MER-----YDPNIDQWSMLGDMQTAREGAGLVVASGVIYCLGGYD-GLNILNSVEKYDPH 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 ANTWTALPPMNEARHNFGIVEIDGMLYILGGEDGEKELISMECYDIYSKTWTKQPDLTMV .. :: . :: : . :.. .. .:..:: :: .: :.: :.: . .:: ..: NP_001 TGHWTNVTPMATKRSGAGVALLNDHIYVVGGFDGTAHLSSVEAYNIRTDSWTTVTSMTTP 350 360 370 380 390 400 420 430 440 450 460 pF1KE4 RKIGCYAA---MKKKIYAMGGGSYGKLFESVECYDPRTQQWTAICPLKERRFGAVACGVA : ::.. .. ..::..: . ..:. :.::::: ..: .. . .: : .: NP_001 R---CYVGATVLRGRLYAIAGYDGNSLLSSIECYDPIIDSWEVVTSMGTQRCDAGVCVLR 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 MELYVFGGVRSREDAQGSEMVTCKSEFYHDEFKRWIYLNDQNLCIPASSSFVYGAVPIGA NP_001 EK >>NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isofo (568 aa) initn: 676 init1: 326 opt: 795 Z-score: 910.0 bits: 178.3 E(85289): 6e-44 Smith-Waterman score: 796; 26.2% identity (60.9% similar) in 573 aa overlap (12-575:15-566) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MAEGSAVSDPQHAARLLRALSSFREESRFCDAHLVLDGEEIPVQKNILAAASPYIRT :: . .. . .. .....::. :: ..::... .:...: :. . 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