Result of FASTA (omim) for
pFN21AE2402
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2402, 694 aa
1>>>pF1KE2402 694 - 694 aa - 694 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.6398+/-0.000358; mu= -2.1129+/- 0.022
mean_var=414.0149+/-85.455, 0's: 0 Z-trim(125.9): 25 B-trim: 2688 in 1/61
Lambda= 0.063033
statistics sampled from 50532 (50570) to 50532 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.837), E-opt: 0.2 (0.593), width: 16
Scan time: 15.580
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001093254 (OMIM: 609085) F-box/LRR-repeat prote ( 694) 4972 466.5 1.6e-130
NP_001269280 (OMIM: 609085) F-box/LRR-repeat prote ( 382) 2679 257.7 6.2e-68
NP_001005366 (OMIM: 609078) lysine-specific demeth (1265) 1337 136.2 7.5e-31
XP_005254018 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec ( 776) 1289 131.6 1.1e-29
XP_011537177 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec ( 779) 1289 131.6 1.1e-29
XP_005254013 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1299) 1289 131.8 1.6e-29
XP_005254012 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1305) 1289 131.8 1.6e-29
NP_115979 (OMIM: 609078) lysine-specific demethyla (1336) 1289 131.9 1.6e-29
XP_011537170 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1339) 1289 131.9 1.6e-29
XP_011537171 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1337) 1278 130.9 3.2e-29
XP_011537169 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-spec (1353) 1278 130.9 3.2e-29
NP_001243334 (OMIM: 605657) lysine-specific demeth ( 723) 1016 106.7 3.2e-22
XP_011543163 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec ( 856) 1016 106.8 3.5e-22
XP_006718543 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1067) 1016 106.9 4.1e-22
XP_011543162 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1134) 1016 107.0 4.3e-22
XP_016872880 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145) 1016 107.0 4.3e-22
XP_016872881 (OMIM: 605657) PREDICTED: lysine-spec (1145) 1016 107.0 4.3e-22
NP_036440 (OMIM: 605657) lysine-specific demethyla (1162) 1016 107.0 4.3e-22
>>NP_001093254 (OMIM: 609085) F-box/LRR-repeat protein 1 (694 aa)
initn: 4972 init1: 4972 opt: 4972 Z-score: 2464.5 bits: 466.5 E(85289): 1.6e-130
Smith-Waterman score: 4972; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 KFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 VHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 KLTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVKGGRERHLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVKGGRERHLKK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 VGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASAEGPAVPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASAEGPAVPSP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEARNGRRPARGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEARNGRRPARGS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 SGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 DHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 VRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLDLR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 WIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQLS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE2 ALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE2 SCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS
670 680 690
>>NP_001269280 (OMIM: 609085) F-box/LRR-repeat protein 1 (382 aa)
initn: 2679 init1: 2679 opt: 2679 Z-score: 1340.7 bits: 257.7 E(85289): 6.2e-68
Smith-Waterman score: 2679; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (313-694:1-382)
290 300 310 320 330 340
pF1KE2 EKPKPPLASAEGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLS
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLS
10 20 30
350 360 370 380 390 400
pF1KE2 EDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVV
40 50 60 70 80 90
410 420 430 440 450 460
pF1KE2 RPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWP
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510 520
pF1KE2 RMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLS
160 170 180 190 200 210
530 540 550 560 570 580
pF1KE2 VSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGL
220 230 240 250 260 270
590 600 610 620 630 640
pF1KE2 ELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTD
280 290 300 310 320 330
650 660 670 680 690
pF1KE2 HCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS
340 350 360 370 380
>>NP_001005366 (OMIM: 609078) lysine-specific demethylas (1265 aa)
initn: 2054 init1: 1232 opt: 1337 Z-score: 674.9 bits: 136.2 E(85289): 7.5e-31
Smith-Waterman score: 2086; 46.3% identity (69.7% similar) in 707 aa overlap (8-675:555-1247)
10 20 30
pF1KE2 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRT
::. ::.. . . .. ::::::::
NP_001 ADDDPSLAITGVPVVTWPKKTPKNRAVGRPKGKLGPASAVKLAANRTT----AGARRRRT
530 540 550 560 570 580
40 50 60 70 80 90
pF1KE2 RCRRCRACVRTECGDCHFCRDMKKFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKE
:::.:.::.:::::.::::.:::::::::::::::..::: :::::::::::.:::::::
NP_001 RCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKE
590 600 610 620 630 640
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 DTVEGEEEKFGLSLMECTICNEIVHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKD
:::: :: ::.: ::::.:::::.::::::. ..:::.: :.:::::::.:.. :.:.:.
NP_001 DTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCLKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQ
650 660 670 680 690 700
160 170 180 190 200
pF1KE2 SGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGP------PPEDVP--
. .::: . :.: .:: . :.... : .:.. .: . ::
NP_001 K-RGPGFKYASNLP--GSLLKEQKMNRDNKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPD
710 720 730 740 750
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 GPPKRK------EREAGNEPP---TPRKKVKGGRERHLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLP
: .:: ... : : . ::..: :.: .: . . : . . :
NP_001 GLLRRKSDDVHLRKKRKYEKPQELSGRKRLKPGKEDKLFR-KKRRSWKNAEDRMALANKP
760 770 780 790 800 810
270 280 290 300 310
pF1KE2 PRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPK---------PPLASAEGPAVPSPSPQREKLERF-
: .. : . : ::.. :. . : .:::: . .:.: .:.
NP_001 LRRFK--QEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRK-RRLP
820 830 840 850 860 870
320 330 340 350 360
pF1KE2 -KRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEARN---G--RRPARGSSGEK
:.. . : . . . .... .... :: :. :: . : .:: : :.: .
NP_001 NKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGICERPHRFSKGLN
880 890 900 910 920 930
370 380 390 400 410
pF1KE2 ENRGGRRAVRPGSGGPLLSWP-LGPAPPPR--PP---QLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAA
: : .: : : : : . ::: :: :.::::.:::: :: ::.:::
NP_001 ---GTPRELRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDD
940 950 960 970 980 990
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 GSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLS
:. : . : .:. ::..:. ..::.::::::::.::: ::::: :.::.. ::.:: :::
NP_001 GAAHVMHREVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCKSITPLMLS
1000 1010 1020 1030 1040 1050
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 GVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLD
:..:::: .::::::..::::: ::.::: ::..::::::::..:::: :. : :: ::
NP_001 GIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLD
1060 1070 1080 1090 1100 1110
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQ
..:.: .::.:.:.:: :: :..::: ..:..:....:::::::..:::::::..:: :
NP_001 VQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 LSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLD
:: : ::.: :: : :..:::: . :..:...::. :...::.:: .:.:: . ..:
NP_001 LSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHID
1180 1190 1200 1210 1220 1230
660 670 680 690
pF1KE2 LRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS
:: :.:.. :.: .. :
NP_001 LRYCKQVTKEGCEQFIAEMSSFQGRSCSTTRLGDE
1240 1250 1260
>>XP_005254018 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-specific (776 aa)
initn: 2017 init1: 1232 opt: 1289 Z-score: 653.8 bits: 131.6 E(85289): 1.1e-29
Smith-Waterman score: 2019; 44.9% identity (65.9% similar) in 735 aa overlap (36-694:50-776)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMKKFGGP
:::::.:.::.:::::.::::.::::::::
XP_005 RAVGRPKGKLGPASAVKLAANRTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGP
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 GRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEIVHPGC
:::::::..::: :::::::::::.::::::::::: :: ::.: ::::.:::::.::::
XP_005 GRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGC
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 LKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEE
::. ..:::.: :.:::::::.:.. :.:.:.. .::: . :.: .:: . :....
XP_005 LKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQK-RGPGFKYASNLP--GSLLKEQKMNRD
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230
pF1KE2 PPLPPPPPRRKGPLPAGP----PPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVK-------GGR
: .:.. .: .. :: :. ... ::: : .::
XP_005 NKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPDGLLRRKSDDVHL-RKKRKYEKPQELSGR
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ER--HLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASA
.: :. :.. : : : .: : . . .. .:: . ..: . .:
XP_005 KRASSLQTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNA
260 270 280 290 300 310
300 310 320 330 340 350
pF1KE2 EGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQ-LLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEA-
: . . .: :.:::. . : ..: . :. : :.: ..: : :.: :
XP_005 EDRMALANKP----LRRFKQEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKK
320 330 340 350 360 370
360 370
pF1KE2 ----RNGRR-------------------------------PARG---SSGEKENRGGRRA
: :: : .. : ::. .:
XP_005 KVKMRRKRRLPNKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGIC
380 390 400 410 420 430
380 390 400 410
pF1KE2 VRPG------SGGPL-LSWPLGPA----------PPPR--PP---QLERHVVRPPPRSPE
:: .: : : :::. ::: :: :.::::.:::: ::
XP_005 ERPHRFSKGLNGTPRELRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPP
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KE2 PDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRK
::.::: :. : . : .:. ::..:. ..::.::::::::.::: ::::: :.::.. :
XP_005 PDSLPLDDGAAHVMHREVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCK
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KE2 SLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAP
:.:: ::::..:::: .::::::..::::: ::.::: ::..::::::::..:::: :.
XP_005 SITPLMLSGIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KE2 LPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLR
: :: ::..:.: .::.:.:.:: :: :..::: ..:..:....:::::::..::::::
XP_005 CPLLRTLDVQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630 640 650
pF1KE2 LLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRR
:..:: : :: : ::.: :: : :..:::: . :..:...::. :...::.:: .:.:
XP_005 LIIRHMPLLSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKR
680 690 700 710 720 730
660 670 680 690
pF1KE2 CPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPG-PFRCPEEKLLLKDS
: . ..::: :.:.. :.: .. : . : ::::: : :
XP_005 CGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS
740 750 760 770
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360 370
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380 390 400 410
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.:: ::::..:::: .::::::..::::: ::.::: ::..::::::::..:::: :.
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: :: ::..:.: .::.:.:.:: :: :..::: ..:..:....:::::::..:::::::
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..:: : :: : ::.: :: : :..:::: . :..:...::. :...::.:: .:.::
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. ..::: :.:.. :.: .. : . : ::::: : :
XP_011 GNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS
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>>XP_005254013 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-specific (1299 aa)
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pF1KE2 LKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEE
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XP_005 NKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPDGLLRRKSDDVHL-RKKRKYEKPQELSGR
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XP_005 KRASSLQTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNA
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: :: ::..:.: .::.:.:.:: :: :..::: ..:..:....:::::::..::::::
XP_005 CPLLRTLDVQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLR
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XP_005 CGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS
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>>XP_005254012 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-specific (1305 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE2 PGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMKKFGGP
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XP_005 RAVGRPKGKLGPASAVKLAANRTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGP
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pF1KE2 GRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEIVHPGC
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XP_005 GRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGC
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pF1KE2 LKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEE
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XP_005 LKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQK-RGPGFKYASNLP--GSLLKEQKMNRD
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pF1KE2 PPLPPPPPRRKGPLPAGP----PPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVK-------GGR
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XP_005 NKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPDGLLRRKSDDVHL-RKKRKYEKPQELSGR
730 740 750 760 770 780
240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ER--HLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASA
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XP_005 KRASSLQTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNA
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pF1KE2 EGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQ-LLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEA-
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XP_005 EDRMALANKP----LRRFKQEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKK
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pF1KE2 ----RNGRR-------------------------------PARG---SSGEKENRGGRRA
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XP_005 KVKMRRKRRLPNKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGIC
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pF1KE2 VRPG------SGGPL-LSWPLGPA----------PPPR--PP---QLERHVVRPPPRSPE
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pF1KE2 PDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRK
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XP_005 CGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS
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>>NP_115979 (OMIM: 609078) lysine-specific demethylase 2 (1336 aa)
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pF1KE2 PGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMKKFGGP
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NP_115 RAVGRPKGKLGPASAVKLAANRTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGP
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pF1KE2 GRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEIVHPGC
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NP_115 GRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGC
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pF1KE2 LKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEE
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NP_115 LKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQK-RGPGFKYASNLP--GSLLKEQKMNRD
700 710 720 730 740 750
190 200 210 220 230
pF1KE2 PPLPPPPPRRKGPLPAGP----PPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVK-------GGR
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NP_115 NKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPDGLLRRKSDDVHL-RKKRKYEKPQELSGR
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240 250 260 270 280 290
pF1KE2 ER--HLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASA
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NP_115 KRASSLQTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNA
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pF1KE2 EGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQ-LLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEA-
: . . .: :.:::. . : ..: . :. : :.: ..: : :.: :
NP_115 EDRMALANKP----LRRFKQEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKK
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360 370
pF1KE2 ----RNGRR-------------------------------PARG---SSGEKENRGGRRA
: :: : .. : ::. .:
NP_115 KVKMRRKRRLPNKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGIC
940 950 960 970 980 990
380 390 400 410
pF1KE2 VRPG------SGGPL-LSWPLGPA----------PPPR--PP---QLERHVVRPPPRSPE
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NP_115 ERPHRFSKGLNGTPRELRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPP
1000 1010 1020 1030 1040 1050
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pF1KE2 PDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRK
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NP_115 PDSLPLDDGAAHVMHREVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCK
1060 1070 1080 1090 1100 1110
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pF1KE2 SLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAP
:.:: ::::..:::: .::::::..::::: ::.::: ::..::::::::..:::: :.
NP_115 SITPLMLSGIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSS
1120 1130 1140 1150 1160 1170
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pF1KE2 LPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLR
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NP_115 CPLLRTLDVQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLR
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pF1KE2 LLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRR
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NP_115 LIIRHMPLLSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKR
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NP_115 CGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS
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>>XP_011537170 (OMIM: 609078) PREDICTED: lysine-specific (1339 aa)
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]