FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2402, 694 aa 1>>>pF1KE2402 694 - 694 aa - 694 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7814+/-0.000877; mu= -2.4876+/- 0.053 mean_var=364.7954+/-75.004, 0's: 0 Z-trim(118.1): 20 B-trim: 205 in 1/54 Lambda= 0.067151 statistics sampled from 18900 (18920) to 18900 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.837), E-opt: 0.2 (0.581), width: 16 Scan time: 5.100 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45465.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 ( 694) 4972 495.6 1e-139 CCDS73873.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 ( 382) 2679 273.2 5e-73 CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1265) 1337 143.7 1.6e-33 CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1336) 1289 139.0 4.2e-32 CCDS58148.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 ( 723) 1016 112.3 2.5e-24 CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (1162) 1016 112.5 3.5e-24 >>CCDS45465.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 (694 aa) initn: 4972 init1: 4972 opt: 4972 Z-score: 2621.8 bits: 495.6 E(32554): 1e-139 Smith-Waterman score: 4972; 100.0% identity (100.0% similar) in 694 aa overlap (1-694:1-694) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 KFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 KFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEI 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 VHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGW 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 KLTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVKGGRERHLKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 KLTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVKGGRERHLKK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 VGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASAEGPAVPSP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 VGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASAEGPAVPSP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 SPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEARNGRRPARGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 SPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEARNGRRPARGS 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 SGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 SGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGS 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 DHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 DHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGV 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 VRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLDLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 VRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLDLR 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 WIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 WIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQLS 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 ALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 ALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLR 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 SCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS :::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS45 SCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS 670 680 690 >>CCDS73873.1 FBXL19 gene_id:54620|Hs108|chr16 (382 aa) initn: 2679 init1: 2679 opt: 2679 Z-score: 1424.6 bits: 273.2 E(32554): 5e-73 Smith-Waterman score: 2679; 100.0% identity (100.0% similar) in 382 aa overlap (313-694:1-382) 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 EKPKPPLASAEGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLS :::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 MCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLS 10 20 30 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 EDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 EDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLERHVV 40 50 60 70 80 90 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 RPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 RPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWP 100 110 120 130 140 150 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 RMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 RMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLS 160 170 180 190 200 210 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 VSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 VSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGL 220 230 240 250 260 270 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 ELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 ELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTD 280 290 300 310 320 330 650 660 670 680 690 pF1KE2 HCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS73 HCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS 340 350 360 370 380 >>CCDS41849.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1265 aa) initn: 2054 init1: 1232 opt: 1337 Z-score: 715.2 bits: 143.7 E(32554): 1.6e-33 Smith-Waterman score: 2086; 46.3% identity (69.7% similar) in 707 aa overlap (8-675:555-1247) 10 20 30 pF1KE2 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRT ::. ::.. . . .. :::::::: CCDS41 ADDDPSLAITGVPVVTWPKKTPKNRAVGRPKGKLGPASAVKLAANRTT----AGARRRRT 530 540 550 560 570 580 40 50 60 70 80 90 pF1KE2 RCRRCRACVRTECGDCHFCRDMKKFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKE :::.:.::.:::::.::::.:::::::::::::::..::: :::::::::::.::::::: CCDS41 RCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGPGRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKE 590 600 610 620 630 640 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 DTVEGEEEKFGLSLMECTICNEIVHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKD :::: :: ::.: ::::.:::::.::::::. ..:::.: :.:::::::.:.. :.:.:. CCDS41 DTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGCLKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQ 650 660 670 680 690 700 160 170 180 190 200 pF1KE2 SGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGP------PPEDVP-- . .::: . :.: .:: . :.... : .:.. .: . :: CCDS41 K-RGPGFKYASNLP--GSLLKEQKMNRDNKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPD 710 720 730 740 750 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 GPPKRK------EREAGNEPP---TPRKKVKGGRERHLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLP : .:: ... : : . ::..: :.: .: . . : . . : CCDS41 GLLRRKSDDVHLRKKRKYEKPQELSGRKRLKPGKEDKLFR-KKRRSWKNAEDRMALANKP 760 770 780 790 800 810 270 280 290 300 310 pF1KE2 PRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPK---------PPLASAEGPAVPSPSPQREKLERF- : .. : . : ::.. :. . : .:::: . .:.: .:. CCDS41 LRRFK--QEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKKKVKMRRK-RRLP 820 830 840 850 860 870 320 330 340 350 360 pF1KE2 -KRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEARN---G--RRPARGSSGEK :.. . : . . . .... .... :: :. :: . : .:: : :.: . CCDS41 NKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGICERPHRFSKGLN 880 890 900 910 920 930 370 380 390 400 410 pF1KE2 ENRGGRRAVRPGSGGPLLSWP-LGPAPPPR--PP---QLERHVVRPPPRSPEPDTLPLAA : : .: : : : : . ::: :: :.::::.:::: :: ::.::: CCDS41 ---GTPRELRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPPPDSLPLDD 940 950 960 970 980 990 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 GSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRKSLTPPMLS :. : . : .:. ::..:. ..::.::::::::.::: ::::: :.::.. ::.:: ::: CCDS41 GAAHVMHREVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCKSITPLMLS 1000 1010 1020 1030 1040 1050 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 GVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAPLPALRLLD :..:::: .::::::..::::: ::.::: ::..::::::::..:::: :. : :: :: CCDS41 GIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSSCPLLRTLD 1060 1070 1080 1090 1100 1110 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 LRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLRLLLRHAPQ ..:.: .::.:.:.:: :: :..::: ..:..:....:::::::..:::::::..:: : CCDS41 VQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLRLIIRHMPL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 LSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRRCPRLRRLD :: : ::.: :: : :..:::: . :..:...::. :...::.:: .:.:: . ..: CCDS41 LSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKRCGNICHID 1180 1190 1200 1210 1220 1230 660 670 680 690 pF1KE2 LRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRCPEEKLLLKDS :: :.:.. :.: .. : CCDS41 LRYCKQVTKEGCEQFIAEMSSFQGRSCSTTRLGDE 1240 1250 1260 >>CCDS41850.1 KDM2B gene_id:84678|Hs108|chr12 (1336 aa) initn: 2017 init1: 1232 opt: 1289 Z-score: 689.8 bits: 139.0 E(32554): 4.2e-32 Smith-Waterman score: 2019; 44.9% identity (65.9% similar) in 735 aa overlap (36-694:610-1336) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 PGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRCRACVRTECGDCHFCRDMKKFGGP :::::.:.::.:::::.::::.:::::::: CCDS41 RAVGRPKGKLGPASAVKLAANRTTAGARRRRTRCRKCEACLRTECGECHFCKDMKKFGGP 580 590 600 610 620 630 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 GRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEGEEEKFGLSLMECTICNEIVHPGC :::::::..::: :::::::::::.::::::::::: :: ::.: ::::.:::::.:::: CCDS41 GRMKQSCIMRQCIAPVLPHTAVCLVCGEAGKEDTVEEEEGKFNLMLMECSICNEIIHPGC 640 650 660 670 680 690 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 LKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGPGRRRADNGEEGASLGSGWKLTEE ::. ..:::.: :.:::::::.:.. :.:.:.. .::: . :.: .:: . :.... CCDS41 LKIKESEGVVNDELPNCWECPKCNHAGKTGKQK-RGPGFKYASNLP--GSLLKEQKMNRD 700 710 720 730 740 750 190 200 210 220 230 pF1KE2 PPLPPPPPRRKGPLPAGP----PPEDVPGPPKRKEREAGNEPPTPRKKVK-------GGR : .:.. .: .. :: :. ... ::: : .:: CCDS41 NKEGQEPAKRRSECEEAPRRRSDEHSKKVPPDGLLRRKSDDVHL-RKKRKYEKPQELSGR 760 770 780 790 800 810 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 ER--HLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPPENWEKPKPPLASA .: :. :.. : : : .: : . . .. .:: . ..: . .: CCDS41 KRASSLQTSPGSSSHLSPRPPLGSSLSPWWRSSLTYFQQQLKPGKEDKLFRKKRRSWKNA 820 830 840 850 860 870 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 EGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQ-LLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSGTSLSEDEAPGEA- : . . .: :.:::. . : ..: . :. : :.: ..: : :.: : CCDS41 EDRMALANKP----LRRFKQEPEDELPEAPPKTRESDHSRSSSPTAGPSTEGAEGPEEKK 880 890 900 910 920 930 360 370 pF1KE2 ----RNGRR-------------------------------PARG---SSGEKENRGGRRA : :: : .. : ::. .: CCDS41 KVKMRRKRRLPNKELSRELSKELNHEIQRTENSLANENQQPIKSEPESEGEEPKRPPGIC 940 950 960 970 980 990 380 390 400 410 pF1KE2 VRPG------SGGPL-LSWPLGPA----------PPPR--PP---QLERHVVRPPPRSPE :: .: : : :::. ::: :: :.::::.:::: :: CCDS41 ERPHRFSKGLNGTPRELRHQLGPSLRSPPRVISRPPPSVSPPKCIQMERHVIRPPPISPP 1000 1010 1020 1030 1040 1050 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 PDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDKRLWPRMDLSRRK ::.::: :. : . : .:. ::..:. ..::.::::::::.::: ::::: :.::.. : CCDS41 PDSLPLDDGAAHVMHREVWMAVFSYLSHQDLCVCMRVCRTWNRWCCDKRLWTRIDLNHCK 1060 1070 1080 1090 1100 1110 480 490 500 510 520 530 pF1KE2 SLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGCSWLSVSALGSAP :.:: ::::..:::: .::::::..::::: ::.::: ::..::::::::..:::: :. CCDS41 SITPLMLSGIIRRQPVSLDLSWTNISKKQLSWLINRLPGLRDLVLSGCSWIAVSALCSSS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 LPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELRLAGLELTDASLR : :: ::..:.: .::.:.:.:: :: :..::: ..:..:....:::::::..:::::: CCDS41 CPLLRTLDVQWVEGLKDAQMRDLLSPPTDNRPGQMDNRSKLRNIVELRLAGLDITDASLR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 600 610 620 630 640 650 pF1KE2 LLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCHRLTDHCLPLFRR :..:: : :: : ::.: :: : :..:::: . :..:...::. :...::.:: .:.: CCDS41 LIIRHMPLLSKLHLSYCNHVTDQSINLLTAVGTTTRDSLTEINLSDCNKVTDQCLSFFKR 1240 1250 1260 1270 1280 1290 660 670 680 690 pF1KE2 CPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPG-PFRCPEEKLLLKDS : . ..::: :.:.. :.: .. : . : ::::: : : CCDS41 CGNICHIDLRYCKQVTKEGCEQFIAEMSVSVQFGQVEEKLLQKLS 1300 1310 1320 1330 >>CCDS58148.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (723 aa) initn: 1528 init1: 600 opt: 1016 Z-score: 550.3 bits: 112.3 E(32554): 2.5e-24 Smith-Waterman score: 1615; 38.9% identity (63.5% similar) in 687 aa overlap (13-694:106-723) 10 20 30 40 pF1KE2 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRC :. ::: ... .::::::.:::.: CCDS58 QWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKC 80 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 RACVRTECGDCHFCRDMKKFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEG .:::. ::: ::.:::::::::::::::::.:::: :: :::...: ::::. ... .. CCDS58 KACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQD 140 150 160 170 180 190 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 EEEKFGLSLMECTICNEIVHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGP :.: :::: :::::::::::.: .::..: :.:::::::.: :: ::.: CCDS58 FEKK----LMECCICNEIVHPGCLQMD-GEGLLNEELPNCWECPKCYQE-----DSSEKA 200 210 220 230 240 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GRRRADNGEEGASLGSGWK--LTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAG .:. ....: : .. . . . :: ::: . : : . : :. :: CCDS58 QKRKMEESDEEAVQAKVLRPLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAG 250 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 pF1KE2 -NEPPTPRKKVKGGRERHLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPP .. . . . :.. :. . . ..: .. . : . :. . .. . . CCDS58 PSDHHSASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREKENNPSG---KKELSEVEK-AKIRGSYLT 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ENWEKPKPPL-ASAEGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSG . ..: : ... : . . . . .:.. :. :... : . . .: . : CCDS58 VTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRHSPRV--LVQHCPARTPQRGDEE------G 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 TSLSEDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLE . :.: : .. .:.... ..:: :: CCDS58 LGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRG--------------SWAQD----------- 420 430 440 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 RHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDK :.. . : .:. ::..:. :::: :::::.:: .:: :: CCDS58 --------------------GDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDK 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 RLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGC ::: ..:::: :...: :::...::: .::::::..::::: ::.::: ::..:.:.:: CCDS58 RLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGC 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 SWLSVSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELR :: .::::... : :: ::::: .:: :.:.:: :: : :::: ..:..:......: CCDS58 SWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPAD-KPGQ-DNRSKLRNMTDFR 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 LAGLELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCH ::::..:::.:::..:: : :: ::::::.:. : : .:::: : : .:..::.:::. CCDS58 LAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCN 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 RLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRC-PEEKLLLKDS .:::. : .:: . .:::.:.:.. .:: .. . . . : .:::. : : CCDS58 KLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS 670 680 690 700 710 720 >>CCDS44657.1 KDM2A gene_id:22992|Hs108|chr11 (1162 aa) initn: 1528 init1: 600 opt: 1016 Z-score: 547.6 bits: 112.5 E(32554): 3.5e-24 Smith-Waterman score: 1615; 38.9% identity (63.5% similar) in 687 aa overlap (13-694:545-1162) 10 20 30 40 pF1KE2 MGMKVPGKGESGPSALLTPPMSSSSRGPGAGARRRRTRCRRC :. ::: ... .::::::.:::.: CCDS44 QWPKRDKLKFPTRPKVRVPTIPITKPHTMKPAPRLTPVRPAAASPIVSGARRRRVRCRKC 520 530 540 550 560 570 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 RACVRTECGDCHFCRDMKKFGGPGRMKQSCLLRQCTAPVLPHTAVCLLCGEAGKEDTVEG .:::. ::: ::.:::::::::::::::::.:::: :: :::...: ::::. ... .. CCDS44 KACVQGECGVCHYCRDMKKFGGPGRMKQSCVLRQCLAPRLPHSVTCSLCGEVDQNEETQD 580 590 600 610 620 630 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 EEEKFGLSLMECTICNEIVHPGCLKMGKAEGVINAEIPNCWECPRCTQEGRTSKDSGEGP :.: :::: :::::::::::.: .::..: :.:::::::.: :: ::.: CCDS44 FEKK----LMECCICNEIVHPGCLQMD-GEGLLNEELPNCWECPKCYQE-----DSSEKA 640 650 660 670 680 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GRRRADNGEEGASLGSGWK--LTEEPPLPPPPPRRKGPLPAGPPPEDVPGPPKRKEREAG .:. ....: : .. . . . :: ::: . : : . : :. :: CCDS44 QKRKMEESDEEAVQAKVLRPLRSCDEPLTPPPHSPTSMLQLIHDPVSPRGMVTRSSPGAG 690 700 710 720 730 740 230 240 250 260 270 pF1KE2 -NEPPTPRKKVKGGRERHLKKVGGDACLLRGSDPGGPGLLPPRVLNPSQAFSSCHPGLPP .. . . . :.. :. . . ..: .. . : . :. . .. . . CCDS44 PSDHHSASRDERFKRRQLLRLQATERTMVREKENNPSG---KKELSEVEK-AKIRGSYLT 750 760 770 780 790 800 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 ENWEKPKPPL-ASAEGPAVPSPSPQREKLERFKRMCQLLERVPDTSSSSSDSDSDSDSSG . ..: : ... : . . . . .:.. :. :... : . . .: . : CCDS44 VTLQRPTKELHGTSIVPKLQAITASSANLRHSPRV--LVQHCPARTPQRGDEE------G 810 820 830 840 850 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 TSLSEDEAPGEARNGRRPARGSSGEKENRGGRRAVRPGSGGPLLSWPLGPAPPPRPPQLE . :.: : .. .:.... ..:: :: CCDS44 LGGEEEEEEEEEEEDDSAEEGGAARLNGRG--------------SWAQD----------- 860 870 880 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 RHVVRPPPRSPEPDTLPLAAGSDHPLPRAAWLRVFQHLGPRELCICMRVCRTWSRWCYDK :.. . : .:. ::..:. :::: :::::.:: .:: :: CCDS44 --------------------GDESWMQREVWMSVFRYLSRRELCECMRVCKTWYKWCCDK 890 900 910 920 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 RLWPRMDLSRRKSLTPPMLSGVVRRQPRALDLSWTGVSKKQLMWLLNRLQGLQELVLSGC ::: ..:::: :...: :::...::: .::::::..::::: ::.::: ::..:.:.:: CCDS44 RLWTKIDLSRCKAIVPQALSGIIKRQPVSLDLSWTNISKKQLTWLVNRLPGLKDLLLAGC 930 940 950 960 970 980 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 SWLSVSALGSAPLPALRLLDLRWIEDVKDSQLRELLLPPPDTKPGQTESRGRLQGVAELR :: .::::... : :: ::::: .:: :.:.:: :: : :::: ..:..:......: CCDS44 SWSAVSALSTSSCPLLRTLDLRWAVGIKDPQIRDLLTPPAD-KPGQ-DNRSKLRNMTDFR 990 1000 1010 1020 1030 1040 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 LAGLELTDASLRLLLRHAPQLSALDLSHCAHVGDPSVHLLTAPTSPLRETLVHLNLAGCH ::::..:::.:::..:: : :: ::::::.:. : : .:::: : : .:..::.:::. CCDS44 LAGLDITDATLRLIIRHMPLLSRLDLSHCSHLTDQSSNLLTAVGSSTRYSLTELNMAGCN 1050 1060 1070 1080 1090 1100 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 RLTDHCLPLFRRCPRLRRLDLRSCRQLSPEACARLAAAGPPGPFRC-PEEKLLLKDS .:::. : .:: . .:::.:.:.. .:: .. . . . : .:::. : : CCDS44 KLTDQTLIYLRRIANVTLIDLRGCKQITRKACEHFISDLSINSLYCLSDEKLIQKIS 1110 1120 1130 1140 1150 1160 694 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 09:18:44 2016 done: Sun Nov 6 09:18:45 2016 Total Scan time: 5.100 Total Display time: 0.110 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]