Result of FASTA (omim) for
pFN21AE9670
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE9670, 3230 aa
1>>>pF1KE9670 3230 - 3230 aa - 3230 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 17.5192+/-0.00051; mu= -29.0608+/- 0.032
mean_var=841.5326+/-174.017, 0's: 0 Z-trim(124.8): 457 B-trim: 0 in 0/61
Lambda= 0.044212
statistics sampled from 46564 (47083) to 46564 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.786), E-opt: 0.2 (0.552), width: 16
Scan time: 23.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006653 (OMIM: 136140,611421) helicase SRCAP [Ho (3230) 21602 1395.7 0
NP_056224 (OMIM: 606265) E1A-binding protein p400 (3123) 1609 120.4 4.7e-25
XP_011519987 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicas (1209) 957 78.6 7.5e-13
NP_003592 (OMIM: 603375) SWI/SNF-related matrix-as (1052) 919 76.1 3.6e-12
XP_016885240 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1036) 916 75.9 4.1e-12
XP_016885239 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1042) 916 75.9 4.1e-12
XP_006724845 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1042) 916 75.9 4.1e-12
XP_005262519 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1048) 916 75.9 4.1e-12
NP_003060 (OMIM: 300012) probable global transcrip (1054) 916 75.9 4.1e-12
XP_005262518 (OMIM: 300012) PREDICTED: probable gl (1054) 916 75.9 4.1e-12
NP_001269804 (OMIM: 300012) probable global transc (1058) 916 75.9 4.2e-12
NP_001269803 (OMIM: 300012) probable global transc (1070) 916 75.9 4.2e-12
NP_620614 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1572) 848 71.7 1.1e-10
NP_003061 (OMIM: 600014,601358) probable global tr (1590) 848 71.7 1.2e-10
NP_001276325 (OMIM: 600014,601358) probable global (1590) 848 71.7 1.2e-10
NP_002448 (OMIM: 158370) mucin-2 precursor [Homo s (5289) 864 73.1 1.4e-10
NP_001122320 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1613) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882657 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1613) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882656 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1614) 822 70.0 3.7e-10
NP_001122319 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1614) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882655 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1616) 822 70.0 3.7e-10
NP_001122318 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1616) 822 70.0 3.7e-10
NP_001122317 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1617) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882654 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1617) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882653 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1645) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882651 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882652 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1646) 822 70.0 3.7e-10
NP_001122316 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1647) 822 70.0 3.7e-10
NP_003063 (OMIM: 603254,613325,614609) transcripti (1647) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882650 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1650) 822 70.0 3.7e-10
XP_016882649 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1678) 822 70.0 3.8e-10
NP_001122321 (OMIM: 603254,613325,614609) transcri (1679) 822 70.0 3.8e-10
XP_006722909 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 822 70.0 3.8e-10
XP_011526500 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 822 70.0 3.8e-10
XP_006722908 (OMIM: 603254,613325,614609) PREDICTE (1679) 822 70.0 3.8e-10
XP_011536691 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2078) 776 67.2 3.4e-09
XP_006719476 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 776 67.2 3.4e-09
XP_006719475 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 776 67.2 3.4e-09
XP_006719477 (OMIM: 601234) PREDICTED: nascent pol (2082) 776 67.2 3.4e-09
XP_011519988 (OMIM: 610169) PREDICTED: DNA helicas ( 906) 692 61.6 7.4e-08
NP_060023 (OMIM: 610169) DNA helicase INO80 [Homo (1556) 692 61.7 1.1e-07
NP_004275 (OMIM: 613039) chromodomain-helicase-DNA ( 897) 659 59.4 3.1e-07
XP_016855492 (OMIM: 208250,604283) PREDICTED: prot (1270) 601 55.9 5.4e-06
NP_001121182 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1270) 601 55.9 5.4e-06
NP_001121181 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1311) 601 55.9 5.5e-06
XP_016855491 (OMIM: 208250,604283) PREDICTED: prot (1311) 601 55.9 5.5e-06
NP_001290161 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1361) 601 55.9 5.6e-06
NP_001121180 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 (1363) 601 55.9 5.7e-06
NP_005798 (OMIM: 208250,604283) proteoglycan 4 iso (1404) 601 55.9 5.8e-06
XP_016858348 (OMIM: 613039) PREDICTED: chromodomai ( 825) 591 55.1 6e-06
>>NP_006653 (OMIM: 136140,611421) helicase SRCAP [Homo s (3230 aa)
initn: 21602 init1: 21602 opt: 21602 Z-score: 7462.5 bits: 1395.7 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 21602; 100.0% identity (100.0% similar) in 3230 aa overlap (1-3230:1-3230)
10 20 30 40 50 60
pF1KE9 MQSSPSPAHPQLPVLQTQMVSDGMTGSNPVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLDGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MQSSPSPAHPQLPVLQTQMVSDGMTGSNPVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLDGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE9 PGPPDGATVPLEGFSLSQAADLANKGPKWEKSHAEIAEQAKHEAEIETRIAELRKEGFWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PGPPDGATVPLEGFSLSQAADLANKGPKWEKSHAEIAEQAKHEAEIETRIAELRKEGFWS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE9 LKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LKRLPKVPEPPRPKGHWDYLCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE9 ERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ERARREEQAKLRRIASTMAKDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE9 EKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EKYSDLLSQSLNQPLTSSKAGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE9 ETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ETIEVEEQQEGNDAEAQRREIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE9 TRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 TRDGPEEGAEEEPPQVLEIKPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE9 EQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE9 GPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQA
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NP_006 GPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE9 DEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DEEEEDDDFGVEYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE9 LATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LATTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE9 ACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHV
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NP_006 ACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE9 CITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQN
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NP_006 CITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE9 SLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRR
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NP_006 SLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRR
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850 860 870 880 890 900
pF1KE9 VKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKV
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NP_006 VKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKV
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910 920 930 940 950 960
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 CNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEA
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pF1KE9 DTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 DTFLPRHRLSRRVLLEVATAPDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVPKQEGRTVVVVNNPRAPLG
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pF1KE9 PVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNSG
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NP_006 PVPVRPPPGPELSAQPTPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNSG
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pF1KE9 SLPQVLPSPLGVLSGTSRPPTPTLSLKPTPPAPVRLSPAPPPGSSSLLKPLTVPPGYTFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SLPQVLPSPLGVLSGTSRPPTPTLSLKPTPPAPVRLSPAPPPGSSSLLKPLTVPPGYTFP
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KE9 PAAATTTSTTTATATTTAVPAPTPAPQRLILSPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVAN
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NP_006 PAAATTTSTTTATATTTAVPAPTPAPQRLILSPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVAN
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE9 AGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVALI
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NP_006 AGGSKPLTFQIQGNKLTLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVALI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 QAVAPTPGPTPVSVLPSSTPSTTPAPTGLSLPLAANQVPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LTPVPPLAPAPRPPSSGLPAVLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHS
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PSPEVSASAPGAAPLTISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLP
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KE9 ISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 ISVPTTLPAPASAPLTIPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASP
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SASALTLGLATAPSLSSSQTPGHPLLLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPFP
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1570 1580 1590 1600 1610 1620
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 SAPNPAPAQASLLAPASSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAAP
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pF1KE9 VLASSQTPVPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 VLASSQTPVPVMAPSSTPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQT
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pF1KE9 LALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LALAPALAPTLGGSSPSQTLSLGTGNPQGPFPTQTLSLTPASSLVPTPAQTLSLAPGPPL
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780 1790 1800
pF1KE9 GPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GPTQTLSLAPAPPLAPASPVGPAPAHTLTLAPASSSASLLAPASVQTLTLSPAPVPTLGP
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1810 1820 1830 1840 1850 1860
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 AAAQTLALAPASTQSPASQASSLVVSASGAAPLPVTMVSRLPVSKDEPDTLTLRSGPPSP
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1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KE9 PSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PSTATSFGGPRPRRQPPPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGT
1870 1880 1890 1900 1910 1920
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pF1KE9 EVLDFCTLPQPVASPIGPRSPGPSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 EVLDFCTLPQPVASPIGPRSPGPSHPTFWTYTEAAHRAVLFPQQRLDQLSEIIERFIFVM
1930 1940 1950 1960 1970 1980
1990 2000 2010 2020 2030 2040
pF1KE9 PPVEAPPPSLHACHPPPWLAPRQAAFQEQLASELWPRARPLHRIVCNMRTQFPDLRLIQY
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10 20
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.:.: . ::. : .:.. :
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:.: .:: .:.:... : :: :..: .. : . . : :. . . . .:. .:
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.: . ..:. ..:: : ... ::::::: :.:: .::::. : ::::.::::
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: :::::...::::::::: ..:.:.:: :.:::::.. .:::...:::..:::::.. :
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.... ::::.:.::..: . .:::::::::.: .: :
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:: : .: :.: :: ::
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... :... .. ...:..:::.:: :: :: ::: :::.::.:
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.:: . .:.. : ::. :.: . : :. :.
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:.::: ::. : . .:.: . : .. :. :.
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.. . : :. :.:.:..:.::.. ::: . .::.:: : :: : ::
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.::.::::::. .:.:.:::::::: :::::.: :...:::::..:::::::..: . .
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:.::.:::::::..:::.: :...: : ::: :..::.:::::::: .. :: :
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. ..:.:: . : ::.: . .: :::.: .::.:::.: :::::. ::::::..:
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:::.::. ::.: . : :.:.: .:::..:..::..:...::::.: .:: : ...
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. . .:::.:.: . .. :.. :::::::....:.::. .: .... :... :..:
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. : :: .:.:..:..::: : :::::. : : .: :
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: . ::.: :: .:: :. .:.. . . . . :.
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. :. . : .: :..: .:. .: :: : :: ..
NP_056 RHQPASASSTAASPAHPAKLRAQTTAQASTPGQP---PPQPQAPSHAAGQSAL-------
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::::.: . ::::::::::.:.::::.. : :.:.:.::.:.
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pF1KE9 TLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVALIQAVAPTPGPTPVSVLP
::. .:.:::..::: :: .:...::: :: .: . :::
NP_056 TLSHSQLRQLTAGQPLQLQGSVLQIVSAPGQPYLRA--------------PGP-------
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:: :
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pF1KE9 IPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASPSASALTLGLATAPSLS
::: .: : :: ::
NP_056 -------TVSQAG------------------------AVHGA--------LG--------
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: : ::
NP_056 --------------------------------------------SKP-----------PA
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pF1KE9 SSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAAPVLASSQTPVPVMAPSS
.. ::::: :.:. :.
NP_056 GG---------------------PSPAP-------LTPQVGV------------------
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pF1KE9 TPGTSLASASPVPAPTPVLAPSSTQTMLPAPVPSPLPSPASTQTLALAPALAPTLGGSSP
:: ..: : :
NP_056 -PGRVAVNALAVGEP---------------------------------------------
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:: ::. :
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:::.: :: ::
NP_056 ASPIG-------------------------------------GP------------TQ--
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pF1KE9 PPPPRSPFYLDSLEEKRKRQRSERLERIFQLSEAHGALAPVYGTEVLDFCTLP-----QP
:.. : .:::..:. ..: . . ::::: ..: .:.:: :
NP_056 --------------EEKTRLLKERLDQIYLVNERRCSQAPVYGRDLLRICALPSHGRVQW
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.: : :. ::.: .. . .:. . .: . ..:...:.: ::.::: : :::
NP_056 RGSLDGRRGKEAGPAH-SYTSSSESPSELMLTLCRCGESLQDVIDRVAFVIPPVVAAPPS
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:.. .::: . :. ... : . : . :.. . :::.:::.:.: :::..::
NP_056 LRVPRPPPLYSHRMRILRQGLREHAAPYFQQLRQTTAPRLLQFPELRLVQFDSGKLEALA
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.::..::.::.::::..:: :::.::.::..: :.:.: .. :::: ::. :: :.
NP_056 ILLQKLKSEGRRVLILSQMILMLDILEMFLNFHYLTYVRIDENASSEQRQELMRSFNRDR
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:::: ::::.: .:.::. ::::::::.: ::.:::.::. : :::. .:.:::::.:
NP_056 RIFCAILSTHSRTTGINLVEADTVVFYDNDLNPVMDAKAQEWCDRIGRCKDIHIYRLVSG
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pF1KE9 RTVEENILKKANQKRMLGDMAIEGGNFTTAYFKQQTIRELFDM--PLEE---PSSSS---
..::..::... : .. ..: .:.... :.. :.::.:::.. :... : ..
NP_056 NSIEEKLLKNGT-KDLIREVAAQGNDYSMAFLTQRTIQELFEVYSPMDDAGFPVKAEEFV
1990 2000 2010 2020 2030 2040
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: : ::.: : .. . .:: : ::: . ..: . : ......:
NP_056 VLSQEPSVTETIAPKIARPFIEALKSIEYLEEDAQKSAQEGVLGPHTDALSSDSENMPC-
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: . : . . :. .:: : . :. : : . :. :.
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:.:: : : .. .: .: .. . . . . : : :. .
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: :. :.. . :: . .. :.. .... : . :. .: .... : .
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.: . ..: :. :. . . ....: . : : .. .. :
NP_056 YRSSKQCRNRYENVIIPREEGKSKNNRPLRTSQIYAQDENATHTQLYTS-HFDLMKMTAG
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.. .: .. . .. . ..:: :.. :.:: :. .:....
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: .. .: :. :: : : :.: ::.. . .. :.
NP_056 EKKALADQQKAQQ---PAVAQPP--------PPQPQPPPPPQQPPPPLPQPQAAGS----
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::: :: ... : . . . . : :...... :. .::.. : . .
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pF1KE9 MSGPESSPPIGGPCEAAPSSSLPTPPQQPFIARRHIELGVTGGGSPENGDGALLAITPPA
.:: :.: :: .:. .: : . ::..: : .. : :
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::. ::: : .:. . . :.:. : . . :. : : :.
NP_056 -------PPRAVGSPATA------TPDLVSMATTQGVRAVTSVTASAVVTTNLTPVQTPA
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:: :. :. ..:.. . . . .. .. . ..... :
NP_056 RSLVPQVSQATGVQLPGKTITPAHFQLLRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQTT
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. . .: . :. : : . :.: ::. :: :. .. :
NP_056 TTSQVQVPQIQGQAQSPAQIKAVGKLTPEHLIKMQKQKLQMPPQ-PPPPQAQSAPPQPTA
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pF1KE9 STSVLESCGLGRRRQPQGQGESEGSSSDEDGSRPLTRLARLRLEAEGMRGRKSGGSMVVA
...: : . :: :. . . . . :: . :.. : . :.. :
NP_056 QVQVQTS------QPPQQQSPQLTTVTAPRPGALLTGTTVANLQVA--RLTRVPTSQLQA
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pF1KE9 VIQDDLDLADSGPGGLELT-PPVVSLTPKLRSTRLRPGSLVPPLETEKL------PRKRA
: ... :. . :. :::::. . :. :: . :... . :.: :
NP_056 --QGQMQTQAPQPAQVALAKPPVVSVPAAVVSS---PGVTTLPMNVAGISVAIGQPQKAA
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: : ..:
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..:.::. .... : : .. :.:. ::
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:..::...::. .:::::::::::::.:.:.:::::: ... ::: ::: :.:.. ::
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..:. :. :.::.: :.: ..::. :. : :. ::: ::::.::.:: . :.
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. . . :::
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:::: . : .. .. :: .: . : : : .. .... . : .
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:.::::::... .. :::...:: :.. :: :.::: :... . : ...:
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. :. . ::.:::.........:.. :::::..:::. ::: ::. . . .:..
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:::::::::::.: :::::..::.: ::.: .: ::. :. :.:. ::.::
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: :::::::::.:.::::..: : : : ::: :: : .: . .. . :
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..:::::::: :::: ::: :. :
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:..:. . ::. .: :: .:: .: :::
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.:.::. ::.:..::::::: .: ::.:: ::::::. :...:.:.. :::: :...:..
NP_003 LGINLATADVVILYDSDWNPQVDLQAMDRAHRIGQTKTVRVFRFITDNTVEERIVERAEM
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: : ...:. : .. ... :...: ... .. .. :::...: .
NP_003 KLRLDSIVIQQGRLVDQNLNKIGKDEMLQM-IRHGAT-----------HVFASKESEITD
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:: . : :.: .. ::. .:....:.. :.. . : :.. : .:
NP_003 ------EDIDGILERGAKKT-AEMNEKLSKMGESSLRNFTMDTESSVYNFEGEDY-REKQ
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.:: ..: . : .: . . ... :: :. .: .. : . : . . :..
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..... . . .. . .::.: . . . . .::. .. :.:: . : .
XP_016 KKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR-----FEFLLKQTELFAHFI
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: ..: ::.:: ::.::...::. .:::::::::::::.:::.::..: .
XP_016 RFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYR
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XP_016 NIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTS
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pF1KE9 YKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLME
:..:......:.. .::::..:::. ::: ::. . . .:.: :::::::::::.: :
XP_016 YEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHE
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XP_016 LWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFD---TKNCLGDQK----LVERLHAVLKPFLLRRIKTD
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:::..: : : : ::: :: : .. . ..: ..:.. : ..:::::::: :
XP_016 VEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDI--DVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCC
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::: ::: :. :
XP_016 NHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILED
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initn: 536 init1: 290 opt: 528 Z-score: 204.7 bits: 51.1 E(85289): 0.00012
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. ::. .: :: .:: .: :::::.::::
XP_016 MQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTR
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