FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9670, 3230 aa 1>>>pF1KE9670 3230 - 3230 aa - 3230 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6704+/-0.00123; mu= -12.1574+/- 0.074 mean_var=683.0692+/-140.712, 0's: 0 Z-trim(116.5): 163 B-trim: 0 in 0/54 Lambda= 0.049073 statistics sampled from 16999 (17154) to 16999 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.527), width: 16 Scan time: 10.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10689.2 SRCAP gene_id:10847|Hs108|chr16 (3230) 21602 1546.9 0 CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123) 1609 131.4 8.9e-29 CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052) 919 82.1 2.1e-14 CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054) 916 81.9 2.4e-14 CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058) 916 81.9 2.4e-14 CCDS76019.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1070) 916 81.9 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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RPLTRLARLRLEAEGMRGRKSGGSMVVAVIQDDLDLADSGPGGLELTPPVVSLTPKLRST 3070 3080 3090 3100 3110 3120 3130 3140 3150 3160 3170 3180 pF1KE9 RLRPGSLVPPLETEKLPRKRAGAPVGGSPGLAKRGRLQPPSPLGPEGSVEESEAEASGEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 RLRPGSLVPPLETEKLPRKRAGAPVGGSPGLAKRGRLQPPSPLGPEGSVEESEAEASGEE 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 3210 3220 3230 pF1KE9 EEGDGTPRRRPGPRRLVGTTNQGDQRILRSSAPPSLAGPAVSHRGRKAKT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 EEGDGTPRRRPGPRRLVGTTNQGDQRILRSSAPPSLAGPAVSHRGRKAKT 3190 3200 3210 3220 3230 >>CCDS31929.2 EP400 gene_id:57634|Hs108|chr12 (3123 aa) initn: 3162 init1: 863 opt: 1609 Z-score: 630.1 bits: 131.4 E(32554): 8.9e-29 Smith-Waterman score: 2298; 25.8% identity (45.7% similar) in 3218 aa overlap (1-3149:633-2924) 10 20 pF1KE9 MQSSPSPAHPQLPVLQTQMVSDGMTGSN-- .:.: . ::. : .:.. : CCDS31 IPAPPSSQLPIPPSQPAQLALHVPTPGKVQVQASQLSSLPQM-VASTRLPVDPAPPCPRP 610 620 630 640 650 660 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 -PVSPASSSSPASSGAGGISPQHIAQDSSLDGPPGPPDGATVPLEGFSLSQAADLANK-- :.: .:: .:.:... : :: :..: .. : . . : :. . . . .:. .: CCDS31 LPTSSTSSLAPVSGSGPGPSP---ARSSPVNRPSSATNKALSPVTSRTPGVVASAPTKPQ 670 680 690 700 710 90 100 110 120 130 pF1KE9 GP------KWEKSHAEIAEQAKHEAEIETRIAELRKEGFWSLKRLPKVPEPPRPKGHWDY .: . ..:. ..:: : ... ::::::: :.:: .::::. : ::::.:::: CCDS31 SPAQNATSSQDSSQDTLTEQITLENQVHQRIAELRKAGLWSQRRLPKLQEAPRPKSHWDY 720 730 740 750 760 770 140 150 160 170 180 190 pF1KE9 LCEEMQWLSADFAQERRWKRGVARKVVRMVIRHHEEQRQKEERARREEQAKLRRIASTMA : :::::...::::::::: ..:.:.:: :.:::::.. .:::...:::..:::::.. : CCDS31 LLEEMQWMATDFAQERRWKVAAAKKLVRTVVRHHEEKQLREERGKKEEQSRLRRIAASTA 780 790 800 810 820 830 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 KDVRQFWSNVEKVVQFKQQSRLEEKRKKALDLHLDFIVGQTEKYSDLLSQSLNQPLTSSK .... ::::.:.::..: . .:::::::::.: .: : CCDS31 REIECFWSNIEQVVEIKLRVELEEKRKKALNL---------QKVS--------------- 840 850 860 870 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 AGSSPCLGSSSAASSPPPPASRLDDEDGDFQPQEDEEEDDEETIEVEEQQEGNDAEAQRR :: CCDS31 ----------------------------------------------------------RR 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 EIELLRREGELPLEELLRSLPPQLLEGPSSPSQTPSSHDSDTRDGPEEGAEEEPPQVLEI :: : .: :.: :: :: CCDS31 GKEL-RPKGFDALQE--------------------SSLDS-------------------- 880 890 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 KPPPSAVTQRNKQPWHPDEDDEEFTANEEEAEDEEDTIAAEEQLEGEVDHAMELSELARE ... :... .. ...:..:::.:: :: :: ::: :::.::.: CCDS31 -----GMSGRKRKA--------SISLTDDEVDDEEETIEEEEANEGVVDHQTELSNLAKE 900 910 920 930 940 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 GELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPVEAEEPPQEDSSSQSDS .:: . .:.. : ::. :.: . : :. :. CCDS31 AELPLLDLMKLYEGAFLPSS--------------------QWPR-----PKPDG------ 950 960 970 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 VEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQADEEEEDDDFGVEYLLARDE :.::: ::. : . .:.: . : .. :. :. CCDS31 ---------------EDTSG---------EEDAD---DCPGDRESRKDLVLIDSLFIMDQ 980 990 1000 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 EQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYTLATTQVKTPIPLLLRGQLR .. . : :. :.:.:..:.::.. ::: . .::.:: : :: : :: CCDS31 FKAAERMNIGKPNA--------KDIADVTAVAEAILPKGSARVTTSVKFNAPSLLYGALR 1010 1020 1030 1040 1050 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 EYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVM .::.::::::. .:.:.:::::::: :::::.: :...:::::..:::::::..: . . CCDS31 DYQKIGLDWLAKLYRKNLNGILADEAGLGKTVQIIAFFAHLACNEGNWGPHLVVVRSCNI 1060 1070 1080 1090 1100 1110 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 LNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFRRKN :.::.:::::::..:::.: :...: : ::: :..::.:::::::: .. :: : CCDS31 LKWELELKRWCPGLKILSYIGSHRELKAKRQEWAEPNSFHVCITSYTQFFRGLTAFTRVR 1120 1130 1140 1150 1160 1170 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 WRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQS :. :..:: : .:.. ..:.......::.:::: .::.:...:::...:::.: . CCDS31 WKCLVIDEMQRVKGMTERHWEAVFTLQSQQRLLLIDSPLHNTFLELWTMVHFLVPGIS-- 1180 1190 1200 1210 1220 1230 800 810 820 830 840 850 pF1KE9 HREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRC . ..:.:: . : ::.: . .: :::.: .::.:::.: :::::. ::::::..: CCDS31 ----RPYLSSPLRAPSEESQDYYHKVVIRLHRVTQPFILRRTKRDVEKQLTKKYEHVLKC 1240 1250 1260 1270 1280 1290 860 870 880 890 900 910 pF1KE9 RLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETLATGHFMSVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITP :::.::. ::.: . : :.:.: .:::..:..::..:...::::.: .:: : ... CCDS31 RLSNRQKALYEDVILQPGTQEALKSGHFVNVLSILVRLQRICNHPGLVEPRHPGSSYVAG 1300 1310 1320 1330 1340 1350 920 930 940 950 960 970 pF1KE9 GICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEADTFLPRHRLSRRVLLEVAT . . .:::.:.: . .. :.. :::::::....:.::. .: .... :... :..: CCDS31 PLEYPSASLILKALERDFWKEADLSMFDLIGLENKITRHEAE-LLSKKKIPRKLMEEIST 1360 1370 1380 1390 1400 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE9 APDPPPRPKPVKMKVNRMLQPVP---KQEGRTVVVVNNPRAPLGPVPVRPPPGPELSAQP . : :: .:.:..:..::: : :::::. : : .: : CCDS31 SAAPAARPAAAKLKASRLFQPVQYGQKPEGRTVAF--------------PSTHPPRTAAP 1410 1420 1430 1440 1450 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE9 TPGPVPQVLPASLMVSASPAGPPLIPASRPPGPVLLPPLQPNSGSLPQVLPSPLGVLSGT : . ::.: :: .:: :. .:.. . . . . :. CCDS31 TTA------------SAAPQGPL---RGRP--PIATFSANPEAKAAAAPFQTSQASASAP 1460 1470 1480 1490 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 SRPPTPTLSLKPTPPAPVRLSPAPPPGSSSLLKPLTVPPGYTFPPAAATTTSTTTATATT . :. . : .: :..: .:. .: :: : :: .. CCDS31 RHQPASASSTAASPAHPAKLRAQTTAQASTPGQP---PPQPQAPSHAAGQSAL------- 1500 1510 1520 1530 1540 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE9 TAVPAPTPAPQRLILSPDMQARLPSGEVVSIGQLASLAQRPVANAGGSKPLTFQIQGNKL ::::.: . ::::::::::.:.::::.. : :.:.:.::.:. CCDS31 ---------PQRLVLPSQAQARLPSGEVVKIAQLASITGPQSRVAQPETPVTLQFQGSKF 1550 1560 1570 1580 1590 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE9 TLTGAQVRQLAVGQPRPLQRNVVHLVSAGGQHHLISQPAHVALIQAVAPTPGPTPVSVLP ::. .:.:::..::: :: .:...::: :: .: . ::: CCDS31 TLSHSQLRQLTAGQPLQLQGSVLQIVSAPGQPYLRA--------------PGP------- 1600 1610 1620 1630 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE9 SSTPSTTPAPTGLSLPLAANQVPPTMVNNTGVVKIVVRQAPRDGLTPVPPLAPAPRPPSS :: : CCDS31 -----------------------------------VVMQ--------------------- 1640 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE9 GLPAVLNPRPTLTPGRLPTPTLGTARAPMPTPTLVRPLLKLVHSPSPEVSASAPGAAPLT CCDS31 ------------------------------------------------------------ 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE9 ISSPLHVPSSLPGPASSPMPIPNSSPLASPVSSTVSVPLSSSLPISVPTTLPAPASAPLT CCDS31 ------------------------------------------------------------ 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE9 IPISAPLTVSASGPALLTSVTPPLAPVVPAAPGPPSLAPSGASPSASALTLGLATAPSLS ::: .: : :: :: CCDS31 -------TVSQAG------------------------AVHGA--------LG-------- 1650 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE9 SSQTPGHPLLLAPTSSHVPGLNSTVAPACSPVLVPASALASPFPSAPNPAPAQASLLAPA : : :: CCDS31 --------------------------------------------SKP-----------PA 1660 1580 1590 1600 1610 1620 1630 pF1KE9 SSASQALATPLAPMAAPQTAILAPSPAPPLAPLPVLAPSPGAAPVLASSQTPVPVMAPSS .. ::::: :.:. :. 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CCDS31 NSIEEKLLKNGT-KDLIREVAAQGNDYSMAFLTQRTIQELFEVYSPMDDAGFPVKAEEFV 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2230 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KE9 VPSAPEEEEETVASKQTHILEQALCRAED-EEDIRAATQAKAEQVAELAEFNENDGFPAG : : ::.: : .. . .:: : ::: . ..: . : ......: CCDS31 VLSQEPSVTETIAPKIARPFIEALKSIEYLEEDAQKSAQEGVLGPHTDALSSDSENMPC- 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2290 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE9 EGEEAGRPGAEDEEMSRAEQEIAALVEQLTPIERYAMKFLEASLEEVSREELKQAEEQVE ::: :. : :.: ..:::::::.::...:: . .:. ...:. : CCDS31 -----------DEEPSQLE-ELADFMEQLTPIEKYALNYLELFHTSIEQEKERNSEDAVM 2110 2120 2130 2140 2150 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KE9 AARKDLD-------QAKEEVFRLPQEEEEGPGAGDESSCGTGGGTHRRSKKAKAPERPGT .: . . : .: .:: ::: : :.. : . . : CCDS31 TAVRAWEFWNLKTLQEREARLRLEQEEAELLTYTREDA---------YSMEYVYEDVDGQ 2160 2170 2180 2190 2200 2400 2410 2420 2430 2440 2450 pF1KE9 RVSERLRGARAETQGANHTPVISAHQTRSTTTP-P--RCSPARERVPRPAPRPRPTPASA : . : . . :. .:: : . :. : : . :. :. CCDS31 TEVMPLWTPPTPPQDDSDIYLDSVMCLMYEATPIPEAKLPPVYVRKERKRHKTDPSAAGR 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2460 2470 2480 2490 2500 pF1KE9 PAAI---PALVPVPVSAPVPISAPNPITILPVHILPSPPPPSQIPPCSSPACTPPPACTP :.:: : : .. .: .: .. . . . . : : :. . CCDS31 KKKQRHGEAVVP-PRSL---FDRATP-GLLKIRREGKEQKKNILLKQQVPFAKPLPTFAK 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2510 2520 2530 2540 2550 2560 pF1KE9 PPAHTPPPAQTCLVTPSSPLLLGPPSV---PISASVTNLPLGLRPEAELCAQALASPESL : :. :.. . :: . .. :.. .... : . :. .: .... : . CCDS31 PTAEPGQDNPEWLISEDWALLQAVKQLLELPLNLTIVS-P-AHTPNWDLVSDVVNSCSRI 2330 2340 2350 2360 2370 2570 2580 2590 2600 2610 pF1KE9 ELASVASSETSSLSLVP-----PKDLLPVAVEILPVSEKNLSLTPSAPSLTLEAGSIPNG .: . ..: :. :. . . ....: . : : .. .. : CCDS31 YRSSKQCRNRYENVIIPREEGKSKNNRPLRTSQIYAQDENATHTQLYTS-HFDLMKMTAG 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2620 2630 2640 2650 2660 2670 pF1KE9 QEQEAPDSAEGTTLTVLPEGEELPLCVSESNGLELPPSAASDEPLQEPLEADRTSEELTE .. .: .. . .. . ..:: :.. :.:: :. .:.... CCDS31 KR--SPPIKPLLGMNPFQKNPKHASVLAES-GINY------DKPLPPIQVASLRAERIAK 2440 2450 2460 2470 2480 2680 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KE9 AKTPTSSPEKPQELVTAEVAAPSTSSSATSSPEGPSPARPPRRRTSADVEIRGQGTGRPG : .. .: :. :: : : :.: ::.. . .. :. CCDS31 EKKALADQQKAQQ---PAVAQPP--------PPQPQPPPPPQQPPPPLPQPQAAGS---- 2490 2500 2510 2520 2530 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KE9 QPP-GPKVLRKLPGRLVTVVEEKELVRRRRQQ---RGAASTLVPGVSETSASPGSPSVRS ::: :: ... : . . . . : :...... :. .::.. : . . CCDS31 QPPAGPPAVQPQPQPQPQTQPQPVQAPAKAQPAITTGGSAAVLAGTIKTSVTGTSMPTGA 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2800 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KE9 MSGPESSPPIGGPCEAAPSSSLPTPPQQPFIARRHIELGVTGGGSPENGDGALLAITPPA .:: :.: :: .:. .: : . ::..: : .. : : CCDS31 VSGNVIVNTIAG-VPAATFQSINKRLASPVAPG---ALTTPGGSAP-----AQVVHTQP- 2600 2610 2620 2630 2640 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KE9 VKRRRGRPPKKNRSPADAGRGVDEAPSSTLKGKTNGADPVPGPETLIVADPVLEPQLIPG ::. ::: : .:. . . :.:. : . . :. : : :. CCDS31 -------PPRAVGSPATA------TPDLVSMATTQGVRAVTSVTASAVVTTNLTPVQTPA 2650 2660 2670 2680 2690 2920 2930 2940 2950 2960 2970 pF1KE9 ----PQPLGPQPVHRPNPLLSPVEKRRRGRPPKARDLPIPGTISSAGDGNSESRTQPPPH :: :. :. ..:.. . . . .. .. . ..... : CCDS31 RSLVPQVSQATGVQLPGKTITPAHFQLLRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQTT 2700 2710 2720 2730 2740 2750 2980 2990 3000 3010 3020 pF1KE9 PSPLTPLPPLL---VCPTATVANTVTTVTISTSPPKRKRGRPPKNPPSPRPSQLPVLDRD . . .: . :. : : . :.: ::. :: :. .. : CCDS31 TTSQVQVPQIQGQAQSPAQIKAVGKLTPEHLIKMQKQKLQMPPQ-PPPPQAQSAPPQPTA 2760 2770 2780 2790 2800 3030 3040 3050 3060 3070 3080 pF1KE9 STSVLESCGLGRRRQPQGQGESEGSSSDEDGSRPLTRLARLRLEAEGMRGRKSGGSMVVA ...: : . :: :. . . . . :: . :.. : . :.. : CCDS31 QVQVQTS------QPPQQQSPQLTTVTAPRPGALLTGTTVANLQVA--RLTRVPTSQLQA 2810 2820 2830 2840 2850 2860 3090 3100 3110 3120 3130 3140 pF1KE9 VIQDDLDLADSGPGGLELT-PPVVSLTPKLRSTRLRPGSLVPPLETEKL------PRKRA : ... :. . :. :::::. . :. :: . :... . :.: : CCDS31 --QGQMQTQAPQPAQVALAKPPVVSVPAAVVSS---PGVTTLPMNVAGISVAIGQPQKAA 2870 2880 2890 2900 2910 3150 3160 3170 3180 3190 3200 pF1KE9 GAPVGGSPGLAKRGRLQPPSPLGPEGSVEESEAEASGEEEEGDGTPRRRPGPRRLVGTTN : : ..: CCDS31 GQTVVAQPVHMQQLLKLKQQAVQQQKAIQPQAAQGPAAVQQKITAQQITTPGAQQKVAYA 2920 2930 2940 2950 2960 2970 >>CCDS3761.1 SMARCA5 gene_id:8467|Hs108|chr4 (1052 aa) initn: 1434 init1: 668 opt: 919 Z-score: 372.2 bits: 82.1 E(32554): 2.1e-14 Smith-Waterman score: 942; 37.3% identity (61.7% similar) in 480 aa overlap (474-918:2-474) 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 MEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDR :: :: : : :.. ..: ... . CCDS37 MSSAAEPPPPPPPESAPSKPAASIASGGSNS 10 20 30 510 520 530 540 550 pF1KE9 SED--EEDEHSEEEETSGSSASEESESEES-EDAQSQSQADEEEEDDDFG---------- :. : .. ...:.. ..: :: .::. .: . .: : . CCDS37 SNKGGPEGVAAQAVASAASAGPADAEMEEIFDDASPGKQKEIQEPDPTYEEKMQTDRANR 40 50 60 70 80 90 560 570 580 590 pF1KE9 VEYLLARDEEQSEADAGSGPPTP-GPTTLGP------KKEITDIAAAAE-----SLQPKG :::: . : .. .. :: .: . : : : .. .... . : . CCDS37 FEYLLKQTELFAHFIQPAAQKTPTSPLKMKPGRPRIKKDEKQNLLSVGDYRHRRTEQEED 100 110 120 130 140 150 600 610 620 630 640 pF1KE9 YTLATTQVK-TPI-------PLLLR-GQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGK : : . : : . : .. :.::.:: ::.::...::. .:::::::::::: CCDS37 EELLTESSKATNVCTRFEDSPSYVKWGKLRDYQVRGLNWLISLYENGINGILADEMGLGK 160 170 180 190 200 210 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 TIQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKR :.::::::... .. :::...:: :.. :: :.::: :... . : ...: CCDS37 TLQTISLLGYMKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMSEFKRWVPTLRSVCLIGDKEQRAAFV 220 230 240 250 260 270 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 QGWTKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQR . :. . ::.:::.........:.. :::::..:::. ::: ::. . . .:.. CCDS37 RDVLLPGEWDVCVTSYEMLIKEKSVFKKFNWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKTTN 280 290 300 310 320 330 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 RLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRL :::::::::::.: :::::..::.: ::.: .: ::. :. :.:. ::.:: CCDS37 RLLLTGTPLQNNLHELWSLLNFLLPDVFNSADDFDSWFD---TNNCLGDQK----LVERL 340 350 360 370 380 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 HKVLRPFLLRRVKVDVEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDD-FMAQTTTKETLATGHFM : :::::::::.:.::::..: : : : ::: :: : .: . .. . : CCDS37 HMVLRPFLLRRIKADVEKSLPPKKEVKIYVGLSKMQREWYTRILMKDIDILNSAGKMDKM 390 400 410 420 430 440 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 SVINILMQLRKVCNHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDL ..:::::::: :::: ::: :. : CCDS37 RLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDMHLVTNSGKMVVLDKLLPKLKEQGSRVLI 450 460 470 480 490 500 >>CCDS14612.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1054 aa) initn: 1404 init1: 670 opt: 916 Z-score: 371.1 bits: 81.9 E(32554): 2.4e-14 Smith-Waterman score: 954; 37.0% identity (64.5% similar) in 467 aa overlap (476-918:26-477) 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 ELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSE : .: :: ..: ..... .. ...: CCDS14 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGE 10 20 30 40 50 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 DEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQS--- ..... . . .. . .::.: . . . . .::. .. :.:: . : . 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CCDS14 RFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYR 170 180 190 200 210 220 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 GNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHVCITS . :::...:: :.. :: :.::: ::.... . : . : . :. . ::.:: CCDS14 NIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTS 230 240 250 260 270 280 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 YKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLME :..:......:.. .::::..:::. ::: ::. . . .:.: :::::::::::.: : CCDS14 YEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHE 290 300 310 320 330 340 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 LWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVD ::.:..::.: ::.: .: ::. : :.:. ::.::: ::.::::::.:.: CCDS14 LWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFD---TKNCLGDQK----LVERLHAVLKPFLLRRIKTD 350 360 370 380 390 400 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 VEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETL-ATGHF--MSVINILMQLRKVC :::..: : : : ::: :: : .. . ..: ..:.. : ..:::::::: : CCDS14 VEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDI--DVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCC 410 420 430 440 450 460 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 NHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEAD ::: ::: :. : CCDS14 NHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILED 470 480 490 500 510 520 >>CCDS76018.1 SMARCA1 gene_id:6594|Hs108|chrX (1058 aa) initn: 1406 init1: 670 opt: 916 Z-score: 371.0 bits: 81.9 E(32554): 2.4e-14 Smith-Waterman score: 954; 37.0% identity (64.5% similar) in 467 aa overlap (476-918:26-477) 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 ELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCEPEGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSE : .: :: ..: ..... .. ...: CCDS76 MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQP-GPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGE 10 20 30 40 50 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 DEEDEHSEEEETSGSSASEESESEESEDAQSQSQADEEEEDDDFGVEYLLARDEEQS--- ..... . . .. . .::.: . . . . .::. .. :.:: . : . 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CCDS76 KKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKR-----FEFLLKQTELFAHFI 60 70 80 90 100 570 580 590 600 610 pF1KE9 EADAGSGPPTPGPTTLG-P---KKEITDIAAAAE-----SLQPKGYTLATTQVKTPI--- . .: ..: .: :: : : : .. .:.. . : . : . . :: CCDS76 QPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCI 110 120 130 140 150 160 620 630 640 650 660 pF1KE9 -----PLLLRG-QLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEK : ..: ::.:: ::.::...::. .:::::::::::::.:::.::..: . CCDS76 RFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYENGVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYR 170 180 190 200 210 220 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 GNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHVCITS . :::...:: :.. :: :.::: ::.... . : . : . :. . ::.:: CCDS76 NIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTS 230 240 250 260 270 280 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 YKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSLLNFNSQRRLLLTGTPLQNSLME :..:......:.. .::::..:::. ::: ::. . . .:.: :::::::::::.: : CCDS76 YEMVIKEKSVFKKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHE 290 300 310 320 330 340 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 LWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNPLTGMIEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVD ::.:..::.: ::.: .: ::. : :.:. ::.::: ::.::::::.:.: CCDS76 LWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFD---TKNCLGDQK----LVERLHAVLKPFLLRRIKTD 350 360 370 380 390 400 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 VEKQMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQTTTKETL-ATGHF--MSVINILMQLRKVC :::..: : : : ::: :: : .. . ..: ..:.. : ..:::::::: : CCDS76 VEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDI--DVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCC 410 420 430 440 450 460 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 NHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEAD ::: ::: :. : CCDS76 NHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKEQGSRVLIFSQMTRLLDILED 470 480 490 500 510 520 >>CCDS34978.1 SMARCA2 gene_id:6595|Hs108|chr9 (1572 aa) initn: 1008 init1: 472 opt: 848 Z-score: 342.8 bits: 77.3 E(32554): 9e-13 Smith-Waterman score: 927; 36.8% identity (63.8% similar) in 478 aa overlap (449-907:563-1022) 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 AEEQLEGEVDHAMELSELAREGELSMEELLQQYAGAYAPGSGSSEDEDEDEVDANSSDCE .. : : :. :. : . .: .:. CCDS34 TDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQ--M 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 PEGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESE-ESEDAQSQ . ::.. . .. . . : : . :.. : ::::.:. : :: . . CCDS34 SDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEE 600 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 SQADEEEEDDDFGVEYLL-ARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITD---IAAAAES :. .: :: . :: .:: :: :: . : :... : . .:.. CCDS34 SSRQETEE------KILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA-------KQDVDDEYSMQYSARG 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 LQPKGYTLA---TTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKT : ::.: . .:. ::. : :..:: ::.:.:..:...:::::::::::::: CCDS34 SQSY-YTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKT 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 pF1KE9 IQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERK-LKR ::::.:...: .: ::.::::: :.. :: .:. .: :: ..: :. :. : CCDS34 IQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVP 760 770 780 790 800 810 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 QGWTKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSL-LNFNSQ : . . :.: .:.:. ...:.. . . :.:.:.::.. .:: . . : : .. . CCDS34 Q--LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAP 820 830 840 850 860 870 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 RRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNP--LTGM-IEGSQEYNEGL ::.:::::::::.: :::.:..::.: .:.: :..::. : .:: .. ..: . . 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CCDS34 TDEYVANLTNLVWEHKQAQAAKEKKKRRRRKKKAEENAEGGESALGPDGEPIDESSQ--M 540 550 560 570 580 590 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 PEGPVEAEEPPQEDSSSQSDSVEDRSEDEEDEHSEEEETSGSSASEESESE-ESEDAQSQ . ::.. . .. . . : : . :.. : ::::.:. : :: . . CCDS34 SDLPVKVTHTETGKVLFGPEAPKASQLDAWLEMNPGYEVAPRSDSEESDSDYEEEDEEEE 600 610 620 630 640 650 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 SQADEEEEDDDFGVEYLL-ARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITD---IAAAAES :. .: :: . :: .:: :: :: . : :... : . .:.. CCDS34 SSRQETEE------KILLDPNSEEVSEKDAKQIIETA-------KQDVDDEYSMQYSARG 660 670 680 690 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 LQPKGYTLA---TTQVKTPIPLLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKT : ::.: . .:. ::. : :..:: ::.:.:..:...:::::::::::::: CCDS34 SQSY-YTVAHAISERVEKQSALLINGTLKHYQLQGLEWMVSLYNNNLNGILADEMGLGKT 700 710 720 730 740 750 660 670 680 690 700 pF1KE9 IQTISLLAHLACEKGNWGPHLIIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERK-LKR ::::.:...: .: ::.::::: :.. :: .:. .: :: ..: :. :. : CCDS34 IQTIALITYLMEHKRLNGPYLIIVPLSTLSNWTYEFDKWAPSVVKISYKGTPAMRRSLVP 760 770 780 790 800 810 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 QGWTKPNAFHVCITSYKLVLQDHQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSL-LNFNSQ : . . :.: .:.:. ...:.. . . :.:.:.::.. .:: . . : : .. . CCDS34 Q--LRSGKFNVLLTTYEYIIKDKHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAP 820 830 840 850 860 870 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 RRLLLTGTPLQNSLMELWSLMHFLMPHVFQSHREFKEWFSNP--LTGM-IEGSQEYNEGL ::.:::::::::.: :::.:..::.: .:.: :..::. : .:: .. ..: . . 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CCDS54 PDGEPLDETSQMSDLPVKVIHVESGKILTGTDAPKAGQLEAWLEMNPGYEVAPRSDSEES 610 620 630 640 650 660 510 520 530 540 550 pF1KE9 RSEDEEDEHSEEEETSGSSAS---EESESEESEDAQSQSQAD--------EEEEDDDFGV ::.::.:. ::. ... . ::... . :... :..: ... ::..:: CCDS54 GSEEEEEEEEEEQPQAAQPPTLPVEEKKKIPDPDSDDVSEVDARHIIENAKQDVDDEYGV 670 680 690 700 710 720 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 EYLLARDEEQSEADAGSGPPTPGPTTLGPKKEITDIAAAAESLQPKGYTLATTQVKTPIP ::: .. : .: :. : .: CCDS54 SQALARGLQSYYA----------------------VAHAV-----------TERVDKQSA 730 740 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 LLLRGQLREYQHIGLDWLVTMYEKKLNGILADEMGLGKTIQTISLLAHLACEKGNWGPHL :.. : :..:: ::.:::..:...::::::::::::::::::.:...: .: :: : CCDS54 LMVNGVLKQYQIKGLEWLVSLYNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALITYLMEHKRINGPFL 750 760 770 780 790 800 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 IIVPTSVMLNWEMELKRWCPSFKILTYYGAQKERKLKRQGWTKPNAFHVCITSYKLVLQD :::: :.. :: .:. .: :: ..: :. :. . . :.: .:.:. ...: CCDS54 IIVPLSTLSNWAYEFDKWAPSVVKVSYKGSPAARR-AFVPQLRSGKFNVLLTTYEYIIKD 810 820 830 840 850 860 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 HQAFRRKNWRYLILDEAQNIKNFKSQRWQSL-LNFNSQRRLLLTGTPLQNSLMELWSLMH .. . . :.:.:.::.. .:: . . : : .. . ::::::::::::.: :::.:.. CCDS54 KHILAKIRWKYMIVDEGHRMKNHHCKLTQVLNTHYVAPRRLLLTGTPLQNKLPELWALLN 870 880 890 900 910 920 800 810 820 830 840 pF1KE9 FLMPHVFQSHREFKEWFSNP--LTGM-IEGSQEYNEGLVKRLHKVLRPFLLRRVKVDVEK ::.: .:.: :..::. : .:: .. ..: . ...:::::::::::::.: .:: CCDS54 FLLPTIFKSCSTFEQWFNAPFAMTGEKVDLNEEETILIIRRLHKVLRPFLLRRLKKEVEA 930 940 950 960 970 980 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 QMPKKYEHVIRCRLSKRQRCLYDDFMAQT------TTKETLATGHFMSVINILMQLRKVC :.:.: :.::.: .: :: :: ..:. . :. . : ...: .:::::.: CCDS54 QLPEKVEYVIKCDMSALQRVLYRHMQAKGVLLTDGSEKDKKGKGGTKTLMNTIMQLRKIC 990 1000 1010 1020 1030 1040 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 NHPNLFDPRPVTSPFITPGICFSTASLVLRATDVHPLQRIDMGRFDLIGLEGRVSRYEAD ::: .: CCDS54 NHPYMFQHIEESFSEHLGFTGGIVQGLDLYRASGKFELLDRILPKLRATNHKVLLFCQMT 1050 1060 1070 1080 1090 1100 3230 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 07:13:36 2016 done: Tue Nov 8 07:13:38 2016 Total Scan time: 10.720 Total Display time: 1.080 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]