FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5535, 455 aa 1>>>pF1KE5535 455 - 455 aa - 455 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4942+/-0.000908; mu= 16.1592+/- 0.054 mean_var=61.5150+/-12.261, 0's: 0 Z-trim(104.0): 39 B-trim: 5 in 1/51 Lambda= 0.163525 statistics sampled from 7638 (7669) to 7638 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.236), width: 16 Scan time: 3.110 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS10642.1 TUFM gene_id:7284|Hs108|chr16 ( 455) 2971 709.7 1.5e-204 CCDS33849.1 EEFSEC gene_id:60678|Hs108|chr3 ( 596) 337 88.4 2.2e-17 CCDS45414.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 499) 272 73.0 7.7e-13 CCDS4980.1 EEF1A1 gene_id:1915|Hs108|chr6 ( 462) 271 72.8 8.5e-13 CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 636) 272 73.1 9.6e-13 CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 ( 637) 272 73.1 9.6e-13 CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 ( 463) 267 71.8 1.6e-12 CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 642) 266 71.6 2.6e-12 CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 ( 684) 266 71.6 2.7e-12 CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX ( 628) 265 71.4 3e-12 >>CCDS10642.1 TUFM gene_id:7284|Hs108|chr16 (455 aa) initn: 2971 init1: 2971 opt: 2971 Z-score: 3785.8 bits: 709.7 E(32554): 1.5e-204 Smith-Waterman score: 2971; 100.0% identity (100.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MTTMAAATLLRATPHFSGLAAGRTFLLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 MTTMAAATLLRATPHFSGLAAGRTFLLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 VNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 VNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYST 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 AARHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 AARHYAHTDCPGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTREHLLLARQIGVEHVV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 VYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCALEGRDPELGLKSVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 VYVNKADAVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCALEGRDPELGLKSVQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 KLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECELLGHSK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECELLGHSK 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSIKPHQKVEAQVY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 NIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSIKPHQKVEAQVY 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 ILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILRQPMILE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 ILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILRQPMILE 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 KGQRFTLRDGNRTIGTGLVTNTLAMTEEEKNIKWG ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS10 KGQRFTLRDGNRTIGTGLVTNTLAMTEEEKNIKWG 430 440 450 >>CCDS33849.1 EEFSEC gene_id:60678|Hs108|chr3 (596 aa) initn: 439 init1: 226 opt: 337 Z-score: 425.6 bits: 88.4 E(32554): 2.2e-17 Smith-Waterman score: 388; 28.5% identity (58.3% similar) in 312 aa overlap (60-342:7-303) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 LLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEGGG .::::..::.: :::.:. :.. . .. 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CCDS49 GWKVTRKDGNASGTTLLEALDCILP-PTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVETGV 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 LKKGDECELLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKP :: : . :. : : ..:: :..: .: :::.: :.... .:.::: : CCDS49 LKPGMVVTFA--PVNVTTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDVRRGNVAGDS 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 GSIKPHQKV--EAQVYILSKEEGGRHKPFVSH-FMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMP . : . . ::: ::. : .: . ::. : .::.. :: CCDS49 KNDPPMEAAGFTAQVIILN------HPGQISAGYAPVLDCHTAHIACKFAELKEKIDRRS 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 pF1KE5 GEDL----KF---------NLILRQPMILEKGQ------RFTLRDGNRTIGTGLVTNTLA :. : :: ... .:: .:. . ::..:: .:...:.. CCDS49 GKKLEDGPKFLKSGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKAVDK 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 MTEEEKNIKWG CCDS49 KAAGAGKVTKSAQKAQKAK 450 460 >>CCDS45413.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (636 aa) initn: 407 init1: 148 opt: 272 Z-score: 342.2 bits: 73.1 E(32554): 9.6e-13 Smith-Waterman score: 401; 28.1% identity (55.0% similar) in 338 aa overlap (58-362:209-537) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG : :::: ::::: ::.:. . : . . 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CCDS45 LPFIPYL----DN-LPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSICKGQQLVM 420 430 440 450 460 470 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSI-KPHQK . ...:.. : :: . . :.:: ..:...:.. :... :... . . CCDS45 MPNKHNVE--VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRT 480 490 500 510 520 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 VEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILR .::. :. CCDS45 FDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQV 530 540 550 560 570 580 >>CCDS45412.1 GSPT1 gene_id:2935|Hs108|chr16 (637 aa) initn: 407 init1: 148 opt: 272 Z-score: 342.2 bits: 73.1 E(32554): 9.6e-13 Smith-Waterman score: 401; 28.1% identity (55.0% similar) in 338 aa overlap (58-362:210-538) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG : :::: ::::: ::.:. . : . . CCDS45 PPEESAHEMMEEEEEIPKPKSVVAPPGAPKKEHVNVVFIGHVDAGKSTIGGQIMYLTGMV 180 190 200 210 220 230 90 100 110 120 130 pF1KE5 GGAKFKKYEE---------------IDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDCPG ..:::. .:. ::: .: :...... . : .:.. : :: CCDS45 DKRTLEKYEREAKEKNRETWYLSWALDTNQEERDKGKTVEVGRAYFETEKKHFTILDAPG 240 250 260 270 280 290 140 150 160 170 180 pF1KE5 HADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYVNK : ..: ::: :.. : .::..: : . ::::: .::. ::.:..: .:: CCDS45 HKSFVPNMIGGASQADLAVLVISARKGEFETGFEKGGQTREHAMLAKTAGVKHLIVLINK 300 310 320 330 340 350 190 200 210 220 230 pF1KE5 AD---AVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEET----PV--IVGSALCALEGRDP-ELG : . ..: : . .. .: . :.. .. : ..:. : : .: CCDS45 MDDPTVNWSNERYEECKEKLVPFLKKVGFNPKKDIHFMPCSGLTGANLKEQSDFCPWYIG 360 370 380 390 400 410 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LKSVQKLLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECEL : . : :. .: :... :. ::. :. :::: : :: : . ::.. . CCDS45 LPFIPYL----DN-LPNFNRSVDGPIRLPIVDKYK--DMGTVVLGKLESGSICKGQQLVM 420 430 440 450 460 470 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 LGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPGSI-KPHQK . ...:.. : :: . . :.:: ..:...:.. :... :... . . CCDS45 MPNKHNVE--VLGILSDDVETDTVAPGENLKIRLKGIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGRT 480 490 500 510 520 530 360 370 380 390 400 410 pF1KE5 VEAQVYILSKEEGGRHKPFVSHFMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKFNLILR .::. :. CCDS45 FDAQIVIIEHKSIICPGYNAVLHIHTCIEEVEITALICLVDKKSGEKSKTRPRFVKQDQV 540 550 560 570 580 590 >>CCDS13522.1 EEF1A2 gene_id:1917|Hs108|chr20 (463 aa) initn: 588 init1: 191 opt: 267 Z-score: 338.1 bits: 71.8 E(32554): 1.6e-12 Smith-Waterman score: 574; 32.5% identity (55.9% similar) in 449 aa overlap (56-441:3-440) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 LLQGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAIT---- ..: :.:. .::::: ::.: :. . CCDS13 MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCG 10 20 30 90 100 110 120 130 pF1KE5 -----------KILAEGGGAKFKKYEEIDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDC : :: : ..:: .:. :: :::::. . .. :. . . : CCDS13 GIDKRTIEKFEKEAAEMGKGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDA 40 50 60 70 80 90 140 150 160 170 180 pF1KE5 PGHADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYV ::: :..:::::::. : .:.:::. : . ::::: ::: .::....: : CCDS13 PGHRDFIKNMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIVGV 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 pF1KE5 NKAD----AVQDSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCA---LEGRDPEL-- :: : : ..... :.:. :. . ..::. .: . :. . :: .:.. CCDS13 NKMDSTEPAYSEKRYDEIVK-EVSAYIKKIGYNPATVPFVPISGWHGDNMLEP-SPNMPW 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KE5 --GLKSVQK--------LLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLER : : .: ::.:.:: .: :.: .::. ::.. ::.. : ::: .: .: CCDS13 FKGWKVERKEGNASGVSLLEALDTILP-PTRPTDKPLRLPLQDVYKIGGIGTVPVGRVET 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 pF1KE5 GILKKGDECELLGHSKNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMV :::. : . :: : : ..:: :..: .: :::.: :.... .:.::: : CCDS13 GILRPGMVVTFA--PVNITTEVKSVEMHHEALSEALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNVCG 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 pF1KE5 KPGSIKPHQKVE--AQVYILSKEEGGRHKPFVSH-FMPVMFSLTWDMACRIILPPEKELA : :.. .. .:: ::. : .: . ::. : .::.. :: CCDS13 DSKSDPPQEAAQFTSQVIILN------HPGQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDR 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 pF1KE5 MPGEDLKFN-------------LILRQPMILEK-GQ-----RFTLRDGNRTIGTGLVTNT :. :. : .. .:: .:. .: ::..:: .:...:.. : CCDS13 RSGKKLEDNPKSLKSGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKNV 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE5 LAMTEEEKNIKWG CCDS13 EKKSGGAGKVTKSAQKAQKAGK 450 460 >>CCDS47479.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 (642 aa) initn: 491 init1: 163 opt: 266 Z-score: 334.5 bits: 71.6 E(32554): 2.6e-12 Smith-Waterman score: 497; 29.5% identity (56.0% similar) in 427 aa overlap (58-440:216-638) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG : .:. .::::: ::.:: . . .:.. 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CCDS47 LCLLEQIDSFKP-PQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGD--RLLAMP 430 440 450 460 470 480 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 KNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPG-SIKPHQKVEAQ : .: :: . . .. : :::... . :. . : .. : :: . .:. CCDS47 PNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRAR 490 500 510 520 530 540 360 370 380 390 400 pF1KE5 VYILSKE-EGGRHKPFVSHFMPV--------MFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKF . :.. : . : . :.. : ..:. . .. : :. :.. CCDS47 ILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLT-KGQNALV 550 560 570 580 590 600 410 420 430 440 450 pF1KE5 NLILRQPMILEKGQ------RFTLRDGNRTIGTGLVTNTLAMTEEEKNIKWG .: ..:. :: . :: :: :. ::..:.:: CCDS47 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE 610 620 630 640 >>CCDS5173.1 HBS1L gene_id:10767|Hs108|chr6 (684 aa) initn: 491 init1: 163 opt: 266 Z-score: 334.1 bits: 71.6 E(32554): 2.7e-12 Smith-Waterman score: 497; 29.5% identity (56.0% similar) in 427 aa overlap (58-440:258-680) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG : .:. .::::: ::.:: . . .:.. CCDS51 QSSTPAPVKKSGKLRQQIDVKAELEKRQGGKQLLNLVVIGHVDAGKSTLMGHMLYLLGNI 230 240 250 260 270 280 90 100 110 120 130 pF1KE5 GGAKFKKYEE---------------IDNAPEERARGITINAAHVEYSTAARHYAHTDCPG . ..:::. .:.. ::: ::.:.... ... :... . : :: CCDS51 NKRTMHKYEQESKKAGKASFAYAWVLDETGEERERGVTMDVGMTKFETTTKVITLMDAPG 290 300 310 320 330 340 140 150 160 170 180 pF1KE5 HADYVKNMITGTAPLDGCILVVAANDGPMP-------QTREHLLLARQIGVEHVVVYVNK : :.. :::::.: : .::: :. : . ::::: ::.:..:: ...: ::: CCDS51 HKDFIPNMITGAAQADVAVLVVDASRGEFEAGFETGGQTREHGLLVRSLGVTQLAVAVNK 350 360 370 380 390 400 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 ADAVQ-DSEMVELVELEIRELLTEFGYKGEETPVIVGSALCA--LEGRDPELGLKSVQK- : :. ..: . . .. ..: . :.: .. : :.: . : :. : . : CCDS51 MDQVNWQQERFQEITGKLGHFLKQAGFKESDVGFIPTSGLSGENLITRSQSSELTKWYKG 410 420 430 440 450 460 250 260 270 280 290 pF1KE5 --LLDAVDTYIPVPARDLEKPFLLPVEAVYSVPGRGTVVTGTLERGILKKGDECELLGHS ::. .:.. : : :...::: : : :.. : : .:: .: : .. :: .::. CCDS51 LCLLEQIDSFKP-PQRSIDKPFRLCVSDVFKDQGSGFCITGKIEAGYIQTGD--RLLAMP 470 480 490 500 510 520 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 KNIRTVVTGIEMFHKSLERAEAGDNLGALVRGLKREDLRRGLVMVKPG-SIKPHQKVEAQ : .: :: . . .. : :::... . :. . : .. : :: . .:. CCDS51 PNETCTVKGITLHDEPVDWAAAGDHVSLTLVGMDIIKINVGCIFCGPKVPIKACTRFRAR 530 540 550 560 570 580 360 370 380 390 400 pF1KE5 VYILSKE-EGGRHKPFVSHFMPV--------MFSLTWDMACRIILPPEKELAMPGEDLKF . :.. : . : . :.. : ..:. . .. : :. :.. CCDS51 ILIFNIEIPITKGFPVLLHYQTVSEPAVIKRLISVLNKSTGEVTKKKPKFLT-KGQNALV 590 600 610 620 630 640 410 420 430 440 450 pF1KE5 NLILRQPMILEKGQ------RFTLRDGNRTIGTGLVTNTLAMTEEEKNIKWG .: ..:. :: . :: :: :. ::..:.:: CCDS51 ELQTQRPIALELYKDFKELGRFMLRYGGSTIAAGVVTEIKE 650 660 670 680 >>CCDS14336.1 GSPT2 gene_id:23708|Hs108|chrX (628 aa) initn: 430 init1: 147 opt: 265 Z-score: 333.4 bits: 71.4 E(32554): 3e-12 Smith-Waterman score: 389; 28.3% identity (54.3% similar) in 339 aa overlap (58-362:201-529) 30 40 50 60 70 80 pF1KE5 QGLLRLLKAPALPLLCRGLAVEAKKTYVRDKPHVNVGTIGHVDHGKTTLTAAITKILAEG : :::: ::::: ::.:. . : . . 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