Result of FASTA (omim) for pFN21AE3486
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3486, 1792 aa
  1>>>pF1KE3486 1792 - 1792 aa - 1792 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.9149+/-0.000572; mu= -22.5973+/- 0.036
 mean_var=725.5423+/-148.920, 0's: 0 Z-trim(123.6): 90  B-trim: 855 in 1/55
 Lambda= 0.047615
 statistics sampled from 43473 (43579) to 43473 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.768), E-opt: 0.2 (0.511), width:  16
 Scan time: 19.910

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_008841 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga (1792) 11889 833.5       0
NP_061173 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga (1758) 7278 516.7 7.6e-145
NP_116015 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein liga ( 118)  654 60.8 9.3e-09
XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819)  409 44.6  0.0047
XP_016855517 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 819)  409 44.6  0.0047
XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 863)  409 44.6  0.0049
XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 820)  408 44.5  0.0049
XP_005245778 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 902)  409 44.6   0.005
XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 864)  408 44.6  0.0051
XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 903)  408 44.6  0.0053
XP_016855514 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821)  406 44.4  0.0054
XP_016855515 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 821)  406 44.4  0.0054
XP_016855502 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 865)  406 44.4  0.0056
NP_005830 (OMIM: 605975) serine/arginine repetitiv ( 904)  406 44.4  0.0058
XP_016855508 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/argi ( 901)  401 44.1  0.0074


>>NP_008841 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein ligase R  (1792 aa)
 initn: 11889 init1: 11889 opt: 11889  Z-score: 4433.2  bits: 833.5 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 11889; 100.0% identity (100.0% similar) in 1792 aa overlap (1-1792:1-1792)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 FTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 FTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

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pF1KE3 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790  
pF1KE3 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
             1750      1760      1770      1780      1790  

>>NP_061173 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein ligase R  (1758 aa)
 initn: 7214 init1: 7214 opt: 7278  Z-score: 2721.4  bits: 516.7 E(85289): 7.6e-145
Smith-Waterman score: 11596; 98.1% identity (98.1% similar) in 1792 aa overlap (1-1792:1-1758)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NFESGPRIKKSTGIPRSFMMEVKDPNMKGAMLTNTGKYAIPTIDAEAYAIGKKEKPPFLP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 EEPSSSSEEDDPIPDELLCLICKDIMTDAVVIPCCGNSYCDECIRTALLESDEHTCPTCH
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 QNDVSPDALIANKFLRQAVNNFKNETGYTKRLRKQLPPPPPPIPPPRPLIQRNLQPLMRS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PISRQQDPLMIPVTSSSTHPAPSISSLTSNQSSLAPPVSGNPSSAPAPVPDITATVSISV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HSEKSDGPFRDSDNKILPAAALASEHSKGTSSIAITALMEEKGYQVPVLGTPSLLGQSLL
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HGQLIPTTGPVRINTARPGGGRPGWEHSNKLGYLVSPPQQIRRGERSCYRSINRGRHHSE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RSQRTQGPSLPATPVFVPVPPPPLYPPPPHTLPLPPGVPPPQFSPQFPPGQPPPAGYSVP
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEEEKKKSKLDE
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::         
NP_061 PPGFPPAPANLSTPWVSSGVQTAHSNTIPTTQAPPLSREEFYREQRRLKEE---------
              610       620       630       640       650          

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 FTNDFAKELMEYKKIQKERRRSFSRSKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
                                :::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 -------------------------SKSPYSGSSYSRSSYTYSKSRSGSTRSRSYSRSFS
                                      660       670       680      

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RSHSRSYSRSPPYPRRGRGKSRNYRSRSRSHGYHRSRSRSPPYRRYHSRSRSPQAFRGQS
        690       700       710       720       730       740      

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PNKRNVPQGETEREYFNRYREVPPPYDMKAYYGRSVDFRDPFEKERYREWERKYREWYEK
        750       760       770       780       790       800      

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 YYKGYAAGAQPRPSANRENFSPERFLPLNIRNSPFTRGRREDYVGGQSHRSRNIGSNYPE
        810       820       830       840       850       860      

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KLSARDGHNQKDNTKSKEKESENAPGDGKGNKHKKHRKRRKGEESEGFLNPELLETSRKS
        870       880       890       900       910       920      

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 REPTGVEENKTDSLFVLPSRDDATPVRDEPMDAESITFKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTK
        930       940       950       960       970       980      

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 RKNDGSAVSKKENIVKPAKGPQEKVDGERERSPRSEPPIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQK
        990      1000      1010      1020      1030      1040      

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDYSKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPL
       1050      1060      1070      1080      1090      1100      

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLEVTEIVKPSPKRKMEPDTEKMDRTPEKDKI
       1110      1120      1130      1140      1150      1160      

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SLSAPAKKIKLNRETGKKIGSTENISNTKEPSEKLESTSSKVKQEKVKGKVRRKVTGTEG
       1170      1180      1190      1200      1210      1220      

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSSTLVDYTSTSSTGGSPVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSK
       1230      1240      1250      1260      1270      1280      

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 WDKDDFESEEEDVKSTQPISSVGKPASVIKNVSTKPSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDV
       1290      1300      1310      1320      1330      1340      

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SHEIIQHEVKSSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNF
       1350      1360      1370      1380      1390      1400      

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 KSLSQSSKEARTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDS
       1410      1420      1430      1440      1450      1460      

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PSRNKDSASGQKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKS
       1470      1480      1490      1500      1510      1520      

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 VDKNPCKDREKHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKSTVKPKPQLSH
       1530      1540      1550      1560      1570      1580      

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSRLSSDLTRETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTA
       1590      1600      1610      1620      1630      1640      

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 AVVQVGISRNQSHSSPSVSPSRSHSPSGSQTRSHSSSASSAESQDSKKKKKKKEKKKHKK
       1650      1660      1670      1680      1690      1700      

             1750      1760      1770      1780      1790  
pF1KE3 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV
       1710      1720      1730      1740      1750        

>>NP_116015 (OMIM: 600938) E3 ubiquitin-protein ligase R  (118 aa)
 initn: 652 init1: 652 opt: 654  Z-score: 278.2  bits: 60.8 E(85289): 9.3e-09
Smith-Waterman score: 654; 94.4% identity (97.2% similar) in 108 aa overlap (1-108:1-108)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_116 MSCVHYKFSSKLNYDTVTFDGLHISLCDLKKQIMGREKLKAADCDLQITNAQTKEEYTDD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAIDDSSASISLAQLTKTANL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.  .. :            
NP_116 NALIPKNSSVIVRRIPIGGVKSTSKTYVISRTEPAMATTKAVCKNTISHFFYTLLLPL  
               70        80        90       100       110          

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 AEANASEEDKIKAMMSQSGHEYDPINYMKKPLGPPPPSYTCFRCGKPGHYIKNCPTNGDK

>>XP_016855518 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine  (819 aa)
 initn: 250 init1: 140 opt: 409  Z-score: 175.8  bits: 44.6 E(85289): 0.0047
Smith-Waterman score: 452; 23.4% identity (51.9% similar) in 770 aa overlap (1028-1750:27-746)

      1000      1010      1020      1030       1040      1050      
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
                                     .: .:::.  :.   . : .  ..:. ..:
XP_016     MMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
                   10        20        30        40        50      

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           .::  :.  : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
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       :  .:::..  : : . ::      .:.  ...    .:.  .  . .:  ... .  . 
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       .. .:  .:      .   :. ..::     :  ..:.     :  . .   . : :.: 
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pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
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>>XP_016855504 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine  (863 aa)
 initn: 319 init1: 140 opt: 409  Z-score: 175.5  bits: 44.6 E(85289): 0.0049
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XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
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XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
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pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
       :  .:::..  : : . ::      .:.  ...    .:.  .  . .:  ... .  . 
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
         220       230       240       250       260       270     

         1230      1240          1250         1260      1270       
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTE---GSSSTLVDYTSTSSTGGS
        :  ..:: . ..   ..    .... .. :::.  ..    ::::.  .  : :     
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKP
         280       290       300       310       320       330     

      1280      1290      1300      1310      1320      1330       
pF1KE3 PVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQ
       : : :     :.:   ..         .:         .:  :  ..   .. . .....
XP_016 PKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPA-------TPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSR
         340       350       360              370       380        

      1340      1350          1360       1370      1380        1390
pF1KE3 PISSVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEK-ESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVK
          : :. .:: :. .:.    ::   : :.: :   ::. .:  : .. . .:.  . .
XP_016 VSVSPGR-TSVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRKVELSESEE-DKGGKMAAADSVQQRRQYR
      390        400       410        420        430       440     

             1400      1410      1420      1430      1440      1450
pF1KE3 SSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEA
        .....::..:..     :  : : : ::..     :.... :  ...  .: : :    
XP_016 RQNQQSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---P
         450            460        470           480       490     

             1460      1470      1480      1490      1500      1510
pF1KE3 RTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASG
       :  .:. : :.   .. .:   ..    .      .::       ::  ::   . : : 
XP_016 RKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP
            500       510       520       530       540       550  

             1520      1530      1540      1550      1560      1570
pF1KE3 QKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDRE
       .. .:  .:      .   :. ..::     :  ..:.     :  . .   . : :.: 
XP_016 RRYSPPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRS
            560         570          580          590       600    

             1580      1590      1600      1610       1620         
pF1KE3 KHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLT
       . : . :. . :: ..     .   ..  .:  . : .:  . .:.:.  ..:     . 
XP_016 SPVTKRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVR
          610       620           630       640       650       660

    1630      1640      1650      1660      1670      1680         
pF1KE3 RETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISR
       :    :.  :.  .: : :.  ...      .:.  . : ..::  : .  .: .:. ::
XP_016 RG---ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSR
                 670       680             690        700       710

    1690            1700                1710      1720         1730
pF1KE3 NQSHS------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKK
       . : :      .: . ::  .:.::: .        ...: . : :  ...:..   :::
XP_016 SVSGSPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKK
              720       730       740       750       760       770

             1740      1750      1760      1770      1780      1790
pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
       :::. ::::: :::::::::                                        
XP_016 KKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKE
              780       790       800       810       820       830

>>XP_016855516 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine  (820 aa)
 initn: 319 init1: 140 opt: 408  Z-score: 175.5  bits: 44.5 E(85289): 0.0049
Smith-Waterman score: 453; 23.0% identity (52.6% similar) in 766 aa overlap (1028-1750:27-747)

      1000      1010      1020      1030       1040      1050      
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
                                     .: .:::.  :.   . : .  ..:. ..:
XP_016     MMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
                   10        20        30        40        50      

         1060      1070      1080      1090      1100      1110    
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
           .::  :.  : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
         60        70        80         90       100       110     

         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
       :.. . .  . .   : . .::.  : . . : :. . .....    :. .:. : : . 
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
          120       130       140       150          160       170 

          1180        1190           1200        1210      1220    
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
       :  .:::..  : : . ::      .:.  ...    .:.  .  . .:  ... .  . 
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
             180       190       200       210       220       230 

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pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVR
        :  ..:: . ..   ..    .... .. :::.  .. . :..  . .:.:: . :: .
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGS--SSSSSSSRSRSPPK
             240       250       260       270         280         

             1290      1300      1310      1320      1330      1340
pF1KE3 KSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPIS
       :  ..:..     . .    .      .        :... .    .:..   ::   .:
XP_016 KPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTR-KSRVSVS
     290       300       310       320       330       340         

             1350          1360      1370      1380        1390    
pF1KE3 SVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVKSSKN
            ..: :. .:.    ::   : :.:  : ::. .:  : .. . .:.  . . ...
XP_016 PGRTSGKVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRK-VELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQ
      350       360       370         380       390       400      

         1400      1410      1420      1430      1440      1450    
pF1KE3 SASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEARTSD
       ..::..:..     :  : : : ::..     :.... :  ...  .: : :    :  .
XP_016 QSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---PRKRQ
        410            420            430       440          450   

         1460      1470      1480      1490      1500      1510    
pF1KE3 KHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASGQKNK
       :. : :.   .. .:   ..    .      .::       ::  ::   . : : .. .
XP_016 KETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYS
           460       470       480       490       500       510   

         1520      1530      1540      1550      1560      1570    
pF1KE3 PREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDREKHVL
       :  .:      .   :. ..::     :  ..:.     :  . .   . : :.: . : 
XP_016 PPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVT
           520         530          540          550       560     

         1580      1590      1600      1610       1620      1630   
pF1KE3 EARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETD
       . :. . :: ..     .   ..  .:  . : .:  . .:.:.  ..:     . :   
XP_016 KRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVRRG--
         570           580       590       600       610           

          1640      1650      1660      1670      1680      1690   
pF1KE3 EAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISRNQSH
        :.  :.  .: : :.  ...      .:.  . : ..::  : .  .: .:. ::. : 
XP_016 -ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSRSVSG
      620       630             640       650        660       670 

                1700                1710      1720         1730    
pF1KE3 S------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKKKKKE
       :      .: . ::  .:.::: .        ...: . : :  ...:..   ::::::.
XP_016 SPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKKKKKK
             680       690       700       710       720       730 

         1740      1750      1760      1770      1780      1790    
pF1KE3 KKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV  
        ::::: :::::::::                                            
XP_016 DKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKETESE
             740       750       760       770       780       790 

>>XP_005245778 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine  (902 aa)
 initn: 250 init1: 140 opt: 409  Z-score: 175.3  bits: 44.6 E(85289): 0.005
Smith-Waterman score: 452; 23.4% identity (51.9% similar) in 770 aa overlap (1028-1750:110-829)

      1000      1010      1020      1030       1040      1050      
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
                                     .: .:::.  :.   . : .  ..:. ..:
XP_005 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
      80        90       100       110       120       130         

         1060      1070      1080      1090      1100      1110    
pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
           .::  :.  : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_005 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
     140       150       160        170       180       190        

         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
       :.. . .  . .   : . .::.  : . . : :. . .....    :. .:. : : . 
XP_005 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
       200       210       220       230       240          250    

          1180        1190           1200        1210      1220    
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
       :  .:::..  : : . ::      .:.  ...    .:.  .  . .:  ... .  . 
XP_005 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
          260       270       280       290       300       310    

         1230      1240          1250         1260      1270       
pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTE---GSSSTLVDYTSTSSTGGS
        :  ..:: . ..   ..    .... .. :::.  ..    ::::.  .  : :     
XP_005 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGSSSSSSSSRSRSPPKKP
          320       330       340       350       360       370    

      1280      1290      1300      1310      1320      1330       
pF1KE3 PVRKSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQ
       : : :     :.:   ..         .:         .:  :  ..   .. . .....
XP_005 PKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPA-------TPPPKTRHSPTPQQSNRTRKSR
          380       390       400              410       420       

      1340      1350          1360       1370      1380        1390
pF1KE3 PISSVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEK-ESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVK
          : :. .:: :. .:.    ::   : :.: :   ::. .:  : .. . .:.  . .
XP_005 VSVSPGR-TSVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRKVELSESEE-DKGGKMAAADSVQQRRQYR
       430        440       450        460        470       480    

             1400      1410      1420      1430      1440      1450
pF1KE3 SSKNSASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEA
        .....::..:..     :  : : : ::..     :.... :  ...  .: : :    
XP_005 RQNQQSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---P
          490            500        510           520       530    

             1460      1470      1480      1490      1500      1510
pF1KE3 RTSDKHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASG
       :  .:. : :.   .. .:   ..    .      .::       ::  ::   . : : 
XP_005 RKRQKETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSP
             540       550       560       570       580       590 

             1520      1530      1540      1550      1560      1570
pF1KE3 QKNKPREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDRE
       .. .:  .:      .   :. ..::     :  ..:.     :  . .   . : :.: 
XP_005 RRYSPPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRS
             600         610          620          630       640   

             1580      1590      1600      1610       1620         
pF1KE3 KHVLEARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLT
       . : . :. . :: ..     .   ..  .:  . : .:  . .:.:.  ..:     . 
XP_005 SPVTKRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVR
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    1630      1640      1650      1660      1670      1680         
pF1KE3 RETDEAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISR
       :    :.  :.  .: : :.  ...      .:.  . : ..::  : .  .: .:. ::
XP_005 RG---ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSR
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pF1KE3 NQSHS------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKK
       . : :      .: . ::  .:.::: .        ...: . : :  ...:..   :::
XP_005 SVSGSPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKK
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             1740      1750      1760      1770      1780      1790
pF1KE3 KKKEKKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSV
       :::. ::::: :::::::::                                        
XP_005 KKKKDKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKE
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>>XP_016855503 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine  (864 aa)
 initn: 319 init1: 140 opt: 408  Z-score: 175.1  bits: 44.6 E(85289): 0.0051
Smith-Waterman score: 453; 23.0% identity (52.6% similar) in 766 aa overlap (1028-1750:71-791)

      1000      1010      1020      1030       1040      1050      
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
                                     .: .:::.  :.   . : .  ..:. ..:
XP_016 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
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pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
           .::  :.  : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
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         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
       :.. . .  . .   : . .::.  : . . : :. . .....    :. .:. : : . 
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
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pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
       :  .:::..  : : . ::      .:.  ...    .:.  .  . .:  ... .  . 
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
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pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVR
        :  ..:: . ..   ..    .... .. :::.  .. . :..  . .:.:: . :: .
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGS--SSSSSSSRSRSPPK
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pF1KE3 KSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPIS
       :  ..:..     . .    .      .        :... .    .:..   ::   .:
XP_016 KPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTR-KSRVSVS
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pF1KE3 SVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVKSSKN
            ..: :. .:.    ::   : :.:  : ::. .:  : .. . .:.  . . ...
XP_016 PGRTSGKVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRK-VELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQ
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pF1KE3 SASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEARTSD
       ..::..:..     :  : : : ::..     :.... :  ...  .: : :    :  .
XP_016 QSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---PRKRQ
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pF1KE3 KHDSTRASSNKDFTPNRDKKTDYDTREYSSSKRRDEKNELTRRKDSPSRNKDSASGQKNK
       :. : :.   .. .:   ..    .      .::       ::  ::   . : : .. .
XP_016 KETSPRGRRRRSPSPPPTRRRRSPSPAPPPRRRRTPTPPPRRRTPSPPPRRRSPSPRRYS
       500       510       520       530       540       550       

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pF1KE3 PREERDLPKKGTGDSKKSNSSPSRDRKPHDHKATYDTKRPNEETKSVDKNPCKDREKHVL
       :  .:      .   :. ..::     :  ..:.     :  . .   . : :.: . : 
XP_016 PPIQRRYSP--SPPPKRRTASPP---PPPKRRAS---PSPPPKRRVSHSPPPKQRSSPVT
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pF1KE3 EARNNKESSGNKLLYILNPPETQVEKEQITGQIDKS-TVKPKPQLSHSSRLSSDLTRETD
       . :. . :: ..     .   ..  .:  . : .:  . .:.:.  ..:     . :   
XP_016 KRRSPSLSSKHRK----GSSPSRSTREARSPQPNKRHSPSPRPRAPQTSSSPPPVRRG--
     610       620           630       640       650       660     

          1640      1650      1660      1670      1680      1690   
pF1KE3 EAAFEPDYNESDSESNVSVKEEESSGNISKDLKDKIVEKAKESLDTAAVVQVGISRNQSH
        :.  :.  .: : :.  ...      .:.  . : ..::  : .  .: .:. ::. : 
XP_016 -ASSSPQRRQSPSPSTRPIRR------VSRTPEPKKIKKAA-SPSPQSVRRVSSSRSVSG
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pF1KE3 S------SPSVSPS--RSHSPSGS--------QTRSHSSSASSAESQDSK---KKKKKKE
       :      .: . ::  .:.::: .        ...: . : :  ...:..   ::::::.
XP_016 SPEPAAKKPPAPPSPVQSQSPSTNWSPAVPVKKAKSPTPSPSPPRNSDQEGGGKKKKKKK
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pF1KE3 KKKHKKHKKHKKHKKHAGTEVELEKSQKHKHKKKKSKKNKDKEKEKEKDDQKVKSVTV  
        ::::: :::::::::                                            
XP_016 DKKHKKDKKHKKHKKHKKEKAVAAAAAAAVTPAAIAAATTTLAQEEPVAAPEPKKETESE
         780       790       800       810       820       830     

>>XP_016855507 (OMIM: 605975) PREDICTED: serine/arginine  (903 aa)
 initn: 250 init1: 140 opt: 408  Z-score: 174.9  bits: 44.6 E(85289): 0.0053
Smith-Waterman score: 453; 23.0% identity (52.6% similar) in 766 aa overlap (1028-1750:110-830)

      1000      1010      1020      1030       1040      1050      
pF1KE3 FKSVSEKDKRERDKPKAKGDKTKRKNDGSAVSKKENIVK-PAKGPQEKVDGERERSPRSE
                                     .: .:::.  :.   . : .  ..:. ..:
XP_016 PDSKMMQINLTGFLNGKNAREFMGELWPLLLSAQENIAGIPSAFLELKKEEIKQRQIEQE
      80        90       100       110       120       130         

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pF1KE3 P--PIKKAKEETPKTDNTKSSSSSQKDEKITGTPRKAHSKSAKEHQETKPVKEEKVKKDY
           .::  :.  : :. .. :: .: :. . .::. .:.: . .....::..:. :...
XP_016 KLASMKKQDEDKDKRDKEEKESSREKRER-SRSPRRRKSRSPSPRRRSSPVRRER-KRSH
     140       150       160        170       180       190        

         1120      1130      1140      1150      1160      1170    
pF1KE3 SKDVKSEKLTTKEEKAKKPNEKNKPLDNKGEKRKRKTEEKGVDKDFESSSMKISKLE-VT
       :.. . .  . .   : . .::.  : . . : :. . .....    :. .:. : : . 
XP_016 SRSPRHRTKSRSPSPAPEKKEKTPELPEPSVKVKEPSVQEATST---SDILKVPKPEPIP
       200       210       220       230       240          250    

          1180        1190           1200        1210      1220    
pF1KE3 EIVKPSPKR--KMEPDTEKM-----DRTPEKDKISLSAPA--KKIKLNRETGKKIGSTEN
       :  .:::..  : : . ::      .:.  ...    .:.  .  . .:  ... .  . 
XP_016 EPKEPSPEKNSKKEKEKEKTRPRSRSRSKSRSRTRSRSPSHTRPRRRHRSRSRSYSPRRR
          260       270       280       290       300       310    

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pF1KE3 ISNTKEPSEKLESTSSKV----KQEKVKGKVRRKVTGTEGSSSTLVDYTSTSSTGGSPVR
        :  ..:: . ..   ..    .... .. :::.  .. . :..  . .:.:: . :: .
XP_016 PSPRRRPSPRRRTPPRRMPPPPRHRRSRSPVRRRRRSSASLSGS--SSSSSSSRSRSPPK
          320       330       340       350         360       370  

             1290      1300      1310      1320      1330      1340
pF1KE3 KSEEKTDTKRTVIKTMEEYNNDNTAPAEDVIIMIQVPQSKWDKDDFESEEEDVKSTQPIS
       :  ..:..     . .    .      .        :... .    .:..   ::   .:
XP_016 KPPKRTSSPPRKTRRLSPSASPPRRRHRPSPPATPPPKTRHSPTPQQSNRTR-KSRVSVS
            380       390       400       410       420        430 

             1350          1360      1370      1380        1390    
pF1KE3 SVGKPASVIKNVSTK----PSNIVKYPEKESEPSEKIQKFTKDVSHEIIQH--EVKSSKN
            ..: :. .:.    ::   : :.:  : ::. .:  : .. . .:.  . . ...
XP_016 PGRTSGKVTKHKGTEKRESPSPAPK-PRK-VELSESEDKGGKMAAADSVQQRRQYRRQNQ
             440       450         460       470       480         

         1400      1410      1420      1430      1440      1450    
pF1KE3 SASSEKGKTKDRDYSVLEKENPEKRKNSTQPEKESNLDRLNEQGNFKSLSQSSKEARTSD
       ..::..:..     :  : : : ::..     :.... :  ...  .: : :    :  .
XP_016 QSSSDSGSS-----SSSEDERP-KRSHV----KNGEVGRRRRHSPSRSASPS---PRKRQ
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