Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE2038
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE2038, 640 aa
1>>>pF1KE2038 640 - 640 aa - 640 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7164+/-0.00133; mu= 18.3852+/- 0.079
mean_var=148.8445+/-27.804, 0's: 0 Z-trim(105.9): 198 B-trim: 7 in 1/50
Lambda= 0.105125
statistics sampled from 8466 (8683) to 8466 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 3.530
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10583.1 UMOD gene_id:7369|Hs108|chr16 ( 640) 4550 703.1 3e-202
CCDS61876.1 UMOD gene_id:7369|Hs108|chr16 ( 673) 4374 676.4 3.4e-194
CCDS10582.2 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 ( 534) 1879 297.9 2.4e-80
CCDS42128.1 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 ( 537) 1863 295.4 1.3e-79
CCDS45432.1 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 ( 387) 1271 205.5 1.1e-52
CCDS45433.1 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 ( 390) 1271 205.5 1.1e-52
CCDS8434.1 TECTA gene_id:7007|Hs108|chr11 (2155) 757 128.5 9.3e-29
CCDS7318.1 OIT3 gene_id:170392|Hs108|chr10 ( 545) 476 85.1 2.8e-16
CCDS44864.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 815) 410 75.3 3.6e-13
CCDS8746.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 816) 410 75.3 3.6e-13
CCDS53781.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 839) 410 75.3 3.7e-13
CCDS44863.1 NELL2 gene_id:4753|Hs108|chr12 ( 866) 410 75.3 3.7e-13
CCDS56214.1 UMODL1 gene_id:89766|Hs108|chr21 (1246) 392 72.8 3.1e-12
CCDS42936.1 UMODL1 gene_id:89766|Hs108|chr21 (1318) 392 72.9 3.2e-12
CCDS56215.1 UMODL1 gene_id:89766|Hs108|chr21 (1374) 392 72.9 3.3e-12
CCDS42935.1 UMODL1 gene_id:89766|Hs108|chr21 (1446) 392 72.9 3.4e-12
CCDS54344.1 LTBP1 gene_id:4052|Hs108|chr2 (1353) 366 68.9 5e-11
CCDS14069.1 FBLN1 gene_id:2192|Hs108|chr22 ( 683) 359 67.5 6.9e-11
>>CCDS10583.1 UMOD gene_id:7369|Hs108|chr16 (640 aa)
initn: 4550 init1: 4550 opt: 4550 Z-score: 3744.4 bits: 703.1 E(32554): 3e-202
Smith-Waterman score: 4550; 100.0% identity (100.0% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KE2 MGQPSLTWMLMVVVASWFITTAATDTSEARWCSECHSNATCTEDEAVTTCTCQEGFTGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGQPSLTWMLMVVVASWFITTAATDTSEARWCSECHSNATCTEDEAVTTCTCQEGFTGDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE2 LTCVDLDECAIPGAHNCSANSSCVNTPGSFSCVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAEPGLSHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LTCVDLDECAIPGAHNCSANSSCVNTPGSFSCVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAEPGLSHC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE2 HALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWHCECSPGSCGPGLDCVPEGDALVCADPCQAHRTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWHCECSPGSCGPGLDCVPEGDALVCADPCQAHRTL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE2 DEYWRSTEYGEGYACDTDLRGWYRFVGQGGARMAETCVPVLRCNTAAPMWLNGTHPSSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DEYWRSTEYGEGYACDTDLRGWYRFVGQGGARMAETCVPVLRCNTAAPMWLNGTHPSSDE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE2 GIVSRKACAHWSGHCCLWDASVQVKACAGGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GIVSRKACAHWSGHCCLWDASVQVKACAGGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEEC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE2 SIDEDCKSNNGRWHCQCKQDFNITDISLLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGFDKVFMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SIDEDCKSNNGRWHCQCKQDFNITDISLLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGFDKVFMY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE2 LSDSRCSGFNDRDNRDWVSVVTPARDGPCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LSDSRCSGFNDRDNRDWVSVVTPARDGPCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE2 INFACSYPLDMKVSLKTALQPMVSALNIRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 INFACSYPLDMKVSLKTALQPMVSALNIRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE2 TEAFLYVGTMLDGGDLSRFALLMTNCYATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TEAFLYVGTMLDGGDLSRFALLMTNCYATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE2 GESSQGRFSVQMFRFAGNYDLVYLHCEVYLCDTMNEKCKPTCSGTRFRSGSVIDQSRVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GESSQGRFSVQMFRFAGNYDLVYLHCEVYLCDTMNEKCKPTCSGTRFRSGSVIDQSRVLN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE2 LGPITRKGVQATVSRAFSSLGLLKVWLPLLLSATLTLTFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LGPITRKGVQATVSRAFSSLGLLKVWLPLLLSATLTLTFQ
610 620 630 640
>>CCDS61876.1 UMOD gene_id:7369|Hs108|chr16 (673 aa)
initn: 4374 init1: 4374 opt: 4374 Z-score: 3599.9 bits: 676.4 E(32554): 3.4e-194
Smith-Waterman score: 4467; 95.1% identity (95.1% similar) in 672 aa overlap (2-640:2-673)
10 20 30
pF1KE2 MGQPSLTWMLMVVVASWFITTAATDTSEAR------------------------------
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 MGQPSLTWMLMVVVASWFITTAATDTSEARTKYNCPARWSWRTPQRGGDTEQGPDEDFTS
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80
pF1KE2 ---WCSECHSNATCTEDEAVTTCTCQEGFTGDGLTCVDLDECAIPGAHNCSANSSCVNTP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QGRWCSECHSNATCTEDEAVTTCTCQEGFTGDGLTCVDLDECAIPGAHNCSANSSCVNTP
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130 140
pF1KE2 GSFSCVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAEPGLSHCHALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 GSFSCVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAEPGLSHCHALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWH
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KE2 CECSPGSCGPGLDCVPEGDALVCADPCQAHRTLDEYWRSTEYGEGYACDTDLRGWYRFVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 CECSPGSCGPGLDCVPEGDALVCADPCQAHRTLDEYWRSTEYGEGYACDTDLRGWYRFVG
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 QGGARMAETCVPVLRCNTAAPMWLNGTHPSSDEGIVSRKACAHWSGHCCLWDASVQVKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 QGGARMAETCVPVLRCNTAAPMWLNGTHPSSDEGIVSRKACAHWSGHCCLWDASVQVKAC
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 AGGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEECSIDEDCKSNNGRWHCQCKQDFNITDIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 AGGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEECSIDEDCKSNNGRWHCQCKQDFNITDIS
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 LLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGFDKVFMYLSDSRCSGFNDRDNRDWVSVVTPARDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 LLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGFDKVFMYLSDSRCSGFNDRDNRDWVSVVTPARDG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 PCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIKINFACSYPLDMKVSLKTALQPMVSALN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 PCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIKINFACSYPLDMKVSLKTALQPMVSALN
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 IRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLDGGDLSRFALLMTNCY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 IRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLDGGDLSRFALLMTNCY
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 ATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVENGESSQGRFSVQMFRFAGNYDLVYLHCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 ATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVENGESSQGRFSVQMFRFAGNYDLVYLHCE
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 VYLCDTMNEKCKPTCSGTRFRSGSVIDQSRVLNLGPITRKGVQATVSRAFSSLGLLKVWL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS61 VYLCDTMNEKCKPTCSGTRFRSGSVIDQSRVLNLGPITRKGVQATVSRAFSSLGLLKVWL
610 620 630 640 650 660
630 640
pF1KE2 PLLLSATLTLTFQ
:::::::::::::
CCDS61 PLLLSATLTLTFQ
670
>>CCDS10582.2 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 (534 aa)
initn: 1790 init1: 959 opt: 1879 Z-score: 1555.9 bits: 297.9 E(32554): 2.4e-80
Smith-Waterman score: 1879; 52.1% identity (76.0% similar) in 526 aa overlap (122-639:17-534)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 CVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAEPGLSHCHALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWHCECS
::..:. : : :: : : :
CCDS10 MPHLMERMVGSGLLWLALVSCI------LTQASAVQRGYGNPIEAS
10 20 30 40
160 170 180 190 200
pF1KE2 PGSCGPGLDCVPEG--DALVCADPCQAHRTLDEYWRSTEYGEG-YACDTDLRGWYRFVGQ
: : ::: : .: :: :::: . ::: .:::: . : .:: .. :::::::.
CCDS10 --SYGLDLDCGAPGTPEAHVCFDPCQNYTLLDEPFRSTENSAGSQGCDKNMSGWYRFVGE
50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 GGARMAETCVPVLRCNTAAPMWLNGTHPSSDEGIVSRKACAHWSGHCCLWDASVQVKACA
::.::.:::: : ::.: ::::::::::. .::... :::::::.::.: . : ::::
CCDS10 GGVRMSETCVQVHRCQTDAPMWLNGTHPALGDGITNHTACAHWSGNCCFWKTEVLVKACP
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 GGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEE-CSIDEDCKSNNGRWHCQCKQDFNITDIS
:::.:: : . : :.: ::::::.:: ::. : .:.: . :. : : :.::.: .:.
CCDS10 GGYHVYRLEGTPWCNLRYCTDPSTVEDKCEKACRPEEECLALNSTWGCFCRQDLNSSDVH
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 LLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGF-DKVFMYLSDSRCSGFNDRDNRDWVSVVTPARD
:. .:.:: ..::.. :: : .::. ..:. :: : ::.. . ..:.::::..:..
CCDS10 SLQPQLDCGPREIKVKVDKCLLGGLGLGEEVIAYLRDPNCSSILQTEERNWVSVTSPVQA
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 GPCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIKINFACSYPLDMKVSLKTALQPMVSAL
. : ..: ::.::: :.::: :....:::: ..::: :.:::::::::..::::.::.:
CCDS10 SACRNILERNQTHAIYKNTLSLVNDFIIRDTILNINFQCAYPLDMKVSLQAALQPIVSSL
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 NIRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLDGGDLSRFALLMTNC
:. : :.: : ::::::: .::.::.:..: ::.:. ::::..:. :: ::: :.. ::
CCDS10 NVSVDGNGEFIVRMALFQDQNYTNPYEGDAVELSVESVLYVGAILEQGDTSRFNLVLRNC
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 YATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVENGESSQGRFSVQMFRFAGNYDLVYLHC
::::. . .: .:::::.. : . :::::.: :::.::..::::::: :::.::::.:::
CCDS10 YATPTEDKADLVKYFIIRNSCSNQRDSTIHVEENGQSSESRFSVQMFMFAGHYDLVFLHC
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 EVYLCDTMNEKCKPTCSGTRFRSG-SVIDQSRVLNLGPITRKGVQA--TVSRAFSSLGLL
:..:::..::.:.:.:: .. :: .:: .:::.::::::.:.:. ... . :. :.:
CCDS10 EIHLCDSLNEQCQPSCSRSQVRSEVPAIDLARVLDLGPITRRGAQSPGVMNGTPSTAGFL
460 470 480 490 500 510
630 640
pF1KE2 KVWLPLLLSATLTLTFQ
.: .::.. :. :
CCDS10 VAWPMVLLTVLLAWLF
520 530
>>CCDS42128.1 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 (537 aa)
initn: 1748 init1: 959 opt: 1863 Z-score: 1542.8 bits: 295.4 E(32554): 1.3e-79
Smith-Waterman score: 1863; 51.8% identity (75.6% similar) in 529 aa overlap (122-639:17-537)
100 110 120 130 140 150
pF1KE2 CVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAEPGLSHCHALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWHCECS
::..:. : : :: : : :
CCDS42 MPHLMERMVGSGLLWLALVSCI------LTQASAVQRGYGNPIEAS
10 20 30 40
160 170 180 190 200
pF1KE2 PGSCGPGLDCVPEG--DALVCADPCQAHRTLDEYWRSTEYGEG-YACDTDLRGWYRFVGQ
: : ::: : .: :: :::: . ::: .:::: . : .:: .. :::::::.
CCDS42 --SYGLDLDCGAPGTPEAHVCFDPCQNYTLLDEPFRSTENSAGSQGCDKNMSGWYRFVGE
50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KE2 GGARMAETCVPVLRCNTAAPMWLNGTHPSSDEGIVSRKACAHWSGHCCLWDASVQVKACA
::.::.:::: : ::.: ::::::::::. .::... :::::::.::.: . : ::::
CCDS42 GGVRMSETCVQVHRCQTDAPMWLNGTHPALGDGITNHTACAHWSGNCCFWKTEVLVKACP
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KE2 GGYYVYNLTAPPECHLAYCT---DPSSVEGTCEE-CSIDEDCKSNNGRWHCQCKQDFNIT
:::.:: : . : :.: ::: :::.:: ::. : .:.: . :. : : :.::.: .
CCDS42 GGYHVYRLEGTPWCNLRYCTVPRDPSTVEDKCEKACRPEEECLALNSTWGCFCRQDLNSS
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KE2 DISLLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGF-DKVFMYLSDSRCSGFNDRDNRDWVSVVTP
:. :. .:.:: ..::.. :: : .::. ..:. :: : ::.. . ..:.::::..:
CCDS42 DVHSLQPQLDCGPREIKVKVDKCLLGGLGLGEEVIAYLRDPNCSSILQTEERNWVSVTSP
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KE2 ARDGPCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIKINFACSYPLDMKVSLKTALQPMV
.. . : ..: ::.::: :.::: :....:::: ..::: :.:::::::::..::::.:
CCDS42 VQASACRNILERNQTHAIYKNTLSLVNDFIIRDTILNINFQCAYPLDMKVSLQAALQPIV
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KE2 SALNIRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLDGGDLSRFALLM
:.::. : :.: : ::::::: .::.::.:..: ::.:. ::::..:. :: ::: :..
CCDS42 SSLNVSVDGNGEFIVRMALFQDQNYTNPYEGDAVELSVESVLYVGAILEQGDTSRFNLVL
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KE2 TNCYATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVENGESSQGRFSVQMFRFAGNYDLVY
::::::. . .: .:::::.. : . :::::.: :::.::..::::::: :::.::::.
CCDS42 RNCYATPTEDKADLVKYFIIRNSCSNQRDSTIHVEENGQSSESRFSVQMFMFAGHYDLVF
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KE2 LHCEVYLCDTMNEKCKPTCSGTRFRSG-SVIDQSRVLNLGPITRKGVQA--TVSRAFSSL
::::..:::..::.:.:.:: .. :: .:: .:::.::::::.:.:. ... . :.
CCDS42 LHCEIHLCDSLNEQCQPSCSRSQVRSEVPAIDLARVLDLGPITRRGAQSPGVMNGTPSTA
460 470 480 490 500 510
630 640
pF1KE2 GLLKVWLPLLLSATLTLTFQ
:.: .: .::.. :. :
CCDS42 GFLVAWPMVLLTVLLAWLF
520 530
>>CCDS45432.1 GP2 gene_id:2813|Hs108|chr16 (387 aa)
initn: 1216 init1: 959 opt: 1271 Z-score: 1059.1 bits: 205.5 E(32554): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 1271; 51.4% identity (79.8% similar) in 356 aa overlap (289-639:32-387)
260 270 280 290 300 310
pF1KE2 DASVQVKACAGGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEE-CSIDEDCKSNNGRWHCQC
:::.:: ::. : .:.: . :. : : :
CCDS45 PHLMERMVGSGLLWLALVSCILTQASAVQRDPSTVEDKCEKACRPEEECLALNSTWGCFC
10 20 30 40 50 60
320 330 340 350 360 370
pF1KE2 KQDFNITDISLLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGF-DKVFMYLSDSRCSGFNDRDNRD
.::.: .:. :. .:.:: ..::.. :: : .::. ..:. :: : ::.. . ..:.
CCDS45 RQDLNSSDVHSLQPQLDCGPREIKVKVDKCLLGGLGLGEEVIAYLRDPNCSSILQTEERN
70 80 90 100 110 120
380 390 400 410 420 430
pF1KE2 WVSVVTPARDGPCGTVLTRNETHATYSNTLYLADEIIIRDLNIKINFACSYPLDMKVSLK
::::..:.. . : ..: ::.::: :.::: :....:::: ..::: :.:::::::::.
CCDS45 WVSVTSPVQASACRNILERNQTHAIYKNTLSLVNDFIIRDTILNINFQCAYPLDMKVSLQ
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pF1KE2 TALQPMVSALNIRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLDGGDL
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CCDS45 AALQPIVSSLNVSVDGNGEFIVRMALFQDQNYTNPYEGDAVELSVESVLYVGAILEQGDT
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500 510 520 530 540 550
pF1KE2 SRFALLMTNCYATPSSNATDPLKYFIIQDRCPHTRDSTIQVVENGESSQGRFSVQMFRFA
::: :.. ::::::. . .: .:::::.. : . :::::.: :::.::..::::::: ::
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310 320 330 340 350 360
620 630 640
pF1KE2 SRAFSSLGLLKVWLPLLLSATLTLTFQ
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CCDS45 NGTPSTAGFLVAWPMVLLTVLLAWLF
370 380
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320 330 340 350 360 370
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CCDS45 RQDLNSSDVHSLQPQLDCGPREIKVKVDKCLLGGLGLGEEVIAYLRDPNCSSILQTEERN
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CCDS45 WVSVTSPVQASACRNILERNQTHAIYKNTLSLVNDFIIRDTILNINFQCAYPLDMKVSLQ
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pF1KE2 TALQPMVSALNIRVGGTGMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLDGGDL
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CCDS45 AALQPIVSSLNVSVDGNGEFIVRMALFQDQNYTNPYEGDAVELSVESVLYVGAILEQGDT
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CCDS45 SRFNLVLRNCYATPTEDKADLVKYFIIRNSCSNQRDSTIHVEENGQSSESRFSVQMFMFA
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CCDS45 GHYDLVFLHCEIHLCDSLNEQCQPSCSRSQVRSEVPAIDLARVLDLGPITRRGAQSPGVM
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620 630 640
pF1KE2 SRAFSSLGLLKVWLPLLLSATLTLTFQ
. . :. :.: .: .::.. :. :
CCDS45 NGTPSTAGFLVAWPMVLLTVLLAWLF
370 380 390
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.. .. .... .. : : .:.::..::.: .:::.. . ..: .:.:. ...:..
CCDS84 PPYGNNSHDIIDAEVTCKAAQMEVSISKCKLFQLGFEREGVRINDRQCTGI---EGEDFI
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CCDS84 SFQINNTKGNCGNIVQSNGTHIMYKNTLWIESANNTGNIITRDRTINVEFSCAYELDIKI
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pF1KE2 SLKTALQPMVSALNIRVGGT-GMFTVRMALFQTPSYTQPYQGSSVTLSTEAFLYVGTMLD
:: ....::.:..:. : : : ..:::... :: .::. . :.:.:. ::::...
CCDS84 SLDSVVKPMLSVINLTVPTQEGSFITKMALYKNASYKHPYRQGEVVLTTRDVLYVGVFVV
1910 1920 1930 1940 1950 1960
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CCDS84 GADATHLILTLNKCYATPTRDSNDKLRYFIIEGGCQNLKDNTIGIEENAVSLTCRFHVTV
1970 1980 1990 2000 2010 2020
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CCDS84 FKFIGDYDEVHLHCAVSLCDSEKYSCKITCPHNSRIATDYTKEPKEQIISVGPIRRKRLD
2030 2040 2050 2060 2070 2080
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pF1KE2 ATVSRAFSSLGLLKVWLPLLLSATLTLTFQ
CCDS84 WCEDNGGCEQICTSRVDGPLCSCVTGTLQEDGKSCRASNSSMELQVWTLLLIMIQISLWH
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200 210 220 230 240 250
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CCDS73 LCDNHVNGEWYHFTGMAGDAMPTFCIPENHCGTHAPVWLNGSHPLEGDGIVQRQACASFN
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CCDS73 GNCCLWNTTVEVKACPGGYYVYRLTKPSVCFHVYCGHFYDICDEDCHGSCSDTSECTCAP
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: : : .:.:. . ..: . :. .: :::.. . : ::
CCDS73 GTVLGPDRQTCFDENECEQNNGGCSEICVNLKNSYRCECGVGRVLRSDGKTCEDVEGCHN
170 180 190 200 210 220
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pF1KE2 ----CQLKSLGFDKVF-----------------------------------------MYL
:. . :: .: . ..:
CCDS73 NNGGCSHSCLGSEKGYQCECPRGLVLSEDNHTCQVPVLCKSNAIEVNIPRELVGGLELFL
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CCDS73 TNTSCRGVS---NGTHVNILFSLKT--CGTVVDVVNDKIVASNLVTGLPKQTPGSSGDFI
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:: .. : .: .: . .: . . : :.: . :.: . .:. . .::.
CCDS73 IRTSKLLIPVTCEFPRLYTISEGYVPNLRNSPLEIMSRNHGIFPFTLEIFKDNEFEEPYR
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. ::. . :: : . .: . :. .:.:::.:. . :::..:.: : . :.
CCDS73 EALPTLKLRDSLYFG-IEPVVHVSGLESLVESCFATPTSKIDEVLKYYLIRDGC--VSDD
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... . . .:.: .:.:.: .. :.:::.: .: ...:. : : :.: :
CCDS73 SVKQYTSRDHLAKHFQVPVFKFVGKDHKEVFLHCRVLVCGVLDERSRCAQGCH-RRMRRG
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.
CCDS73 AGGEDSAGLQGQTLTGGPIRIDWED
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CCDS44 ALREDNAYCEDIDECA-EGRHYCRENTMCVNTPGSFMCICKTGYIRIDDYSCTEHDECIT
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. .:.:. : : . : : : : : . .: :. :..:.
CCDS44 IDECGTGRHSCANDTICFNLDGGYDCR--CPH-GKNCTGDCIHDGKVKHNGQIWVLENDR
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pF1KE2 --VKACAGGYYVYNLTAPPECHLAYCTDPSSVEGTCEECS--IDEDCKSNNGR-------
: .: .:. . . : : .:. : ::. .. .: .::.
CCDS44 CSVCSCQNGFVMCRRMV---CD---CENPTVDLFCCPECDPRLSSQCLHQNGETLYNSGD
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pF1KE2 -WHCQCKQDFNITDISLLEHRLECGANDMKVSLGKCQLKSLGFDKVFMYLSDSRCSGFND
: .:.:
CCDS44 TWVQNCQQCRCLQGEVDCWPLPCPDVECEFSILPENECCPRCVTDPCQADTIRNDITKTC
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Smith-Waterman score: 446; 29.9% identity (49.1% similar) in 338 aa overlap (31-319:400-721)
10 20 30 40 50
pF1KE2 MGQPSLTWMLMVVVASWFITTAATDTSEARWCSE---CHSNATCTEDEAVTTCTCQEGFT
.::: : :. : . . ..:.:..::
CCDS87 ESSGCPALDCPESHQITLSHSCCKVCKGYDFCSERHNCMENSICRNLNDRAVCSCRDGFR
370 380 390 400 410 420
60 70 80 90 100 110
pF1KE2 G---DGLTCVDLDECAIPGAHNCSANSSCVNTPGSFSCVCPEGFRLSPGLGCTDVDECAE
. :. : :.:::: : : : :. :::::::: :.: :. .::. :::
CCDS87 ALREDNAYCEDIDECA-EGRHYCRENTMCVNTPGSFMCICKTGYIRIDDYSCTEHDECIT
430 440 450 460 470 480
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pF1KE2 PGLSHCHALATCVNVVGSYLCVCPAGYRGDGWHCE--CSPGSCGPGLDCVPEGDALVCAD
. .: : : :.::.. ::: :: :.: :. :. : : : :. : :::
CCDS87 -NQHNCDENALCFNTVGGHNCVCKPGYTGNGTTCKAFCKDG-CRNGGACIA---ANVCAC
490 500 510 520 530 540
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pF1KE2 PCQAHRTLDEYWRSTEYGEGYA-CDT-----DLRGWYRFVGQGGAR-------MAETCVP
: :. . : ..:.. ::. .: :::. . : . .:.:
CCDS87 P-QGFTGPSCETDIDECSDGFVQCDSRANCINLPGWYHCECRDGYHDNGMFSPSGESCED
550 560 570 580 590 600
220 230 240 250 260
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. .:.:. : : . : : : : : . .: :. :..:.
CCDS87 IDECGTGRHSCANDTICFNLDGGYDCR--CPH-GKNCTGDCIHDGKVKHNGQIWVLENDR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]