Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3993
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3993, 274 aa
1>>>pF1KE3993 274 - 274 aa - 274 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0733+/-0.00119; mu= 10.1874+/- 0.070
mean_var=113.7747+/-23.457, 0's: 0 Z-trim(105.0): 233 B-trim: 245 in 1/49
Lambda= 0.120241
statistics sampled from 7914 (8213) to 7914 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.628), E-opt: 0.2 (0.252), width: 16
Scan time: 1.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10388.1 ASB7 gene_id:140460|Hs108|chr15 ( 274) 1835 329.7 1.4e-90
CCDS10387.1 ASB7 gene_id:140460|Hs108|chr15 ( 318) 1823 327.6 6.7e-90
CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 377 77.1 4.2e-14
CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 ( 367) 337 69.9 3e-12
CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 346 72.1 3.3e-12
CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 346 72.1 3.3e-12
CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 337 70.2 5.1e-12
CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 346 72.4 5.7e-12
CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250) 337 70.4 7.2e-12
CCDS34060.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1429) 337 70.4 8e-12
CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 337 70.5 9.7e-12
CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 337 70.5 9.7e-12
CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 337 70.9 1.8e-11
CCDS14536.1 PSMD10 gene_id:5716|Hs108|chrX ( 226) 315 65.9 2.9e-11
CCDS4798.1 ANKS1A gene_id:23294|Hs108|chr6 (1134) 315 66.5 9.5e-11
>>CCDS10388.1 ASB7 gene_id:140460|Hs108|chr15 (274 aa)
initn: 1835 init1: 1835 opt: 1835 Z-score: 1739.6 bits: 329.7 E(32554): 1.4e-90
Smith-Waterman score: 1835; 100.0% identity (100.0% similar) in 274 aa overlap (1-274:1-274)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKE
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CCDS10 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDIINAKSNDGWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDIINAKSNDGWTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GFLLRYAVIKSNHSYCRMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNYGADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GFLLRYAVIKSNHSYCRMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNYGADT
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE3 NTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
250 260 270
>>CCDS10387.1 ASB7 gene_id:140460|Hs108|chr15 (318 aa)
initn: 1823 init1: 1823 opt: 1823 Z-score: 1727.5 bits: 327.6 E(32554): 6.7e-90
Smith-Waterman score: 1823; 100.0% identity (100.0% similar) in 272 aa overlap (1-272:1-272)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 RCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDIINAKSNDGWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDIINAKSNDGWTP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 LHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 GFLLRYAVIKSNHSYCRMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNYGADT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GFLLRYAVIKSNHSYCRMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNYGADT
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KE3 NTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTRQPRNLQDLCRIKIRQCIGLQNLKLLDE
250 260 270 280 290 300
CCDS10 LPIAKVMKDYLKHKFDDI
310
>>CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 (784 aa)
initn: 332 init1: 166 opt: 377 Z-score: 366.7 bits: 77.1 E(32554): 4.2e-14
Smith-Waterman score: 377; 33.3% identity (68.3% similar) in 246 aa overlap (21-261:413-651)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTL
:...::. . :.:. . :. : .:
CCDS13 SRGSLSLSFEREPSTSDLGTTDVQKKKLVDAIVSGDTSKLMKILQPQDVDLALDS-GASL
390 400 410 420 430 440
60 70 80 90 100
pF1KE3 LHFSAARGKERCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRAR-IARLMLESEYRSDI
::... :.:.:.. .: ..:.:.... :. : ::.:. . :.: ...:.: :.
CCDS13 LHLAVEAGQEECAKWLLLNNANPNLSNRRGS-TPLHMAVER-RVRGVVELLLA---RKIS
450 460 470 480 490
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 INAKSNDGWTPLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKIL
.:::..: :: :: ::. : .: .::::: .: :. .. .: ::...: . . . :.::
CCDS13 VNAKDEDQWTALHFAAQNGDESSTRLLLEKNASVNEVDFEGRTPMHVACQHGQENIVRIL
500 510 520 530 540 550
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 LDHNANIDIQ--NGFL-LRYAVIKSNHSYCRMFL-QRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRD
: .......: ...: :.::. ... ... : :...: : ::.:::::.: :
CCDS13 LRRGVDVSLQGKDAWLPLHYAAWQGHLPIVKLLAKQPGVSVNAQTL-DGRTPLHLAAQRG
560 570 580 590 600 610
230 240 250 260 270
pF1KE3 DVLCARMLYNYGADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
::.: . .:.:. . .:::: :. . .:
CCDS13 HYRVARILIDLCSDVNVCSLLAQTPLHVAAETGHTSTARLLLHRGAGKEAMTSDGYTALH
620 630 640 650 660 670
CCDS13 LAARNGHLATVKLLVEEKADVLARGPLNQTALHLAAAHGHSEVVEELVSADVIDLFDEQG
680 690 700 710 720 730
>>CCDS33355.2 ANKRD44 gene_id:91526|Hs108|chr2 (367 aa)
initn: 288 init1: 107 opt: 337 Z-score: 333.5 bits: 69.9 E(32554): 3e-12
Smith-Waterman score: 343; 29.5% identity (64.5% similar) in 251 aa overlap (8-254:103-346)
10 20 30
pF1KE3 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQG
:. . : :.. :: : :. .. ..
CCDS33 MWLTPLHRAVASRSEEAVQVLIKHSADVNARDKNWQTPLHVAAANKA--VKCAEVIIPLL
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 YSPNGRDANGWTLLHFSAARGKERCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIA
: : : .: : :: .: :. . : ..: .::. .. : :::.::. :. ..
CCDS33 SSVNVSDRGGRTALHHAALNGHVEMVNLLLAKGANINAFDK-KDRRALHWAAYMGHLDVV
140 150 160 170 180
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 RLMLESEYRSDIINAKSNDGWTPLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLA
:... . .. :.. :.::::.:: :. . :. ::.. .:.: .. :.: :..:
CCDS33 ALLINHGAE---VTCKDKKGYTPLHAAASNGQINVVKHLLNLGVEIDEINVYGNTALHIA
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 IIRERSSCVKILLDHNANIDI--QNGFL-LRYAVIKSNHSYC-RMFLQRGADTNLGRLED
... :. :.:..::.. .::: :..:. ... . : ..... :::.:. . .:
CCDS33 CYNGQDAVVNELIDYGANVNQPNNNGFTPLHFAAASTHGALCLELLVNNGADVNI-QSKD
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 GQTPLHLSALRDDVLCARMLYNYGADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTS
:..:::..:.. .. : . :.. . . .:.::: :.
CCDS33 GKSPLHMTAVHGRFTRSQTLIQNGGEIDCVDKDGNTPLHVAARYGHELLINTLITSGADT
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 M
CCDS33 AK
>>CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863 aa)
initn: 522 init1: 177 opt: 346 Z-score: 332.7 bits: 72.1 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 351; 31.1% identity (63.2% similar) in 228 aa overlap (35-254:130-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 HCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKERCVR
:.: . . .:.: : . .:... :
CCDS54 ANINAQSQNGFTPLYMAAQENHIDVVKYLLENGANQSTATEDGFTPLAVALQQGHNQAVA
100 110 120 130 140 150
70 80 90 100 110
pF1KE3 VFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDI-----INAKSNDGWT
..::. . :. . ::: :: . .. : :.:.... .:. .: ...:.:
CCDS54 ILLENDTKGKVR-----LPALHIAARKDDTKSAALLLQNDHNADVQSKMMVNRTTESGFT
160 170 180 190 200 210
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQ
:::.::::: . . :::. : :: . .: :::..: : .. ::.:::....:: .
CCDS54 PLHIAAHYGNVNVATLLLNRGAAVDFTARNGITPLHVASKRGNTNMVKLLLDRGGQIDAK
220 230 240 250 260 270
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 --NGFLLRYAVIKSNHSYC-RMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNY
.:. . . .:.:. ...:.::: :.: ..: .:::..: : : :.. : ..
CCDS54 TRDGLTPLHCAARSGHDQVVELLLERGAPL-LARTKNGLSPLHMAAQGDHVECVKHLLQH
280 290 300 310 320 330
240 250 260 270
pF1KE3 GADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
: .. . . : : :.
CCDS54 KAPVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYRVTKLLLDKRANPNARALNGFTPLHIACKKNRIKVM
340 350 360 370 380 390
>>CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872 aa)
initn: 522 init1: 177 opt: 346 Z-score: 332.7 bits: 72.1 E(32554): 3.3e-12
Smith-Waterman score: 351; 31.1% identity (63.2% similar) in 228 aa overlap (35-254:151-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 HCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKERCVR
:.: . . .:.: : . .:... :
CCDS43 ANINAQSQNGFTPLYMAAQENHIDVVKYLLENGANQSTATEDGFTPLAVALQQGHNQAVA
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110
pF1KE3 VFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDI-----INAKSNDGWT
..::. . :. . ::: :: . .. : :.:.... .:. .: ...:.:
CCDS43 ILLENDTKGKVR-----LPALHIAARKDDTKSAALLLQNDHNADVQSKMMVNRTTESGFT
190 200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQ
:::.::::: . . :::. : :: . .: :::..: : .. ::.:::....:: .
CCDS43 PLHIAAHYGNVNVATLLLNRGAAVDFTARNGITPLHVASKRGNTNMVKLLLDRGGQIDAK
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 --NGFLLRYAVIKSNHSYC-RMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNY
.:. . . .:.:. ...:.::: :.: ..: .:::..: : : :.. : ..
CCDS43 TRDGLTPLHCAARSGHDQVVELLLERGAPL-LARTKNGLSPLHMAAQGDHVECVKHLLQH
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270
pF1KE3 GADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
: .. . . : : :.
CCDS43 KAPVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYRVTKLLLDKRANPNARALNGFTPLHIACKKNRIKVM
360 370 380 390 400 410
>>CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 (765 aa)
initn: 635 init1: 159 opt: 337 Z-score: 329.3 bits: 70.2 E(32554): 5.1e-12
Smith-Waterman score: 337; 34.4% identity (65.1% similar) in 215 aa overlap (18-224:531-734)
10 20 30 40
pF1KE3 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANG
.. :: : :......:..: :.. : .:
CCDS44 AAYFGHVSLVKLLTSQGAELDAQQRNLRTPLHLAVERGKVRAIQHLLKSGAVPDALDQSG
510 520 530 540 550 560
50 60 70 80 90 100
pF1KE3 WTLLHFSAARGKERCVRVFLEHGAD---PTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESE
. :: .::::: ...:..::. :: . :.: :: ::..:. .: .:. ::.
CCDS44 YGPLHTAAARGKYLICKMLLRYGASLELPTHQ----GWTPLHLAAYKGHLEIIHLLAESH
570 580 590 600 610
110 120 130 140 150 160
pF1KE3 YRSDIINAKSNDGWTPLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSS
..: . :::::.::..:... : ::. :. . ..: :::.::. :
CCDS44 ANMGALGAVN---WTPLHLAARHGEEAVVSALLQCGADPNAAEQSGWTPLHLAVQRSTFL
620 630 640 650 660 670
170 180 190 200 210
pF1KE3 CVKILLDHNANIDIQN--GFL-LRYAVIKSNHSYCRMFLQRGADTNLGRLEDGQ--TPLH
: ::.:.::. .: :. . :..:.: . ..... ::. .. .:: :::.
CCDS44 SVINLLEHHANVHARNKVGWTPAHLAALKGNTAILKVLVEAGAQLDV---QDGVSCTPLQ
680 690 700 710 720 730
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 LSALRDDVLCARMLYNYGADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
: :::
CCDS44 L-ALRSRKQGIMSFLEGKEPSVATLGGSKPGAEMEI
740 750 760
>>CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957 aa)
initn: 522 init1: 177 opt: 346 Z-score: 328.4 bits: 72.4 E(32554): 5.7e-12
Smith-Waterman score: 351; 31.1% identity (63.2% similar) in 228 aa overlap (35-254:151-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 HCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKMLEQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKERCVR
:.: . . .:.: : . .:... :
CCDS37 ANINAQSQNGFTPLYMAAQENHIDVVKYLLENGANQSTATEDGFTPLAVALQQGHNQAVA
130 140 150 160 170 180
70 80 90 100 110
pF1KE3 VFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRARIARLMLESEYRSDI-----INAKSNDGWT
..::. . :. . ::: :: . .. : :.:.... .:. .: ...:.:
CCDS37 ILLENDTKGKVR-----LPALHIAARKDDTKSAALLLQNDHNADVQSKMMVNRTTESGFT
190 200 210 220 230
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 PLHVAAHYGRDSFVRLLLEFKAEVDPLSDKGTTPLQLAIIRERSSCVKILLDHNANIDIQ
:::.::::: . . :::. : :: . .: :::..: : .. ::.:::....:: .
CCDS37 PLHIAAHYGNVNVATLLLNRGAAVDFTARNGITPLHVASKRGNTNMVKLLLDRGGQIDAK
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 --NGFLLRYAVIKSNHSYC-RMFLQRGADTNLGRLEDGQTPLHLSALRDDVLCARMLYNY
.:. . . .:.:. ...:.::: :.: ..: .:::..: : : :.. : ..
CCDS37 TRDGLTPLHCAARSGHDQVVELLLERGAPL-LARTKNGLSPLHMAAQGDHVECVKHLLQH
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270
pF1KE3 GADTNTRNYEGQTPLAVSISISGSSRPCLDFLQEVTSM
: .. . . : : :.
CCDS37 KAPVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYRVTKLLLDKRANPNARALNGFTPLHIACKKNRIKVM
360 370 380 390 400 410
>>CCDS54802.1 ANKRD50 gene_id:57182|Hs108|chr4 (1250 aa)
initn: 223 init1: 157 opt: 337 Z-score: 326.5 bits: 70.4 E(32554): 7.2e-12
Smith-Waterman score: 337; 30.3% identity (61.8% similar) in 254 aa overlap (5-254:564-807)
10 20 30
pF1KE3 MLHHHCRRNPELQEELQIQAAVAAGDVHTVRKML
:: .. . .:. : : .: .:
CCDS54 ALSVAALCVPASKGHASVVSLLIDRGAEVDHCDKDGM----TPLLVAAYEGHVDVVDLLL
540 550 560 570 580
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 EQGYSPNGRDANGWTLLHFSAARGKERCVRVFLEHGADPTVKDLIGGFTALHYAAMHGRA
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