Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6476, 479 aa
1>>>pF1KE6476 479 - 479 aa - 479 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6074+/-0.00102; mu= 16.9343+/- 0.062
mean_var=79.4830+/-16.243, 0's: 0 Z-trim(105.2): 22 B-trim: 191 in 1/51
Lambda= 0.143859
statistics sampled from 8300 (8319) to 8300 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10351.1 RHCG gene_id:51458|Hs108|chr15 ( 479) 3235 681.3 6e-196
CCDS41414.2 RHBG gene_id:57127|Hs108|chr1 ( 458) 1728 368.5 8.2e-102
CCDS4927.1 RHAG gene_id:6005|Hs108|chr6 ( 409) 1357 291.5 1.1e-78
CCDS60030.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 396) 618 138.1 1.6e-32
CCDS262.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 417) 617 137.9 2e-32
CCDS60027.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 431) 617 137.9 2e-32
CCDS60029.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 463) 617 138.0 2.1e-32
CCDS60028.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 493) 617 138.0 2.2e-32
CCDS53285.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 321) 611 136.6 3.8e-32
CCDS60031.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 ( 378) 609 136.2 5.7e-32
CCDS81283.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 ( 372) 587 131.7 1.3e-30
CCDS30635.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 ( 417) 587 131.7 1.5e-30
CCDS30637.1 RHCE gene_id:6006|Hs108|chr1 ( 354) 572 128.5 1.1e-29
>>CCDS10351.1 RHCG gene_id:51458|Hs108|chr15 (479 aa)
initn: 3235 init1: 3235 opt: 3235 Z-score: 3631.4 bits: 681.3 E(32554): 6e-196
Smith-Waterman score: 3235; 100.0% identity (100.0% similar) in 479 aa overlap (1-479:1-479)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE6 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
430 440 450 460 470
>>CCDS41414.2 RHBG gene_id:57127|Hs108|chr1 (458 aa)
initn: 1580 init1: 1445 opt: 1728 Z-score: 1941.3 bits: 368.5 E(32554): 8.2e-102
Smith-Waterman score: 1728; 57.4% identity (85.6% similar) in 432 aa overlap (8-439:12-438)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEF
: .::: ::.:: ..::.:::::. ..:: : . .:.: .:::
CCDS41 MAGSPSRAAGRRLQLPLLCLFLQGATAVLFAVFVRYNHKTDAALWHRSNHSN---ADNEF
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 YYRYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDR
:.:::::::::.::::::::::.::::::::.:::.::::::..::. :.::..: ..
CCDS41 YFRYPSFQDVHAMVFVGFGFLMVFLQRYGFSSVGFTFLLAAFALQWSTLVQGFLHSFHGG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 YIVVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVK
.: ::::..::::::...: ..:::::::..: :::.:....:.::..:::.::.:: :.
CCDS41 HIHVGVESMINADFCAGAVLISFGAVLGKTGPTQLLLMALLEVVLFGINEFVLLHLLGVR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 DAGGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFN
:::::::::::::::::...:.::: .::.::.::.:::.:::::::::.:::..:::::
CCDS41 DAGGSMTIHTFGAYFGLVLSRVLYRPQLEKSKHRQGSVYHSDLFAMIGTIFLWIFWPSFN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 SAISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTA
.:.. : .:::.:.::: :::: .: . :.:. . . :.:::::::::.:::::.:::.
CCDS41 AALTALGAGQHRTALNTYYSLAASTLGTFALSALVGEDGRLDMVHIQNAALAGGVVVGTS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 AEMMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGA
.:::: :.::: ::. : .::::. ..::.:::....:::::..::::.::..:...:.
CCDS41 SEMMLTPFGALAAGFLAGTVSTLGYKFFTPILESKFKVQDTCGVHNLHGMPGVLGALLGV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 VTAASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLIL
..:. :. :.:: .:: : . . .:. .: .:. :..::.::: .: .:: . ::.:
CCDS41 LVAGLATHEAYG-DGLESVFPLIA-EGQRSATSQAMHQLFGLFVTLMFASVGGGLGGLLL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 RLPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVP
.::: .: : . .:: :.:..:
CCDS41 KLPFLDSPPDSQHYEDQVHWQVPGEHEDKAQRPLRVEEADTQA
420 430 440 450
>>CCDS4927.1 RHAG gene_id:6005|Hs108|chr6 (409 aa)
initn: 1497 init1: 994 opt: 1357 Z-score: 1525.9 bits: 291.5 E(32554): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 1507; 50.7% identity (80.6% similar) in 434 aa overlap (7-440:1-407)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYYRY
.:. .:: ..:.. :..:::.::.: :.: . . . .:: . :. :
CCDS49 MRFTFPLMAIVLEIAMIVLFGLFVEY--ETDQTVLEQLNITKPTDM-GIFFELY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 PSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYIVV
: :::::::.:::::::::::..::::.::.:.:.::.:.::. ..:: .. : . . .
CCDS49 PLFQDVHVMIFVGFGFLMTFLKKYGFSSVGINLLVAALGLQWGTIVQGILQS-QGQKFNI
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 GVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDAGG
:..:.::::: .:.: ..:::::::.:: :.::::......:: ::... ...:..: :.
CCDS49 GIKNMINADFSAATVLISFGAVLGKTSPTQMLIMTILEIVFFAHNEYLVSEIFKASDIGA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 SMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSAIS
:::::.:::::::.:. :::: .:....: ..:.: ::::::::::::::.::::::::.
CCDS49 SMTIHAFGAYFGLAVAGILYRSGLRKGHENEESAYYSDLFAMIGTLFLWMFWPSFNSAIA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 YHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAEMM
::.: :: .::: ::::::::. :.:: ....:::.::::::::::::::::: :.:
CCDS49 EPGDKQCRAIVNTYFSLAACVLTAFAFSSLVEHRGKLNMVHIQNATLAGGVAVGTCADMA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVTAA
. :.:..::: . :..:.::. .:::.. ..:.:.::::..::::.::..::..: :..:
CCDS49 IHPFGSMIIGSIAGMVSVLGYKFLTPLFTTKLRIHDTCGVHNLHGLPGVVGGLAGIVAVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 SASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRLPF
.. . :. .: .: ... :..::...::::.::.
CCDS49 MGA-----------------------SNTSMAMQAAALGSSIGTAVVGGLMTGLILKLPL
360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KE6 WGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPLVP
::::::.::..:.:::..:.
CCDS49 WGQPSDQNCYDDSVYWKVPKTR
390 400
>>CCDS60030.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (396 aa)
initn: 669 init1: 615 opt: 618 Z-score: 697.2 bits: 138.1 E(32554): 1.6e-32
Smith-Waterman score: 648; 31.6% identity (66.6% similar) in 374 aa overlap (6-379:8-367)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS60 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS60 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS60 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS60 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: . : : . .. .. :..: :. :
CCDS60 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNFSLLGLLGEIIYIVL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRL
. .. . . :. .::.
CCDS60 LVLDTVGAGNGIFLIWLLDFKQKHPRKTRPVQKQDNFLSLLPAFVREKRS
350 360 370 380 390
>>CCDS262.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (417 aa)
initn: 777 init1: 614 opt: 617 Z-score: 695.8 bits: 137.9 E(32554): 2e-32
Smith-Waterman score: 742; 31.7% identity (65.7% similar) in 435 aa overlap (6-439:8-411)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS26 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS26 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS26 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS26 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS26 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: . : : . .. .. :..: :. :
CCDS26 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNFSLLGLLGEIIYIVL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AASASLEVYGK-EGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILR
. :.. : .:.. :: : ..: : .....:::.:...::.:
CCDS26 LV---LDTVGAGNGMI------GF--------QVLLSIGELSLAIVIALMSGLLTGLLLN
350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPL
: .: : . . :.: :.:..:
CCDS26 LKIWKAPHEAKYFDDQVFWKFPHLAVGF
390 400 410
>>CCDS60027.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (431 aa)
initn: 656 init1: 602 opt: 617 Z-score: 695.6 bits: 137.9 E(32554): 2e-32
Smith-Waterman score: 647; 32.7% identity (67.6% similar) in 352 aa overlap (6-357:8-345)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS60 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS60 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS60 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS60 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: . : : . .. .. :..: :. :
CCDS60 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNFSLLGLLGEIIYIVL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRL
CCDS60 LVLDTVGAGNGMSLGWNLAVKMAEAGDEELMRLDVSQRNHGGAAVPTGSWMPSTETTIAP
350 360 370 380 390 400
>>CCDS60029.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (463 aa)
initn: 656 init1: 602 opt: 617 Z-score: 695.1 bits: 138.0 E(32554): 2.1e-32
Smith-Waterman score: 648; 31.2% identity (65.4% similar) in 407 aa overlap (6-411:8-383)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS60 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS60 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS60 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS60 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: . : : . .. .. :..: :. :
CCDS60 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNFSLLGLLGEIIYIVL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AASASLEVYGK-EGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILR
. :.. : .:.. :: : ..: : .....:::.:..
CCDS60 LV---LDTVGAGNGMI------GF--------QVLLSIGELSLAIVIALMSGLLTVSSFG
350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 LPFWGQPSDENCFEDAVYWEMPEGNSTVYIPEDPTFKPSGPSVPSVPMVSPLPMASSVPL
CCDS60 CWILSKSIQEKQGLFKNKTTSSHCCLHLYVRNAHDSKVSNVRAGTGVRENGVESFLCHSL
390 400 410 420 430 440
>>CCDS60028.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (493 aa)
initn: 656 init1: 602 opt: 617 Z-score: 694.7 bits: 138.0 E(32554): 2.2e-32
Smith-Waterman score: 647; 32.7% identity (67.6% similar) in 352 aa overlap (6-357:8-345)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS60 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS60 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS60 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS60 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: . : : . .. .. :..: :. :
CCDS60 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPGCCNRVLGIPHSSIMGYNFSLLGLLGEIIYIVL
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 AASASLEVYGKEGLVHSFDFQGFNGDWTARTQGKFQIYGLLVTLAMALMGGIIVGLILRL
CCDS60 LVLDTVGAGNGMSLGWNLAVKMAEAGDEELMRLDVSQRNHGGAAVPTGSWMPSTETTIAP
350 360 370 380 390 400
>>CCDS53285.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (321 aa)
initn: 656 init1: 602 opt: 611 Z-score: 690.7 bits: 136.6 E(32554): 3.8e-32
Smith-Waterman score: 641; 34.5% identity (69.9% similar) in 322 aa overlap (6-327:8-314)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS53 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS53 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS53 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS53 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS53 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: ::
CCDS53 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYL-PFPHLAVGF
290 300 310 320
>>CCDS60031.1 RHD gene_id:6007|Hs108|chr1 (378 aa)
initn: 660 init1: 606 opt: 609 Z-score: 687.4 bits: 136.2 E(32554): 5.7e-32
Smith-Waterman score: 639; 34.1% identity (69.7% similar) in 323 aa overlap (6-328:8-316)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MAWNTNLRWRLPLTCLLLQVIMVILFGVFVRYDFEADAHWWSERTHKNLSDMENEFYY
..: ::: : :.. ...:: :..:: .: :... .
CCDS60 MSSKYPRSVRRCLPLWALTLEAALILLFYFFTHYD-------------ASLEDQKG-LVA
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 RYPSFQDVHVMVFVGFGFLMTFLQRYGFSAVGFNFLLAAFGIQWALLMQGWFHFLQDRYI
: ::. ::. .:.::: . ..:...:.:.::... :.:.:::.:..:.. . . .
CCDS60 SYQVGQDLTVMAAIGLGFLTSSFRRHSWSSVAFNLFMLALGVQWAILLDGFLSQFPSGKV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 VVGVENLINADFCVASVCVAFGAVLGKVSPIQLLIMTFFQVTLFAVNEFILLNLLKVKDA
:. . .. : . . :: .. ::::::. ::..:.. .:: .. .... :....
CCDS60 VITLFSIRLATMSALSVLISVDAVLGKVNLAQLVVMVLVEVTALGNLRMVISNIFNTDYH
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 GGSMTIHTFGAYFGLTVTRILYRRNLEQSKERQNSVYQSDLFAMIGTLFLWMYWPSFNSA
. : :..:.:::::.:. : . : ........ .: ::.:.:::::.:::::::
CCDS60 MNMMHIYVFAAYFGLSVAWCLPKPLPEGTEDKDQTATIPSLSAMLGALFLWMFWPSFNSA
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 ISYHGDSQHRAAINTYCSLAACVLTSVAISSALHKKGKLDMVHIQNATLAGGVAVGTAAE
. .. :..::: ..:. :.:... :: : .::.. .....:.:::::::::. .
CCDS60 LLRSPIERKNAVFNTYYAVAVSVVTAISGSSLAHPQGKISKTYVHSAVLAGGVAVGTSCH
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 MMLMPYGALIIGFVCGIISTLGFVYLTPFLESRLHIQDTCGINNLHGIPGIIGGIVGAVT
.. :. :...:.: :.::. : :: .:
CCDS60 LIPSPWLAMVLGLVAGLISVGGAKYLPDWLPGPPQHWGTQLGHRDSSHVWSPDSFLIWLL
290 300 310 320 330 340
479 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 13:40:19 2016 done: Tue Nov 8 13:40:19 2016
Total Scan time: 2.590 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]