FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3764, 630 aa 1>>>pF1KE3764 630 - 630 aa - 630 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3755+/-0.000352; mu= 7.0281+/- 0.022 mean_var=207.6378+/-44.656, 0's: 0 Z-trim(120.5): 121 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.089006 statistics sampled from 35770 (35907) to 35770 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.743), E-opt: 0.2 (0.421), width: 16 Scan time: 11.180 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001123512 (OMIM: 600560) SHC-transforming prote ( 584) 1548 211.6 6.3e-54 NP_892113 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein ( 583) 1540 210.6 1.3e-53 NP_003020 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein ( 474) 1457 199.8 1.8e-50 NP_001123513 (OMIM: 600560) SHC-transforming prote ( 473) 1449 198.8 3.6e-50 NP_001189788 (OMIM: 600560) SHC-transforming prote ( 428) 1446 198.4 4.4e-50 XP_011508194 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 593) 1435 197.1 1.5e-49 XP_011508195 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 592) 1434 197.0 1.6e-49 XP_005245506 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 598) 1351 186.3 2.7e-46 XP_005245508 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 488) 1260 174.5 7.5e-43 XP_011508200 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 432) 1213 168.5 4.5e-41 NP_036567 (OMIM: 605217) SHC-transforming protein ( 582) 1196 166.4 2.5e-40 XP_011526195 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 594) 1079 151.4 8.6e-36 XP_011526198 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 437) 1013 142.8 2.4e-33 XP_016882056 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 437) 1013 142.8 2.4e-33 NP_058544 (OMIM: 605263) SHC-transforming protein ( 594) 1002 141.5 8.2e-33 XP_011517087 (OMIM: 605263) PREDICTED: SHC-transfo ( 598) 1002 141.5 8.2e-33 XP_011526197 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 537) 860 123.2 2.3e-27 XP_011526196 (OMIM: 605217) PREDICTED: SHC-transfo ( 549) 860 123.2 2.4e-27 XP_011517088 (OMIM: 605263) PREDICTED: SHC-transfo ( 452) 803 115.8 3.3e-25 XP_011508199 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 465) 803 115.8 3.3e-25 XP_016857570 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 566) 804 116.0 3.5e-25 XP_011508196 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 575) 803 115.9 3.9e-25 XP_016857572 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 455) 801 115.6 3.9e-25 XP_016857571 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transfo ( 565) 801 115.7 4.6e-25 XP_016870299 (OMIM: 605263) PREDICTED: SHC-transfo ( 307) 712 104.0 8.1e-22 NP_001294960 (OMIM: 176942) tyrosine-protein kinas ( 453) 236 43.0 0.0027 XP_011541578 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 468) 236 43.0 0.0028 NP_001294957 (OMIM: 176942) tyrosine-protein kinas ( 647) 236 43.2 0.0035 XP_016864722 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 764) 236 43.2 0.004 XP_016864721 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 773) 236 43.2 0.004 XP_016864720 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822) 236 43.2 0.0042 NP_005237 (OMIM: 176942) tyrosine-protein kinase F ( 822) 236 43.2 0.0042 XP_011541573 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822) 236 43.2 0.0042 XP_016864719 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 822) 236 43.2 0.0042 XP_016864718 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837) 236 43.3 0.0043 XP_011541571 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837) 236 43.3 0.0043 XP_011541572 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837) 236 43.3 0.0043 XP_011541569 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837) 236 43.3 0.0043 XP_011541568 (OMIM: 176942) PREDICTED: tyrosine-pr ( 837) 236 43.3 0.0043 >>NP_001123512 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 (584 aa) initn: 1722 init1: 862 opt: 1548 Z-score: 1089.1 bits: 211.6 E(85289): 6.3e-54 Smith-Waterman score: 1638; 49.1% identity (69.9% similar) in 611 aa overlap (27-619:7-582) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH . ::. .::::..::.::.:: :. . :.: NP_001 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ .:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : . 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NP_001 KDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL 550 560 570 580 >>NP_892113 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 is (583 aa) initn: 1590 init1: 862 opt: 1540 Z-score: 1083.6 bits: 210.6 E(85289): 1.3e-53 Smith-Waterman score: 1635; 49.0% identity (69.6% similar) in 612 aa overlap (27-619:7-581) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH . ::. .::::..::.::.:: :. . :.: NP_892 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ .:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : . NP_892 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS ... : : . :. :: : :. : : . .. : : . .. . NP_892 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA . : .:. ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .::::::: NP_892 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF .:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: : .::::::::::::: NP_892 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.:: NP_892 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::.::: :::.. :. : : NP_892 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYI : :.. : : .. .:. :. :..: : .::::: :. NP_892 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPP---PPPCPGRELFDDPSYV 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 NTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQL :.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : : .:. . .:: NP_892 NVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQL 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 WSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVR .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: :: NP_892 RGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVR 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 pF1KE3 TKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK :::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.. NP_892 TKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL 550 560 570 580 >>NP_003020 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 is (474 aa) initn: 1512 init1: 862 opt: 1457 Z-score: 1027.2 bits: 199.8 E(85289): 1.8e-50 Smith-Waterman score: 1472; 55.8% identity (75.3% similar) in 450 aa overlap (180-619:40-472) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL : ....: :..: ::::::::::::::.: NP_003 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL 10 20 30 40 50 60 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC ::. :::::::::: .:::::::.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: NP_003 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS 70 80 90 100 110 120 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD ::.:: : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::: NP_003 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP :::::::::::::::::.:: .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.:: NP_003 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP 190 200 210 220 230 240 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS .::: :::.. :. : : : :.. : : .. .:. :. :.. NP_003 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK 250 260 270 280 290 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 QRDTSLLKHTCRVDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---Q : . : .::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. . . NP_003 QMPPPPPCPAGR-ELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMK 300 310 320 330 340 350 510 520 530 540 550 pF1KE3 P--GATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYV : : : .:. . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::: NP_003 PFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYV 360 370 380 390 400 410 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 LSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRK :.:::.:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.. NP_003 LTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVER 420 430 440 450 460 470 620 630 pF1KE3 DNNPALLHSNK NP_003 KL >>NP_001123513 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 (473 aa) initn: 1380 init1: 862 opt: 1449 Z-score: 1021.6 bits: 198.8 E(85289): 3.6e-50 Smith-Waterman score: 1469; 55.7% identity (74.9% similar) in 451 aa overlap (180-619:40-471) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL : ....: :..: ::::::::::::::.: NP_001 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL 10 20 30 40 50 60 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC ::. :::::::::: .:::::::.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: NP_001 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS 70 80 90 100 110 120 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD ::.:: : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::: NP_001 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP :::::::::::::::::.:: .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.:: NP_001 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP 190 200 210 220 230 240 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS .::: :::.. :. : : : :.. : : .. .:. :. :.. NP_001 LGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRK 250 260 270 280 290 450 460 470 480 490 500 pF1KE3 QRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV--- : : .::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. . NP_001 QMPPP---PPCPGRELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDM 300 310 320 330 340 350 510 520 530 540 550 pF1KE3 QP--GATAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQY .: : : .:. . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.:::: NP_001 KPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQY 360 370 380 390 400 410 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 VLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVR ::.:::.:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::. NP_001 VLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVE 420 430 440 450 460 470 620 630 pF1KE3 KDNNPALLHSNK . NP_001 RKL >>NP_001189788 (OMIM: 600560) SHC-transforming protein 1 (428 aa) initn: 1379 init1: 861 opt: 1446 Z-score: 1020.1 bits: 198.4 E(85289): 4.4e-50 Smith-Waterman score: 1466; 56.2% identity (75.1% similar) in 445 aa overlap (186-619:1-426) 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 TALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRT .: :..: ::::::::::::::.:::. :: NP_001 MGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRT 10 20 30 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 QVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMN :::::::: .:::::::.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: NP_001 QVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMA 40 50 60 70 80 90 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 LDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIG : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::: NP_001 ADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIG 100 110 120 130 140 150 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 QAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSD :::::::::::.:: .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::.::: : NP_001 QAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVD 160 170 180 190 200 210 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 MRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSL ::.. :. : : : :.. : : .. .:. :. :..: NP_001 MRLREGAAPGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPP- 220 230 240 250 460 470 480 490 500 pF1KE3 LKHTCR-VDLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GA : .::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : NP_001 --PPCPGRELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDA 260 270 280 290 300 310 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 TAQPASSHSLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQ : .:. . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.::: NP_001 LRVPPPPQSVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQ 320 330 340 350 360 370 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 GGQAKHLLLVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPA .:: :::::::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.. NP_001 SGQPKHLLLVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL 380 390 400 410 420 630 pF1KE3 LLHSNK >>XP_011508194 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin (593 aa) initn: 1711 init1: 851 opt: 1435 Z-score: 1010.6 bits: 197.1 E(85289): 1.5e-49 Smith-Waterman score: 1628; 48.5% identity (68.4% similar) in 620 aa overlap (27-619:7-591) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH . ::. .::::..::.::.:: :. . :.: XP_011 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ .:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : . XP_011 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS ... : : . :. :: : :. : : . .. : : . .. . XP_011 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA . : .:. ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .::::::: XP_011 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF .:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: : .::::::::::::: XP_011 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNP-SL ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.:: .: XP_011 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 pF1KE3 NTSCESEEVHI-------------DSHAEEREDHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQAT : .:. . : . :: ::.:::..:::.::.::: :::.. :. XP_011 VTPHDSHSFTVLSLRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAA 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 EQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCRVD : : : :.. : : .. .:. :. :..: . : . XP_011 PGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPPPPCPAGR-E 390 400 410 420 430 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 LFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHS ::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : : .: XP_011 LFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQS 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 LPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLL . . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.:::.:: ::::: XP_011 VS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLL 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 VDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK ::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.. XP_011 VDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL 550 560 570 580 590 >>XP_011508195 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin (592 aa) initn: 1718 init1: 851 opt: 1434 Z-score: 1009.9 bits: 197.0 E(85289): 1.6e-49 Smith-Waterman score: 1625; 48.5% identity (68.1% similar) in 621 aa overlap (27-619:7-590) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH . ::. .::::..::.::.:: :. . :.: XP_011 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ .:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : . XP_011 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS ... : : . :. :: : :. : : . .. : : . .. . XP_011 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA . : .:. ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .::::::: XP_011 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF .:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: : .::::::::::::: XP_011 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNP-SL ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.:: .: XP_011 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 pF1KE3 NTSCESEEVHI-------------DSHAEEREDHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQAT : .:. . : . :: ::.:::..:::.::.::: :::.. :. XP_011 VTPHDSHSFTVLSLRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAA 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 EQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-V : : : :.. : : .. .:. :. :..: : XP_011 PGAAR-PTA-------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPP---PPPCPGR 390 400 410 420 460 470 480 490 500 510 pF1KE3 DLFDDPCYINTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSH .::::: :.:.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : : . XP_011 ELFDDPSYVNVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQ 430 440 450 460 470 480 520 530 540 550 560 570 pF1KE3 SLPHIKQQLWSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLL :. . .:: .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.:::.:: :::: XP_011 SVS-MAEQLRGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLL 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 pF1KE3 LVDPEGKVRTKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK :::::: :::::: :..:.::: ::::: :::::.:::. :.:::.. XP_011 LVDPEGVVRTKDHRFESVSHLISYHMDNHLPIISAGSELCLQQPVERKL 550 560 570 580 590 >>XP_005245506 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin (598 aa) initn: 1366 init1: 862 opt: 1351 Z-score: 952.3 bits: 186.3 E(85289): 2.7e-46 Smith-Waterman score: 1446; 47.6% identity (68.2% similar) in 573 aa overlap (27-580:7-542) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRERGQDSLAGLVLYVGLFGHPGMLHRAKYSRFRNESITSLDEGSSGGSVGNKGSPQPPH . ::. .::::..::.::.:: :. . :.: XP_005 MDLLPPKPKYNPLRNESLSSLEEGASG-STPPEELPSPSA 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PALAPHLPTEDATLPSQESPTPLCTLIPRMASMKLANPATLLSLKNFCLGTKEVPRLKLQ .:.: :: ::...::: ::...:::....::::: :.: : . XP_005 SSLGPILP----PLPGDDSPTTLCSFFPRMSNLRLANPAGGRP------GSKGEPGRAAD 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 pF1KE3 ESRDPGSSGPSSPETSLSRSGTAPPPQQ--DLVGHRATALTPDSCPLPGPG---EPTLRS ... : : . :. :: : :. : : . .. : : . .. . XP_005 DGE--GIVGAAMPD-----SGPLPLLQDMNKLSGGGGRRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVN 90 100 110 120 130 140 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 RQDRHFLQ---HLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSLDFGMRTQVTREAISRLCEAVPGA . : .:. ...: :..: ::::::::::::::.:::. :::::::::: .::::::: XP_005 KPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRALDFNTRTQVTREAISLVCEAVPGA 150 160 170 180 190 200 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 NGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTCSLTLMNLDNQQIIANHHMQSISF .:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: ::.:: : .::::::::::::: XP_005 KGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTSSLNLMAADCKQIIANHHMQSISF 210 220 230 240 250 260 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 ASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQDVISTIGQAFELRFKQYLKNPSLN ::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::::::::::::::::::::.:: XP_005 ASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQDVISTIGQAFELRFKQYLRNPPKL 270 280 290 300 310 320 360 370 380 390 400 pF1KE3 TSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPPVGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQ .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.::.::: :::.. :. : : XP_005 VTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPPLGGVVDMRLREGAAPGAAR-PTA 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 CEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQSQRDTSLLKHTCR-VDLFDDPCYI : :.. : : .. .:. :. :..: : .::::: :. XP_005 -------P-NAQTPSHLGATLPVGQPVGG-DPE-VRKQMPPP---PPCPGRELFDDPSYV 390 400 410 420 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 NTQALQSTPGSAGNQRSAQPLGSPWHCGKAPETV---QP--GATAQPASSHSLPHIKQQL :.: :... ..:. : : .: :.::. . .: : : .:. . .:: XP_005 NVQNLDKARQAVGG---AGP-PNPAINGSAPRDLFDMKPFEDALRVPPPPQSVS-MAEQL 430 440 450 460 470 480 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 WSEECYHGKLSRKAAESLLVKDGDFLVRESATSPGQYVLSGLQGGQAKHLLLVDPEGKVR .: .::::::. ::.:: .::::::::.:.::::::.:::.:: :::::::::: : XP_005 RGEPWFHGKLSRREAEALLQLNGDFLVRESTTTPGQYVLTGLQSGQPKHLLLVDPEGVVS 490 500 510 520 530 540 590 600 610 620 630 pF1KE3 TKDHVFDNVGHLIRYHMDNSLPIISSGSEVSLKQPVRKDNNPALLHSNK XP_005 VAEVWVRGGKKEGTVPYSVSLFLPSLLCRHSRWAAVYGPLLLFKVSGIFLQRLIP 550 560 570 580 590 >>XP_005245508 (OMIM: 600560) PREDICTED: SHC-transformin (488 aa) initn: 1156 init1: 862 opt: 1260 Z-score: 890.3 bits: 174.5 E(85289): 7.5e-43 Smith-Waterman score: 1280; 54.4% identity (73.5% similar) in 412 aa overlap (180-580:40-432) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 LVGHRATALTPDSCPLPGPGEPTLRSRQDRHFLQHLLGMGMNYCVRYMGCVEVLQSMRSL : ....: :..: ::::::::::::::.: XP_005 RRTRVEGGQLGGEEWTRHGSFVNKPTRGWLHPNDKVMGPGVSYLVRYMGCVEVLQSMRAL 10 20 30 40 50 60 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 DFGMRTQVTREAISRLCEAVPGANGAIKKRKPPVKFLSTVLGKSNLQFSGMNIKLTISTC ::. :::::::::: .:::::::.:: ..::: . ::..::.:::.:.:: : ::.:: XP_005 DFNTRTQVTREAISLVCEAVPGAKGATRRRKPCSRPLSSILGRSNLKFAGMPITLTVSTS 70 80 90 100 110 120 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 SLTLMNLDNQQIIANHHMQSISFASGGDPDTTDYVAYVAKDPVNQRACHILECHNGMAQD ::.:: : .:::::::::::::::::::::..:::::::::::::::::::: .:.::: XP_005 SLNLMAADCKQIIANHHMQSISFASGGDPDTAEYVAYVAKDPVNQRACHILECPEGLAQD 130 140 150 160 170 180 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 VISTIGQAFELRFKQYLKNPSLNTSCESEEVHIDSHA--EERE---DHEYYNEIPGKQPP :::::::::::::::::.:: .. ... . .:. : ::.: ::.:::..:::.:: XP_005 VISTIGQAFELRFKQYLRNPPKLVTPHDRMAGFDGSAWDEEEEEPPDHQYYNDFPGKEPP 190 200 210 220 230 240 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 VGGVSDMRIKVQATEQMAYCPIQCEKLCYLPGNSKCSSVYENCLEQSRAIGNVHPRGVQS .::: :::.. :. : : : :.. : : .. .:. :. :.. 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