Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE4279
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE4279, 1382 aa
1>>>pF1KE4279 1382 - 1382 aa - 1382 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6541+/-0.00113; mu= 16.7399+/- 0.068
mean_var=92.4146+/-18.646, 0's: 0 Z-trim(104.6): 35 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.133415
statistics sampled from 7971 (8004) to 7971 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 4.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382) 9138 1770.1 0
CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386) 625 131.5 1.6e-29
CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 476 102.9 6.7e-21
CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 471 101.9 1.2e-20
CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 456 99.0 1e-19
CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 450 97.8 1.6e-19
CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143) 449 97.6 2.1e-19
CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157) 419 91.9 1.2e-17
CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 408 89.7 5.2e-17
CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 702) 391 86.4 3.1e-16
CCDS11617.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 ( 779) 391 86.4 3.4e-16
CCDS10907.1 DHX38 gene_id:9785|Hs108|chr16 (1227) 392 86.7 4.5e-16
CCDS11072.1 DHX33 gene_id:56919|Hs108|chr17 ( 707) 368 82.0 6.8e-15
CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 360 80.5 2.7e-14
CCDS4685.1 DHX16 gene_id:8449|Hs108|chr6 (1041) 358 80.1 3.6e-14
CCDS77040.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1181) 320 72.8 6.4e-12
CCDS11464.1 DHX8 gene_id:1659|Hs108|chr17 (1220) 320 72.8 6.6e-12
CCDS54463.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 672) 314 71.6 8.7e-12
CCDS13310.1 DHX35 gene_id:60625|Hs108|chr20 ( 703) 314 71.6 9e-12
CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 ( 795) 313 71.4 1.2e-11
>>CCDS9987.2 TDRD9 gene_id:122402|Hs108|chr14 (1382 aa)
initn: 9138 init1: 9138 opt: 9138 Z-score: 9499.1 bits: 1770.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 9138; 100.0% identity (100.0% similar) in 1382 aa overlap (1-1382:1-1382)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 MLRKLTIEQINDWFTIGKTVTNVELLGAPPAFPAGAAREEVQRQDVAPGAGPAAQAPALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 MLRKLTIEQINDWFTIGKTVTNVELLGAPPAFPAGAAREEVQRQDVAPGAGPAAQAPALA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 QAPARPAAAFERSLSQRSSEVEYINKYRQLEAQELDVCRSVQPTSGPGPRPSLAKLSSVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QAPARPAAAFERSLSQRSSEVEYINKYRQLEAQELDVCRSVQPTSGPGPRPSLAKLSSVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 CIPGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDHYVQRSAYC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 CIPGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDHYVQRSAYC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 SIVVTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIATEDTRLIYMTTGVLLQKIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SIVVTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIATEDTRLIYMTTGVLLQKIV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SAKSLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRFVKVVLMSATISCKEFADYFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SAKSLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRFVKVVLMSATISCKEFADYFA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VPVQNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLNDLEHIHHSKLSPHLLEEPVITKDIYEVAVSLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VPVQNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLNDLEHIHHSKLSPHLLEEPVITKDIYEVAVSLI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 QMFDDLDMKESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLGEINYMHELLTSLVHKRLQVYPLHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QMFDDLDMKESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLGEINYMHELLTSLVHKRLQVYPLHS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 SVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 RLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 LDMGEPRALLATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LDMGEPRALLATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 LPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSGSSKSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSGSSKSD
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 CIALVEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRISQFNMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 CIALVEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRISQFNMH
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 VDSRRPVMDQEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKDPKTTVVLKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VDSRRPVMDQEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKDPKTTVVLKH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE4 IPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQVKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIKMSQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 IPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQVKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIKMSQLK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 VSLELSVHSAEEIEGKVQGMNVSKLRNTRVNVDFQKQTVDPMQVSFNTSDRSQTVTDLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 VSLELSVHSAEEIEGKVQGMNVSKLRNTRVNVDFQKQTVDPMQVSFNTSDRSQTVTDLLL
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE4 TIDVTEVVEVGHFWGYRIDENNSEILKKLTAEINQLTLVPLPTHPHPDLVCLAPFADFDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 TIDVTEVVEVGHFWGYRIDENNSEILKKLTAEINQLTLVPLPTHPHPDLVCLAPFADFDK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE4 QRYFRAQVLYVSGNSAEVFFVDYGNKSHVDLHLLMEIPCQFLELPFQALEFKICKMRPSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QRYFRAQVLYVSGNSAEVFFVDYGNKSHVDLHLLMEIPCQFLELPFQALEFKICKMRPSA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE4 KSLVCGKHWSDGASQWFASLVSGCTLLVKVFSVVHSVLHVDVYQYSGVQDAINIRDVLIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 KSLVCGKHWSDGASQWFASLVSGCTLLVKVFSVVHSVLHVDVYQYSGVQDAINIRDVLIQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE4 QGYAELTEESYESKQSHEVLKGLFSKSVENMTDGSVPFPMKDDEKYLIRILLESFSTNKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QGYAELTEESYESKQSHEVLKGLFSKSVENMTDGSVPFPMKDDEKYLIRILLESFSTNKL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KE4 GTPNCKAELHGPFNPYELKCHSLTRISKFRCVWIEKESINSVIISDAPEDLHQRMLVAAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GTPNCKAELHGPFNPYELKCHSLTRISKFRCVWIEKESINSVIISDAPEDLHQRMLVAAS
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KE4 LSINATGSTMLLRETSLMPHIPGLPALLSMLFAPVIELRIDQNGKYYTGVLCGLGWNPAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 LSINATGSTMLLRETSLMPHIPGLPALLSMLFAPVIELRIDQNGKYYTGVLCGLGWNPAT
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KE4 GASILPEHDMELAFDVQFSVEDVVEVNILRAAINKLVCDGPNGCKCLGPERVAQLQDIAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 GASILPEHDMELAFDVQFSVEDVVEVNILRAAINKLVCDGPNGCKCLGPERVAQLQDIAR
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 QKLLGLFCQSKPREKIVPKWHEKPYEWNQVDPKLVMEQADRESSRGKNTFLYQLHKLVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 QKLLGLFCQSKPREKIVPKWHEKPYEWNQVDPKLVMEQADRESSRGKNTFLYQLHKLVVL
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KE4 GT
::
CCDS99 GT
>>CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386 aa)
initn: 984 init1: 343 opt: 625 Z-score: 643.6 bits: 131.5 E(32554): 1.6e-29
Smith-Waterman score: 1057; 29.5% identity (59.9% similar) in 843 aa overlap (83-818:496-1319)
60 70 80 90 100 110
pF1KE4 AAQAPALAQAPARPAAAFERSLSQRSSEVEYINKYRQLEAQELDVCRSVQPTSGPGPRPS
:.: ... . .::. .: .
CCDS18 NQIPEVEKASESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGKICKQF
470 480 490 500 510 520
120 130 140 150 160 170
pF1KE4 LAKLSSVTCIPGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDH
: .: . . . .:: . .: ...:.....::.: : :: ::.::.::.:::
CCDS18 RMKQAS-RQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDD
530 540 550 560 570 580
180 190 200 210 220 230
pF1KE4 YVQRSA--YCSIVVTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIATEDTRLIYM
.. .:. ::::.:.: :.:. ..:::: .: .::::. ::.. . :::.:
CCDS18 SLNGPPEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVGLTVGYQIRLESVKSSATRLLYC
590 600 610 620 630 640
240 250 260 270 280 290
pF1KE4 TTGVLLQKIVSAKSLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRFVKVVLMSATI
::::::... . .:. .:::.::::::::: ::::::.. .. .. ..:.:::::.
CCDS18 TTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIV-SQRPGLQVILMSATL
650 660 670 680 690 700
300 310 320 330
pF1KE4 SCKEFADYF----AVPVQNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLND-------LEHIHHSKL-
. . :.::: .. . .. :. : .: .: .: :.: ...: . ::
CCDS18 NAELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAI-AVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLK
710 720 730 740 750 760
340 350 360
pF1KE4 -----------------SPHLLEEPVIT-----------------KDIYEVAVSLIQMFD
: :: .. . : . . ... ....:
CCDS18 ARRNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMD
770 780 790 800 810 820
370 380 390 400 410
pF1KE4 ----DLDMKESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLGEINYMHELL--TSLVHKRLQ----
.:.. :. . .. ...:::::::.::....: : .:: ..: .
CCDS18 FEKVNLELIEALLEWIVDGKHSYPPGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCV
830 840 850 860 870 880
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 VYPLHSSVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDED
..:::::.. :::. ::..: : :::.::::::.:.:. :: :::: . : .
CCDS18 IHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDAS
890 900 910 920 930 940
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 TNYQSLRLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGST
...::. ...:... :::::::::. : :..: . ..... . .::. : :: .
CCDS18 KGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQL
950 960 970 980 990 1000
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 ILKVKLLDMGEPRAL---LATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGEL
:..:.:.: . : .. . :: .... . . :...:::. : : .:
CCDS18 CLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALT---------P-DERL
1010 1020 1030 1040 1050
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 TFLGRVLAQLPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKV
: :: ::.:::. ..:::...: .: ::: : :::.:..:. :. :. .. .. ..:.
CCDS18 TPLGYHLASLPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 NFSGSSKSDCIALVEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELK
.:. ..:: .::..:.: :. . : . :. : :... . ..:.: : ...
CCDS18 EFA-FANSDYLALLQAYKGWQLSTKEGV----RASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFT
1120 1130 1140 1150 1160
720 730 740 750
pF1KE4 TRISQFNMHVDSRRP------------VMD---QEYIYKQRF--ILQVVLAGAFYPNYFT
.:.... .. : :.: .: . . .....: .:.:::
CCDS18 ELLSDIGFAREGLRAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQ
1170 1180 1190 1200 1210 1220
760 770 780 790
pF1KE4 FGQPDEEM------AVRELAGKDPKTTVVLK-----HIPPYG------------FLYYKQ
.:. .. ::: . :. . : : :: : . .::...
CCDS18 VKSPEGKFQKTSTGAVR-MQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEK
1230 1240 1250 1260 1270 1280
800 810 820 830 840
pF1KE4 LQS---LFRQCGQVKS---IVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIKMSQLKVSLEL
... ..:.:..:. ..: :... :...:
CCDS18 IKTSRVFIRDCSMVSVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKE
1290 1300 1310 1320 1330 1340
850 860 870 880 890 900
pF1KE4 SVHSAEEIEGKVQGMNVSKLRNTRVNVDFQKQTVDPMQVSFNTSDRSQTVTDLLLTIDVT
CCDS18 LRCELDQLLQDKIKNPSIDLCTCPRGSRIISTIVKLVTTQ
1350 1360 1370 1380
>>CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369 aa)
initn: 1037 init1: 288 opt: 476 Z-score: 488.7 bits: 102.9 E(32554): 6.7e-21
Smith-Waterman score: 1038; 30.3% identity (60.5% similar) in 745 aa overlap (110-791:550-1275)
80 90 100 110 120 130
pF1KE4 EVEYINKYRQLEAQELDVCRSVQPTSGPGPRPSLAKLSSVTCIPGTTYKYPDLPISRYKE
: . ::.:. . .::. ....
CCDS34 PEESWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRD
520 530 540 550 560 570
140 150 160 170 180 190
pF1KE4 EVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDHYV---QRSAYCSIVVTQPRKIGASSIA
.: .. . ::.. : ::::::::.:...:. . ... :.:: ::::.:.: :.:
CCDS34 SIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLA
580 590 600 610 620 630
200 210 220 230 240 250
pF1KE4 RWISKERAWTLG-----GVVGYQVGLEKIATEDTRLIYMTTGVLLQKIVSAKSLMEFTHI
. : . : .. :::. .:. : :.:::.: ::::::.:. : . .:.
CCDS34 NRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHV
640 650 660 670 680 690
260 270 280 290 300
pF1KE4 IIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRFVKVVLMSATISCKEFADYFA-VPV---QNKM
:.::::::. . ::::......:. : . ...:::::.. ..:. ::. :. ...
CCDS34 IVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDL-HLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRS
700 710 720 730 740 750
310 320 330 340
pF1KE4 NPAYIFEVEG----------KPHSVEEYYLNDLEHI------------HHSKLSP-----
:. .:..: : . .:.. :.. .... :
CCDS34 YPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGA
760 770 780 790 800 810
350 360 370 380 390
pF1KE4 HLLEEPVITKDIYEVAVSLIQMFD---DLDMK-ESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLG
: .: : .. ... : .::. : .. :: ...::.:::::.
CCDS34 HADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLA
820 830 840 850 860 870
400 410 420 430 440 450
pF1KE4 EINYMHELLTS---LVHKRLQVYPLHSSVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVT
.:. ...::.. . .: .: ::: .. ..: .: : :: :::.:.:::::...:
CCDS34 HIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGIT
880 890 900 910 920 930
460 470 480 490 500 510
pF1KE4 VPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSLRLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDF
.::: .::: :. :.....:: ...::.: ::.:::::: :.:.:. ..
CCDS34 IPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRER
940 950 960 970 980 990
520 530 540 550 560 570
pF1KE4 WDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKLLDMGEPRALLATALSPPGLSDIERTILLLKEVG
... . :. :::.:: :: :.. ..: :. .:. ::.:: :. : .. ::...:
CCDS34 FEGFM-DYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIG
1000 1010 1020 1030 1040 1050
580 590 600 610 620 630
pF1KE4 ALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQLPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLK
: : ..: .:: ::. :: :::: ..::....: .::::: .::... :
CCDS34 AC------ELNEP---KLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEK
1060 1070 1080 1090 1100
640 650 660 670 680
pF1KE4 NFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSGSS----KSDCIALVEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNW
. :. :. : ....... :. :: ... .:. :: :: : : .:...
CCDS34 SPFTTPI-----GRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYR---SEITY
1110 1120 1130 1140 1150 1160
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 GRLNYIQIKRIREVAELYEELK--TRISQFNMHVDSRR---PVMDQEYIYKQRFILQVVL
: :... . . .. .:: .. . :. . : .: ... .:..::
CCDS34 CRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVL
1170 1180 1190 1200 1210 1220
750 760 770 780 790
pF1KE4 AGAFYPN-----YFTFGQPDEEMA-VRELA-GKDP-KTTVVLKHIPPYGFLYYKQLQSLF
....: : : . :..: . : : :: . . : . . .:.: :..
CCDS34 VAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQTHGWLLYQEKIRYA
1230 1240 1250 1260 1270 1280
800 810 820 830 840 850
pF1KE4 RQCGQVKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIKMSQLKVSLELSVHSAEEIEGK
CCDS34 RVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVL
1290 1300 1310 1320 1330 1340
>>CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270 aa)
initn: 953 init1: 305 opt: 471 Z-score: 484.0 bits: 101.9 E(32554): 1.2e-20
Smith-Waterman score: 1074; 37.1% identity (62.3% similar) in 607 aa overlap (132-700:388-963)
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 QPTSGPGPRPSLAKLSSVTCIPGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGK
::..... :.. : .::::::.:::: ::
CCDS41 EQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFESEILEAISQNSVVIIRGATGCGK
360 370 380 390 400 410
170 180 190 200 210
pF1KE4 STQLPQYILDHYVQ--RSAYCSIVVTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEK
.::.::.::: ..: :.: :.:::::::.:.: :.:. .. ::. : ::.: .:.
CCDS41 TTQVPQFILDDFIQNDRAAECNIVVTQPRRISAVSVAERVAFERGEEPGKSCGYSVRFES
420 430 440 450 460 470
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 IATED-TRLIYMTTGVLLQKIVSAKSLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNS
: . . ... :.::::.:. . .. ..:.:.::.::: . ::::.:.: ....
CCDS41 ILPRPHASIMFCTVGVLLRKLEA--GIRGISHVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYP
480 490 500 510 520 530
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 RFVKVVLMSATISCKEFADYF-AVPVQNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLNDLEHIHHSK
. :..:::::::. . : .:: : :.:: :. . :.::.:.: .. :
CCDS41 E-VRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCP---------IIEVYGRTYPVQEYFLEDCIQMTHFV
540 550 560 570 580
340 350 360 370 380
pF1KE4 LSPHLLEEP---------------VITKDIY--EVAVSLIQMFDDLDMKESGNKAWSGAQ
:. .. .: : : :. .:. : :. ::. . .
CCDS41 PPPKDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICGDEYGPETRLSMSQ----LNEKETPFELIEALL
590 600 610 620 630 640
390 400 410 420 430
pF1KE4 FVLER----SSVLVFLPGLGEINYMHELLTSLVH---KRLQVYPLHSSVALEEQNNVFLS
.: ..::::::: . : :.. : : .: :. ::::.. ::: .:: .
CCDS41 KYIETLNVPGAVLVFLPGWNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVF-D
650 660 670 680 690 700
440 450 460 470 480 490
pF1KE4 PVP-GYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSLRLSWASKTSCNQ
::: : :.::::::::.:.:. :: :::: : .. . .:. . :::::. .:
CCDS41 PVPVGVTKVILSTNIAETSITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQ
710 720 730 740 750 760
500 510 520 530 540 550
pF1KE4 RKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKLLDMGEPRALLAT
:::::::: :.:..: . .. . :..:::.: :: :..::: .: .::
CCDS41 RKGRAGRVRPGFCFHLCSRARFER-LETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAK
770 780 790 800 810
560 570 580 590 600 610
pF1KE4 ALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQLPVNQQLGKLIV
:. :: :. . .. :.:. :: : : ::: :::.::.::.. ..::...
CCDS41 AIEPPPLDAVIEAEHTLRELDAL-------DAND---ELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMI
820 830 840 850 860
620 630 640 650 660 670
pF1KE4 LGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSGSSKSDCIALVEAFKTWK
.: .: : :::: . . : .. :: .. ::.:. :: .::. .:..:
CCDS41 MGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINEGKRL--GYIHR-NFAGNRFSDHVALLSVFQAWD
870 880 890 900 910 920
680 690 700 710 720
pF1KE4 ACRQTGE---LRY-PKDELNWGRLNY-----IQIKRIREVAELYEELKTRISQFNMHVDS
:. :: .:. . .:: . : . .:.:.:
CCDS41 DARMGGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWEAKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDN
930 940 950 960 970 980
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 RRPVMDQEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKDPKTTVVLKHIPP
CCDS41 NLDVVISLLAFGVYPNVCYHKEKRKILTTEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFG
990 1000 1010 1020 1030 1040
>>CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430 aa)
initn: 805 init1: 335 opt: 456 Z-score: 467.6 bits: 99.0 E(32554): 1e-19
Smith-Waterman score: 680; 27.5% identity (49.4% similar) in 874 aa overlap (132-805:193-1027)
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 QPTSGPGPRPSLAKLSSVTCIPGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGK
::. . .::.:..:. :.::.: : :::::
CCDS41 MSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETGSGK
170 180 190 200 210 220
170 180 190 200 210 220
pF1KE4 STQLPQYILDHYVQRSAYCSIVVTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIA
.::.::..:: . . : : ::::...: ..:. .. :: .: ..:::. ::. .
CCDS41 TTQIPQFLLDDCFKNGIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIGQTIGYQIRLESRV
230 240 250 260 270 280
230 240 250 260 270 280
pF1KE4 TEDTRLIYMTTGVLLQKIVSAKS-LMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRF
. : : . :.::::. .... : : ::.:.:::::: . :::: .: ::. . .
CCDS41 SPKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTKLRDLLQKHPTL
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330
pF1KE4 VKVVLMSATISCKEFADYF-AVPVQNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLNDL---------
:..: ::... . : :: . :: :. ..:.: :.:..:.:.
CCDS41 -KLILSSAALDVNLFIRYFGSCPV--------IY-IQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTNK
350 360 370 380 390
340
pF1KE4 EHIHHSK----------------------LSPH---------------LLE---------
: ....: ..:. ::.
CCDS41 EMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFSQ
400 410 420 430 440 450
350 360
pF1KE4 ---------EPVITKDIYEVAVSLIQMFDDLD----------------------------
:: . :.. .. .: : . :.:
CCDS41 LTEKDVNCLEPWLIKEM-DACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATAL
460 470 480 490 500 510
370 380
pF1KE4 MKESG------------------NKA--------WS---GAQFV---------------L
: .: .:: :. : . :
CCDS41 MVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNL
520 530 540 550 560 570
390
pF1KE4 ERSS-------------------------------------------------VLVFLPG
..:: ::.::::
CCDS41 DESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPG
580 590 600 610 620 630
400 410 420 430 440
pF1KE4 LGEINYMHELL-------TSLVHKRLQVYPLHSSVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNI
:: ... . .. .: : ::. :::.. .:..:. .: : :::::::::
CCDS41 YDEIVGLRDRILFDDKRFADSTH-RYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNI
640 650 660 670 680 690
450 460 470 480 490 500
pF1KE4 AESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSLRLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYR
::.:.:: :: .::: .. : . :.. : ::.: :::::::: : :.:
CCDS41 AETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFR
700 710 720 730 740 750
510 520 530 540 550 560
pF1KE4 LVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKLL-DMGEPRA-LLATALSPPGLSDIERT
: . ..: . . .::.:: :: :..::: .. : : .: : :: .. .
CCDS41 LFSRLRFQNML-EFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNA
760 770 780 790 800
570 580 590 600 610 620
pF1KE4 ILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQLPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLI
. .:: . :. :: :: :: ::.:::. .:::... . :. ::: :
CCDS41 VQMLKTIDAM---DTWED-------LTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILT
810 820 830 840 850
630 640 650 660 670 680
pF1KE4 IAAALSLKNFFAMPFR--QHLDGYRNKVNFSGSSKSDCIALVEAFKTWKACRQTGELRY-
:: .:. .. :..: . :. .. . :.... :: .::..::..:. :. : :
CCDS41 IACTLAYRDPFVLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERAF
860 870 880 890 900 910
690 700 710 720 730 740
pF1KE4 -PKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRISQFNMHVDSRRPVMDQEYIYKQRFILQ
:. :. . .. : : . ...: : : : ... . . : . .. ...
CCDS41 CEKNFLSQATMEIIIGMRTQLLGQL------RASGF-VRARGGGDIRDVNTNSENWAVVK
920 930 940 950 960 970
750 760 770 780 790 800
pF1KE4 VVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKDPKTTVVLKHIPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQ
..:....::: . :.: : :.: :: : : : . : : ... ::
CCDS41 AALVAGMYPNLV---HVDRENLV--LTG--PKEKKVRFH--PASVLSQPQYKKIPPANGQ
980 990 1000 1010 1020
810 820 830 840 850 860
pF1KE4 VKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIKMSQLKVSLELSVHSAEEIEGKVQGMN
. .:
CCDS41 AAAIKALPTDWLIYDEMTRAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVD
1030 1040 1050 1060 1070 1080
>>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa)
initn: 1031 init1: 282 opt: 450 Z-score: 463.8 bits: 97.8 E(32554): 1.6e-19
Smith-Waterman score: 1041; 33.5% identity (62.4% similar) in 711 aa overlap (132-789:207-888)
110 120 130 140 150 160
pF1KE4 QPTSGPGPRPSLAKLSSVTCIPGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGK
:: ...:.:.::....:..: : :: ::
CCDS31 DGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVISGETGCGK
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210
pF1KE4 STQLPQYILDHYVQRS--AYCSIVVTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGG--VVGYQVGL
.::. :.:::.:..:. . : :: ::::.:.: :.:. .. ::: . :. .:::. :
CCDS31 TTQVTQFILDNYIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGNSTGYQIRL
240 250 260 270 280 290
220 230 240 250 260 270
pF1KE4 E-KIATEDTRLIYMTTGVLLQKIVSAKSLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRT
. .. .. ..: :::..:: . : : .::..::.:::. . : :. ::. ::
CCDS31 QSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLMTVVKDLLNF
300 310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KE4 NSRFVKVVLMSATISCKEFADYFA-VPVQNKMNPAYIFEV-EGKPHSVEE---YYLNDLE
: . ::.:::::.. ..:..::. :. . :.. : : : ..: : : .. :
CCDS31 RSDL-KVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIH--IPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRYVPEQKE
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370
pF1KE4 HIHHSK---LSPHL-----LEEPVITKD-----IYEV-------AVSLIQMFDDLDMKES
: . : .. :. :. .: :. . :. .:..:.:..: : : .
CCDS31 HRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMED-D-KVD
420 430 440 450 460 470
380 390 400 410 420
pF1KE4 GNKAWSGAQFVL---ERSSVLVFLPGLGEINYMHELLTSLVH---KRLQVYPLHSSVALE
: . .... : ...:::::: .:. .:.:: : : .. . :::: .
CCDS31 LNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTV
480 490 500 510 520 530
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSLRLSWA
.:..:: :: :::...:::::.:.:. :: :::: . : ..: ... :.
CCDS31 NQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWV
540 550 560 570 580 590
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 SKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKLLDMGE
::.. .:::::::::. :.::.: .. . . . :. .::.:: :: :..:.: .:
CCDS31 SKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHL-YNGLRASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGG
600 610 620 630 640 650
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 PRALLATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQLPVNQ
.:. ..::. . .: : :..:: :.. ::: :: ::.:::.
CCDS31 IAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNAL-------DKQE---ELTPLGVHLARLPVEP
660 670 680 690 700
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 QLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPF-RQHLDGYRNKVNFSGSSKSDCIAL
..::.:..: .: ::: : :::.::.:. :..:. .... : : ... ...:: ...
CCDS31 HIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIADARRK-ELAKDTRSDHLTV
710 720 730 740 750
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 VEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRISQFNMH----
:.::. :. :. : .:: :: : .:. . .. .. ...: .:: :
CCDS31 VNAFEGWEEARRRG-FRYEKD-YCW---EYFLSS---NTLQMLHNMK---GQFAEHLLGA
760 770 780 790 800
730 740 750 760
pF1KE4 --VDSRRPVMDQEYIYK--QRFILQVVLAGAFYPNY----FTFGQPDEEMAVRE----LA
:.:: : . : . ...: :. :: .::. ...:. . . : :.
CCDS31 GFVSSRNPKDPESNINSDNEKIIKAVICAG-LYPKVAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGLV
810 820 830 840 850 860
770 780 790 800 810 820
pF1KE4 GKDPKTTVVLKHIPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQVKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLP
. ::.. : . :..: :
CCDS31 AVHPKSVNVEQTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQET
870 880 890 900 910 920
>>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143 aa)
initn: 812 init1: 293 opt: 449 Z-score: 461.8 bits: 97.6 E(32554): 2.1e-19
Smith-Waterman score: 940; 30.4% identity (60.4% similar) in 674 aa overlap (42-711:77-688)
20 30 40 50 60 70
pF1KE4 DWFTIGKTVTNVELLGAPPAFPAGAAREEVQRQDVAPGAGPAAQAPALAQAPARPAAAFE
.... :: : . ::::. : ..
CCDS12 EDYIRQGSEECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQ-PKHSIPALADLPRTYDPRYR
50 60 70 80 90 100
80 90 100 110 120
pF1KE4 RSLSQRSSEVEYINKY-RQLEAQEL-DVCRSVQPTSGPGPRPSLAKLSSVTCIPGTTYKY
.:: . .. . :.: :... . :.. : . ....:... .
CCDS12 INLSVLGPATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQ------RER
110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDHYVQRSAYCSIVVTQPRK
:::..: ..... .. ..::.. : :: :::::.:::.: ... .. ::::.
CCDS12 AALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLA-----AGFSHVACTQPRR
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 IGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIATEDTRLIYMTTGVLLQKIVSAKSLMEFT
:. :.:. .. : :. ::::. .:. . :.....:.:.::..: :: ..
CCDS12 IACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYE
220 230 240 250 260 270
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 HIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRFVKVVLMSATISCKEFADYFAVPVQNKMNP
.:.:::::: . :::: :...:: : . ::.::::::. . :..::.
CCDS12 VLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDL-KVILMSATINISLFSSYFS--------N
280 290 300 310 320
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 AYIFEVEGKPHSVEEYYLNDLEHIHHSKLSPHLLEEPVITKDIYEVAVSLIQMFDDLDMK
: . .: :. . : .:. ::. .:. ........: :
CCDS12 APVVQVPGRLFPITVVY------------QPQE-AEPTTSKSEKLDPRPFLRVLESIDHK
330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 ESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLGEINYMHELLTSLV-H-KRLQVYPLHSSVALEEQ
. ::...:::: :..::. . : . . : .: : ::::.... .:
CCDS12 YPPE----------ERGDLLVFLSGMAEISAVLEAAQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQ
380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 NNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSLRLSWASK
..:: :: :: ::::::::.:::. ...:.: .. . : ... : :. : :.
CCDS12 DKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 TSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKLLDMGEPR
.: .::::::::.. : :.:: .. .: : . :::. : : : .:..: ...:.::
CCDS12 ASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAFAP-YPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE4 ALLATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLAQLPVNQQL
.. . :: ...: .:: :.. ::: : :: .: .::::::. .
CCDS12 TF--PFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSSEA----------LTPIGSLLAQLPVDVVI
550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KE4 GKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSGSSKSDCIALVEA
::...:: .:. .. : ::::::... :. .. . . . :...: ..: ..
CCDS12 GKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECAAARRPLE-SDQGDPFTLFNV
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KE4 FKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRISQFNMHVDSRRPV
:..: .. . .. .: : :. .:. :.:.: ...:
CCDS12 FNAWVQVKS----ERSRNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFKELLEDHGLLAGAQAAQ
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KE4 MDQEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKDPKTTVVLKHIPPYGFL
CCDS12 VGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGGSSDEDRAGPAPPGASD
710 720 730 740 750 760
>>CCDS9261.1 DHX37 gene_id:57647|Hs108|chr12 (1157 aa)
initn: 655 init1: 287 opt: 419 Z-score: 430.6 bits: 91.9 E(32554): 1.2e-17
Smith-Waterman score: 661; 26.3% identity (52.2% similar) in 855 aa overlap (39-792:174-985)
10 20 30 40 50 60
pF1KE4 QINDWFTIGKTVTNVELLGAPPAFPAGAAREEVQRQDVAPGAGPAAQAPALAQAPARPAA
:: .. : :.: :: . . . :: ::
CCDS92 SSLSGAHRKRRRWPSAEEEEEEEEESESELEEESELDEDPAAEPAEAGVGTTVAPLPPAP
150 160 170 180 190 200
70 80 90 100 110 120
pF1KE4 AFERSLSQRSSEVEYINKYRQLEAQELDVCRSVQP---TSGPGPRPSLAK---LSSVTCI
: :: : . . .: : .. : :: .::: . :.
CCDS92 A-------PSS-------------QPVPAGMTVPPPPAAAPPLPR-ALAKPAVFIPVNRS
210 220 230 240
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 PGTTYKYPDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDHYVQRSAYCSI
: . ::: .. .. . . .::. : :::::.::.::.. . . :. ::
CCDS92 PEMQEERLKLPILSEEQVIMEAVAEHPIVIVCGETGSGKTTQVPQFLYE--AGFSSEDSI
250 260 270 280 290 300
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 V-VTQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIATEDTRLIYMTTGVLLQKIVS
. ::.::...: .... ..:: . ::.::. : .::.::. .:: ::::..: .
CCDS92 IGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEMNLSQR-VVSYQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQK
310 320 330 340 350
250 260 270 280 290
pF1KE4 AKSLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKL--LRTNSRF-VKVVLMSATISCKEFAD-
:... .::::.:::. :.:. .. .. ::.. . .:...::::. ..:..
CCDS92 DFLLLRYKVVIIDEAHERSVYTDILIGLLSRIVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQN
360 370 380 390 400 410
300 310 320 330
pF1KE4 --YFAVP-----VQNKMNPAYIFEVEGKP---HSVEEY-----------------YLNDL
:: : :.... :. . . : .: : . .:.
CCDS92 PRLFAKPPPVIKVESRQFPVTVHFNKRTPLEDYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQ
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380
pF1KE4 EHIHH-----SKLSPHLLEEPVITKDIYEVAVSLIQMFDDLDMKESGNKAWSGAQFVLER
..: : : .: : . .: .. : . . .: :. :..
CCDS92 AEVHALCRRLRKAFPPSRARPQEKDDDQKDSVEEMRKFKKSRARAKKARAEVLPQINLDH
480 490 500 510 520 530
390 400 410 420
pF1KE4 SSVLVFLPG----LGEINYMHELLTSLVHKRL-----------------QVYPLHSSVAL
::: : .:.. . : : . : .: ::.: .:
CCDS92 YSVLPAGEGDEDREAEVDEEEGALDSDLDLDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAP
540 550 560 570 580 590
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 EEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSLRLSW
:.: .:: : : : ...::.::.:.:.: .:::.: .. :. :. .:.:..:
CCDS92 EKQAQVFKPPPEGTRLCVVATNVAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTW
600 610 620 630 640 650
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 ASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRL----VHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKL
.:..: .:: :::::. :.:::: : :: ...: ::. : :. . ::..:
CCDS92 VSQASADQRAGRAGRTEPGHCYRLYSSAVFGDF--EQFPP---PEITRRPVEDLILQMKA
660 670 680 690 700 710
550 560 570 580 590
pF1KE4 LDMGEPRALLATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQRE-----DENPHDGELTFLG
:.. ... .::.. . . :: .::: . : .:: . .: ::
CCDS92 LNV--EKVINFPFPTPPSVEALLAAEELLIALGALQPPQKAERVKQLQENRLSCPITALG
720 730 740 750 760 770
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RVLAQLPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSG
:..: .:: . .:...:.. ::: . :.:.......: ..:: . .
CCDS92 RTMATFPVAPRYAKMLALSRQHGCLPYAITIVASMTVRELF-----EELDRPAASDEELT
780 790 800 810 820
660 670 680 690 700
pF1KE4 SSKSDCIALVEAFKTWK---ACRQTGEL----------RYPKDELNWGRLNYIQIKRIRE
:: ... .:: : . :.: .: . .. . : .. : . :
CCDS92 RLKSKRARVAQMKRTWAGQGASLKLGDLMVLLGAVGACEYASCTPQFCEANGLRYKAMME
830 840 850 860 870 880
710 720 730 740 750
pF1KE4 VAELYEELKTRIS----QFNMHVDSRRPVMDQEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQP
. .: .: : .. . .. :: : :. . .. :.: :: ....
CCDS92 IRRLRGQLTTAVNAVCPEAELFVD---PKMQPPTESQVTYLRQIVTAG--LGDHLARRVQ
890 900 910 920 930 940
760 770 780 790 800
pF1KE4 DEEM-------AVRELAGKDP----KTTVVLKHIPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQVKSIVF
.::: : . :: ..:..:..: :. :...
CCDS92 SEEMLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFKELPE--FVVYQEIVETTKMYMKGVSSVE
950 960 970 980 990 1000
810 820 830 840 850 860
pF1KE4 DGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIKMSQLKVSLELSVHSAEEIEGKVQGMNVSKLRN
CCDS92 VQWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRASVFYRVGWPLPAIEVDFPEGIDR
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>>CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194 aa)
initn: 669 init1: 295 opt: 408 Z-score: 418.9 bits: 89.7 E(32554): 5.2e-17
Smith-Waterman score: 966; 30.8% identity (61.0% similar) in 736 aa overlap (51-757:339-1032)
30 40 50 60 70 80
pF1KE4 TNVELLGAPPAFPAGAAREEVQRQDVAPGAGPAAQAPALAQAPARPAAAFERSLSQRSSE
: . . : :.: .: :.. :
CCDS27 CKKLKSLGLVDRNNEPLTHAMYNLASLRELGETQRRPCTIQVPEPILRKIETFLNHYPVE
310 320 330 340 350 360
90 100 110 120
pF1KE4 VEYINKYRQLEAQE-LDVCRSVQPTSGP--G-PR-PSL----AKLS-SVTCI---PGTTY
.: .:.... : . .. : : : : : : : ..:: :. . : ..
CCDS27 SSWIAPELRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRRRGPVW
370 380 390 400 410 420
130 140 150 160 170 180
pF1KE4 KY-PDLPISRYKEEVVSLIESNSVVIIHGATGSGKSTQLPQYILDHYVQ--RSAYCSIVV
. :.::.. ... ... ::.. ::.: : :: ::.:..:: .:..:: :.: :....
CCDS27 QEAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYVTEGRGARCNVII
430 440 450 460 470 480
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 TQPRKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLE-KIATEDTRLIYMTTGVLLQKIVSAK
::::.:.: :.:. .:.: . .: ::.:: :: : .. :.. :.:.::.:. :
CCDS27 TQPRRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNP
490 500 510 520 530 540
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 SLMEFTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNSRFVKVVLMSATISCKEFADYFA-VP
:: .:.:.:::::: . ::::.... : : : . ..:::::: . ..:. ::. :
CCDS27 SLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPAL-RLVLMSATGDNERFSRYFGGCP
550 560 570 580 590 600
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 VQNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLNDL--EHIHHSKLSPHLLEEPVITKDIYEVAVSLI
: ..: : . :.:.::.:. . .:. : : .: ..: : :..:
CCDS27 V---------IKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLGKHQYLHRHRHHE---SED--ECALDL-
610 620 630 640 650
370 380 390 400 410
pF1KE4 QMFDDLDMKESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLGEINYMHELLTSLV--HK-RLQVYP
.. :: .. .. .: .: :::: ::. ... : . :. . . :
CCDS27 DLVTDLVLHIDARGEPGG---------ILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILP
660 670 680 690 700
420 430 440 450 460 470
pF1KE4 LHSSVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNY
.::.. . .:. .: .: : :::.:.:::::.:.:. :. .:.: : . : :.
CCDS27 VHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIVLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKV
710 720 730 740 750 760
480 490 500 510 520 530
pF1KE4 QSLRLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILK
. :. :.:... ::.::::: . :. :.: .. .. .: .: ::.:: :: . .:.
CCDS27 SCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQSGFAYHLFPRSRLEKMVPFQV-PEILRTPLENLVLQ
770 780 790 800 810 820
540 550 560 570 580 590
pF1KE4 VKLLDMGEPRAL--LATALSPPGLSDIERTILLLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLG
.:. : : :. :. :.. :... ......::.:.:.: ::: :: ::
CCDS27 AKI-HMPEKTAVEFLSKAVDSPNIKAVDEAVILLQEIGVL---DQRE-------YLTTLG
830 840 850 860 870
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 RVLAQLPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMPFRQHLDGYRNKVNFSG
. ::.. .. .:.: :::. .: :: :.... :. .. :. .... . . :. .:
CCDS27 QRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSH
880 890 900 910 920 930
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 SSKSDCIALVEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRIS
.: :: .:.:.: :. . . : .. :. . : . .: . : .... :
CCDS27 DSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQD-RSSRE--NYLEENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIY
940 950 960 970 980
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 Q-FNMHVDSRRPVMD---QEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKD
. : . : . . .:: ..... :..:: .::: . :
CCDS27 EAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAG-LYPNLIQVRQGKVTRQGKFKPNSV
990 1000 1010 1020 1030 1040
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 PKTTVVLKHIPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQVKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVY
CCDS27 TYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSRWLTYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGD
1050 1060 1070 1080 1090 1100
>>CCDS54150.1 DHX40 gene_id:79665|Hs108|chr17 (702 aa)
initn: 526 init1: 323 opt: 391 Z-score: 404.9 bits: 86.4 E(32554): 3.1e-16
Smith-Waterman score: 629; 27.4% identity (58.4% similar) in 543 aa overlap (218-748:60-551)
190 200 210 220 230 240
pF1KE4 RKIGASSIARWISKERAWTLGGVVGYQVGLEKIATEDTRLIYMTTGVLLQKIVSAKSLME
.:: .: . ::: : ::..:.. .: .
CCDS54 SAVCIADREEKGCTSQEGGTTPTFPIQKQRKKIIQAETAIKYMTDGCLLKHILGDPNLTK
30 40 50 60 70 80
250 260 270 280 290 300
pF1KE4 FTHIIIDEVHERTEEMDFLLLVVRKLLRTNS----RFVKVVLMSATISCKEFADYFAVPV
:. ::.::.:::: :.:. ...::.. .: . .:::.::::. ... .:.
CCDS54 FSVIILDEAHERTLTTDILFGLLKKLFQEKSPNRKEHLKVVVMSATMELAKLSAFFG---
90 100 110 120 130 140
310 320 330 340 350 360
pF1KE4 QNKMNPAYIFEVEGKPHSVEEYYLNDLEHIHHSKLSPHLLEEPVITKDIYEVA--VSLIQ
: ::.. :. . :.: . : ..:. :. . . : .:. . : .
CCDS54 ---NCP--IFDIPGRLYPVREKFCN--------LIGPRDRENTAYIQAIVKVTMDIHLNE
150 160 170 180 190
370 380 390 400 410 420
pF1KE4 MFDDLDMKESGNKAWSGAQFVLERSSVLVFLPGLGE-INYMHELLTSLVHKRLQVYPLHS
: :. . .: :: .:.: :.: ..: ..: ... . . : . : ..
CCDS54 MAGDILVFLTG-------QFEIEKSCELLFQ--MAESVDYDYDVQDTTLDG-LLILPCYG
200 210 220 230 240
430 440 450 460 470 480
pF1KE4 SVALEEQNNVFLSPVPGYRKIILSTNIAESSVTVPDVKYVIDFCLTRTLVCDEDTNYQSL
:.. ..: .:: : :: :: ..::::. .:.:. ..::.: ... : . . . :
CCDS54 SMTTDQQRRIFLPPPPGIRKCVISTNISATSLTIDGIRYVVDGGFVKQLNHNPRLGLDIL
250 260 270 280 290 300
490 500 510 520 530 540
pF1KE4 RLSWASKTSCNQRKGRAGRVSRGYCYRLVHKDFWDNSIPDHVVPEMLRCPLGSTILKVKL
.. ::. ::.:::::.: : :.:. ::::.. .::::.::. : : :..: .:
CCDS54 EVVPISKSEALQRSGRAGRTSSGKCFRIYSKDFWNQCMPDHVIPEIKRTSLTSVVLTLKC
310 320 330 340 350 360
550 560 570 580 590
pF1KE4 LDMGEPRALLATALSPPGLSDIERTIL-LLKEVGALAVSGQREDENPHDGELTFLGRVLA
: . . .. :.::. :: :: ::.. . : ..:..: :: ..
CCDS54 LAIHD--VIRFPYLDPPN----ERLILEALKQL-------YQCDAIDRSGHVTRLGLSMV
370 380 390 400 410
600 610 620 630 640 650
pF1KE4 QLPVNQQLGKLIVLGHVFGCLDECLIIAAALSLKNFFAMP----FRQHLDGYRNKVNFSG
..:. .: .. . . : : : ::: ::..: : : .... . . .. ..
CCDS54 EFPLPPHLTCAVIKAASLDCEDLLLPIAAMLSVENVFIRPVDPEYQKEAEQRHRELAAKA
420 430 440 450 460 470
660 670 680 690 700 710
pF1KE4 SSKSDCIALVEAFKTWKACRQTGELRYPKDELNWGRLNYIQIKRIREVAELYEELKTRIS
.. .: .:. : . :...: : .: . ..:. . . . .. .:. :
CCDS54 GGFNDFATLAVIF---EQCKSSGA---PA---SWCQKHWIHWRCLFSAFRVEAQLRELIR
480 490 500 510 520
720 730 740 750 760 770
pF1KE4 QFNMHVDSRRPVMDQEYIYKQRFILQVVLAGAFYPNYFTFGQPDEEMAVRELAGKDPKTT
..... : . ... :.. . . . :: :
CCDS54 KLKQQSDFPKETFEGP---KHEVLRRCLCAGYFKNVARRSVGRTFCTMDGRGSPVHIHPS
530 540 550 560 570
780 790 800 810 820 830
pF1KE4 VVLKHIPPYGFLYYKQLQSLFRQCGQVKSIVFDGAKAFVEFSRNPTERFKTLPAVYMAIK
CCDS54 SALHEQETKLEWIIFHEVLVTTKVYARIVCPIRYEWVRDLLPKLHEFNAHDLSSVARREV
580 590 600 610 620 630
1382 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 03:15:04 2016 done: Sun Nov 6 03:15:05 2016
Total Scan time: 4.080 Total Display time: 0.360
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]