FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2514, 894 aa 1>>>pF1KE2514 894 - 894 aa - 894 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.6359+/-0.00111; mu= -15.0407+/- 0.066 mean_var=633.6293+/-151.254, 0's: 0 Z-trim(117.5): 201 B-trim: 848 in 1/52 Lambda= 0.050951 statistics sampled from 18017 (18251) to 18017 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.82), E-opt: 0.2 (0.561), width: 16 Scan time: 3.720 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9950.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 ( 894) 6275 476.8 7.5e-134 CCDS9949.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 ( 823) 4785 367.3 6.6e-101 CCDS1862.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 835) 2921 230.3 1.2e-59 CCDS1861.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 ( 773) 2345 187.9 6.2e-47 >>CCDS9950.1 BCL11B gene_id:64919|Hs108|chr14 (894 aa) initn: 6275 init1: 6275 opt: 6275 Z-score: 2516.5 bits: 476.8 E(32554): 7.5e-134 Smith-Waterman score: 6275; 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92.1% identity (92.1% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-823) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 MSRRKQGNPQHLSQRELITPEADHVEAAILEEDEGLEIEEPSGLGLMVGGPDPDLLTCGQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 CQMNFPLGDILVFIEHKRKQCGGSLGACYDKALDKDSPPPSSRSELRKVSEPVEIGIQVT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAGPCRPAQLPAVAPIAASSHPHSSVITSPLRALGALPPC ::::::::::::::::::::::: CCDS99 PDEDDHLLSPTKGICPKQENIAG------------------------------------- 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 LPLPCCSARPVSGDGTQGEGQTEAPFGCQCQLSGKDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA :::::::::::::::::::::::::: CCDS99 ----------------------------------KDEPSSYICTTCKQPFNSAWFLLQHA 150 160 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 QNTHGFRIYLEPGPASSSLTPRLTIPPPLGPEAVAQSPLMNFLGDSNPFNLLRMTGPILR 170 180 190 200 210 220 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 DHPGFGEGRLPGTPPLFSPPPRHHLDPHRLSAEEMGLVAQHPSAFDRVMRLNPMAIDSPA 230 240 250 260 270 280 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 MDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 MDFSRRLRELAGNSSTPPPVSPGRGNPMHRLLNPFQPSPKSPFLSTPPLPPMPPGGTPPP 290 300 310 320 330 340 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 QPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 QPPAKSKSCEFCGKTFKFQSNLIVHRRSHTGEKPYKCQLCDHACSQASKLKRHMKTHMHK 350 360 370 380 390 400 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 AGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 AGSLAGRSDDGLSAASSPEPGTSELAGEGLKAADGDFRHHESDPSLGHEPEEEDEEEEEE 410 420 430 440 450 460 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 EEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 EEELLLENESRPESSFSMDSELSRNRENGGGGVPGVPGAGGGAAKALADEKALVLGKVME 470 480 490 500 510 520 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 NVGLGALPQYGELLADKQKRGAFLKRAAGGGDAGDDDDAGGCGDAGAGGAVNGRGGGFAP 530 540 550 560 570 580 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 GTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 GTEPFPGLFPRKPAPLPSPGLNSAAKRIKVEKDLELPPAALIPSENVYSQWLVGYAASRH 590 600 610 620 630 640 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 FMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 FMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDLLDGGLSGRSGTASGGSTPHLG 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 GPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 GPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHTGERPYKCELCNYACAQSSKLT 710 720 730 740 750 760 850 860 870 880 890 pF1KE2 RHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS99 RHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGEHLLTNDVKIEQAERS 770 780 790 800 810 820 >>CCDS1862.1 BCL11A gene_id:53335|Hs108|chr2 (835 aa) initn: 2489 init1: 860 opt: 2921 Z-score: 1184.5 bits: 230.3 E(32554): 1.2e-59 Smith-Waterman score: 3459; 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CCDS18 RALPD--------VMQGMVLSSMQHFSEAFHQVLGEKHKRG-HLAEAEGHRDTCDEDSVA 550 560 570 580 590 650 660 670 680 690 pF1KE2 GCGDAGAGGAVNGRGGGFAPGTEPFPGLFPRKPAPLPSPG-LNSAAKRIKVEKDLELPPA : .: :.::::: .:: :: : : ::. :. .::::.::...:::: CCDS18 GESDRIDDGTVNGRG--CSPGESASGGL--SKKLLLGSPSSLSPFSKRIKLEKEFDLPPA 600 610 620 630 640 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 ALIPSENVYSQWLVGYAASRHFMKDPFLGFTDARQSPFATSSEHSSENGSLRFSTPPGDL :. .::::::::.::::::. .:::::.: :.::::::.::::::::::::::::::.: CCDS18 AMPNTENVYSQWLAGYAASRQ-LKDPFLSFGDSRQSPFASSSEHSSENGSLRFSTPPGEL 650 660 670 680 690 700 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 LDGGLSGRSGTASGGSTPHLGGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHT :::.::::::.:::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS18 -DGGISGRSGTGSGGSTPHISGPGPGRPSSKEGRRSDTCEYCGKVFKNCSNLTVHRRSHT 710 720 730 740 750 760 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 GERPYKCELCNYACAQSSKLTRHMKTHGQIGKEVYRCDICQMPFSVYSTLEKHMKKWHGE :::::::::::::::::::::::::::::.::.::.:.::.:::::::::::::::::.. 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