FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0602, 358 aa 1>>>pF1KE0602 358 - 358 aa - 358 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7888+/-0.00121; mu= 3.3033+/- 0.069 mean_var=243.8483+/-56.991, 0's: 0 Z-trim(107.6): 686 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.082132 statistics sampled from 8888 (9681) to 8888 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.297), width: 16 Scan time: 2.580 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 2464 305.7 4e-83 CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 1834 230.9 9.9e-61 CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 1534 195.4 5.4e-50 CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 1260 163.2 4.3e-40 CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 1260 163.3 4.7e-40 CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 1038 136.9 3.4e-32 CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 1038 137.0 4e-32 CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 976 129.9 8.9e-30 CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 976 129.9 9.3e-30 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 794 107.7 1.3e-23 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 766 104.4 1.3e-22 CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 762 103.9 1.8e-22 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 761 103.8 1.9e-22 CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 700 97.0 4.7e-20 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 695 96.1 4.9e-20 CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 689 95.6 1.1e-19 CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 689 95.7 1.2e-19 CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 689 95.7 1.2e-19 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 673 93.5 3e-19 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 665 92.7 7.4e-19 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 665 92.7 7.4e-19 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 654 91.4 1.8e-18 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 654 91.4 1.8e-18 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 654 91.5 1.9e-18 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 651 91.0 2.2e-18 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 651 91.0 2.3e-18 CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 638 89.5 7e-18 CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 612 86.3 4.6e-17 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 592 84.0 2.6e-16 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 592 84.0 2.7e-16 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 592 84.0 2.8e-16 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 575 82.0 1.1e-15 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 567 81.0 1.9e-15 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 567 81.0 2e-15 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 566 80.8 2e-15 CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 563 80.4 2.5e-15 CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 563 80.5 2.8e-15 CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 561 80.2 3.1e-15 CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 556 79.6 4.5e-15 CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 554 79.4 5.3e-15 CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 418) 554 79.5 5.9e-15 CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 550 78.9 7e-15 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 556 80.0 7.2e-15 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 556 80.0 7.4e-15 CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 550 78.9 7.5e-15 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 556 80.0 7.5e-15 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 551 79.4 1.1e-14 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 551 79.4 1.1e-14 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 551 79.4 1.1e-14 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 551 79.4 1.1e-14 >>CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (358 aa) initn: 2464 init1: 2464 opt: 2464 Z-score: 1605.9 bits: 305.7 E(32554): 4e-83 Smith-Waterman score: 2464; 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CCDS82 GKAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVR 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE .:. .. :::: ..:..: .. : : :::.:: .: : .:::: .:. : ...: CCDS82 LPEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI . ..: : CCDS82 LQLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGS 300 310 320 330 340 350 >>CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (455 aa) initn: 871 init1: 871 opt: 1038 Z-score: 691.5 bits: 136.9 E(32554): 3.4e-32 Smith-Waterman score: 1038; 49.2% identity (78.6% similar) in 299 aa overlap (2-300:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK :: :: .::.::::::.:.::....:::::::: : : .. : .:::.:::..:::.. 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CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE0 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK : :::::.::::.:...:::::. ::::: ::..: .:. . ... .: :.:... :. CCDS47 HENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHS 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE0 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY .: ::::.::::::... .. ::::::::: :..:.: :::::::::::.:::.. ::.: CCDS47 NNIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSY 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE0 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK : :::.::.::.. :. .: : :..::.: :. : .:.: :. :..:: . :.:: CCDS47 GKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVV 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE0 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFENIREIEDLAKE .:. . . . :.:... ....::..::..:.. .:::: :: :: . : CCDS47 LPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPE 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 pF1KE0 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI CCDS47 LKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKV 300 310 320 330 340 350 >>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (960 aa) initn: 846 init1: 745 opt: 976 Z-score: 648.1 bits: 129.9 E(32554): 8.9e-30 Smith-Waterman score: 988; 43.0% identity (75.1% similar) in 358 aa overlap (1-356:9-354) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALRE .:.:.: .: .:::.::::.:::...: .::::::: .::.. .:. .::: CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 IRMLKQLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTL ..::. ::. :.:.: :.:::. .:.::::: ....:. :... ::: . ::: .: . 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CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE0 QAVNFCHKHNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLT-GPSDYYTDYVATRWYRSP .:...:::.. .:::.::::.::....:.::::::::: :. : . ::.:::::::::: CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE0 ELLVGDTQYGPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFS :::.: . :: ::.:..::...:: .: ::.::.:..:::. :.:.:: : .....: CCDS14 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE0 TNQYFSGVKIPDPEDMEPLELKFPNISYPAL-GLLKGCLHMDPTQRLTCEQLLHHPYFEN .: : :...: . . :: .. .: .: :.:. :..::..: :: :.:: :.. CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE0 IREIEDLAKEHNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQVTGSSILPALDNKKYYCDTKK : .. .:.:.. :: .: .:.: :. :. :. : . ... : .. CCDS14 QRLLD------RSPSRSAKRK--PYH--VESSTLSNRNQAGKSTALQS-HHRSNSKDIQN 300 310 320 330 340 pF1KE0 LNYRFPNI :. .: CCDS14 LSVGLPRADEGLPANESFLNGNLAGASLSPLHTKTYQASSQPGSTSKDLTNNNIPHLLSP 350 360 370 380 390 400 >>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa) initn: 785 init1: 446 opt: 794 Z-score: 537.3 bits: 107.7 E(32554): 1.3e-23 Smith-Waterman score: 794; 44.3% identity (68.8% similar) in 298 aa overlap (2-288:1-286) 10 20 30 40 50 pF1KE0 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKF---LESEDDPVIKKIALREIRMLK :. ..:. :::::.::::.: .::.:::.::.::. :: : : . :.::: .:: CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVP---STAIREISLLK 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE0 QLKHPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRG-VPEHLVKSITWQTLQAVN .:::::.: ::.: . .:.:.::::. .. . . .: . .: ::.:: .: ::.:. 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