FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2085, 759 aa 1>>>pF1KE2085 759 - 759 aa - 759 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6247+/-0.000448; mu= 19.5011+/- 0.028 mean_var=84.3880+/-17.360, 0's: 0 Z-trim(111.7): 63 B-trim: 288 in 2/53 Lambda= 0.139616 statistics sampled from 20290 (20353) to 20290 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.239), width: 16 Scan time: 11.760 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001008895 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 1 [H ( 759) 4978 1013.3 0 NP_003580 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 2 [Homo ( 659) 4320 880.7 0 NP_001265442 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 2 [H ( 659) 4320 880.7 0 XP_011535825 (OMIM: 603137) PREDICTED: cullin-4A i ( 659) 4320 880.7 0 NP_001265443 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 3 [H ( 667) 4276 871.8 0 NP_001073341 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isofo ( 895) 4106 837.7 0 NP_001317553 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isofo ( 900) 4106 837.7 0 NP_003579 (OMIM: 300304,300354) cullin-4B isoform ( 913) 4106 837.7 0 XP_006724847 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 902) 4092 834.9 0 XP_005262538 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 915) 4092 834.9 0 XP_011529702 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 717) 4031 822.5 0 XP_011529701 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 719) 4017 819.7 0 XP_011529703 (OMIM: 300304,300354) PREDICTED: cull ( 701) 3808 777.6 0 NP_003581 (OMIM: 603136,614496) cullin-3 isoform 1 ( 768) 1009 213.8 2.1e-54 XP_011510297 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 754) 1002 212.4 5.6e-54 XP_006712863 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 757) 1002 212.4 5.6e-54 NP_001244127 (OMIM: 603136,614496) cullin-3 isofor ( 774) 1002 212.4 5.7e-54 NP_001244126 (OMIM: 603136,614496) cullin-3 isofor ( 702) 932 198.3 9.2e-50 XP_011510298 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 704) 932 198.3 9.2e-50 XP_011510296 (OMIM: 603136,614496) PREDICTED: cull ( 719) 932 198.3 9.4e-50 NP_001311305 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform e [Ho ( 614) 915 194.8 8.9e-49 NP_001311304 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform d [Ho ( 682) 915 194.9 9.7e-49 NP_003582 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform c [Homo ( 745) 915 194.9 1e-48 NP_001185706 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform c [Ho ( 745) 915 194.9 1e-48 XP_011518049 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 745) 915 194.9 1e-48 NP_001185708 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform b [Ho ( 758) 915 194.9 1.1e-48 NP_001185707 (OMIM: 603135) cullin-2 isoform a [Ho ( 764) 915 194.9 1.1e-48 XP_011518047 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 808) 915 194.9 1.1e-48 XP_011518045 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 808) 915 194.9 1.1e-48 XP_011518046 (OMIM: 603135) PREDICTED: cullin-2 is ( 808) 915 194.9 1.1e-48 XP_011514932 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43 XP_011514931 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43 XP_011514934 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43 NP_003583 (OMIM: 603134) cullin-1 [Homo sapiens] ( 776) 831 178.0 1.3e-43 XP_005250117 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43 XP_011514933 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 776) 831 178.0 1.3e-43 XP_016868212 (OMIM: 603134) PREDICTED: cullin-1 is ( 455) 822 176.0 3.1e-43 XP_016873853 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 519) 441 99.3 4.3e-20 XP_016873854 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 519) 441 99.3 4.3e-20 XP_005271739 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 721) 441 99.4 5.6e-20 XP_016873852 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 742) 441 99.4 5.7e-20 NP_003469 (OMIM: 601741) cullin-5 [Homo sapiens] ( 780) 441 99.4 5.9e-20 NP_037498 (OMIM: 606946) anaphase-promoting comple ( 822) 230 56.9 3.8e-07 XP_011541315 (OMIM: 601741) PREDICTED: cullin-5 is ( 396) 190 48.7 5.8e-05 >>NP_001008895 (OMIM: 603137) cullin-4A isoform 1 [Homo (759 aa) initn: 4978 init1: 4978 opt: 4978 Z-score: 5418.3 bits: 1013.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4978; 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