FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6369, 348 aa 1>>>pF1KE6369 348 - 348 aa - 348 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2414+/-0.000946; mu= 16.5025+/- 0.056 mean_var=65.5100+/-13.733, 0's: 0 Z-trim(103.9): 22 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.158460 statistics sampled from 7616 (7628) to 7616 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.234), width: 16 Scan time: 1.940 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs108|chr13 ( 348) 2324 540.3 8.8e-154 CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs108|chr4 ( 377) 1115 263.9 1.5e-70 CCDS3482.1 SLC10A4 gene_id:201780|Hs108|chr4 ( 437) 740 178.3 1.1e-44 CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs108|chr14 ( 349) 709 171.1 1.2e-42 CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs108|chr8 ( 438) 530 130.2 3.1e-30 CCDS48195.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs108|chrX ( 448) 434 108.3 1.3e-23 CCDS14755.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs108|chrX ( 477) 434 108.3 1.3e-23 >>CCDS9506.1 SLC10A2 gene_id:6555|Hs108|chr13 (348 aa) initn: 2324 init1: 2324 opt: 2324 Z-score: 2874.4 bits: 540.3 E(32554): 8.8e-154 Smith-Waterman score: 2324; 99.7% identity (100.0% similar) in 348 aa overlap (1-348:1-348) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MNDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 MNDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 HIKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 HIKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 GDMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVALVVPVSIGM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::: CCDS95 GDMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVSLVVPVSIGM 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 FVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 FVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYSL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 GFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 GFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLAF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 AAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS95 AAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK 310 320 330 340 >>CCDS3614.1 SLC10A6 gene_id:345274|Hs108|chr4 (377 aa) initn: 1198 init1: 1070 opt: 1115 Z-score: 1380.1 bits: 263.9 E(32554): 1.5e-70 Smith-Waterman score: 1118; 47.9% identity (81.0% similar) in 326 aa overlap (30-345:30-355) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MNDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLG : .:...: :....:.:::.::.:::.:. . 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CCDS34 PTTSGLAGGAASHGPSPFPRPWAPHALPFWDTPLNHGLNVFVGAALCI----TMLGLGCT 70 80 90 100 110 120 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 VEIKKFLGHIKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTAS :....: .:..:: : .. :::::..:: .:.:..:: . . ::.::. ::::::. : CCDS34 VDVNHFGAHVRRPVGALLAALCQFGLLPLLAFLLALAFKLDEVAAVAVLLCGCCPGGNLS 130 140 150 160 170 180 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NILAYWVDGDMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSI-VIPYDNIGTSLVA :... :::::.::. :: :::::: .::::: ::. :... . ..: .. .: . CCDS34 NLMSLLVDGDMNLSIIMTISSTLLALVLMPLCLWIYSWAWINTPIVQLLPLGTVTLTLCS 190 200 210 220 230 240 180 190 200 210 220 pF1KE6 LVVPVSIGMFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAI-LIVLIAVVGGILYQSAWIIAPK-LWII ..:...:.:. .:. . : :.:.. . . :.::. ..: .: : ...: CCDS34 TLIPIGLGVFIRYKYSRVADYIVKVSLWSLLVTLVVLFIMTGTMLGPELLASIPAAVYVI 250 260 270 280 290 300 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GTIFPVAGYSLGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTF . ..:.:::. :. :: . :: ::: .::: ::.:::..:..:.: :. .. .. : CCDS34 AIFMPLAGYASGYGLATLFHLPPNCKRTVCLETGSQNVQLCTAILKLAFPPQFIGSMYMF 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 PLIYSIFQLAFAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK ::.:..:: : :.::. .: : CCDS34 PLLYALFQSAEAGIFVLIYKMYGSEMLHKRDPLDEDEDTDISYKKLKEEEMADTSYGTVK 370 380 390 400 410 420 >>CCDS9797.1 SLC10A1 gene_id:6554|Hs108|chr14 (349 aa) initn: 691 init1: 401 opt: 709 Z-score: 879.0 bits: 171.1 E(32554): 1.2e-42 Smith-Waterman score: 709; 38.4% identity (73.4% similar) in 297 aa overlap (32-322:25-319) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 NDPNSCVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFSMGCNVEIKKFLGH ..::..:...: ..:.:.::..:..:. .: CCDS97 MEAHNASAPFNFTLPPNFGKRPTDLALSVILVFMLFFIMLSLGCTMEFSKIKAH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 IKRPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVDG . .: :. .... :.::::::.:.:. .: . ..:...:. :: :::. ::... . : CCDS97 LWKPKGLAIALVAQYGIMPLTAFVLGKVFRLKNIEALAILVCGCSPGGNLSNVFSLAMKG 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE6 DMDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIV--IPYDNIGTSLVALVVPVSIG ::.::. ::::::. ::::::: : ::.. : :.. .:: .: ::: ...: .:: CCDS97 DMNLSIVMTTCSTFCALGMMPLLLYIYSRGIYD-GDLKDKVPYKGIVISLVLVLIPCTIG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 MFVNHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIA--PKLWIIGTIFPVAG . .. : :: . ..: : : . : ..:...: .. ..: : : ....: : CCDS97 IVLKSKRPQYMRYVIKGGMIIILLCSVAVTVLSAINVGKSIMFAMTPLLIATSSLMPFIG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 YSLGFLLARIAGLPWYRCR-TVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIF . ::..:. . : ::: ::..::: ::.::::::....: :: .. .: :::.: :: CCDS97 FLLGYVLSALFCLNG-RCRRTVSMETGCQNVQLCSTILNVAFPPEVIGPLFFFPLLYMIF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE6 QLAFAAIFLGFYVAYKKCHG-KNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK ::. . ...... :.: . :.:... CCDS97 QLGEGLLLIAIFWCYEKFKTPKDKTKMIYTAATTEETIPGALGNGTYKGEDCSPCTA 300 310 320 330 340 >>CCDS34915.1 SLC10A5 gene_id:347051|Hs108|chr8 (438 aa) initn: 456 init1: 368 opt: 530 Z-score: 656.4 bits: 130.2 E(32554): 3.1e-30 Smith-Waterman score: 530; 32.6% identity (63.2% similar) in 285 aa overlap (37-314:143-424) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 CVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMFS---MGCNVEIKKFLGHIK .: ..: :.... .::..:.. : : CCDS34 RLIEEIKNVKVKVLKQKDSLLQAPMHIDRNILMLILPLILLNKCAFGCKIELQLFQTVWK 120 130 140 150 160 170 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCCPGGTASNILAYWVDGDM :: . .: . :: .::. ::.:: . :: :.. :::: .. ..: .:::. CCDS34 RPLPVILGAVTQFFLMPFCGFLLSQIVALPEAQAFGVVMTCTCPGGGGGYLFALLLDGDF 180 190 200 210 220 230 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVALVVPVSIGMFVN :.. :: :::::: :::. ::... ::.. :: ..: ..:. ..::::::. .. CCDS34 TLAILMTCTSTLLALIMMPVNSYIYSRILGLSGTFHIPVSKIVSTLLFILVPVSIGIVIK 240 250 260 270 280 290 190 200 210 220 230 pF1KE6 HKWPQKA----KIILKIGSIAGAILIVLIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYS :. :.:: .:: .. : . : : .:: .. .. . .. ..: . :. : CCDS34 HRIPEKASFLERIIRPLSFILMFVGIYLTFTVGLVFLKTDNL---EVILLGLLVPALGLL 300 310 320 330 340 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLA .:. .:.. :: :.:::.:.:: :. : ...:::: . :.. . :. .. . CCDS34 FGYSFAKVCTLPLPVCKTVAIESGMLNSFLALAVIQLSFPQSKANLASVAPFTVAMCSGC 350 360 370 380 390 400 300 310 320 330 340 pF1KE6 FAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK ... : : :.: CCDS34 EMLLIILVYKAKKRCIFFLQDKRKRNFLI 410 420 430 >>CCDS48195.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs108|chrX (448 aa) initn: 336 init1: 225 opt: 434 Z-score: 537.6 bits: 108.3 E(32554): 1.3e-23 Smith-Waterman score: 434; 28.8% identity (64.1% similar) in 281 aa overlap (37-309:163-440) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 CVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMF---SMGCNVEIKKFLGHIK .: .:: :.. :.::.::.. . : .. CCDS48 ERRDFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQ 140 150 160 170 180 190 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCC-PGGTASNILAYWVDGD : . .:.: :: .::: .:... .: .:: .. ::: : ::: .: ... . :: CCDS48 SPQPMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVF-MLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGD 200 210 220 230 240 250 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 MDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVALVVPVSIGMFV . :..::: ::. : :..:: ::... .. .: ..: .:. ...:...:... CCDS48 VTLAISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLI 260 270 280 290 300 310 190 200 210 220 230 pF1KE6 NHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIV---LIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYS . : :. ....:.. . . .:.. ..: :. . : : : . ..: :..: CCDS48 KSKLPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGV-FILAGIRLP-IVLVGITVPLVGLL 320 330 340 350 360 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLA .:. :: :: . :::..:.:.::. : ...:::. . . . :.: .. . CCDS48 VGYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTS 370 380 390 400 410 420 300 310 320 330 340 pF1KE6 -FAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK . :. .: .. CCDS48 EMLALVIGHFIYSSLFPVP 430 440 >>CCDS14755.1 SLC10A3 gene_id:8273|Hs108|chrX (477 aa) initn: 290 init1: 225 opt: 434 Z-score: 537.2 bits: 108.3 E(32554): 1.3e-23 Smith-Waterman score: 434; 28.8% identity (64.1% similar) in 281 aa overlap (37-309:192-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 CVDNATVCSGASCVVPESNFNNILSVVLSTVLTILLALVMF---SMGCNVEIKKFLGHIK .: .:: :.. :.::.::.. . : .. CCDS14 ERRDFCIKVSPAEDTPATLSADLAHFSENPILYLLLPLIFVNKCSFGCKVELEVLKGLMQ 170 180 190 200 210 220 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RPWGICVGFLCQFGIMPLTGFILSVAFDILPLQAVVVLIIGCC-PGGTASNILAYWVDGD : . .:.: :: .::: .:... .: .:: .. ::: : ::: .: ... . :: CCDS14 SPQPMLLGLLGQFLVMPLYAFLMAKVF-MLPKALALGLIITCSSPGGGGSYLFSLLLGGD 230 240 250 260 270 280 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 MDLSVSMTTCSTLLALGMMPLCLLIYTKMWVDSGSIVIPYDNIGTSLVALVVPVSIGMFV . :..::: ::. : :..:: ::... .. .: ..: .:. ...:...:... CCDS14 VTLAISMTFLSTVAATGFLPLSSAIYSRLLSIHETLHVPISKILGTLLFIAIPIAVGVLI 290 300 310 320 330 340 190 200 210 220 230 pF1KE6 NHKWPQKAKIILKIGSIAGAILIV---LIAVVGGILYQSAWIIAPKLWIIGTIFPVAGYS . : :. ....:.. . . .:.. ..: :. . : : : . ..: :..: CCDS14 KSKLPKFSQLLLQVVKPFSFVLLLGGLFLAYRMGV-FILAGIRLP-IVLVGITVPLVGLL 350 360 370 380 390 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LGFLLARIAGLPWYRCRTVAFETGMQNTQLCSTIVQLSFTPEELNVVFTFPLIYSIFQLA .:. :: :: . :::..:.:.::. : ...:::. . . . :.: .. . CCDS14 VGYCLATCLKLPVAQRRTVSIEVGVQNSLLALAMLQLSLRRLQADYASQAPFIVALSGTS 400 410 420 430 440 450 300 310 320 330 340 pF1KE6 -FAAIFLGFYVAYKKCHGKNKAEIPESKENGTEPESSFYKANGGFQPDEK . :. .: .. CCDS14 EMLALVIGHFIYSSLFPVP 460 470 348 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:32:37 2016 done: Tue Nov 8 12:32:37 2016 Total Scan time: 1.940 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]