FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5555, 367 aa 1>>>pF1KE5555 367 - 367 aa - 367 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6723+/-0.000902; mu= 6.6090+/- 0.055 mean_var=142.4621+/-28.737, 0's: 0 Z-trim(111.0): 26 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.107454 statistics sampled from 12001 (12027) to 12001 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.719), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16 Scan time: 2.980 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9484.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 ( 367) 2477 395.3 4.6e-110 CCDS76644.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 ( 373) 2265 362.4 3.6e-100 CCDS9483.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 ( 361) 2187 350.3 1.5e-96 CCDS3163.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 382) 1890 304.3 1.2e-82 CCDS3168.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 342) 1722 278.2 7.4e-75 CCDS3164.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 370) 1678 271.4 8.9e-73 CCDS3165.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 388) 1571 254.8 9.1e-68 CCDS3167.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 340) 1458 237.3 1.5e-62 CCDS14634.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 334) 1367 223.2 2.7e-58 CCDS14633.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 354) 1359 221.9 6.6e-58 CCDS82864.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 343) 1089 180.1 2.6e-45 CCDS55493.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 292) 1033 171.3 9.2e-43 CCDS55494.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 304) 1020 169.3 3.8e-42 CCDS55492.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX ( 258) 762 129.3 3.7e-30 CCDS54656.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 302) 676 116.0 4.3e-26 CCDS3166.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 ( 314) 676 116.0 4.5e-26 >>CCDS9484.1 MBNL2 gene_id:10150|Hs108|chr13 (367 aa) initn: 2477 init1: 2477 opt: 2477 Z-score: 2089.5 bits: 395.3 E(32554): 4.6e-110 Smith-Waterman score: 2477; 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CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSP--SLVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF :::.::::::.::::: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::: ::::::: CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATV-----------------MAFPPGALHP ::::::::::::::.:.:::: ::::::.::.. ...: ..: : CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAAMTQSAVKSLKRPLEATFDLGIPQAVLPP 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 LPKRQALEKSNGTSAVFNPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHS :::: ::::.::..:::: ....:::::.. :::::.::.: : :::.:. CCDS31 LPKRPALEKTNGATAVFNTGIFQYQQALANMQLQQHTAFLP--------P----VPMVHG 300 310 320 330 340 340 350 360 pF1KE5 ATSATVSAATTPATSVPFAATATANQIILK :: :::::::: ::::::::::::::: CCDS31 ATPATVSAATTSATSVPFAATATANQIPIISAEHLTSHKYVTQM 350 360 370 380 >>CCDS3167.1 MBNL1 gene_id:4154|Hs108|chr3 (340 aa) initn: 1310 init1: 634 opt: 1458 Z-score: 1236.3 bits: 237.3 E(32554): 1.5e-62 Smith-Waterman score: 1471; 66.1% identity (83.9% similar) in 342 aa overlap (1-335:1-326) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKGR ::..:.:.::::::::::::.:::::::: : ::::::: :::::::::::::::::::: CCDS31 MAVSVTPIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRPDTECKFAHPSKSCQVENGRVIACFDSLKGR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 CSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQF---MFPGTPLHPVPTFP :::::::::::: ::::::::::::::::::. : :::::::. :.::.::.::: : CCDS31 CSRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKNMA-MLAQQMQLANAMMPGAPLQPVPMFS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 VGPAIGTN-TAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTAT--QKLL :.:...:: .: .: :::.::.:. :::.:::::.:..: :.: : ::...:. :::. CCDS31 VAPSLATNASAAAFNPYLGPVSPS--LVPAEILPTAPMLVTGNPGVPVPAAAAAAAQKLM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 RTDKLEVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYF :::.::::::.::::: :::.:::::::::::::::.::::::::::::::: ::::::: CCDS31 RTDRLEVCREYQRGNCNRGENDCRFAHPADSTMIDTNDNTVTVCMDYIKGRCSREKCKYF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 HPPAHLQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPL-PKRQALEKSNGTSAV ::::::::::::::.:.:::: ::::::.::... . .:: :..: : . : CCDS31 HPPAHLQAKIKAAQYQVNQAA-AAQAAATAAAMFPWCTVLRQPLCPQQQHLPQ------V 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 FNPSVLHYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSV : ::. :: .. . . .... :.. : . : ...:.. CCDS31 F-PSL---QQPQPTSPILDASTLL--GATSCPAAAGKMIPIISAEHLTSHKYVTQM 300 310 320 330 340 360 pF1KE5 PFAATATANQIILK >>CCDS14634.1 MBNL3 gene_id:55796|Hs108|chrX (334 aa) initn: 1453 init1: 707 opt: 1367 Z-score: 1160.2 bits: 223.2 E(32554): 2.7e-58 Smith-Waterman score: 1526; 62.0% identity (80.2% similar) in 363 aa overlap (2-364:3-317) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MALNVAPVRDTKWLTLEVCRQFQRGTCSRSDEECKFAHPPKSCQVENGRVIACFDSLKG :.::: .::::::::::::.::::::::.: .:::::::. :.::::::.:::::::: CCDS14 MTAVNVALIRDTKWLTLEVCREFQRGTCSRADADCKFAHPPRVCHVENGRVVACFDSLKG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 RCSRENCKYLHPPTHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMLAQQMQFMFPGTPLHPVPTFPVG ::.:::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::.:. .. . . .::. 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CCDS14 RCTRENCKYLHPPPHLKTQLEINGRNNLIQQKTAAAMFAQQMQLMLQNAQMSSLGSFPMT 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 PAIGTNTAISFAPYLAPVTPGVGLVPTEILPTTPVIVPGSPPVTVPGSTATQKLLRTDKL :.: .: ..: ::. : ::.::::.:..:.:::..::.::...::... ::.:.::: CCDS14 PSIPANPPMAFNPYI-P-HPGMGLVPAELVPNTPVLIPGNPPLAMPGAVGP-KLMRSDKL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 EVCREFQRGNCARGETDCRFAHPADSTMIDTSDNTVTVCMDYIKGRCMREKCKYFHPPAH :::::::::::.:::.:::.:::.:..::..::::::.::::::::: :::::::::::: CCDS14 EVCREFQRGNCTRGENDCRYAHPTDASMIEASDNTVTICMDYIKGRCSREKCKYFHPPAH 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LQAKIKAAQHQANQAAVAAQAAAAAATVMAFPPGALHPLPKRQALEKSNGTSAVFNPSVL :::..:::.:: :..: :..::. ::.:. .:::.:::: ::.. ::::.:. CCDS14 LQARLKAAHHQMNHSA---------ASAMALQPGTLQLIPKRSALEKPNGATPVFNPTVF 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KE5 HYQQALTSAQLQQHAAFIPTGSVLCMTPATSIVPMMHSATSATVSAATTPATSVPFAATA : :::::. :: : ::::.: .:::.::..::::::.:: .:::::::::::::::: . 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