FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB5802, 471 aa 1>>>pF1KB5802 471 - 471 aa - 471 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8888+/-0.0012; mu= 14.6412+/- 0.071 mean_var=169.0348+/-71.571, 0's: 0 Z-trim(102.2): 362 B-trim: 843 in 2/47 Lambda= 0.098648 statistics sampled from 6263 (6861) to 6263 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.211), width: 16 Scan time: 2.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 3069 450.4 1.9e-126 CCDS53867.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 387) 2195 325.9 4.8e-89 CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 939 147.2 3.4e-35 CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 ( 481) 782 124.9 1.9e-28 CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 626 102.6 8.4e-22 CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 626 102.7 8.6e-22 CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 626 102.7 8.9e-22 CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 620 101.9 1.7e-21 CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 562 93.5 4.5e-19 CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 541 90.6 3.9e-18 CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 540 90.4 4.1e-18 CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 540 90.4 4.2e-18 CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 540 90.5 4.3e-18 CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 537 90.1 6.4e-18 CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 523 87.9 1.9e-17 CCDS59174.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 248) 519 87.1 2.3e-17 CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 507 85.7 1.1e-16 CCDS197.1 HTR6 gene_id:3362|Hs108|chr1 ( 440) 489 83.1 6.3e-16 CCDS8361.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 443) 463 79.5 8.2e-15 CCDS8362.1 DRD2 gene_id:1813|Hs108|chr11 ( 414) 462 79.3 8.7e-15 CCDS5006.1 HTR1E gene_id:3354|Hs108|chr6 ( 365) 455 78.2 1.6e-14 CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 454 78.0 1.7e-14 CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 454 78.2 2.1e-14 CCDS7710.1 DRD4 gene_id:1815|Hs108|chr11 ( 419) 439 76.0 8.5e-14 CCDS4395.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 359) 412 72.1 1.1e-12 CCDS47344.1 HRH2 gene_id:3274|Hs108|chr5 ( 397) 412 72.1 1.2e-12 CCDS33829.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 367) 410 71.8 1.4e-12 CCDS2978.1 DRD3 gene_id:1814|Hs108|chr3 ( 400) 410 71.8 1.4e-12 CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 410 71.9 1.6e-12 CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 401 70.6 3.6e-12 CCDS7569.2 ADRA2A gene_id:150|Hs108|chr10 ( 465) 399 70.4 4.7e-12 CCDS56129.1 ADRA2B gene_id:151|Hs108|chr2 ( 450) 390 69.1 1.1e-11 CCDS4986.1 HTR1B gene_id:3351|Hs108|chr6 ( 390) 388 68.7 1.2e-11 CCDS3405.1 DRD5 gene_id:1816|Hs108|chr4 ( 477) 388 68.8 1.4e-11 CCDS2920.1 HTR1F gene_id:3355|Hs108|chr3 ( 366) 379 67.4 2.9e-11 CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 378 67.3 3.5e-11 CCDS1616.1 CHRM3 gene_id:1131|Hs108|chr1 ( 590) 380 67.8 3.5e-11 CCDS231.1 HTR1D gene_id:3352|Hs108|chr1 ( 377) 369 66.0 8e-11 >>CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 (471 aa) initn: 3069 init1: 3069 opt: 3069 Z-score: 2383.5 bits: 450.4 E(32554): 1.9e-126 Smith-Waterman score: 3069; 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CCDS14 NNTTCVLNDPNFVLIGSFVAFFIPLTIMVITYCLTIYVLRRQALMLLHGHTEEPPGLSLD 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 pF1KB5 FLP--------QSSLSSEKLFQRSIHREPGSYTGRRTMQSISNEQKACKVLGIVFFLFVV :: . . .. . : . .:. : :::.:.::.:: ::::::::.:.. CCDS14 FLKCCKRNTAEEENSANPNQDQNARRRKKKERRPRGTMQAINNERKASKVLGIVFFVFLI 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB5 MWCPFFITNIMAVICKESCNEDVIGALLNVFVWIGYLSSAVNPLVYTLFNKTYRSAFSRY ::::::::::..:.:..:::. .. ::::::::::. :..:::::::::: :: ::: : CCDS14 MWCPFFITNILSVLCEKSCNQKLMEKLLNVFVWIGYVCSGINPLVYTLFNKIYRRAFSNY 330 340 350 360 370 380 400 410 420 430 440 450 pF1KB5 IQCQYKENKKPLQLILVNTIPALAYKSSQLQMGQKKNSKQDA--KTTDNDCSMVALGKQH ..:.:: .::: . . . : : .. .:... ..... . :..::. .. . . CCDS14 LRCNYKVEKKP-PVRQIPRVAATALSGRELNVNIYRHTNEPVIEKASDNEPGIEM--QVE 390 400 410 420 430 460 470 pF1KB5 SEEASKDNSDGVNEKVSCV . : . :. :.:..: : CCDS14 NLELPVNPSSVVSERISSV 440 450 >>CCDS2483.1 HTR2B gene_id:3357|Hs108|chr2 (481 aa) initn: 1182 init1: 628 opt: 782 Z-score: 624.4 bits: 124.9 E(32554): 1.9e-28 Smith-Waterman score: 1200; 53.4% identity (78.0% similar) in 350 aa overlap (75-403:55-403) 50 60 70 80 90 100 pF1KB5 WTVDSENRTNLSCEGCLSPSCLSLLHLQEKNWSALLTAVVIILTIAGNILVIMAVSLEKK .:.::: .::: ::.:: :::.::::::: CCDS24 HVISSNWSGLQTESIPEEMKQIVEEQGNKLHWAALLILMVIIPTIGGNTLVILAVSLEKK 30 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 160 pF1KB5 LQNATNYFLMSLAIADMLLGFLVMPVSMLTILYGYRWPLPSKLCAVWIYLDVLFSTASIM :: ::::::::::.::.:.:..:::...:::.. :::: :: .:..::::::::::: CCDS24 LQYATNYFLMSLAVADLLVGLFVMPIALLTIMFEAMWPLPLVLCPAWLFLDVLFSTASIM 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 pF1KB5 HLCAISLDRYVAIQNPIHHSRFNSRTKAFLKIIAVWTISVGISMPIPVFGLQDDSKVFKE ::::::.:::.::..::. ...:::. ::.:: .:: ::.::..:.:. :.. : .. CCDS24 HLCAISVDRYIAIKKPIQANQYNSRATAFIKITVVWLISIGIAIPVPIKGIETDVDNPNN 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 pF1KB5 GSCLLADD---NFVLIGSFVSFFIPLTIMVITYFLTIKSLQKEATLCVSDLGTRAKLASF .:.:. . .:.:.::...:: ::.::..::::::..:::.: : . : . CCDS24 ITCVLTKERFGDFMLFGSLAAFFTPLAIMIVTYFLTIHALQKKAYLVKNKPPQRLTWLTV 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 pF1KB5 SFLPQSSL----SSEKLFQRSIHRE----PGS----------YTGRRTMQSISNEQKACK : . : . : ::. . . :. :.: :....:.:::::.: : CCDS24 STVFQRDETPCSSPEKVAMLDGSRKDKALPNSGDETLMRRTSTIGKKSVQTISNEQRASK 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB5 VLGIVFFLFVVMWCPFFITNIMAVICKESCNEDVIGALLNVFVWIGYLSSAVNPLVYTLF :::::::::..:::::::::: :.: .:::. .. ::..::::::.::.::::::::: CCDS24 VLGIVFFLFLLMWCPFFITNITLVLC-DSCNQTTLQMLLEIFVWIGYVSSGVNPLVYTLF 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KB5 NKTYRSAFSRYIQCQYKENKKPLQLILVNTIPALAYKSSQLQMGQKKNSKQDAKTTDNDC :::.:.::.::: :.:. .: CCDS24 NKTFRDAFGRYITCNYRATKSVKTLRKRSSKIYFRNPMAENSKFFKKHGIRNGINPAMYQ 390 400 410 420 430 440 >>CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (432 aa) initn: 528 init1: 326 opt: 626 Z-score: 504.9 bits: 102.6 E(32554): 8.4e-22 Smith-Waterman score: 634; 31.8% identity (64.7% similar) in 380 aa overlap (36-404:51-409) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 EENTSLSSTTNSLMQLNDDTRLYSNDFNSGEANTSDAFNWTVDSENRTNLSCEGCLSPSC :...: : .: . .: . :: CCDS74 LPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNAS-----GCGEQ-- 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 LSLLHLQEKNWSALLTAVVIILTIAGNILVIMAVSLEKKLQNATNYFLMSLAIADMLLGF .. .... ...:: .. .:::::: ::...: . :::.. .::...:::.::. .. CCDS74 INYGRVEKVVIGSILT-LITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAV 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 LVMPVSMLTILYGYRWPLPSKLCAVWIYLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIQNPIHHS- ::: .: : : .: . .: :.: .::. ::::: ::.::.:::..: :. . CCDS74 AVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPV 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 RFNSRTKAFLKIIAVWTISVGISMPIPVFGLQDDSKVFKEGSCLLADD-NFVLIGSFVSF : :.. : . :..:: .:..:..: :.:: .. : . ::...: .... .. :.: CCDS74 RQNGKCMAKM-ILSVWLLSASITLP-PLFGWAQN--VNDDKVCLISQDFGYTIYSTAVAF 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 FIPLTIMVITYFLTIKSLQKEATLCVSDLGTRAKLASFSFL-PQSSLSSEKL--FQRSIH .::...:.. :. :. .: :. . :. .: . :.: .. . . .:. .. CCDS74 YIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAA--------KHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 REPG-SYTGRRTMQSIS---NEQKACKVLGIVFFLFVVMWCPFFI-TNIMAVICKESCNE . . : .. ..:: :::: .:::. :.: : :::. .. :: ::. CCDS74 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DVIGALLNVFVWIGYLSSAVNPLVYTLFNKTYRSAFSRYIQCQYKE-NKKPLQLILVNTI . . .:.:.:: .: .::..:..::. :... .::::.. :.: CCDS74 -IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEAL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 PALAYKSSQLQMGQKKNSKQDAKTTDNDCSMVALGKQHSEEASKDNSDGVNEKVSCV CCDS74 KLAERPERPEFVL 420 430 >>CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 (445 aa) initn: 528 init1: 326 opt: 626 Z-score: 504.7 bits: 102.7 E(32554): 8.6e-22 Smith-Waterman score: 634; 31.8% identity (64.7% similar) in 380 aa overlap (36-404:51-409) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 EENTSLSSTTNSLMQLNDDTRLYSNDFNSGEANTSDAFNWTVDSENRTNLSCEGCLSPSC :...: : .: . .: . :: CCDS74 LPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSEVTASPAPTWDAPPDNAS-----GCGEQ-- 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KB5 LSLLHLQEKNWSALLTAVVIILTIAGNILVIMAVSLEKKLQNATNYFLMSLAIADMLLGF .. .... ...:: .. .:::::: ::...: . :::.. .::...:::.::. .. 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CCDS74 INYGRVEKVVIGSILT-LITLLTIAGNCLVVISVCFVKKLRQPSNYLIVSLALADLSVAV 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KB5 LVMPVSMLTILYGYRWPLPSKLCAVWIYLDVLFSTASIMHLCAISLDRYVAIQNPIHHS- ::: .: : : .: . .: :.: .::. ::::: ::.::.:::..: :. . CCDS74 AVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASIMTLCVISIDRYLGITRPLTYPV 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KB5 RFNSRTKAFLKIIAVWTISVGISMPIPVFGLQDDSKVFKEGSCLLADD-NFVLIGSFVSF : :.. : . :..:: .:..:..: :.:: .. : . ::...: .... .. :.: CCDS74 RQNGKCMAKM-ILSVWLLSASITLP-PLFGWAQN--VNDDKVCLISQDFGYTIYSTAVAF 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB5 FIPLTIMVITYFLTIKSLQKEATLCVSDLGTRAKLASFSFL-PQSSLSSEKL--FQRSIH .::...:.. :. :. .: :. . :. .: . :.: .. . . .:. .. CCDS74 YIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAA--------KHKFPGFPRVEPDSVIALNGIVKLQKEVE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB5 REPG-SYTGRRTMQSIS---NEQKACKVLGIVFFLFVVMWCPFFI-TNIMAVICKESCNE . . : .. ..:: :::: .:::. :.: : :::. .. :: ::. CCDS74 ECANLSRLLKHERKNISIFKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLPFFLLSTARPFICGTSCSC 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KB5 DVIGALLNVFVWIGYLSSAVNPLVYTLFNKTYRSAFSRYIQCQYKE-NKKPLQLILVNTI . . .:.:.:: .: .::..:..::. :... .::::.. :.: CCDS74 -IPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLLQCQYRNINRKLSAAGMHEAL 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB5 PALAYKSSQLQMGQKKNSKQDAKTTDNDCSMVALGKQHSEEASKDNSDGVNEKVSCV CCDS74 KLAERPERPEFVLRACTRRVLLRPEKRPPVSVWVLQSPDHHNWLADKMLTTVEKKVMIHD 420 430 440 450 460 470 >>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa) initn: 506 init1: 194 opt: 620 Z-score: 499.4 bits: 101.9 E(32554): 1.7e-21 Smith-Waterman score: 620; 31.6% identity (64.1% similar) in 376 aa overlap (31-398:4-366) 10 20 30 40 50 60 pF1KB5 MDILCEENTSLSSTTNSLMQLNDDTRLYSNDFNSGEANTSDAFNWTVDSENRTNLSCEGC :...:. ::: .: . .: . . . 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