Result of FASTA (ccds) for pFN21AB7061
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7061, 655 aa
  1>>>pF1KB7061 655 - 655 aa - 655 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2476+/-0.000988; mu= 0.2416+/- 0.060
 mean_var=318.0680+/-65.311, 0's: 0 Z-trim(115.8): 63  B-trim: 441 in 1/52
 Lambda= 0.071914
 statistics sampled from 16363 (16426) to 16363 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.782), E-opt: 0.2 (0.505), width:  16
 Scan time:  4.420

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS9371.1 FOXO1 gene_id:2308|Hs108|chr13          ( 655) 4467 477.1 3.4e-134
CCDS5068.1 FOXO3 gene_id:2309|Hs108|chr6           ( 673) 1106 128.4 3.3e-29
CCDS43969.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX          ( 505)  944 111.5   3e-24
CCDS55440.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX          ( 450)  838 100.4 5.7e-21


>>CCDS9371.1 FOXO1 gene_id:2308|Hs108|chr13               (655 aa)
 initn: 4467 init1: 4467 opt: 4467  Z-score: 2522.6  bits: 477.1 E(32554): 3.4e-134
Smith-Waterman score: 4467; 100.0% identity (100.0% similar) in 655 aa overlap (1-655:1-655)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANPDAAAGLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANPDAAAGLPS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 ASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 APPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 APPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKAIESSAEKR
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 LTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKASLQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPG
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 SHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPPSAAKMASTLP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SLSEISNPENMENLLDNLNLLSSPTSLTVSTQSSPGTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 YQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 YQKYTYGQSSMSPLPQMPIQTLQDNKSSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIMTPV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 DPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DPGVAQPNSRVLGQNVMMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLP
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 HTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 HTVSTMPHTSGMNRLTQVKTPVQVPLPHPMQMSALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPS
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650     
pF1KB7 DLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DLDGMFIERLDCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQSFPHSVKTTTHSWVSG
              610       620       630       640       650     

>>CCDS5068.1 FOXO3 gene_id:2309|Hs108|chr6                (673 aa)
 initn: 1474 init1: 790 opt: 1106  Z-score: 637.9  bits: 128.4 E(32554): 3.3e-29
Smith-Waterman score: 1767; 47.0% identity (69.4% similar) in 702 aa overlap (4-655:12-673)

                       10        20        30        40         50 
pF1KB7         MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPA-PSGSAAAN
                  .:  ::.::.:::  ::::::::: :::..      .::: ::: .::.
CCDS50 MAEAPASPAPLSPLEVELDPEFEPQSRPRSCTWPLQRPELQ------ASPAKPSGETAAD
               10        20        30        40              50    

                        60             70        80        90      
pF1KB7 ---P-------DAAAGLPSASAAAV-----SADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAA
          :       :  .:  ..:: :.     :. . :.: :::.:     :::.   . . 
CCDS50 SMIPEEEDDEDDEDGGGRAGSAMAIGGGGGSGTLGSGL-LLEDSARV-LAPGGQDPGSGP
           60        70        80        90        100        110  

        100       110       120       130       140       150      
pF1KB7 AAAAAATGGLCGDFQGPEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSR
       :.::   ::: :   : .:  :.:  : :::           :.:::  .::::: :: :
CCDS50 ATAA---GGLSG---GTQA-LLQPQQPLPPPQ----------PGAAGG-SGQPRKCSS-R
               120           130                 140        150    

        160       170       180       190       200       210      
pF1KB7 RNAWGNLSYADLITKAIESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
       ::::::::::::::.::::: .:::::::::::::. :::::::::::::::::::::::
CCDS50 RNAWGNLSYADLITRAIESSPDKRLTLSQIYEWMVRCVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHN
           160       170       180       190       200       210   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KB7 LSLHSKFIRVQNEGTGKSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKAS
       :::::.:.:::::::::::::..::.::::::.:::::.::::..:..:::.:::::::.
CCDS50 LSLHSRFMRVQNEGTGKSSWWIINPDGGKSGKAPRRRAVSMDNSNKYTKSRGRAAKKKAA
           220       230       240       250       260       270   

        280       290       300       310       320       330      
pF1KB7 LQSGQEGAGDSPGSQFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIM--TE
       ::.. :.: ::: ::.::::.:: :.:.:..: :. :: ::.:::::.::::::::  ::
CCDS50 LQTAPESADDSP-SQLSKWPGSPTSRSSDELDAWTDFRSRTNSNASTVSGRLSPIMASTE
           280        290       300       310       320       330  

          340               350        360       370               
pF1KB7 QDDLGEGD--VHSMVYP------PSAAKMAST-LPSLSEISNPENM-----ENLLDNL-N
        :.. . :  .  :.:       ::..:  .. :: :.....  :.     :::.:.: .
CCDS50 LDEVQDDDAPLSPMLYSSSASLSPSVSKPCTVELPRLTDMAGTMNLNDGLTENLMDDLLD
            340       350       360       370       380       390  

     380       390        400       410       420       430        
pF1KB7 LLSSPTSLTVSTQSSP-GTMMQQTPCYSFAPPNTSLNSPSPNYQKYTYGQSSMSPLPQMP
        .. : :     : :: : .::..  . ..  ...:.::. .... ..: ::.. : : :
CCDS50 NITLPPS-----QPSPTGGLMQRSSSFPYTTKGSGLGSPTSSFNSTVFGPSSLNSLRQSP
                 400       410       420       430       440       

      440        450       460       470        480       490      
pF1KB7 IQTLQDNK-SSYGGMSQYNCAPGLLKELLTSDSPPHNDIM-TPVDPGVAQPNSRVLGQNV
       .::.:.:: .....::.:.     :..::::::  :.:.: :  :: ..: .. : .:: 
CCDS50 MQTIQENKPATFSSMSHYGNQT--LQDLLTSDSLSHSDVMMTQSDPLMSQASTAVSAQNS
       450       460         470       480       490       500     

           500       510       520       530       540       550   
pF1KB7 ---MMGPNSVMSTYGSQASHNKMMNPSSHTHPGHAQQTSAVNGRPLPHTVSTMPHTSGMN
          .:  :. : ....: ......: ..  :  :  : .  ..: : ..::.:   :  .
CCDS50 RRNVMLRNDPMMSFAAQPNQGSLVN-QNLLHHQHQTQGALGGSRALSNSVSNMG-LSESS
         510       520       530        540       550        560   

           560       570         580       590       600        610
pF1KB7 RLTQVKTPVQVPLPHPMQM--SALGGYSSVSSCNGYGRMGLLHQEKLPSDLD-GMFIERL
        : ..:   : :. . ::   ..:.: :  :.  .   ::   .::.:::::  ::   :
CCDS50 SLGSAKHQQQSPVSQSMQTLSDSLSGSSLYSTSANLPVMG---HEKFPSDLDLDMFNGSL
           570       580       590       600          610       620

              620       630       640               650     
pF1KB7 DCDMESIIRNDLMDGDTLDFNFDNVLPNQS--------FPHSVKTTTHSWVSG
       .::::::::..:::.: ::::::... .:.        :  . .....::: :
CCDS50 ECDMESIIRSELMDADGLDFNFDSLISTQNVVGLNVGNFTGAKQASSQSWVPG
              630       640       650       660       670   

>>CCDS43969.1 FOXO4 gene_id:4303|Hs108|chrX               (505 aa)
 initn: 1247 init1: 699 opt: 944  Z-score: 548.7  bits: 111.5 E(32554): 3e-24
Smith-Waterman score: 1165; 40.4% identity (59.6% similar) in 638 aa overlap (3-633:11-502)

                       10        20        30        40        50  
pF1KB7         MAEAPQVVEIDPDFEPLPRPRSCTWPLPRPEFSQSNSATSSPAPSGSAAANP
                 ::  ....::::::  :::::::::::::....        ::    ..:
CCDS43 MDPGNENSATEAAAIIDLDPDFEPQSRPRSCTWPLPRPEIANQ--------PSEPPEVEP
               10        20        30        40                50  

             60        70        80        90       100       110  
pF1KB7 DAAAGLPSASAAAVSADFMSNLSLLEESEDFPQAPGSVAAAVAAAAAAAATGGLCGDFQG
       : .          : ..  :.  ::         :. .                      
CCDS43 DLGE--------KVHTEGRSEPILL---------PSRL----------------------
                     60                 70                         

            120       130       140       150       160       170  
pF1KB7 PEAGCLHPAPPQPPPPGPLSQHPPVPPAAAGPLAGQPRKSSSSRRNAWGNLSYADLITKA
              : :   : :: :           : ..: :::..: ::::::: :::.::..:
CCDS43 -------PEPAGGPQPGIL-----------GAVTG-PRKGGS-RRNAWGNQSYAELISQA
                   80                   90         100       110   

            180       190       200       210       220       230  
pF1KB7 IESSAEKRLTLSQIYEWMVKSVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIRVQNEGTG
       :::. ::::::.:::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::.:.::.::
CCDS43 IESAPEKRLTLAQIYEWMVRTVPYFKDKGDSNSSAGWKNSIRHNLSLHSKFIKVHNEATG
           120       130       140       150       160       170   

            240       250       260       270        280        290
pF1KB7 KSSWWMLNPEGGKSGKSPRRRAASMDNNSKFAKSRSRAAKKKAS-LQSGQEGAGD-SPGS
       ::::::::::::::::.:::::::::..::. ..::.: ::: : : .  :::   :: .
CCDS43 KSSWWMLNPEGGKSGKAPRRRAASMDSSSKLLRGRSKAPKKKPSVLPAPPEGATPTSPVG
           180       190       200       210       220       230   

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 QFSKWPASPGSHSNDDFDNWSTFRPRTSSNASTISGRLSPIMTEQDDLGEGDVHSMVYPP
       .:.:: .:: :.. .. : :.:::::.:::::..: ::::.  :.. :.:        : 
CCDS43 HFAKWSGSPCSRNREEADMWTTFRPRSSSNASSVSTRLSPLRPESEVLAE------EIPA
           240       250       260       270       280             

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