FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2777, 836 aa 1>>>pF1KE2777 836 - 836 aa - 836 aa Library: human.CCDS.faa 18921897 residues in 33420 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7277+/-0.00124; mu= 18.1705+/- 0.075 mean_var=68.9652+/-13.599, 0's: 0 Z-trim(100.5): 35 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.154440 statistics sampled from 6208 (6223) to 6208 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.186), width: 16 Scan time: 1.690 The best scores are: opt bits E(33420) CCDS9364.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 836) 5390 1211.0 0 CCDS81764.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 808) 5046 1134.3 0 CCDS66531.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 809) 4421 995.1 0 CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 781) 4395 989.3 0 CCDS45034.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 779) 4391 988.4 0 CCDS66530.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 ( 749) 4384 986.8 0 CCDS47266.1 TGFBI gene_id:7045|Hs109|chr5 ( 683) 1992 453.8 4.6e-127 >>CCDS9364.1 POSTN gene_id:10631|Hs109|chr13 (836 aa) initn: 5390 init1: 5390 opt: 5390 Z-score: 6485.3 bits: 1211.0 E(33420): 0 Smith-Waterman score: 5390; 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