FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4033, 242 aa 1>>>pF1KE4033 242 - 242 aa - 242 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2908+/-0.00089; mu= 15.3607+/- 0.054 mean_var=90.9613+/-18.241, 0's: 0 Z-trim(108.5): 163 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.134476 statistics sampled from 10065 (10245) to 10065 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.699), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16 Scan time: 2.190 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9321.1 RASL11A gene_id:387496|Hs108|chr13 ( 242) 1598 319.7 1.1e-87 CCDS3490.1 RASL11B gene_id:65997|Hs108|chr4 ( 248) 797 164.4 6.5e-41 CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 199) 426 92.3 2.6e-19 CCDS1123.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 219) 362 79.9 1.5e-15 CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 236) 362 79.9 1.6e-15 CCDS66332.1 RERGL gene_id:79785|Hs108|chr12 ( 204) 353 78.1 4.8e-15 CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12 ( 183) 325 72.7 1.9e-13 CCDS10200.1 RASL12 gene_id:51285|Hs108|chr15 ( 266) 323 72.4 3.3e-13 CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 ( 183) 318 71.3 5e-13 CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 ( 204) 316 71.0 7e-13 CCDS14632.1 RAP2C gene_id:57826|Hs108|chrX ( 183) 315 70.7 7.4e-13 CCDS5460.1 RALA gene_id:5898|Hs108|chr7 ( 206) 315 70.8 8.1e-13 CCDS2131.1 RALB gene_id:5899|Hs108|chr2 ( 206) 313 70.4 1.1e-12 CCDS5927.1 RHEB gene_id:6009|Hs108|chr7 ( 184) 309 69.6 1.7e-12 CCDS3170.1 RAP2B gene_id:5912|Hs108|chr3 ( 183) 307 69.2 2.2e-12 CCDS6687.1 DIRAS2 gene_id:54769|Hs108|chr9 ( 199) 305 68.8 3e-12 CCDS8984.1 RAP1B gene_id:5908|Hs108|chr12 ( 184) 303 68.4 3.7e-12 CCDS11921.1 RIT2 gene_id:6014|Hs108|chr18 ( 217) 301 68.1 5.5e-12 CCDS8679.1 RERGL gene_id:79785|Hs108|chr12 ( 205) 294 66.7 1.4e-11 CCDS53753.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 ( 180) 290 65.9 2.1e-11 CCDS58036.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 ( 183) 287 65.3 3.2e-11 CCDS8703.1 KRAS gene_id:3845|Hs108|chr12 ( 189) 286 65.1 3.7e-11 CCDS3100.1 MRAS gene_id:22808|Hs108|chr3 ( 208) 283 64.6 6e-11 CCDS840.1 RAP1A gene_id:5906|Hs108|chr1 ( 184) 282 64.3 6.3e-11 CCDS12092.1 DIRAS1 gene_id:148252|Hs108|chr19 ( 198) 280 64.0 8.7e-11 >>CCDS9321.1 RASL11A gene_id:387496|Hs108|chr13 (242 aa) initn: 1598 init1: 1598 opt: 1598 Z-score: 1688.0 bits: 319.7 E(32554): 1.1e-87 Smith-Waterman score: 1598; 100.0% identity (100.0% similar) in 242 aa overlap (1-242:1-242) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS93 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS93 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS93 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKVKAPSA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS93 NYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKVKAPSA 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 LG :: CCDS93 LG >>CCDS3490.1 RASL11B gene_id:65997|Hs108|chr4 (248 aa) initn: 779 init1: 365 opt: 797 Z-score: 848.0 bits: 164.4 E(32554): 6.5e-41 Smith-Waterman score: 797; 54.2% identity (83.8% similar) in 216 aa overlap (28-241:34-248) 10 20 30 40 50 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYE .:.::.::. :::.:..::::::::::::: CCDS34 IQNMCTIAEYPAPGNAAASDCCVGAAGRRLVKIAVVGASGVGKTALVVRFLTKRFIGDYE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 PNTGKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITD :.:.::.: : .::. :.::.::::: .:.... . ..:..:..::.. ..:.:::: CCDS34 RNAGNLYTRQVQIEGETLALQVQDTPG-IQVHENSLSCSEQLNRCIRWADAVVIVFSITD 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 YDSYLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEIS : :: : :.::....: .. ::..:.::.:::: .::. : :.:::. :: : :.: CCDS34 YKSYELISQLHQHVQQLHLGTRLPVVVVANKADLLHIKQVDPQLGLQLASMLGCSFYEVS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TSENYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSG--ERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKV .::::.:: ..:. ::::::. . :. :.::.:.::::.:::::::::::::::: :: CCDS34 VSENYNDVYSAFHVLCKEVSHKQQPSSTPEKRRTSLIPRPKSPNMQDLKRRFKQALSAKV 190 200 210 220 230 240 240 pF1KE4 KAPSALG .. ... CCDS34 RTVTSV >>CCDS8673.1 RERG gene_id:85004|Hs108|chr12 (199 aa) initn: 425 init1: 262 opt: 426 Z-score: 460.2 bits: 92.3 E(32554): 2.6e-19 Smith-Waterman score: 426; 38.0% identity (70.1% similar) in 184 aa overlap (27-210:6-181) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT ..:::..: . :::::..::::::::: .:.:. CCDS86 MAKSAEVKLAIFGRAGVGKSALVVRFLTKRFIWEYDPTL 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS . : . . .. . .:..: :: : :.. : . .:.:::.:::.::: : CCDS86 ESTYRHQATIDDEVVSMEILDTAG----QEDTIQREGHM----RWGEGFVLVYDITDRGS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE . . :: . . ... ... .:.::::.:: :.:::.:..: .::.::. : : :. 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CCDS11 MDSGTRPVGSCCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFISHRFPEDHDPTI 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS :. . .. . .:.: :: : : . . :. . .:::.. ::::: : CCDS11 EDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAG----QAEFTAMRDQYMRA---GEGFIICYSITDRRS 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE . .: . : : .:. . .::..::::.:: . ::: ..:. :: :.. :.: :.. CCDS11 FHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREFSCPFFETSAAY 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KE4 NYEDVCDVFQHLCKEVSKMHG---LSGERR---RASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPK : . :::. : .:. . . :. :.. . :. : .:: CCDS11 RYY-IDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKNSVWKRLKSPFRKKKDSVT 170 180 190 200 210 240 pF1KE4 VKAPSALG >>CCDS58037.1 RIT1 gene_id:6016|Hs108|chr1 (236 aa) initn: 347 init1: 180 opt: 362 Z-score: 392.2 bits: 79.9 E(32554): 1.6e-15 Smith-Waterman score: 362; 34.5% identity (62.1% similar) in 206 aa overlap (19-218:30-227) 10 20 30 40 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLT :: : .. ::..:::: :::::: ..:.. CCDS58 MERWLFLGATEEGPKRTMDSGTRPVGSCCSSPAGLSREYKLVMLGAGGVGKSAMTMQFIS 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 KRFIGDYEPNTGKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGF .:: :..:. :. . .. . .:.: :: : : . . :. . .::: CCDS58 HRFPEDHDPTIEDAYKIRIRIDDEPANLDILDTAG----QAEFTAMRDQYMRA---GEGF 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LLVYSITDYDSYLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANEL .. ::::: :. .: . : : .:. . .::..::::.:: . ::: ..:. :: :. CCDS58 IICYSITDRRSFHEVREFKQLIYRVRRTDDTPVVLVGNKSDLKQLRQVTKEEGLALAREF 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 GSLFLEISTSENYEDVCDVFQHLCKEVSKMHG---LSGERR---RASIIPRPRSPNMQDL . :.: :.. : . :::. : .:. . . :. :.. . :. : .:: CCDS58 SCPFFETSAAYRYY-IDDVFHALVREIRRKEKEAVLAMEKKSKPKNSVWKRLKSPFRKKK 180 190 200 210 220 230 230 240 pF1KE4 KRRFKQALSPKVKAPSALG CCDS58 DSVT >>CCDS66332.1 RERGL gene_id:79785|Hs108|chr12 (204 aa) initn: 362 init1: 171 opt: 353 Z-score: 383.5 bits: 78.1 E(32554): 4.8e-15 Smith-Waterman score: 353; 38.6% identity (66.7% similar) in 189 aa overlap (27-210:3-184) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT :.::::::. .::::. ::::::::::.: : CCDS66 MNDVKLAVLGGEGTGKSALTVRFLTKRFIGEYASNF 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS ..:.. . .: ::.:.: : : . : : .. ::.. ..::.::..::.:.: .: CCDS66 ESIYKKHLCLERKQLNLEIYD-PCS-QTQ----KAKFSLTSELHWADGFVIVYDISDRSS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDS-----KAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLE . . : .::. . . .. :..:::: :: :.:.: ..: .:: : : : CCDS66 FAFAKALIYRIREPQTSHCKRAVESAVFLVGNKRDLCHVREVGWEEGQKLALENRCQFCE 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ISTSENYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKV .:..:. .: .: .. :.. :. :.:: : CCDS66 LSAAEQSLEVEMMFIRIIKDILINFKLK-EKRRPSGSKSMAKLINNVFGKRRKSV 160 170 180 190 200 240 pF1KE4 KAPSALG >>CCDS8778.1 RHEBL1 gene_id:121268|Hs108|chr12 (183 aa) initn: 296 init1: 210 opt: 325 Z-score: 354.8 bits: 72.7 E(32554): 1.9e-13 Smith-Waterman score: 325; 31.5% identity (66.8% similar) in 184 aa overlap (29-212:8-183) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT :...:: :::... .:. .: :.:.. CCDS87 MPLVRYRKVVILGYRCVGKTSLAHQFVEGEFSEGYDPTV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS . ::..: . :.. :.. :: : :: . :. . ..:..::::.:. : CCDS87 ENTYSKIVTLGKDEFHLHLVDTAG----QDEYSILPYSF---IIGVHGYVLVYSVTSLHS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE . :. :::.... : ...::..::::.:: :.::. .: .::. :. :.: :. : CCDS87 FQVIESLYQKLHEGHGKTRVPVVLVGNKADLSPEREVQAVEGKKLAESWGATFMESSARE 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKVKAPSA : . . .: .. .:...... :..:: .. CCDS87 N-QLTQGIFTKVIQEIARVENSYGQERRCHLM 160 170 180 pF1KE4 LG >>CCDS10200.1 RASL12 gene_id:51285|Hs108|chr15 (266 aa) initn: 331 init1: 164 opt: 323 Z-score: 350.6 bits: 72.4 E(32554): 3.3e-13 Smith-Waterman score: 323; 33.9% identity (65.0% similar) in 177 aa overlap (25-198:18-185) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT : ...::.:: .::::. :.:::::::..:.:: CCDS10 MSSVFGKPRAGSGPQSAPLEVNLAILGRRGAGKSALTVKFLTKRFISEYDPNL 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS :: :. . . :...:: :. :. . . ..::..::.:::. . .: CCDS10 EDTYSSEETVDHQPVHLRVMDTAD----LDT-PRNCE---RYLNWAHAFLVVYSVDSRQS 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHP---DSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEIS . : : .. .: . . :....::: :. . ::: .:. ::...: ::.:.: CCDS10 FDSSSS-YLELLALHAKETQRSIPALLLGNKLDMAQYRQVTKAEGVALAGRFGCLFFEVS 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 TSENYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKVKA . ..: : ::.. .:. . CCDS10 ACLDFEHVQHVFHEAVREARRELEKSPLTRPLFISEERALPHQAPLTARHGLASCTFNTL 170 180 190 200 210 220 >>CCDS9485.1 RAP2A gene_id:5911|Hs108|chr13 (183 aa) initn: 316 init1: 175 opt: 318 Z-score: 347.4 bits: 71.3 E(32554): 5e-13 Smith-Waterman score: 318; 34.3% identity (68.0% similar) in 172 aa overlap (26-197:2-165) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT .. :..:::.: :::::. :.:.: :: :.:. CCDS94 MREYKVVVLGSGGVGKSALTVQFVTGTFIEKYDPTI 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS .: . . :... :.: :: : :. :. .. .. ..::.::::... .: CCDS94 EDFYRKEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFA-SMRDLY------IKNGQGFILVYSLVNQQS 40 50 60 70 80 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE . .:.:. ..: .:. :.:::.:::: :: :.:....: ::.: : :.: : .. CCDS94 FQDIKPMRDQIIRVKRYEKVPVILVGNKVDLESEREVSSSEGRALAEEWGCPFMETS-AK 90 100 110 120 130 140 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKVKAPSA . : ..: .. .... CCDS94 SKTMVDELFAEIVRQMNYAAQPDKDDPCCSACNIQ 150 160 170 180 >>CCDS7814.1 RRAS2 gene_id:22800|Hs108|chr11 (204 aa) initn: 282 init1: 186 opt: 316 Z-score: 344.7 bits: 71.0 E(32554): 7e-13 Smith-Waterman score: 316; 32.6% identity (64.0% similar) in 172 aa overlap (29-200:16-179) 10 20 30 40 50 60 pF1KE4 MRPLSMSGHFLLAPIPESSSDYLLPKDIKLAVLGAGRVGKSAMIVRFLTKRFIGDYEPNT .:.:.:.: :::::. ..:. . :. ::.:. CCDS78 MAAAGWRDGSGQEKYRLVVVGGGGVGKSALTIQFIQSYFVTDYDPTI 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE4 GKLYSRLVYVEGDQLSLQIQDTPGGVQIQDSLPQVVDSLSKCVQWAEGFLLVYSITDYDS :.. .. :.: :: : :. . . .. . .::::::.:.:: : CCDS78 EDSYTKQCVIDDRAARLDILDTAG----QEEFGAMREQYMRT---GEGFLLVFSVTDRGS 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 YLSIRPLYQHIRKVHPDSKAPVIIVGNKGDLLHARQVQTQDGIQLANELGSLFLEISTSE . : . ..: .:. .. :.:..:::.:: : ::: ..: ::: .: ..: : .. CCDS78 FEEIYKFQRQILRVKDRDEFPMILIGNKADLDHQRQVTQEEGQQLARQLKVTYMEAS-AK 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 NYEDVCDVFQHLCKEVSKMHGLSGERRRASIIPRPRSPNMQDLKRRFKQALSPKVKAPSA .: ..:..: . . :.. CCDS78 IRMNVDQAFHELVRVIRKFQEQECPPSPEPTRKEKDKKGCHCVIF 160 170 180 190 200 242 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 22:42:16 2016 done: Sat Nov 5 22:42:16 2016 Total Scan time: 2.190 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]