FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6747, 856 aa 1>>>pF1KE6747 856 - 856 aa - 856 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5423+/-0.00039; mu= 20.6365+/- 0.024 mean_var=81.7902+/-16.635, 0's: 0 Z-trim(113.1): 35 B-trim: 287 in 1/53 Lambda= 0.141815 statistics sampled from 22311 (22345) to 22311 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.262), width: 16 Scan time: 7.820 The best scores are: opt bits E(85289) NP_036595 (OMIM: 219200,278250,611716) V-type prot ( 856) 5694 1175.3 0 NP_065683 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2248 470.3 1.6e-131 NP_570855 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2248 470.3 1.6e-131 XP_005250450 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-ty ( 840) 2248 470.3 1.6e-131 XP_005250451 (OMIM: 602722,605239) PREDICTED: V-ty ( 840) 2248 470.3 1.6e-131 NP_570856 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPa ( 840) 2248 470.3 1.6e-131 XP_016880255 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 816) 1833 385.4 5.8e-106 NP_001123492 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 1 ( 838) 1830 384.8 9.1e-106 XP_005257520 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 784) 1828 384.3 1.1e-105 XP_005257518 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 790) 1828 384.3 1.2e-105 XP_016880256 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 809) 1828 384.4 1.2e-105 NP_005168 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 116 ( 831) 1825 383.7 1.8e-105 XP_016880260 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 777) 1823 383.3 2.3e-105 XP_016880259 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 783) 1823 383.3 2.3e-105 XP_016880257 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 803) 1823 383.3 2.4e-105 XP_011523210 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 802) 1815 381.7 7.4e-105 XP_016880258 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 795) 1810 380.7 1.5e-104 XP_005257516 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 844) 1659 349.8 3.1e-95 XP_016880261 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 581) 1288 273.8 1.6e-72 XP_016880262 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 581) 1288 273.8 1.6e-72 NP_001123493 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 1 ( 837) 1288 273.9 2.2e-72 XP_016872579 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 532) 1217 259.2 3.6e-68 NP_006044 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPa ( 614) 1217 259.3 4e-68 XP_011543028 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 830) 1217 259.4 5.1e-68 XP_005273766 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 830) 1217 259.4 5.1e-68 NP_006010 (OMIM: 259700,604592) V-type proton ATPa ( 830) 1217 259.4 5.1e-68 XP_016872578 (OMIM: 259700,604592) PREDICTED: V-ty ( 805) 1116 238.7 8.3e-62 XP_016880263 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type prot ( 575) 1042 223.4 2.3e-57 >>NP_036595 (OMIM: 219200,278250,611716) V-type proton A (856 aa) initn: 5694 init1: 5694 opt: 5694 Z-score: 6292.3 bits: 1175.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 5694; 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NP_065 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW : : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_065 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV .:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.::::::::::::: NP_065 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA : : :: :::: NP_065 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE 820 830 840 >>NP_570855 (OMIM: 602722,605239) V-type proton ATPase 1 (840 aa) initn: 2906 init1: 1005 opt: 2248 Z-score: 2482.0 bits: 470.3 E(85289): 1.6e-131 Smith-Waterman score: 2892; 52.5% identity (78.7% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-830) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE : :.:::: :::.::::: .:: :.. ::: :::::.:::.::.:::::::.::.::: NP_570 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ::::: .: .:. . .: . : :: .: .... .. :.::: ::.:...:.. :.. 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NP_570 IKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF . .: .::: :::::: ::::::::::::::::.::: .::::::::::::::: ::: NP_570 VQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN ::.: :: ..::: . :.:. .:: ::.:::..::::.::.:::::::::::::.: NP_570 VMLLAALWMILNERR-LLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI .:::.:.:. :. .. :: :.... :::::.::::. : :::.::::: NP_570 IFGSSWSVQPMFRNG----------TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPI 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC ::::.:.::::::.::::::::::..:.:::::..:::..::. .:: : :::..:.:: NP_570 WNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILC 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV .::::.:::..:: :....:. ::::::.::::::: : .:. :: :. :: ..: NP_570 LFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVV 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEV-SLLGSQDIEEGNHQ .. .::: ..: :: :.: . .: . ..: :..:. :.. . .: . . :.. 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XP_005 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL ..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:. XP_005 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK ::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.: XP_005 INRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV :::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: . XP_005 KICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI :.:.::::.::.::::..:::..:.:::.: : :: ..::::.: . ::... .:. 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NP_570 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW : : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_570 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV .:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.::::::::::::: NP_570 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA : : :: :::: NP_570 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE 820 830 840 >>XP_016880255 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type proton A (816 aa) initn: 2697 init1: 1049 opt: 1833 Z-score: 2023.3 bits: 385.4 E(85289): 5.8e-106 Smith-Waterman score: 2881; 53.7% identity (78.8% similar) in 831 aa overlap (1-822:1-814) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.:::: XP_016 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :.. XP_016 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSL--ESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVS :.::: : .:: :. : . .:.. :.: ::.:::. : : : .::::. XP_016 NFLELTELKFILRKTQQFFDE-AELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GLINQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHK :.::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. .. XP_016 GVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 VKKICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYS :::::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::... XP_016 VKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RVIQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFM :.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::.. XP_016 WFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSIL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 NIIPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGH : . :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .:::::::::::::::::: XP_016 NRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGH 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 GFVMFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMF---FNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSK :..: :::. .:: :.. :.:..: .:: :.::::.::::.::.:::::::::::: XP_016 GILMTLFAVWMVLRESRI-LSQKNE-NEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SVNLFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGID :.:.:::.:.: :.. . :.. ..: : .:::.:..:::: ::::.::: XP_016 SLNIFGSSWSVRPMFTYN-----------WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGID 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 PIWNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFM ::::.:::.:::::::::::::::::::: ::: :..:::..:.: .:::. :::..:: XP_016 PIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFM 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 LCIFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLF--PASKTSGLYTGQEYVQRVL .::::...::::: ...:.::. :::.::.::::::: : : : ::.::. .: : XP_016 TSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 LVVTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFG-VNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGN .::. : :: ..: ::: : . :. .: .: .: . .::.. .. : . .. XP_016 VVVALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEII--QHDQLST 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 HQVEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW :. ::. . : :.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: XP_016 HS-EDADEPSEDEVFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW 710 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV .:....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.:::: XP_016 TMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWSP 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA >>NP_001123492 (OMIM: 192130) V-type proton ATPase 116 k (838 aa) initn: 2884 init1: 1049 opt: 1830 Z-score: 2019.9 bits: 384.8 E(85289): 9.1e-106 Smith-Waterman score: 2989; 54.3% identity (79.1% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-828) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.:::: NP_001 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :.. NP_001 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSL--ESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVS :.::: : .:: :. : . .:.. :.: ::.:::. : : : .::::. NP_001 NFLELTELKFILRKTQQFFDE-AELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GLINQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHK :.::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. .. NP_001 GVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 VKKICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYS :::::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::... NP_001 VKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RVIQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFM :.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::.. 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NP_001 VVVALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEII--QHDQLST 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 HQVEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW :. ::. .::.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: NP_001 HS-EDA------DEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV .:....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.:::::::::::: NP_001 TMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYS 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA :.: ::.:::: NP_001 GTGFKFLPFSFEHIREGKFEE 820 830 >>XP_005257520 (OMIM: 192130) PREDICTED: V-type proton A (784 aa) initn: 2553 init1: 1049 opt: 1828 Z-score: 2018.1 bits: 384.3 E(85289): 1.1e-105 Smith-Waterman score: 2658; 53.2% identity (78.5% similar) in 776 aa overlap (1-767:1-753) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.:::: XP_005 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :.. 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