FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6747, 856 aa 1>>>pF1KE6747 856 - 856 aa - 856 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8079+/-0.000935; mu= 18.9544+/- 0.057 mean_var=77.8073+/-15.674, 0's: 0 Z-trim(106.2): 27 B-trim: 0 in 0/50 Lambda= 0.145400 statistics sampled from 8841 (8853) to 8841 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16 Scan time: 2.820 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 ( 856) 5694 1204.4 0 CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 ( 840) 2248 481.5 2.6e-135 CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 838) 1830 393.9 6.4e-109 CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 831) 1825 392.8 1.3e-108 CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 ( 837) 1288 280.2 1.1e-74 CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 614) 1217 265.2 2.5e-70 CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 ( 830) 1217 265.3 3.2e-70 >>CCDS9254.1 ATP6V0A2 gene_id:23545|Hs108|chr12 (856 aa) initn: 5694 init1: 5694 opt: 5694 Z-score: 6449.4 bits: 1204.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5694; 100.0% identity (100.0% similar) in 856 aa overlap (1-856:1-856) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE6 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE6 SGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 SGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE6 TNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 TNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGY 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE6 LIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGLYTGQEYVQRVLLVVTALSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 LIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGLYTGQEYVQRVLLVVTALSV 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE6 PVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQVEDGCRE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 PVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQVEDGCRE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 MACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 MACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLR 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 VDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS92 VDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPF 790 800 810 820 830 840 850 pF1KE6 SFSLLSSKFNNDDSVA :::::::::::::::: CCDS92 SFSLLSSKFNNDDSVA 850 >>CCDS5849.1 ATP6V0A4 gene_id:50617|Hs108|chr7 (840 aa) initn: 2906 init1: 1005 opt: 2248 Z-score: 2542.8 bits: 481.5 E(32554): 2.6e-135 Smith-Waterman score: 2892; 52.5% identity (78.7% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-830) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE : :.:::: :::.::::: .:: :.. ::: :::::.:::.::.:::::::.::.::: CCDS58 MVSVFRSEEMCLSQLFLQVEAAYCCVAELGELGLVQFKDLNMNVNSFQRKFVNEVRRCES 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ::::: .: .:. . .: . : :: .: .... .. :.::: ::.:...:.. :.. CCDS58 LERILRFLEDEM-QNEIVVQLLEKSPLTPLPREMITLETVLEKLEGELQEANQNQQALKQ 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQ-RLGAKLGFVSGL ..::: : ..:. :. : . .... ..: . ....::. . . . .::::..:. CCDS58 SFLELTELKYLLKKTQDFFETETNLA---DDFFTEDTSGLLELKAVPAYMTGKLGFIAGV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK ::. .. .::..:::.:.: . ....:.: :::: : : :. .:.: . :::. .:.: CCDS58 INRERMASFERLLWRICRGNVYLKFSEMDAPLEDPVTKEEIQKNIFIIFYQGEQLRQKIK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV :::: .. ::: :. : ::::. :..:.:..:: ::. .::.. ...: .:: . .: . CCDS58 KICDGFRATVYPCPEPAVERREMLESVNVRLEDLITVITQTESHRQRLLQEAAANWHSWL 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI :.:.::::.::.::::..:::..:.:::.: : :: ..::::.: . ::... .:. CCDS58 IKVQKMKAVYHILNMCNIDVTQQCVIAEIWFPVADATRIKRALEQGMELSGSSMAPIMTT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF . .: .::: :::::: ::::::::::::::::.::: .::::::::::::::: ::: CCDS58 VQSKTAPPTFNRTNKFTAGFQNIVDAYGVGSYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDCGHGT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQS--QEIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVN ::.: :: ..::: . :.:. .:: ::.:::..::::.::.:::::::::::::.: CCDS58 VMLLAALWMILNERR-LLSQKTDNEIWNTFFHGRYLILLMGIFSIYTGLIYNDCFSKSLN 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 LFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRG-PYPLGIDPI .:::.:.:. :. .. :: :.... :::::.::::. : :::.::::: CCDS58 IFGSSWSVQPMFRNG----------TWNTHVMEESLYLQLDPAIPGVYFGNPYPFGIDPI 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC ::::.:.::::::.::::::::::..:.:::::..:::..::. .:: : :::..:.:: CCDS58 WNLASNKLTFLNSYKMKMSVILGIVQMVFGVILSLFNHIYFRRTLNIILQFIPEMIFILC 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSG--LYTGQEYVQRVLLV .::::.:::..:: :....:. ::::::.::::::: : .:. :: :. :: ..: CCDS58 LFGYLVFMIIFKWCCFDVHVSQHAPSILIHFINMFLFNYSDSSNAPLYKHQQEVQSFFVV 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEV-SLLGSQDIEEGNHQ .. .::: ..: :: :.: . .: . ..: :..:. :.. . .: . . :.. CCDS58 MALISVPWMLLIKP-FILRASHRKSQLQASR-----IQEDATENIEGDSSSPSSRSGQRT 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 VED--GCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW : : . ::::::.... :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS58 SADTHGALDDHGEEFNFGDVFVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV .:.: ::.. :.. .. ..:.:::::. ::::::::::::::.::::::::::::: CCDS58 TMVMNSGLQTRGWGGIVGVFIIFAVFAVLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYV 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA : : :: :::: CCDS58 GDGYKFSPFSFKHILDGTAEE 820 830 840 >>CCDS45683.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (838 aa) initn: 2884 init1: 1049 opt: 1830 Z-score: 2069.0 bits: 393.9 E(32554): 6.4e-109 Smith-Waterman score: 2989; 54.3% identity (79.1% similar) in 851 aa overlap (1-842:1-828) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.:::: CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :.. CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSL--ESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVS :.::: : .:: :. : . .:.. :.: ::.:::. : : : .::::. CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDE-AELHHQQMADPDLLEESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 GLINQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHK :.::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. .. CCDS45 GVINRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 VKKICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYS :::::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::... CCDS45 VKKICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 RVIQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFM :.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::.. CCDS45 WFIKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSIL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 NIIPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGH : . :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .:::::::::::::::::: CCDS45 NRMQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGH 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 GFVMFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMF---FNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSK :..: :::. .:: :.. :.:..: .:: :.::::.::::.::.:::::::::::: CCDS45 GILMTLFAVWMVLRESRI-LSQKNE-NEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSK 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 SVNLFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGID :.:.:::.:.: :.. . :.. ..: : .:::.:..:::: ::::.::: CCDS45 SLNIFGSSWSVRPMFTYN-----------WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGID 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 PIWNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFM ::::.:::.:::::::::::::::::::: ::: :..:::..:.: .:::. :::..:: CCDS45 PIWNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFM 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 LCIFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLF--PASKTSGLYTGQEYVQRVL .::::...::::: ...:.::. :::.::.::::::: : : : ::.::. .: : CCDS45 TSLFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFL 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 LVVTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFG-VNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGN .::. : :: ..: ::: : . :. .: .: .: . .::.. .. : . .. CCDS45 VVVALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEII--QHDQLST 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 HQVEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLW :. ::. .::.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: CCDS45 HS-EDA------DEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLW 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 AMLMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYV .:....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.:::::::::::: CCDS45 TMVIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYS 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GAGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA :.: ::.:::: CCDS45 GTGFKFLPFSFEHIREGKFEE 820 830 >>CCDS11426.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (831 aa) initn: 2884 init1: 1049 opt: 1825 Z-score: 2063.4 bits: 392.8 E(32554): 1.3e-108 Smith-Waterman score: 2984; 54.3% identity (78.9% similar) in 849 aa overlap (1-842:1-821) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.:::: CCDS11 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :.. CCDS11 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVSGL :.::: : .:: :. : . .. : : ::.:::. : : : .::::.:. CCDS11 NFLELTELKFILRKTQQFFDEMAD--PDLLE----ESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK ::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. ..:: CCDS11 INRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV :::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::... CCDS11 KICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI :.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::..: CCDS11 IKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF . :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .:::::::::::::::::::. CCDS11 MQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMF---FNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSV .: :::. .:: :.. :.:..: .:: :.::::.::::.::.:::::::::::::. CCDS11 LMTLFAVWMVLRESRI-LSQKNE-NEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 NLFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPI :.:::.:.: :.. . :.. ..: : .:::.:..:::: ::::.::::: CCDS11 NIFGSSWSVRPMFTYN-----------WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPI 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC ::.:::.:::::::::::::::::::: ::: :..:::..:.: .:::. :::..:: CCDS11 WNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLF--PASKTSGLYTGQEYVQRVLLV .::::...::::: ...:.::. :::.::.::::::: : : : ::.::. .: :.: CCDS11 LFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVV 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFG-VNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQ :. : :: ..: ::: : . :. .: .: .: . .::.. .. : . ..:. CCDS11 VALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEII--QHDQLSTHS 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 VEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAM ::. .::.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.: CCDS11 -EDA------DEFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTM 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 LMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGA ....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.:::::::::::: :. CCDS11 VIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGT 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA : ::.:::: CCDS11 GFKFLPFSFEHIREGKFEE 820 830 >>CCDS45684.1 ATP6V0A1 gene_id:535|Hs108|chr17 (837 aa) initn: 2810 init1: 1115 opt: 1288 Z-score: 1454.5 bits: 280.2 E(32554): 1.1e-74 Smith-Waterman score: 2989; 54.3% identity (78.9% similar) in 849 aa overlap (1-842:1-827) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :: ::::: : :::::::: .:: :.: ::: : ::::::: .:. ::::::.::.:::: CCDS45 MGELFRSEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGKVQFRDLNPDVNVFQRKFVNEVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ..: : .. .:: .:.::. . .: .: ....... ...:.: ::.:.. :.: :.. CCDS45 MDRKLRFVEKEIRKANIPIMDTGENPEVPFPRDMIDLEANFEKIENELKEINTNQEALKR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQR-LGAKLGFVSGL :.::: : .:: :. : . .. : : ::.:::. : : : .::::.:. CCDS45 NFLELTELKFILRKTQQFFDEMAD--PDLLE----ESSSLLEPSEMGRGTPLRLGFVAGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 INQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVK ::. .. .::.::::::.: ... ::... :::: ::. .. ::.: : :.:. ..:: CCDS45 INRERIPTFERMLWRVCRGNVFLRQAEIENPLEDPVTGDYVHKSVFIIFFQGDQLKNRVK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 KICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRV :::. .. .:: :.: .::.:. :.::::.:: ::..:::. ..:: ::... CCDS45 KICEGFRASLYPCPETPQERKEMASGVNTRIDDLQMVLNQTEDHRQRVLQAAAKNIRVWF 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE6 IQVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNI :.:.::::::: ::.:..:::.:::::::::: .::.... ::..:...::.:.::..: CCDS45 IKVRKMKAIYHTLNLCNIDVTQKCLIAEVWCPVTDLDSIQFALRRGTEHSGSTVPSILNR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE6 IPTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGF . :..:::: .::::: ::::::::::.:.:::.::: .:::::::::::::::::::. CCDS45 MQTNQTPPTYNKTNKFTYGFQNIVDAYGIGTYREINPAPYTIITFPFLFAVMFGDFGHGI 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE6 VMFLFALLLVLNENHPRLNQSQEIMRMF---FNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSV .: :::. .:: :.. :.:..: .:: :.::::.::::.::.:::::::::::::. CCDS45 LMTLFAVWMVLRESRI-LSQKNE-NEMFSTVFSGRYIILLMGVFSMYTGLIYNDCFSKSL 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 NLFGSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPI :.:::.:.: :.. . :.. ..: : .:::.:..:::: ::::.::::: CCDS45 NIFGSSWSVRPMFTYN-----------WTEETLRGNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPI 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 WNLATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLC ::.:::.:::::::::::::::::::: ::: :..:::..:.: .:::. :::..:: CCDS45 WNIATNKLTFLNSFKMKMSVILGIIHMLFGVSLSLFNHIYFKKPLNIYFGFIPEIIFMTS 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 IFGYLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLF--PASKTSGLYTGQEYVQRVLLV .::::...::::: ...:.::. :::.::.::::::: : : : ::.::. .: :.: CCDS45 LFGYLVILIFYKWTAYDAHTSENAPSLLIHFINMFLFSYPESGYSMLYSGQKGIQCFLVV 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 VTALSVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFG-VNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIEEGNHQ :. : :: ..: ::: : . :. .: .: .: . .::.. .. : . ..:. CCDS45 VALLCVPWMLLFKPLVLRRQYLRRKHLGTLNFGGIRVGNGPTEEDAEII--QHDQLSTHS 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 VEDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAM ::. . : :.::. .. :.::.::::::::::::::::::::::::::::.:::.: CCDS45 -EDADEPSEDEVFDFGDTMVHQAIHTIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWTM 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 LMRVGLRVDTTYGVLLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGA ....:: : . : :.:. .. ::.::. ::::::::::::::.:::::::::::: :. CCDS45 VIHIGLSVKSLAGGLVLFFFFTAFATLTVAILLIMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGT 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 GTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA : ::.:::: CCDS45 GFKFLPFSFEHIREGKFEE 820 830 >>CCDS53670.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 (614 aa) initn: 2121 init1: 737 opt: 1217 Z-score: 1376.1 bits: 265.2 E(32554): 2.5e-70 Smith-Waterman score: 2195; 53.6% identity (75.8% similar) in 627 aa overlap (225-843:3-610) 200 210 220 230 240 250 pF1KE6 VCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKKICDCYHCHVYPYPN ::::.::::::.:..:: ::.::::.:. . CCDS53 MTFLISYWGEQIGQKIRKITDCFHCHVFPFLQ 10 20 30 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 TAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVIQVKKMKAIYHMLNM : : . :. . :.: :: .:: .: ::: .. . . .::.::::.: ::. CCDS53 QEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQVQVHKMKAVYLALNQ 40 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 pF1KE6 CSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNIIPTKETPPTRIRTNK :: ..:.::::::.:: :: :..::...: : : . . . :: .. ::: ::::. CCDS53 CSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEG--VSAVAHRIPCRDMPPTLIRTNR 100 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KE6 FTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFVMFLFALLLVLNENH :: .::.:::::::: :.::::: .::::::::::::::: :::..:::::: .:: ::. CCDS53 FTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLLMFLFALAMVLAENR 160 170 180 190 200 210 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 PRLNQSQ-EIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLFGSGWNVSAMYSSSH : .. .: :: . :: :::.::::::::.:::.:::.:::.....: :::.:.:: ..: CCDS53 PAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIFPSGWSVAAMANQSG 220 230 240 250 260 270 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 PPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNLATNRLTFLNSFKMK :.:. . ....: :::.. ::: ::::.::::::.::.:.:.:::::::: CCDS53 ----------WSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSLAANHLSFLNSFKMK 280 290 300 310 320 560 570 580 590 600 610 pF1KE6 MSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFGYLIFMIFYKWLVFS ::::::..::.:::.::.:::.:: .. . : ..::: :.: .::::.:...:::: CCDS53 MSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFGYLVFLVIYKWLCVW 330 340 350 360 370 380 620 630 640 650 660 670 pF1KE6 AETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGL-YTGQEYVQRVLLVVTALSVPVLFLGKPLFLL : . ::::::.::::::: : .. : : :: :: .:.:.. ::.:.:: :: :: CCDS53 AARAASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALAMVPILLLGTPLHLL 390 400 410 420 430 440 680 690 700 710 720 pF1KE6 WLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIE----EGNHQVEDGCREMACEEFNF : : . : .. :....:: : .... : . :. CCDS53 HRHRRR----LRRRPAD---RQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEKAGGLDDEEEAELVP 450 460 470 480 490 730 740 750 760 770 780 pF1KE6 GEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAMLMRVGLRVDTTYGV- .:.:: :.::.::.::::.::::::::::::::::::::.:::::.::.:: . :: CCDS53 SEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMVMRIGLGLGREVGVA 500 510 520 530 540 550 790 800 810 820 830 840 pF1KE6 -LLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVGAGTKFVPFSFSLLS ..:.:..: :::.:. :::.::::::::::.:::::::::::: :.: :. ::.:. CCDS53 AVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSGTGYKLSPFTFAATD 560 570 580 590 600 610 850 pF1KE6 SKFNNDDSVA CCDS53 D >>CCDS8177.1 TCIRG1 gene_id:10312|Hs108|chr11 (830 aa) initn: 2717 init1: 737 opt: 1217 Z-score: 1374.1 bits: 265.3 E(32554): 3.2e-70 Smith-Waterman score: 2773; 50.4% identity (74.6% similar) in 851 aa overlap (1-843:1-826) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGSLFRSETMCLAQLFLQSGTAYECLSALGEKGLVQFRDLNQNVSSFQRKFVGEVKRCEE :::.:::: . :.:::: ...:: :.: ::: :::.::::: .::.:::.:: .:.:::: CCDS81 MGSMFRSEEVALVQLFLPTAAAYTCVSRLGELGLVEFRDLNASVSAFQRRFVVDVRRCEE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 LERILVYLVQEINRADIPLPEGEASPPAPPLKQVLEMQEQLQKLEVELREVTKNKEKLRK ::. ...: .:. :: . :: .. :::: ...:..::. ..: :::.: :.. :: CCDS81 LEKTFTFLQEEVRRAGLVLPPPKGRLPAPPPRDLLRIQEETERLAQELRDVRGNQQALRA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 NLLELIEYTHMLRVTKTFVKRNVEFEPTYEEFPSLESDSLLDYSCMQRLGAKLGFVSGLI .: .: .. .:: . .. . . :. : :.. . . : : ...::.: . CCDS81 QLHQLQLHAAVLRQGHEPQLAAAHTDGASERTPLLQAPG----GPHQDL--RVNFVAGAV 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 NQGKVEAFEKMLWRVCKGYTIVSYAELDESLEDPETGEVIKWYVFLISFWGEQIGHKVKK . :. :.:..:::.:.:. :.:. ::.. :: : ::: :..::::.::::::.:..: CCDS81 EPHKAPALERLLWRACRGFLIASFRELEQPLEHPVTGEPATWMTFLISYWGEQIGQKIRK 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 ICDCYHCHVYPYPNTAEERREIQEGLNTRIQDLYTVLHKTEDYLRQVLCKAAESVYSRVI : ::.::::.:. . : : . :. . :.: :: .:: .: ::: .. . . . CCDS81 ITDCFHCHVFPFLQQEEARLGALQQLQQQSQELQEVLGETERFLSQVLGRVLQLLPPGQV 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE6 QVKKMKAIYHMLNMCSFDVTNKCLIAEVWCPEADLQDLRRALEEGSRESGATIPSFMNII ::.::::.: ::.:: ..:.::::::.:: :: :..::...: : : . . . : CCDS81 QVHKMKAVYLALNQCSVSTTHKCLIAEAWCSVRDLPALQEALRDSSMEEG--VSAVAHRI 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE6 PTKETPPTRIRTNKFTEGFQNIVDAYGVGSYREVNPALFTIITFPFLFAVMFGDFGHGFV : .. ::: ::::.:: .::.:::::::: :.::::: .::::::::::::::: :::.. CCDS81 PCRDMPPTLIRTNRFTASFQGIVDAYGVGRYQEVNPAPYTIITFPFLFAVMFGDVGHGLL 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 pF1KE6 MFLFALLLVLNENHPRLNQSQ-EIMRMFFNGRYILLLMGLFSVYTGLIYNDCFSKSVNLF :::::: .:: ::.: .. .: :: . :: :::.::::::::.:::.:::.:::.....: CCDS81 MFLFALAMVLAENRPAVKAAQNEIWQTFFRGRYLLLLMGLFSIYTGFIYNECFSRATSIF 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE6 GSGWNVSAMYSSSHPPAEHKKMVLWNDSVVRHNSILQLDPSIPGVFRGPYPLGIDPIWNL :::.:.:: ..: :.:. . ....: :::.. ::: ::::.::::::.: CCDS81 PSGWSVAAMANQSG----------WSDAFLAQHTMLTLDPNVTGVFLGPYPFGIDPIWSL 480 490 500 510 520 540 550 560 570 580 590 pF1KE6 ATNRLTFLNSFKMKMSVILGIIHMTFGVILGIFNHLHFRKKFNIYLVSIPELLFMLCIFG :.:.:.::::::::::::::..::.:::.::.:::.:: .. . : ..::: :.: .:: CCDS81 AANHLSFLNSFKMKMSVILGVVHMAFGVVLGVFNHVHFGQRHRLLLETLPELTFLLGLFG 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 pF1KE6 YLIFMIFYKWLVFSAETSRVAPSILIEFINMFLFPASKTSGL-YTGQEYVQRVLLVVTAL ::.:...:::: : . ::::::.::::::: : .. : : :: :: .:.:.. CCDS81 YLVFLVIYKWLCVWAARAASAPSILIHFINMFLFSHSPSNRLLYPRQEVVQATLVVLALA 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 pF1KE6 SVPVLFLGKPLFLLWLHNGRSCFGVNRSGYTLIRKDSEEEVSLLGSQDIE----EGNHQV ::.:.:: :: :: : : . : .. :....:: : .... CCDS81 MVPILLLGTPLHLLHRHRRR----LRRRP---ADRQEENKAGLLDLPDASVNGWSSDEEK 650 660 670 680 690 720 730 740 750 760 770 pF1KE6 EDGCREMACEEFNFGEILMTQVIHSIEYCLGCISNTASYLRLWALSLAHAQLSDVLWAML : . :. .:.:: :.::.::.::::.::::::::::::::::::::.:::::. CCDS81 AGGLDDEEEAELVPSEVLMHQAIHTIEFCLGCVSNTASYLRLWALSLAHAQLSEVLWAMV 700 710 720 730 740 750 780 790 800 810 820 830 pF1KE6 MRVGLRVDTTYGV--LLLLPVIALFAVLTIFILLIMEGLSAFLHAIRLHWVEFQNKFYVG ::.:: . :: ..:.:..: :::.:. :::.::::::::::.:::::::::::: : CCDS81 MRIGLGLGREVGVAAVVLVPIFAAFAVMTVAILLVMEGLSAFLHALRLHWVEFQNKFYSG 760 770 780 790 800 810 840 850 pF1KE6 AGTKFVPFSFSLLSSKFNNDDSVA .: :. ::.:. CCDS81 TGYKLSPFTFAATDD 820 830 856 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 15:58:58 2016 done: Tue Nov 8 15:58:58 2016 Total Scan time: 2.820 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]