Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6493
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6493, 610 aa
1>>>pF1KE6493 610 - 610 aa - 610 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4769+/-0.00118; mu= 18.1780+/- 0.071
mean_var=69.6635+/-14.574, 0's: 0 Z-trim(101.5): 39 B-trim: 0 in 0/46
Lambda= 0.153664
statistics sampled from 6516 (6541) to 6516 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.544), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16
Scan time: 2.230
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9080.1 SLC5A8 gene_id:160728|Hs108|chr12 ( 610) 4020 901.0 0
CCDS7860.2 SLC5A12 gene_id:159963|Hs108|chr11 ( 618) 2055 465.4 9.7e-131
CCDS12368.1 SLC5A5 gene_id:6528|Hs108|chr19 ( 643) 1953 442.8 6.4e-124
CCDS1740.1 SLC5A6 gene_id:8884|Hs108|chr2 ( 635) 1694 385.4 1.2e-106
CCDS59278.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 569) 283 72.6 1.6e-12
CCDS2074.1 SLC5A7 gene_id:60482|Hs108|chr2 ( 580) 270 69.7 1.2e-11
CCDS59277.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 560) 262 67.9 4e-11
CCDS42275.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 596) 262 67.9 4.3e-11
CCDS11201.2 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 ( 612) 262 67.9 4.4e-11
>>CCDS9080.1 SLC5A8 gene_id:160728|Hs108|chr12 (610 aa)
initn: 4020 init1: 4020 opt: 4020 Z-score: 4815.1 bits: 901.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4020; 100.0% identity (100.0% similar) in 610 aa overlap (1-610:1-610)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTLLVGILVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 NSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTLLVGILVS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE6 LSTGGRKQNLDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAFNHIELNSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LSTGGRKQNLDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAFNHIELNSD
550 560 570 580 590 600
610
pF1KE6 QSGKSNGTRL
::::::::::
CCDS90 QSGKSNGTRL
610
>>CCDS7860.2 SLC5A12 gene_id:159963|Hs108|chr11 (618 aa)
initn: 2168 init1: 2037 opt: 2055 Z-score: 2460.7 bits: 465.4 E(32554): 9.7e-131
Smith-Waterman score: 2163; 53.9% identity (80.5% similar) in 605 aa overlap (7-609:3-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVALS
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CCDS78 MEVKNFAVWDYVVFAALFFISSGIGVFFAIKERKKATSREFLVGGRQMSFGPVGLS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEYLE
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CCDS78 LTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGASFLVFFIAYLFVILLTSELFLPVFYRSGITSTYEYLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCTLG
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CCDS78 LRFNKPVRYAATVIYIVQTILYTGVVVYAPALALNQVTGFDLWGSVFATGIVCTFYCTLG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 GLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRH
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CCDS78 GLKAVVWTDAFQMVVMIVGFLTVLIQGSTHAGGFHNVLEQSTNGSRLHIFDFDVDPLRRH
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCGLA
::::: .:::::: .::::::: .:: ::::.. .:::.::.::.::: ::.:.:: ::
CCDS78 TFWTITVGGTFTWLGIYGVNQSTIQRCISCKTEKHAKLALYFNLLGLWIILVCAVFSGLI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 LYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSINAL
.::...::::::. .:::::::::.:..:. .:::::::::::.:::::::.::::::
CCDS78 MYSHFKDCDPWTSGIISAPDQLMPYFVMEIFATMPGLPGLFVACAFSGTLSTVASSINAL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 AAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGALLQAALSVFGMV
:.:: ::..: : ::.. .:::.:. ...:..: .::. ::.::...::.::. ::
CCDS78 ATVTFEDFVKSCFPHLSDKLSTWISKGLCLLFGVMCTSMAVAASVMGGVVQASLSIHGMC
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 GGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDIQGC
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CCDS78 GGPMLGLFSLGIVFPFVNWKGALGGLLTGITLSFWVAIGAFIYPAPASKTWPLPLSTDQC
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE6 NSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTLLVGILVS
..:. :.: : .: : . :.:::.::::.:.:: : ...:...:
CCDS78 I----KSNV-TATGPPVLSS--------RPGIADTWYSISYLYYSAVGCLGCIVAGVIIS
480 490 500 510 520
550 560 570 580 590
pF1KE6 LSTGGRKQNLDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAFNH--IELN
: :: :... : . .: . . :. : .::. .:.::.. ... . .
CCDS78 LITG-RQRGEDIQPLLIRP--VCNLFCFWSKKYKTLCWCGVQHDSGTEQENLENGSARKQ
530 540 550 560 570 580
600 610
pF1KE6 SDQSGKSNGTRL
. .: .:: :
CCDS78 GAESVLQNGLRRESLVHVPGYDPKDKSYNNMAFETTHF
590 600 610
>>CCDS12368.1 SLC5A5 gene_id:6528|Hs108|chr19 (643 aa)
initn: 1712 init1: 1633 opt: 1953 Z-score: 2338.2 bits: 442.8 E(32554): 6.4e-124
Smith-Waterman score: 1953; 51.8% identity (81.1% similar) in 550 aa overlap (9-552:11-560)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRRMTAVPVA
:: .::: ::: ::..:..::.. ..: :::....::. ::::..:.::.
CCDS12 MEAVETGERPTFGAWDYGVFALMLLVSTGIGLWVGLARGGQRSAEDFFTGGRRLAALPVG
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 LSLTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLGITSTYEY
:::.::::::: :::.:::.::.: : . . .. :..: .:.::::.::.::::::
CCDS12 LSLSASFMSAVQVLGVPSEAYRYGLKFLWMCLGQLLNSVLTALLFMPVFYRLGLTSTYEY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 LELRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAVVATGVVCTFYCT
::.::.. ::::::. .:: :.:::::::::::: ::::::.:.:.....::..:::: .
CCDS12 LEMRFSRAVRLCGTLQYIVATMLYTGIVIYAPALILNQVTGLDIWASLLSTGIICTFYTA
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 LGGLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQ
.::.:::.::::::: .:..:: :. ..:.. :: .:. : . .:.:. .:::.: .
CCDS12 VGGMKAVVWTDVFQVVVMLSGFWVVLARGVMLVGGPRQVLTLAQNHSRINLMDFNPDPRS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 RHTFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVGLWAILTCSVFCG
:.::::...:::..: :.:::::.:::::..:... ::::.: :: :::. :.. .. ::
CCDS12 RYTFWTFVVGGTLVWLSMYGVNQAQVQRYVACRTEKQAKLALLINQVGLFLIVSSAACCG
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE6 LALYSRYHDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVACAYSGTLSTVSSSIN
.... : :::: ..::::: :: :::::..: ::.::::.::::::::::.:.:::
CCDS12 IVMFVFYTDCDPLLLGRISAPDQYMPLLVLDIFEDLPGVPGLFLACAYSGTLSTASTSIN
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE6 ALAAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALASLMGA-LLQAALSVF
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CCDS12 AMAAVTVEDLIKPRLRSLAPRKLVIISKGLSLIYGSACLTVAALSSLLGGGVLQGSFTVM
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE6 GMVGGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIYPPLPERTLPLHLDI
:...:::.: : ::...: :. :.:.:: ::.:.::::..:: .::: . : .
CCDS12 GVISGPLLGAFILGMFLPACNTPGVLAGLGAGLALSLWVALGATLYPPSEQTMRVLPSSA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE6 QGCNS-TYNETNLMTTTEMPFTTSVFQI---YNVQRTPLMDNWYSLSYLYFSTVGTLVTL
: . . : ..:. . .: . : ....: : :..:..::::....:::.:.
CCDS12 ARCVALSVNASGLLDPALLPANDSSRAPSSGMDASRPALADSFYAISYLYYGALGTLTTV
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE6 LVGILVSLSTGGRKQN-LDPRYILTKEDFLSNFDIFKKKKHVLSYKSHPVEDGGTDNPAF
: : :.: :: :.. : :
CCDS12 LCGALISCLTGPTKRSTLAPGLLWWDLARQTASVAPKEEVAILDDNLVKGPEELPTGNKK
550 560 570 580 590 600
>>CCDS1740.1 SLC5A6 gene_id:8884|Hs108|chr2 (635 aa)
initn: 1673 init1: 1595 opt: 1694 Z-score: 2028.0 bits: 385.4 E(32554): 1.2e-106
Smith-Waterman score: 1694; 46.3% identity (73.5% similar) in 589 aa overlap (3-585:17-594)
10 20 30 40
pF1KE6 MDTPRGIGTFVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFL
: :..:: . :::::. .::.: :::.:.: : :..: ..:
CCDS17 MSVGVSTSAPLSPTSGTSVGMSTFSIMDYVVFVLLLVLSLAIGLYHACRGWGRHTVGELL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE6 MGGRRMTAVPVALSLTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPV
:. :.: .:::::: :.:.:::..::.:::.::::. . ... ::. ..: :..:.::
CCDS17 MADRKMGCLPVALSLLATFQSAVAILGVPSEIYRFGTQYWFLGCCYFLGLLIPAHIFIPV
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE6 FYKLGITSTYEYLELRFNKCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVIYAPALALNQVTGFDLWGAV
::.: .::.:::::::::: ::.:::: :: : ..: :.:.:::.:::: ::::::: .:
CCDS17 FYRLHLTSAYEYLELRFNKTVRVCGTVTFIFQMVIYMGVVLYAPSLALNAVTGFDLWLSV
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 VATGVVCTFYCTLGGLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGISTILNDAYDGGR
.: :.::: : .::::::::::::::. .: : .::: . . ::.. . : . ::
CCDS17 LALGIVCTVYTALGGLKAVIWTDVFQTLVMFLGQLAVIIVGSAKVGGLGRVWAVASQHGR
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 LNFWNFNPNPLQRHTFWTIIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAKLSLYINLVG
.. ....:.:. ::::::. .::.: :.:::::.:::::.: ... : :: : .
CCDS17 ISGFELDPDPFVRHTFWTLAFGGVFMMLSLYGVNQAQVQRYLSSRTEKAAVLSCYA-VFP
250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE6 LWAILTCSVFC--GLALYSRYHDCDPWTAKKV-SAPDQLMPYLVLDILQDYPGLPGLFVA
. . : : : ::.... :.. : . ... .::::.. :.:.:.:. :::::::.:
CCDS17 FQQVSLC-VGCLIGLVMFAYYQEY-PMSIQQAQAAPDQFVLYFVMDLLKGLPGLPGLFIA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE6 CAYSGTLSTVSSSINALAAVTVEDLIKPYFRSLSERSLSWISQGMSVVYGALCIGMAALA
: .::.:::.::..:.::.::.::::.:.: .:: .:.:.. :: ::.::: ..
CCDS17 CLFSGSLSTISSAFNSLATVTMEDLIRPWFPEFSEARAIMLSRGLAFGYGLLCLGMAYIS
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE6 SLMGALLQAALSVFGMVGGPLMGLFALGILVPFANSIGALVGLMAGFAISLWVGIGAQIY
: :: .::::.:.::::::::.::: ::.. : :: ::.:::.::.....:.:::. :
CCDS17 SQMGPVLQAAISIFGMVGGPLLGLFCLGMFFPCANPPGAVVGLLAGLVMAFWIGIGS-IV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE6 PPLPERTLPLHLDIQGCNSTYNETNLMTTTEMPFTTSVFQIYNVQRTPLMDNWYSLSYLY
. : . .. . : : .:: ::.:: .. .. .::::::.
CCDS17 TSMGSSMPPSPSNGSSFSLPTNLTVATVTTLMPLTT-------FSKPTGLQRFYSLSYLW
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KE6 FSTVGTLVTLLVGILVSLSTGG-RKQNLDPRYIL-TKEDFLSNFDI-FKKKKHVLSYKSH
.:. .. ....::..::: :: : ..:.: : . .:: . . .:. : :: .
CCDS17 YSAHNSTTVIVVGLIVSLLTGRMRGRSLNPATIYPVLPKLLSLLPLSCQKRLHCRSYGQD
530 540 550 560 570 580
590 600 610
pF1KE6 PVEDGGTDNPAFNHIELNSDQSGKSNGTRL
.. :
CCDS17 HLDTGLFPEKPRNGVLGDSRDKEAMALDGTAYQGSSSTCILQETSL
590 600 610 620 630
>>CCDS59278.1 SLC5A10 gene_id:125206|Hs108|chr17 (569 aa)
initn: 184 init1: 113 opt: 283 Z-score: 338.2 bits: 72.6 E(32554): 1.6e-12
Smith-Waterman score: 306; 23.5% identity (56.7% similar) in 473 aa overlap (1-452:9-455)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MDTPRGIGT-FVVWDYVVFAGMLVISAAIGIYYAFAGGGQQTSKDFLMGGRR
. :: :: . : : .:.. ......:.::. . .. ..: . ....::
CCDS59 MAANSTSDLHTP---GTQLSVADIIVITVYFALNVAVGIWSSCRAS-RNTVNGYFLAGRD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 MTAVPVALSLTASFMSAVTVLGTPSEVYRFGAIFSIFAFTYFFVVVISAEVFLPVFYKLG
:: :.. :: :: .. .: . : . : .. .:.. : ::.:.. .
CCDS59 MTWWPIGASLFASSEGSGLFIGLAGSGAAGGLAVAGFEWNATYVLLALAWVFVPIYISSE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KE6 ITSTYEYLELRFN-KCVRLCGTVLFIVQTILYTGIVI--YAPALALNQVTGFDLWGAVVA
:.. ::.. :.. . .:. .:: .. .. .: : . :: :: .. :.... ...
CCDS59 IVTLPEYIQKRYGGQRIRMYLSVLSLLLSV-FTKISLDLYAGALFVHICLGWNFYLSTIL
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE6 TGVVCTFYCTLGGLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGIS-TILNDAYDGGRL
: . ..: :.... :.: :... ..:. :. : :: : . :
CCDS59 TLGITALY-TIAAFD--------QIG----GYGQ--LEAAYAQAIPSRTIANTTCHLPRT
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 NFWNFNPNPLQRHTFWT-IIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRFQAK----LSLYI
. .. .: :: . .: :. : . ..: ::: .: .. .:: :. :.
CCDS59 DAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQRSLSARDLNHAKAGSILASYL
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE6 NLVGLWAILTCSVFCGLALYSRY------HDCDPWTAKKVSAPDQLMPYLVLDILQDYP-
... . :. ... . ::. .: . .:. . .: ::.... :
CCDS59 KMLPMGLIIMPGMI-SRALFPDDVGCVVPSECLRACGAEVGCSNIAYPKLVMELM---PI
290 300 310 320 330
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:: ::..: .. .:...: .:. ... . :. . .:: : . : :. . .
CCDS59 GLRGLMIAVMLAALMSSLTSIFNSSSTLFTMDIWRRLRPRSGERELLLV--GRLVIVALI
340 350 360 370 380 390
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...: . :. : :. :: . .. :. ..:.::.. :: ::. ::.::..
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.
CCDS59 VGATRLVLEFLNPAPPCGEPDTRPAVLGSIHYLHFAVALFALSGAVVVAGSLLTPPPQSV
460 470 480 490 500 510
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.:: .... .::. :. .:.... :. ...::: . .
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....::..... . :: :: .: .. . : . ..... : . . : ..
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. .. ..: :. : .::: . ..... .. : . ... . :. .:. ...
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. :.: .::: .: .::: :. . .:. :: . . .: . :.... . :. :
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. . . .: ...:: . : :. :: .: .: :.. .. :
CCDS20 GTVDSSEVYSWLDSFLLLMLGG-IPW-------QAYFQRVLSSSSATYAQVLSFLAAFGC
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.. ... : : : :: :.... :...: .. . : .. ::
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.. : ...:...::: . ... .... . :: . :.. . :. . :.:: .::
CCDS20 AVSA--AVMSSADSSILSASSMFARNIYQLSFRQNASDKEIVWVMRITVFVFGASATAMA
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:.. . .: . .. .: : . : .: .: .:. ::..: ..:. . . :.
CCDS20 LLTKTVYGLWYLSSDLVYIVIFPQL-LCVL--FVKGTNTYGAVAGYVSGLFLRI---TGG
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. : : :: . : : . : . . ..:: : .. : .. : .:
CCDS20 EPYLYLQ----PLIF-YPG---YYPDDNGIYNQKFPFKTLAMV------TSFLTN-ICIS
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:: :. ::: : .. .. . ..:.: .. .:.. :... . : ..
CCDS20 YLAKYLFESGTLPPKL-DVFDAVVARHSEENMDKTILVKNENIKLDELALVKPRQ-----
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: . . :.. :: :. :.: ...::
CCDS20 -SMTLSSTFTNKEAF----LDVDSSPEGSGTEDNLQ
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. :: :: . : : .:.. ......:.::. . .. ..: . ....::
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: . ..: ::: :::.::..:. :::.: . . :.: . :: .
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:: : . : . .. .: :: . .: :. : . ..: ::: .: ..
CCDS59 TIANTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQRSLSARDLN
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.:: :. :.... . :: . :: ..
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: .::: ::..: .. .:...: .:. ... . :. . .:: : . : :
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. . . ...: . :. : :. :: . .. :. ..:.::.. :: ::. ::
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.::...
CCDS59 IAGLVVGATRLVLEFLNPAPPCGEPDTRPAVLGSIHYLHFAVALFALSGAVVVAGSLLTP
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. :: :: . : : .:.. ......:.::. . .. ..: . ....::
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:: :.. :: :: .. .: . : . : .. .:.. : ::.:.. .
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: . ..: ::: :::.::..:. :::.: . . :.: . :: .
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::.... : :: ::..: .. .:...: .:. ... . :. . .:: :
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120 130 140 150 160 170
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pF1KE6 TGVVCTFYCTLGGLKAVIWTDVFQVGIMVAGFASVIIQAVVMQGGIS-------------
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CCDS11 TLGITALYTIAGGLAAVIYTDALQTLIMVVGAVILTIKAFDQIGGYGQLEAAYAQAIPSR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 TILNDAYDGGRLNFWNFNPNPLQRHTFWT-IIIGGTFTWTSIYGVNQSQVQRYISCKSRF
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CCDS11 TIANTTCHLPRTDAMHMFRDPHTGDLPWTGMTFGLTIMATWYWCTDQVIVQRSLSARDLN
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CCDS11 WRRLRPRSGERELLLV--GRLVIVALIGVSVAWIPVLQDSNSGQLFIYMQSVTSSLAPPV
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]