FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9441, 907 aa 1>>>pF1KE9441 907 - 907 aa - 907 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8400+/-0.00102; mu= 18.7569+/- 0.061 mean_var=115.2446+/-27.834, 0's: 0 Z-trim(106.2): 221 B-trim: 940 in 2/49 Lambda= 0.119471 statistics sampled from 8591 (8852) to 8591 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.625), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16 Scan time: 3.350 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 907) 5994 1045.4 0 CCDS61195.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 835) 4735 828.4 0 CCDS61194.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 ( 883) 4368 765.1 0 CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 967) 3295 580.2 6.2e-165 CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 915) 3134 552.5 1.3e-156 CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 ( 828) 2490 441.4 3.2e-123 CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 ( 951) 1748 313.6 1.1e-84 CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 ( 699) 685 130.2 1.3e-29 CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 669) 571 110.6 1e-23 CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 ( 695) 571 110.6 1.1e-23 CCDS9872.1 TSHR gene_id:7253|Hs108|chr14 ( 764) 557 108.2 6e-23 CCDS45905.1 LINGO3 gene_id:645191|Hs108|chr19 ( 592) 495 97.4 8.3e-20 CCDS6524.1 LINGO2 gene_id:158038|Hs108|chr9 ( 606) 468 92.8 2.1e-18 CCDS73766.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 614) 461 91.6 5e-18 CCDS45313.1 LINGO1 gene_id:84894|Hs108|chr15 ( 620) 461 91.6 5e-18 CCDS7568.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 582) 449 89.5 2e-17 CCDS47218.1 LRRC70 gene_id:100130733|Hs108|chr5 ( 622) 430 86.2 2e-16 CCDS42595.1 LRRC4B gene_id:94030|Hs108|chr19 ( 713) 421 84.7 6.6e-16 CCDS1448.1 LRRN2 gene_id:10446|Hs108|chr1 ( 713) 419 84.4 8.3e-16 CCDS47272.1 LRRTM2 gene_id:26045|Hs108|chr5 ( 516) 412 83.0 1.5e-15 CCDS9039.1 DCN gene_id:1634|Hs108|chr12 ( 359) 400 80.8 5e-15 CCDS8245.1 LRRC32 gene_id:2615|Hs108|chr11 ( 662) 403 81.6 5.3e-15 CCDS75573.1 TRIL gene_id:9865|Hs108|chr7 ( 811) 402 81.5 6.9e-15 CCDS33920.1 CPN2 gene_id:1370|Hs108|chr3 ( 545) 397 80.5 9.6e-15 CCDS13777.1 RTN4R gene_id:65078|Hs108|chr22 ( 473) 392 79.6 1.6e-14 CCDS58095.1 SHOC2 gene_id:8036|Hs108|chr10 ( 536) 392 79.6 1.7e-14 CCDS1966.1 LRRTM1 gene_id:347730|Hs108|chr2 ( 522) 389 79.1 2.4e-14 CCDS46951.1 LRRIQ4 gene_id:344657|Hs108|chr3 ( 560) 388 78.9 2.9e-14 CCDS46715.1 CHADL gene_id:150356|Hs108|chr22 ( 762) 389 79.2 3.1e-14 CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 385 78.7 6.4e-14 CCDS5799.1 LRRC4 gene_id:64101|Hs108|chr7 ( 653) 382 78.0 6.5e-14 CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 385 78.7 6.6e-14 CCDS3306.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 581) 376 76.9 1.2e-13 CCDS46984.1 LRRC15 gene_id:131578|Hs108|chr3 ( 587) 376 76.9 1.2e-13 CCDS3307.1 GP5 gene_id:2814|Hs108|chr3 ( 560) 372 76.2 1.9e-13 CCDS34172.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1302) 376 77.2 2.2e-13 CCDS58954.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1346) 376 77.3 2.2e-13 CCDS58951.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1367) 376 77.3 2.2e-13 CCDS3990.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1371) 376 77.3 2.2e-13 CCDS58953.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1412) 376 77.3 2.3e-13 CCDS58952.1 ERBIN gene_id:55914|Hs108|chr5 (1419) 376 77.3 2.3e-13 CCDS10446.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 605) 361 74.3 7.6e-13 CCDS53982.1 IGFALS gene_id:3483|Hs108|chr16 ( 643) 361 74.3 7.9e-13 CCDS7453.1 SLIT1 gene_id:6585|Hs108|chr10 (1534) 362 74.9 1.3e-12 CCDS4369.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1523) 360 74.5 1.6e-12 CCDS64311.1 SLIT3 gene_id:6586|Hs108|chr5 (1530) 360 74.6 1.6e-12 CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093) 355 73.5 2.3e-12 CCDS4953.2 LRRC1 gene_id:55227|Hs108|chr6 ( 524) 349 72.2 2.9e-12 CCDS31464.1 LRRC4C gene_id:57689|Hs108|chr11 ( 640) 345 71.6 5.3e-12 CCDS724.1 LRRC8B gene_id:23507|Hs108|chr1 ( 803) 346 71.9 5.5e-12 >>CCDS9000.1 LGR5 gene_id:8549|Hs108|chr12 (907 aa) initn: 5994 init1: 5994 opt: 5994 Z-score: 5589.1 bits: 1045.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5994; 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97.2% identity (97.4% similar) in 907 aa overlap (1-907:1-883) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA :::::::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS61 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKEL------------------------HFYDNPIQFVGRSA 250 260 270 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL 580 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP :::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 ERGFSVKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC 700 710 720 730 740 750 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV 760 770 780 790 800 810 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS61 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS 820 830 840 850 860 870 pF1KE9 VAFVPCL ::::::: CCDS61 VAFVPCL 880 >>CCDS30971.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (967 aa) initn: 2808 init1: 1977 opt: 3295 Z-score: 3074.6 bits: 580.2 E(32554): 6.2e-165 Smith-Waterman score: 3295; 55.7% identity (80.9% similar) in 894 aa overlap (22-906:23-904) 10 20 30 40 50 pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSE :..:. : .::. :::. :: ..: .:::.:::: CCDS30 MPSPPGLRALWLCAALCASRRAGGAPQPGPGPTACPAPCHCQEDG-IMLSADCSELGLSA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 LPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVL .:..:. .:.::::::::...: :. . :::::::::.:: :..:: ::.::::::.: CCDS30 VPGDLDPLTAYLDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKIL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 MLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPV ::::::: .:.::: .: :::::::::: :: :: : :: ::::::::::::::::: CCDS30 MLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANLISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 QAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETL .:. .: ::::::::::.: ::::::: ::.::::::::::::. :: . :.:::.:::: CCDS30 RALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNLTSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 DLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRS :::::.:.:::.:::::. :.:::::.:::..::::::.::: : ::::::::::::::: CCDS30 DLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRS 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 AFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDL :::.::.:.::.:::: .: ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.: CCDS30 AFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLEL 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 SYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFS :.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.::: CCDS30 SHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFS 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 TLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQC :: ::.::::..: :...:..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.:::::: CCDS30 TLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQC 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 CAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH--KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDL : .:.: . .: :.:: .... .:: . :. :.. : : .::... :..: : CCDS30 CPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DS 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPI : ::::::.::::::::.:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :. CCDS30 KPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPV 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 KLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSV :...:.::..: :::.: ..::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.:: CCDS30 KFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASV 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 FLLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLC .::::::.. . :.. . . ..:... .: : :: ::.:: . ..::::::: CCDS30 LLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLC 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 LPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIAL :: : :.:...:. :::...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.: CCDS30 LPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAW 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 LLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKED :.:.. .: ::::::::.:...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..: CCDS30 LIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDD 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 LVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAY : :: .. . : . ..::.:::::::::.: :.. : : . : CCDS30 LRRLRPRA-----GDSGPLAYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP-- 840 850 860 870 880 900 pF1KE9 PVTESCHLSSVAFVPCL : :. . ::... : CCDS30 PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGG 890 900 910 920 930 940 >>CCDS1424.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (915 aa) initn: 2714 init1: 1883 opt: 3134 Z-score: 2925.0 bits: 552.5 E(32554): 1.3e-156 Smith-Waterman score: 3134; 56.0% identity (81.0% similar) in 856 aa overlap (60-906:8-852) 30 40 50 60 70 80 pF1KE9 LLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSELPSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSL : ..:.. : ::::::...: :. . : CCDS14 MGRPRLTLVCQVSIIISARDLSMNNLTELQPGLFHHL 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE9 RFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLMLQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANH ::::::::.:: :..:: ::.::::::.:::::::: .:.::: .: :::::::::: CCDS14 RFLEELRLSGNHLSHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLRLDANL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE9 ISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNL :: :: : :: :::::::::::::::::.:. .: ::::::::::.: ::::::: :: CCDS14 ISLVPERSFEGLSSLRHLWLDDNALTEIPVRALNNLPALQAMTLALNRISHIPDYAFQNL 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE9 SSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNI .::::::::::::. :: . :.:::.:::::::::.:.:::.:::::. :.:::::.::: CCDS14 TSLVVLHLHNNRIQHLGTHSFEGLHNLETLDLNYNKLQEFPVAIRTLGRLQELGFHNNNI 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 RSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTAN ..::::::.::: : ::::::::::::::::::.::.:.::.:::: .: ::::: ::.. CCDS14 KAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDIQEFPDLKGTTS 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 LESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEI :: :::: : : ::. .:.::: :.::.::.: .:.:::. ::::..: :.::.:.:: CCDS14 LEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEEIGLQHNRIWEI 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 KVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLK .:::.:: ::..:.:.:: : :::.::::: ::.::::..: :...:..:: :: ::: CCDS14 GADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLPLAGLGGLMHLK 340 350 360 370 380 390 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 LTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLH-- : :: ::.. .:...::.:...:.::::::: .:.: . .: :.:: .... .:: . CCDS14 LKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQW-EAEDLHLDDEESS 400 410 420 430 440 450 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIG :. :.. : : .::... :..: : : ::::::.::::::::.:...: ::.. CCDS14 KRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DSKPHPSVQCSPTPGPFKPCEYLFESWGIRLA 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 VWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFG ::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.:...:.::..: :::.: ..::.:::.::: CCDS14 VWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCGLLASVDALTFG 520 530 540 550 560 570 630 640 650 660 670 680 pF1KE9 SFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLK .:...:: ::.:.::.. :::....::.::.::::::.. . :.. . . ..:.. CCDS14 QFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRAYGKSPSLGSVR 580 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 VIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPL--PFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMM . .: : :: ::.:: . ..::::::::: : :.:...:. :::...::.:::.. CCDS14 AGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVALVMMNSFCFLVV 640 650 660 670 680 690 750 760 770 780 790 800 pF1KE9 TIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEV . :: ::::.: .::.: .:::.::.:.: :.:.. .: ::::::::.:...: ..::. CCDS14 AGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFASMLGLFPVTPEA 700 710 720 730 740 750 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 IKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQ .: .::::.:::::::::::.::::::..:: :: .. .. : : . ..::. CCDS14 VKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPRAG----DSGP-LAYAAAGELEKS 760 770 780 790 800 810 870 880 890 900 pF1KE9 SCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL :::::::::.: :.. : : . : : :. . ::... : CCDS14 SCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--PGLETYGFPSVTLISCQQPGAPRLEGSHCV 820 830 840 850 860 CCDS14 EPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV 870 880 890 900 910 >>CCDS30972.1 LGR6 gene_id:59352|Hs108|chr1 (828 aa) initn: 2080 init1: 1249 opt: 2490 Z-score: 2325.6 bits: 441.4 E(32554): 3.2e-123 Smith-Waterman score: 2490; 51.0% identity (78.8% similar) in 747 aa overlap (169-906:30-765) 140 150 160 170 180 190 pF1KE9 SLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQAFRSLSALQAMTLALNKI :. : :::. :. : :. . :. :.. CCDS30 MRLEGEGRSARAGQNLSRAGSARRGAPRDLSMNNLTELQPGLFHHLRFLEELRLSGNHL 10 20 30 40 50 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 HHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPTAIRTLSN ::: ::..: :: .: :.::.. .. . . : ::..::::::.:.:::.:::::. CCDS30 SHIPGQAFSGLYSLKILMLQNNQLGGIPAEALWELPSLQSLDLNYNKLQEFPVAIRTLGR 60 70 80 90 100 110 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 LKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLNGASQI :.:::::.:::..::::::.::: : ::::::::::::::::::.::.:.::.:::: .: CCDS30 LQELGFHNNNIKAIPEKAFMGNPLLQTIHFYDNPIQFVGRSAFQYLPKLHTLSLNGAMDI 120 130 140 150 160 170 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 TEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVCQKLQK ::::: ::..:: :::: : : ::. .:.::: :.::.::.: .:.:::. ::::.. CCDS30 QEFPDLKGTTSLEILTLTRAGIRLLPSGMCQQLPRLRVLELSHNQIEELPSLHRCQKLEE 180 190 200 210 220 230 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 IDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSNLLSSFP : :.::.:.:: .:::.:: ::..:.:.:: : :::.::::: ::.::::..: :...: CCDS30 IGLQHNRIWEIGADTFSQLSSLQALDLSWNAIRSIHPEAFSTLHSLVKLDLTDNQLTTLP 240 250 260 270 280 290 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 ITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCENAYKISNQWNKG ..:: :: :::: :: ::.. .:...::.:...:.::::::: .:.: . .: :.:: .. CCDS30 LAGLGGLMHLKLKGNLALSQAFSKDSFPKLRILEVPYAYQCCPYGMCASFFKASGQW-EA 300 310 320 330 340 350 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 DNSSMDDLH--KKDAGMFQAQDE----RDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPGPFKPCE .. .:: . :. :.. : : .::... :..: : : ::::::.:::::::: CCDS30 EDLHLDDEESSKRPLGLLARQAENHYDQDLDELQLEME-DSKPHPSVQCSPTPGPFKPCE 360 370 380 390 400 410 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 HLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRS-PLYISPIKLLIGVIAAVNMLTGVSSA .:...: ::..::.:..:.. ::.:: ::: . :. . :.:...:.::..: :::.: . CCDS30 YLFESWGIRLAVWAIVLLSVLCNGLVLLTVFAGGPVPLPPVKFVVGAIAGANTLTGISCG 420 430 440 450 460 470 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 VLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSAKYSAK .::.:::.:::.:...:: ::.:.::.. :::....::.::.::::::.. . :.. CCDS30 LLASVDALTFGQFSEYGARWETGLGCRATGFLAVLGSEASVLLLTLAAVQCSVSVSCVRA 480 490 500 510 520 530 680 690 700 710 720 pF1KE9 FETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPL--PFGEPSTMGYMVAL . . ..:... .: : :: ::.:: . ..::::::::: : :.:...:. ::: CCDS30 YGKSPSLGSVRAGVLGCLALAGLAAALPLASVGEYGASPLCLPYAPPEGQPAALGFTVAL 540 550 560 570 580 590 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 ILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFLSFSS ...::.:::... :: ::::.: .::.: .:::.::.:.: :.:.. .: ::::::::.: CCDS30 VMMNSFCFLVVAGAYIKLYCDLPRGDFEAVWDCAMVRHVAWLIFADGLLYCPVAFLSFAS 600 610 620 630 640 650 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 LINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSKHPSL ...: ..::..: .::::.:::::::::::.::::::..:: :: . . .. : : CCDS30 MLGLFPVTPEAVKSVLLVVLPLPACLNPLLYLLFNPHFRDDLRRLRPR----AGDSGP-L 660 670 680 690 700 710 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 MSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVPCL . ..::.:::::::::.: :.. : : . : : :. . ::... : CCDS30 AYAAAGELEKSSCDSTQALVAF--SDVDLILEASEAGRP--PGLETYGFPSVTLISCQQP 720 730 740 750 760 CCDS30 GAPRLEGSHCVEPEGNHFGNPQPSMDGELLLRAEGSTPAGGGLSGGGGFQPSGLAFASHV 770 780 790 800 810 820 >>CCDS31449.1 LGR4 gene_id:55366|Hs108|chr11 (951 aa) initn: 2692 init1: 1688 opt: 1748 Z-score: 1633.7 bits: 313.6 E(32554): 1.1e-84 Smith-Waterman score: 2736; 51.1% identity (75.7% similar) in 845 aa overlap (10-854:5-832) 10 20 30 40 50 60 pF1KE9 MDTSRLGVLLSLPVLLQLATGGSSPRSGVLLRGCPTHCHCEPDGRMLLRVDCSDLGLSEL :.: .: :. ::. ::. : . : :. : ::::: ::. . CCDS31 MPGPLGLLCFLALGLLGSAGPSGAAPPLCAAPCSCDGDR----RVDCSGKGLTAV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE9 PSNLSVFTSYLDLSMNNISQLLPNPLPSLRFLEELRLAGNALTYIPKGAFTGLYSLKVLM : .::.::. ::.:::::.:: . . .. :::::.:::: :..: :..:: :::: CCDS31 PEGLSAFTQALDISMNNITQLPEDAFKNFPFLEELQLAGNDLSFIHPKALSGLKELKVLT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE9 LQNNQLRHVPTEALQNLRSLQSLRLDANHISYVPPSCFSGLHSLRHLWLDDNALTEIPVQ ::::::. ::.::...: .:::::::::::. :: . : :: .:::::::::.:::.::. CCDS31 LQNNQLKTVPSEAIRGLSALQSLRLDANHITSVPEDSFEGLVQLRHLWLDDNSLTEVPVH 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 AFRSLSALQAMTLALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLD . .: .:::.::::::: :::.:: :::::::::::::.:.::...::::: .::::: CCDS31 PLSNLPTLQALTLALNKISSIPDFAFTNLSSLVVLHLHNNKIRSLSQHCFDGLDNLETLD 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE9 LNYNNLDEFPTAIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSA :::::: ::: ::..: .:::::::::.: ::. :: ::: : :::.::::..::: :: CCDS31 LNYNNLGEFPQAIKALPSLKELGFHSNSISVIPDGAFDGNPLLRTIHLYDNPLSFVGNSA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE9 FQHLPELRTLTLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLS :..: .:..:.. :::.. .::.::::..::::::::..:::.:...:.. :..:::: CCDS31 FHNLSDLHSLVIRGASMVQQFPNLTGTVHLESLTLTGTKISSIPNNLCQEQKMLRTLDLS 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 YNLLEDLPSFSVCQKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPNAFST :: ..:::::. :. :..:.:..:.::.:: ::: :.::: :.:. : : :: ::.: CCDS31 YNNIRDLPSFNGCHALEEISLQRNQIYQIKEGTFQGLISLRILDLSRNLIHEIHSRAFAT 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 LPSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCC : . .::.: : :.::: ::.::..:::.:: :. .....: .:. . .::::::: CCDS31 LGPITNLDVSFNELTSFPTEGLNGLNQLKLVGNFKLKEALAAKDFVNLRSLSVPYAYQCC 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 AFGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQ :: :.. .. : ::: .: .. : . : .. . : . :.. .: CCDS31 AFWGCDSYANL----NTEDNSLQDHSVAQEKG---TADAANVTSTLENEEHSQIIIH--- 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 CSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIA :.:: : :::::.:: .:.::. :: : ..:: : :: :.: : . ::.::.:. CCDS31 CTPSTGAFKPCEYLLGSWMIRLTVWFIFLVALFFNLLVILTTFASCTSLPSSKLFIGLIS 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 AVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAAL . :.. :. ...:. .:: ..: ::. : :::.: ::.: :::..:.:::..::: ::.. CCDS31 VSNLFMGIYTGILTFLDAVSWGRFAEFGIWWETGSGCKVAGFLAVFSSESAIFLLMLATV 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 ERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEP ::..::: : . .....: :: : : . . ::. ..:.:::::::.: :: CCDS31 ERSLSAKDIMKNGKSNHLKQFRVAALLAFLGATVAGCFPLFHRGEYSASPLCLPFPTGET 650 660 670 680 690 700 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 STMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENIWDCSMVKHIALLLFTNCILNC ..:. :.:.::::: ::.:.. ::::::::.: :: . . ::.::.: :.:::::. : CCDS31 PSLGFTVTLVLLNSLAFLLMAVIYTKLYCNLEKEDLSENSQSSMIKHVAWLIFTNCIFFC 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 PVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYV ::::.::. ::. ::::..: . :. ::::::::.::..:::.:::: :.... CCDS31 PVAFFSFAPLITAISISPEIMKSVTLIFFPLPACLNPVLYVFFNPKFKEDWKLLKRRV-- 770 780 790 800 810 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 WTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSS :... .::.: CCDS31 -TKKSGSVSVSISSQGGCLEQDFYYDCGMYSHLQGNLTVCDCCESFLLTKPVSCKHLIKS 820 830 840 850 860 870 >>CCDS1842.1 LHCGR gene_id:3973|Hs108|chr2 (699 aa) initn: 649 init1: 395 opt: 685 Z-score: 645.1 bits: 130.2 E(32554): 1.3e-29 Smith-Waterman score: 743; 26.2% identity (59.9% similar) in 619 aa overlap (228-834:43-637) 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 IHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGLHSLETLDLNYNNLDEFPT-AIRTL .: .: :.: : . .:. :.: : CCDS18 LLLLLQPPLPRALREALCPEPCNCVPDGALRCPGPTAGLTRLSLAYLPVKVIPSQAFRGL 20 30 40 50 60 70 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 SNLKELGFHS-NNIRSIPEKAF--VGNPSLITIHFYDNPIQFVGRSAFQHLPELRTLTLN ... .. . . .... : .:: . : : : :. : .... .:: .::.:. :.. CCDS18 NEVIKIEISQIDSLERIEANAFDNLLNLSEILIQNTKN-LRYIEPGAFINLPRLKYLSIC 80 90 100 110 120 130 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 GASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSFSVC ... : .:::.: . . : :.. .:. ::.. . : .. . . :: CCDS18 NTG-IRKFPDVTKVFSSE---------SNFILEICD---NLHITTIPGNAFQGMNNESVT 140 150 160 170 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 QKLQKIDLRHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWN-KIAIIHPNAFSTLPSLIKLDLSSN :: : . :.. .:. .: ::.: : .. .: .:: . ::.::. CCDS18 LKLYG-----NGFEEVQSHAFNGT-TLTSLELKENVHLEKMHNGAFRGATGPKTLDISST 180 190 200 210 220 230 440 450 460 470 480 pF1KE9 LLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCEN----- :...: ::... .: :....:..: : :.: .: . : .:::: . CCDS18 KLQALPSYGLESIQRLIATSSYSLKKLPSRETFVNLLEATLTYPSHCCAFRNLPTKEQNF 240 250 260 270 280 290 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 AYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQ-DERDLEDFLLDFEEDLKALHSVQCSPSPG ...::....: .:.. ...: ..... : .: . :.: . .. .:.: : CCDS18 SHSISENFSKQCESTVRKVNNKT--LYSSMLAESELSGW--DYEYGFCLPKTPRCAPEPD 300 310 320 330 340 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 PFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIKLLIGVIAAVNMLT :.::: .. ..:. .: : .::. : : ... : .. ..:. .. ... CCDS18 AFNPCEDIMGYDFLRVLIWLINILAIMGNMTVLFVLLTSRYKLTVPRFLMCNLSFADFCM 350 360 370 380 390 400 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 GVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVFLLTLAALERGFSA :. ..:.::. : :.. :. :..: :: . ::...:::: ::. ::. .::: . CCDS18 GLYLLLIASVDSQTKGQYYNHAIDWQTGSGCSTAGFFTVFASELSVYTLTVITLERWHTI 410 420 430 440 450 460 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 KYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCLPLPFGEPSTMGYM :. ... : . .:.: :.. .: .::.: :.: .:.:. .. :. CCDS18 TYAIHLDQKLRLRHAILIMLGGWLFSSLIAMLPLVGVSNYMKVSICFPMDVETTLSQVYI 470 480 490 500 510 520 730 740 750 760 770 780 pF1KE9 VALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDLENI-WDCSMVKHIALLLFTNCILNCPVAFL .....:: . :... : :.: . . .: : ...:..:.:.::. :..:. CCDS18 LTILILNVVAFFIICACYIKIYFAVRNPELMATNKDTKIAKKMAILIFTDFTCMAPISFF 530 540 550 560 570 580 790 800 810 820 830 840 pF1KE9 SFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLVSLRKQTYVWTRSK ..:. ... .:. : .:.. :. .: ::.:: .:. :..:. : CCDS18 AISAAFKVPLITVTNSKVLLVLFYPINSCANPFLYAIFTKTFQRDFFLLLSKFGCCKRRA 590 600 610 620 630 640 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 HPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPVTESCHLSSVAFVP CCDS18 ELYRRKDFSAYTSNCKNGFTGSNKPSQSTLKLSTLHCQGTALLDKTRYTEC 650 660 670 680 690 >>CCDS1844.2 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (669 aa) initn: 627 init1: 419 opt: 571 Z-score: 539.2 bits: 110.6 E(32554): 1e-23 Smith-Waterman score: 739; 26.9% identity (59.0% similar) in 632 aa overlap (224-834:13-614) 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 ALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGL-HSLETLDL-NYNNLDEFPT :::. : . : . . : . ... :.:. CCDS18 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPS 10 20 30 40 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 AIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPI-QFVGRSAFQHLPELRTL . : :: : ...: : . :: : .: :.. .: . . . ..:..::.:. . CCDS18 DLP--RNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEI 50 60 70 80 90 100 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 TLNGASQITEFPDLTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQVLDLSYNLLEDLPSF .. :. :: .. :.. : ::::: : .: . .. ::. CCDS18 RIEKAN------------NLLYIN---------PEAFQN-LPNLQYLLISNTGIKHLPDV 110 120 130 380 390 400 410 420 pF1KE9 SVCQKLQKIDL--RHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPN-AFSTLPSLIKL ..:::. : .: : ::. .:. .: :::. :. :: .: . . : CCDS18 HKIHSLQKVLLWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGASGPVIL 140 150 160 170 180 190 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 DLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCAFGVCEN :.: . . :.: ::..: .:. ... :..: . :.. : . : .::::. : CCDS18 DISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCAFA---N 200 210 220 230 240 250 490 500 510 520 530 pF1KE9 AYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERD--LED--------FLL---DFEEDL- . .. . :.:. :... : ::. .:. :: : . .:. :: CCDS18 WRRQISELHPICNKSI--LRQEVDYMTQARGQRSSLAEDNESSYSRGFDMTYTEFDYDLC 260 270 280 290 300 310 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 KALHSVQCSPSPGPFKPCEHLLDGWLIRIGVWTIAVLALTCNALVTSTVFRSPLYISPIK . . .: :::.: :.::: .. ..:. .: :..::.: : .: . : .. . CCDS18 NEVVDVTCSPKPDAFNPCEDIMGYNILRVLIWFISILAITGNIIVLVILTTSQYKLTVPR 320 330 340 350 360 370 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 LLIGVIAAVNMLTGVSSAVLAGVDAFTFGSFARHGAWWENGVGCHVIGFLSIFASESSVF .:. .: ... :. ..:.:: : ... .. :..:.:: . ::...:::: ::. CCDS18 FLMCNLAFADLCIGIYLLLIASVDIHTKSQYHNYAIDWQTGAGCDAAGFFTVFASELSVY 380 390 400 410 420 430 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 LLTLAALERGFSAKYSAKFETKAPFSSLKVIILLCALLALTMAAVPLLGGSKYGASPLCL :: .::: . .. ... :. . .... ..:.. : :..: :.: .:: CCDS18 TLTAITLERWHTITHAMQLDCKVQLRHAASVMVMGWIFAFAAALFPIFGISSYMKVSICL 440 450 460 470 480 490 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 PLPFGEPSTMGYMVALILLNSLCFLMMTIAYTKLYCNLDKGDL-ENIWDCSMVKHIALLL :. . : .. :...:..:: : :... : ..: .. . .. . : ..:..:.:. CCDS18 PMDIDSPLSQLYVMSLLVLNVLAFVVICGCYIHIYLTVRNPNIVSSSSDTRIAKRMAMLI 500 510 520 530 540 550 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 FTNCILNCPVAFLSFSSLINLTFISPEVIKFILLVVVPLPACLNPLLYILFNPHFKEDLV ::. . :..:...:. ... .:. :..:.. :. .: ::.:: .:. .:..:. CCDS18 FTDFLCMAPISFFAISASLKVPLITVSKAKILLVLFHPINSCANPFLYAIFTKNFRRDFF 560 570 580 590 600 610 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 SLRKQTYVWTRSKHPSLMSINSDDVEKQSCDSTQALVTFTSSSITYDLPPSSVPSPAYPV : CCDS18 ILLSKCGCYEMQAQIYRTETSSTVHNTHPRNGHCSSAPRVTSGSTYILVPLSHLAQN 620 630 640 650 660 >>CCDS1843.1 FSHR gene_id:2492|Hs108|chr2 (695 aa) initn: 628 init1: 419 opt: 571 Z-score: 539.0 bits: 110.6 E(32554): 1.1e-23 Smith-Waterman score: 738; 26.3% identity (61.0% similar) in 638 aa overlap (224-834:13-640) 200 210 220 230 240 250 pF1KE9 ALNKIHHIPDYAFGNLSSLVVLHLHNNRIHSLGKKCFDGL-HSLETLDL-NYNNLDEFPT :::. : . : . . : . ... :.:. CCDS18 MALLLVSLLAFLSLGSGCHHRICHCSNRVFLCQESKVTEIPS 10 20 30 40 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 AIRTLSNLKELGFHSNNIRSIPEKAFVGNPSLITIHFYDNPI-QFVGRSAFQHLPELRTL . : :: : ...: : . :: : .: :.. .: . . . ..:..::.:. . CCDS18 DLP--RNAIELRFVLTKLRVIQKGAFSGFGDLEKIEISQNDVLEVIEADVFSNLPKLHEI 50 60 70 80 90 100 320 330 340 350 360 pF1KE9 TLNGASQITEF-PD-LTGTANLESLTLTGAQISSLPQTVCNQLPNLQ--VLDLSYNL-LE .. :... . :. . . ::. : .... :. ::.. ... .:: .::.. :. .. CCDS18 RIEKANNLLYINPEAFQNLPNLQYLLISNTGIKHLPDV--HKIHSLQKVLLDIQDNINIH 110 120 130 140 150 370 380 390 400 410 420 pF1KE9 DLPSFS-VCQKLQKIDL--RHNEIYEIKVDTFQQLLSLRSLNLAWNKIAIIHPN-AFSTL . : : ..... : .: : ::. .:. .: :::. :. :: .: CCDS18 TIERNSFVGLSFESVILWLNKNGIQEIHNCAFNGT-QLDELNLSDNNNLEELPNDVFHGA 160 170 180 190 200 210 430 440 450 460 470 480 pF1KE9 PSLIKLDLSSNLLSSFPITGLHGLTHLKLTGNHALQSLISSENFPELKVIEMPYAYQCCA . . ::.: . . :.: ::..: .:. ... :..: . :.. : . : .::: CCDS18 SGPVILDISRTRIHSLPSYGLENLKKLRARSTYNLKKLPTLEKLVALMEASLTYPSHCCA 220 230 240 250 260 270 490 500 510 520 pF1KE9 FGVCENAYKISNQWNKGDNSSMDDLHKKDAGMFQAQDERD--LED--------FLL---D :. : . .. . :.:. :... : ::. .:. :: : . . 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