Result of FASTA (omim) for
pFN21AE5357
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE5357, 309 aa
1>>>pF1KE5357 309 - 309 aa - 309 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8177+/-0.000533; mu= 18.7541+/- 0.033
mean_var=67.9478+/-14.645, 0's: 0 Z-trim(106.8): 63 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.155592
statistics sampled from 14849 (14899) to 14849 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.501), E-opt: 0.2 (0.175), width: 16
Scan time: 6.150
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 2021 463.1 3.1e-130
NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1421 328.5 1.1e-89
NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1385 320.4 2.9e-87
NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1354 313.4 3.7e-85
NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1351 312.7 5.7e-85
NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1340 310.3 3.1e-84
XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1340 310.3 3.1e-84
XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1340 310.3 3.1e-84
NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1311 303.8 2.9e-82
NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1264 293.2 4.3e-79
NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 882 207.5 2.8e-53
NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 750 177.8 2.4e-44
NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 690 164.4 2.8e-40
NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 678 161.7 1.8e-39
NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 618 148.2 2e-35
NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 602 144.6 2.4e-34
NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 581 139.9 6.4e-33
NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 573 138.1 2.2e-32
NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 462 113.2 6.7e-25
NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 432 106.5 7.3e-23
NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 418 103.3 6.3e-22
NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 398 98.8 1.5e-20
NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 374 93.4 5.9e-19
NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 341 86.0 1.1e-16
NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 338 85.4 1.7e-16
NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 329 83.3 6.4e-16
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 145 42.1 0.002
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 145 42.1 0.002
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 145 42.1 0.0021
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 145 42.1 0.0022
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 145 42.1 0.0022
NP_001287 (OMIM: 602648) atypical chemokine recept ( 384) 143 41.7 0.0029
>>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 2021 init1: 2021 opt: 2021 Z-score: 2459.1 bits: 463.1 E(85289): 3.1e-130
Smith-Waterman score: 2021; 100.0% identity (100.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
:::::::::
NP_795 AKGQNQSTP
>>NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1449 init1: 1410 opt: 1421 Z-score: 1731.2 bits: 328.5 E(85289): 1.1e-89
Smith-Waterman score: 1421; 69.5% identity (87.0% similar) in 308 aa overlap (1-308:1-308)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSILIVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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NP_795 VLVLNWYATELNPAFNSIEVRITAYNVWAVINHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 LKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMNQIIWTKEYEGNMTWKIKLRSAMYLSNTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 ILANLVPFTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSMKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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NP_795 YFLSIIMSVWSFESLENKPVFMFCEAIAFSYPSTHPFILIWGNKKLKQTFLSVLWHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
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NP_795 VKGEKPSSS
>>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1400 init1: 1374 opt: 1385 Z-score: 1687.5 bits: 320.4 E(85289): 2.9e-87
Smith-Waterman score: 1385; 67.0% identity (86.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
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NP_795 VKGEKTSSP
>>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa)
initn: 1363 init1: 1343 opt: 1354 Z-score: 1649.8 bits: 313.4 E(85289): 3.7e-85
Smith-Waterman score: 1354; 69.2% identity (85.6% similar) in 305 aa overlap (1-305:1-305)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
.: ..
NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF
310
>>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1351 init1: 1351 opt: 1351 Z-score: 1646.5 bits: 312.7 E(85289): 5.7e-85
Smith-Waterman score: 1351; 69.8% identity (86.9% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
>>NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1355 init1: 1329 opt: 1340 Z-score: 1633.1 bits: 310.3 E(85289): 3.1e-84
Smith-Waterman score: 1340; 68.7% identity (85.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
:.::.::::::::. .... : ::::.::: : ::::::::::::.::: ::: .
NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
::. .::: :.:: .. :.:.:::.:. : : :::::::: ::::.::::::.
NP_795 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
>>XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1355 init1: 1329 opt: 1340 Z-score: 1633.1 bits: 310.3 E(85289): 3.1e-84
Smith-Waterman score: 1340; 68.7% identity (85.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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XP_006 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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XP_006 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
:::..:::.::..:: :.::.::: . . :::.: :::.::::::: ::.::. ::.
XP_006 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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XP_006 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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XP_006 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
>>XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste receptor (299 aa)
initn: 1355 init1: 1329 opt: 1340 Z-score: 1633.1 bits: 310.3 E(85289): 3.1e-84
Smith-Waterman score: 1340; 68.7% identity (85.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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XP_003 MITFLPIIFSILVVVTFVIGNFANGFIALVNSTEWVKRQKISFADQIVTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
>>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa)
initn: 1310 init1: 1286 opt: 1311 Z-score: 1597.8 bits: 303.8 E(85289): 2.9e-82
Smith-Waterman score: 1311; 65.7% identity (84.1% similar) in 309 aa overlap (1-309:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
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NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH
70 80 90 100 110 120
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pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
:.::.::::::. ::::: ::::::::::::::::::::::.:::::::: ::.: :.
NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV
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pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 AKGQNQSTP
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NP_795 VKGEKPSSP
>>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa)
initn: 1283 init1: 1235 opt: 1264 Z-score: 1540.9 bits: 293.2 E(85289): 4.3e-79
Smith-Waterman score: 1264; 64.2% identity (86.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KE5 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW
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NP_795 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW
10 20 30 40 50 60
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pF1KE5 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH
..::.:: :::::. .... : :::.::::::.:::..:::::::::.::: :.: :
NP_795 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE5 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA
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NP_795 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE5 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI
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NP_795 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE5 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW
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NP_795 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC
250 260 270 280 290
pF1KE5 AKGQNQSTP
309 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 07:33:47 2016 done: Tue Nov 8 07:33:48 2016
Total Scan time: 6.150 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]