FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5374, 299 aa 1>>>pF1KE5374 299 - 299 aa - 299 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1766+/-0.00052; mu= 16.3004+/- 0.032 mean_var=69.7161+/-15.374, 0's: 0 Z-trim(106.6): 95 B-trim: 896 in 2/49 Lambda= 0.153606 statistics sampled from 14588 (14670) to 14588 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.494), E-opt: 0.2 (0.172), width: 16 Scan time: 5.790 The best scores are: opt bits E(85289) NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 mem ( 299) 1937 438.9 5.7e-123 NP_795368 (OMIM: 612774) taste receptor type 2 mem ( 309) 1373 313.9 2.5e-85 XP_006726600 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1339 306.4 4.4e-83 NP_795367 (OMIM: 613967) taste receptor type 2 mem ( 299) 1339 306.4 4.4e-83 XP_003961040 (OMIM: 612668) PREDICTED: taste recep ( 299) 1339 306.4 4.4e-83 NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 mem ( 309) 1338 306.2 5.3e-83 NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 ( 319) 1333 305.1 1.2e-82 NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 mem ( 309) 1328 304.0 2.5e-82 NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 mem ( 309) 1264 289.8 4.6e-78 NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 mem ( 299) 1258 288.4 1.1e-77 NP_076409 (OMIM: 604792) taste receptor type 2 mem ( 303) 816 190.5 3.5e-48 NP_076411 (OMIM: 604790) taste receptor type 2 mem ( 317) 774 181.2 2.3e-45 NP_076408 (OMIM: 604793) taste receptor type 2 mem ( 318) 618 146.6 5.8e-35 NP_076406 (OMIM: 604795) taste receptor type 2 mem ( 312) 609 144.6 2.3e-34 NP_076407 (OMIM: 604794) taste receptor type 2 mem ( 309) 600 142.6 9.1e-34 NP_852094 (OMIM: 613966) taste receptor type 2 mem ( 314) 543 130.0 5.8e-30 NP_076410 (OMIM: 604791) taste receptor type 2 mem ( 307) 522 125.4 1.4e-28 NP_058639 (OMIM: 604868) taste receptor type 2 mem ( 316) 520 124.9 2e-28 NP_795364 (OMIM: 613965) taste receptor type 2 mem ( 307) 457 111.0 3.1e-24 NP_061853 (OMIM: 605062) taste receptor type 2 mem ( 299) 412 101.0 3.1e-21 NP_062545 (OMIM: 604796) taste receptor type 2 mem ( 299) 373 92.3 1.2e-18 NP_058640 (OMIM: 604869) taste receptor type 2 mem ( 299) 342 85.5 1.4e-16 NP_058641 (OMIM: 103780,604867) taste receptor typ ( 291) 328 82.3 1.2e-15 NP_803186 (OMIM: 613968) taste receptor type 2 mem ( 318) 317 79.9 7e-15 NP_795363 (OMIM: 613964) taste receptor type 2 mem ( 323) 311 78.6 1.8e-14 NP_789787 (OMIM: 171200,607751) taste receptor typ ( 333) 264 68.2 2.5e-11 NP_001295396 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_001295398 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_001295400 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_001295405 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_001295394 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_001295399 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_001295397 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene ( 346) 139 40.5 0.0056 NP_065110 (OMIM: 605666) cysteinyl leukotriene rec ( 346) 139 40.5 0.0056 >>NP_795371 (OMIM: 609627) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1937 init1: 1937 opt: 1937 Z-score: 2328.7 bits: 438.9 E(85289): 5.7e-123 Smith-Waterman score: 1937; 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XP_003 VLLLNWYSTVLNPAFYSVELRTTAYNIWAVTGHFSNWPATSLSIFYLLKIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT :::::.:::::.::: :.::.:::.:.::.. .:..::::::: :.::: ...:: ::: XP_003 LKRRVKSVILVVLLGPLLFLACHLFVVNMNQIVWTKEYEGNMTWKIKLRRAMYLSDTTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI : ...:::..:::::.:.::::::::::::::.:::: :::::::.:::.:::.:: :: XP_003 MLANLVPFTVTLISFLLLVCSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKVLQTVISFFLLRAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC .:. .:.:::: . :.: :: : .:.: . ::::: .::::.:.: .: :.: XP_003 YFVSVIISVWSFKNLENKPVFMFCQAIGFSCSSAHPFILIWGNKKLKQTYLSVLWQMRY 250 260 270 280 290 >>NP_795365 (OMIM: 612668) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1351 init1: 1327 opt: 1338 Z-score: 1611.1 bits: 306.2 E(85289): 5.3e-83 Smith-Waterman score: 1338; 68.5% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW ::::: :.:: :..: ::.:::::::::::: :.: ::.::: ::::::::::::.:::: NP_795 MITFLPIIFSSLVVVTFVIGNFANGFIALVNSIEWFKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH .:::::: ::::::: :::.: :.:: :.: :::: :::..::::::::::::::..::: NP_795 VLLLNWYSTVLNPAFNSVEVRTTAYNIWAVINHFSNWLATTLSIFYLLKIANFSNFIFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT :::::.:::::.::: :.::.:::.: ::.: . ..:.::::: :.::......: .::: NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACHLFVINMNEIVRTKEFEGNMTWKIKLKSAMYFSNMTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI . ...::::.:.::..::::::::::::::::.:::: :::::::::::.::::::::: NP_795 MVANLVPFTLTLLSFMLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVISFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC .:: ...:::: :.: :: : ::. : .. ::::: .::::.::: .. :.: NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVFWQMRYW 250 260 270 280 290 300 NP_795 VKGEKTSSP >>NP_001091112 (OMIM: 613963) taste receptor type 2 memb (319 aa) initn: 1362 init1: 1333 opt: 1333 Z-score: 1604.9 bits: 305.1 E(85289): 1.2e-82 Smith-Waterman score: 1333; 68.8% identity (88.6% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW ::::: :.:::::.:.::.:::::::::::: :.::::.::: .:::::::::::.:::: NP_001 MITFLPIIFSILIVVIFVIGNFANGFIALVNSIEWVKRQKISFVDQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH .:::.:: : :::::::::.:::.::.:.:::::: :::..::.::::.:::::::.::. NP_001 VLLLHWYATQLNPAFYSVEVRITAYNVWAVTNHFSSWLATSLSMFYLLRIANFSNLIFLR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT .::::.::.:::::: :.::::::.: ::::..:..:::::.: :.:::.... : .:.: NP_001 IKRRVKSVVLVILLGPLLFLVCHLFVINMDETVWTKEYEGNVTWKIKLRSAMYHSNMTLT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI : .:.:.::.:::::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::. :::::::: NP_001 MLANFVPLTLTLISFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLLLCAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC .:: .:.:: . ::...:: : .:. : . :::: .::::. :: .: ..: NP_001 YFLSMIISVCNFGRLEKQPVFMFCQAIIFSYPSTHPFILILGNKKLKQIFLSVLRHVRYW 250 260 270 280 290 300 NP_001 VKDRSLRLHRFTRGALCVF 310 >>NP_795366 (OMIM: 612669) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1345 init1: 1322 opt: 1328 Z-score: 1599.1 bits: 304.0 E(85289): 2.5e-82 Smith-Waterman score: 1328; 69.1% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (1-298:1-298) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW : ::. :.:: ...::::.:::::::::::: :. :::.::: ::::::::::::.:::: NP_795 MTTFIPIIFSSVVVVLFVIGNFANGFIALVNSIERVKRQKISFADQILTALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH .:::::: ::.::::::::.: :.::.:.::.::: :::..:::::::::::::::.::: NP_795 VLLLNWYSTVFNPAFYSVEVRTTAYNVWAVTGHFSNWLATSLSIFYLLKIANFSNLIFLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT :::::.:::::.::: :.::.:.:.: :: : . ..:::::.: :.:::..:.:: ::: NP_795 LKRRVKSVILVMLLGPLLFLACQLFVINMKEIVRTKEYEGNLTWKIKLRSAVYLSDATVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI :: ...::::.:. ::.::::::::::::::::.:::: :::::::::::.: ::::::. NP_795 TLGNLVPFTLTLLCFLLLICSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKVHIKALQTVIFFLLLCAV 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC .:: ...:::: :.: :: : ::. : .. ::::: .::::.::: .: :.: NP_795 YFLSIMISVWSFGSLENKPVFMFCKAIRFSYPSIHPFILIWGNKKLKQTFLSVLRQVRYW 250 260 270 280 290 300 NP_795 VKGEKPSSP >>NP_795370 (OMIM: 613962) taste receptor type 2 member (309 aa) initn: 1283 init1: 1235 opt: 1264 Z-score: 1522.5 bits: 289.8 E(85289): 4.6e-78 Smith-Waterman score: 1264; 64.2% identity (86.0% similar) in 299 aa overlap (1-299:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW :..::.: ::::..: :.:::::::::::.::: ::::.::::::::..::::::.:::: NP_795 MMSFLHIVFSILVVVAFILGNFANGFIALINFIAWVKRQKISSADQIIAALAVSRVGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH ..::.:: :::::. .... : :::.::::::.:::..:::::::::.::: :.: : NP_795 VILLHWYSTVLNPTSSNLKVIIFISNAWAVTNHFSIWLATSLSIFYLLKIVNFSRLIFHH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT :::...::.:::.::.:.::::::.. . ..:.:: :::.: :.::::..::: :::. NP_795 LKRKAKSVVLVIVLGSLFFLVCHLVMKHTYINVWTEECEGNVTWKIKLRNAMHLSNLTVA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI : ..:::::.:::::.:: :::::::::::::.:::: :::.:::::::. :::.: :: NP_795 MLANLIPFTLTLISFLLLIYSLCKHLKKMQLHGKGSQDPSTKIHIKALQTVTSFLILLAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC .:: ::.: :. . .. :.:. .: : :: .: :::::: .: ::.::: .: :. : NP_795 YFLCLIISFWNFKMRPKEIVLMLCQAFGIIYPSFHSFILIWGNKTLKQTFLSVLWQVTCW 250 260 270 280 290 300 NP_795 AKGQNQSTP >>NP_795369 (OMIM: 613961) taste receptor type 2 member (299 aa) initn: 1266 init1: 1246 opt: 1258 Z-score: 1515.5 bits: 288.4 E(85289): 1.1e-77 Smith-Waterman score: 1258; 65.3% identity (86.9% similar) in 297 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW :. :: :. :::.. ::::: ::::::::: ::::. .:::::.::::::.:::::::: NP_795 MMCFLLIISSILVVFAFVLGNVANGFIALVNVIDWVNTRKISSAEQILTALVVSRIGLLW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLFLH ..:. :: ::.: :.:..:.::.. :::.:::::::::::.:::: ::::::::::. :: NP_795 VMLFLWYATVFNSALYGLEVRIVASNAWAVTNHFSMWLAASLSIFCLLKIANFSNLISLH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 LKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLTVT ::.:..::.:::::: :.::.:.: : .::: .:..:::::.: :.::::..::: :::: NP_795 LKKRIKSVVLVILLGPLVFLICNLAVITMDERVWTKEYEGNVTWKIKLRNAIHLSSLTVT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 TLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLLLCAI :: ..:::::::: ::.::::::::::::.::..:::: :::::::::::. :::.: :: NP_795 TLANLIPFTLSLICFLLLICSLCKHLKKMRLHSKGSQDPSTKVHIKALQTVTSFLMLFAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQIRC .:: .:.:.:. : .. :... ..:. .: .: ::::: ..:::.::: .: :. NP_795 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 250 260 270 280 290 299 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:11:26 2016 done: Tue Nov 8 00:11:27 2016 Total Scan time: 5.790 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]