FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5374, 299 aa 1>>>pF1KE5374 299 - 299 aa - 299 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5301+/-0.00121; mu= 14.3274+/- 0.072 mean_var=71.3010+/-16.061, 0's: 0 Z-trim(100.9): 57 B-trim: 352 in 1/46 Lambda= 0.151889 statistics sampled from 6239 (6283) to 6239 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.193), width: 16 Scan time: 1.940 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 ( 299) 1937 434.1 6.3e-122 CCDS53748.1 TAS2R46 gene_id:259292|Hs108|chr12 ( 309) 1373 310.5 1e-84 CCDS53749.1 TAS2R43 gene_id:259289|Hs108|chr12 ( 309) 1338 302.8 2.1e-82 CCDS53750.1 TAS2R30 gene_id:259293|Hs108|chr12 ( 319) 1333 301.7 4.6e-82 CCDS53747.1 TAS2R31 gene_id:259290|Hs108|chr12 ( 309) 1328 300.6 9.6e-82 CCDS8639.1 TAS2R20 gene_id:259295|Hs108|chr12 ( 309) 1264 286.6 1.6e-77 CCDS8640.1 TAS2R19 gene_id:259294|Hs108|chr12 ( 299) 1258 285.3 3.9e-77 CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 ( 303) 816 188.4 5.6e-48 CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 ( 317) 774 179.2 3.4e-45 CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 ( 318) 618 145.0 6.7e-35 CCDS8633.1 TAS2R9 gene_id:50835|Hs108|chr12 ( 312) 609 143.1 2.6e-34 CCDS8632.1 TAS2R8 gene_id:50836|Hs108|chr12 ( 309) 600 141.1 1e-33 CCDS31747.1 TAS2R42 gene_id:353164|Hs108|chr12 ( 314) 543 128.6 5.9e-30 CCDS8634.1 TAS2R10 gene_id:50839|Hs108|chr12 ( 307) 522 124.0 1.4e-28 CCDS5867.1 TAS2R3 gene_id:50831|Hs108|chr7 ( 316) 520 123.6 2e-28 CCDS43663.1 TAS2R41 gene_id:259287|Hs108|chr7 ( 307) 457 109.8 2.7e-24 CCDS5869.1 TAS2R5 gene_id:54429|Hs108|chr7 ( 299) 412 99.9 2.5e-21 CCDS3876.1 TAS2R1 gene_id:50834|Hs108|chr5 ( 299) 373 91.3 9.3e-19 CCDS47729.1 TAS2R39 gene_id:259285|Hs108|chr7 ( 338) 354 87.2 1.8e-17 CCDS5868.1 TAS2R4 gene_id:50832|Hs108|chr7 ( 299) 342 84.5 1e-16 CCDS5785.1 TAS2R16 gene_id:50833|Hs108|chr7 ( 291) 328 81.5 8.4e-16 CCDS5885.1 TAS2R60 gene_id:338398|Hs108|chr7 ( 318) 317 79.1 4.8e-15 CCDS43662.1 TAS2R40 gene_id:259286|Hs108|chr7 ( 323) 311 77.8 1.2e-14 CCDS34765.1 TAS2R38 gene_id:5726|Hs108|chr7 ( 333) 269 68.6 7.4e-12 >>CCDS8638.1 TAS2R50 gene_id:259296|Hs108|chr12 (299 aa) initn: 1937 init1: 1937 opt: 1937 Z-score: 2302.5 bits: 434.1 E(32554): 6.3e-122 Smith-Waterman score: 1937; 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CCDS86 YFLCIITSTWNLRTQQSKLVLLLCQTVAIMYPSFHSFILIMGSRKLKQTFLSVLWQMTR 250 260 270 280 290 >>CCDS8635.1 TAS2R13 gene_id:50838|Hs108|chr12 (303 aa) initn: 789 init1: 285 opt: 816 Z-score: 974.8 bits: 188.4 E(32554): 5.6e-48 Smith-Waterman score: 816; 44.2% identity (75.4% similar) in 301 aa overlap (1-297:1-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW : . : .:...:.. :..::..::::.:.: ::::.....::.:..: ::.:::::.: CCDS86 MESALPSIFTLVIIAEFIIGNLSNGFIVLINCIDWVSKRELSSVDKLLIILAISRIGLIW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFY--SVELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLF .:..:.:.. :.. .. ::: .. :.:.:::..:::. .:::::::::.::. : CCDS86 EILVSWFLALHYLAIFVSGTGLRIMIFS-WIVSNHFNLWLATIFSIFYLLKIASFSSPAF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LHLKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRN--TVHLSY :.:: :: .:::.::::::.:: .:. :: . : ..:: : : .... . : .: CCDS86 LYLKWRVNKVILMILLGTLVFLFLNLIQINMHIKDWLDRYERNTTWNFSMSDFETFSVSV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LTVTTLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLL . :..:. :::...::::.:: :: :::.::::. .: .: :::: .::. .::::: CCDS86 KFTMTMFSLTPFTVAFISFLLLIFSLQKHLQKMQLNYKGHRDPRTKVHTNALKIVISFLL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQ . : ::: ...: : . .: . :. ...: . . ::.:: . ::...:::. . 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CCDS86 VWAKR 300 >>CCDS8637.1 TAS2R14 gene_id:50840|Hs108|chr12 (317 aa) initn: 743 init1: 270 opt: 774 Z-score: 924.8 bits: 179.2 E(32554): 3.4e-45 Smith-Waterman score: 774; 45.2% identity (76.2% similar) in 294 aa overlap (9-298:9-299) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW :.....: :..::..:.:::::: ::::: .::::.:.::::::.:::.:.: CCDS86 MGGVIKSIFTFVLIVEFIIGNLGNSFIALVNCIDWVKGRKISSVDRILTALAISRISLVW 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSVE--LRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLF .. .: ..:. ::....: .:. . : :.: ::::.:::..:. ::.:::::::: .: CCDS86 LIFGSWCVSVFFPALFATEKMFRMLT-NIWTVINHFSVWLATGLGTFYFLKIANFSNSIF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LHLKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVANMDESMWAEEYEGNMTGKMKLRNTVHLSYLT :.:: ::..:.::.:: : .:: .. . :. . . :. : : . : ...: : CCDS86 LYLKWRVKKVVLVLLLVTSVFLFLNIALINIHINASINGYRRNKTCSSDSSNFTRFSSLI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 V--TTLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLISFLL : .:.. :::::::: ::.:: :. :: :::: . : : :::.: ......:.:.: CCDS86 VLTSTVFIFIPFTLSLAMFLLLIFSMWKHRKKMQHTVKISGDASTKAH-RGVKSVITFFL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLILCQ : ::: : ...:::. .::... ....:...: : . : .:: .:::... : .: CCDS86 LYAIFSLSFFISVWTSERLEEN-LIILSQVMGMAYPSCHSCVLILGNKKLRQASLSVLLW 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 IRC .: CCDS86 LRYMFKDGEPSGHKEFRESS 300 310 >>CCDS8631.1 TAS2R7 gene_id:50837|Hs108|chr12 (318 aa) initn: 623 init1: 246 opt: 618 Z-score: 740.0 bits: 145.0 E(32554): 6.7e-35 Smith-Waterman score: 618; 38.9% identity (71.5% similar) in 288 aa overlap (17-297:17-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MITFLYIFFSILIMVLFVLGNFANGFIALVNFIDWVKRKKISSADQILTALAVSRIGLLW : .: ..:.::.::: .::::..::.: : :::.::.::: :: CCDS86 MADKVQTTLLFLAVGEFSVGILGNAFIGLVNCMDWVKKRKIASIDLILTSLAISRICLLC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 ALLLNWYLTVLNPAFYSV--ELRITSYNAWVVTNHFSMWLAANLSIFYLLKIANFSNLLF ..::. .. :: : :.. :.:: .. :..:::.:.:.:. :::.:..::.:: . :: CCDS86 VILLDCFILVLYPDVYATGKEMRIIDF-FWTLTNHLSIWFATCLSIYYFFKIGNFFHPLF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 LHLKRRVRSVILVILLGTLIFLVCHLLVA----NMDESMWAE-EYEGNMTGKMKLRNTVH : .: :. :: :::: ... : : : : : . .. . . :.: . .. .: : CCDS86 LWMKWRIDRVISWILLGCVVLSVFISLPATENLNADFRFCVKAKRKTNLTWSCRVNKTQH 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LSYLTVTTLWSFIPFTLSLISFLMLICSLCKHLKKMQLHGEGSQDLSTKVHIKALQTLIS : .: ...:: . :.::..:: :: .:...::: . : .: ::..:..::...:: CCDS86 ASTKLFLNLATLLPFCVCLMSFFLLILSLRRHIRRMQLSATGCRDPSTEAHVRALKAVIS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 FLLLCAIFFLFLIVSVWSPRRLRNDPVVMVSKAVGNIYLAFDSFILIWRTKKLKHTFLLI :::: ..: ..... : ... .:. ..... :: . ::::: ..::.:. : . CCDS86 FLLLFIAYYLSFLIATSSYFMPETELAVIFGESIALIYPSSHSFILILGNNKLRHASLKV 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LCQIRC . .. CCDS86 IWKVMSILKGRKFQQHKQI 300 310 299 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 00:11:25 2016 done: Tue Nov 8 00:11:26 2016 Total Scan time: 1.940 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]