FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6631, 316 aa 1>>>pF1KE6631 316 - 316 aa - 316 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8419+/-0.00138; mu= 8.3068+/- 0.081 mean_var=194.4008+/-40.128, 0's: 0 Z-trim(104.7): 180 B-trim: 3 in 1/51 Lambda= 0.091987 statistics sampled from 7812 (8024) to 7812 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.618), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16 Scan time: 1.860 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44778.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 316) 2111 293.3 1.7e-79 CCDS8491.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 344) 2090 290.5 1.2e-78 CCDS44777.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 355) 2082 289.5 2.6e-78 CCDS41733.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 ( 344) 1900 265.3 4.8e-71 CCDS8492.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 345) 1711 240.2 1.7e-63 CCDS31722.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 338) 1533 216.6 2.2e-56 CCDS81649.1 OPCML gene_id:4978|Hs108|chr11 ( 304) 1425 202.2 4.2e-52 CCDS2982.1 LSAMP gene_id:4045|Hs108|chr3 ( 338) 1189 171.0 1.2e-42 CCDS661.1 NEGR1 gene_id:257194|Hs108|chr1 ( 354) 1068 154.9 8.4e-38 CCDS46158.1 IGLON5 gene_id:402665|Hs108|chr19 ( 336) 955 139.9 2.7e-33 >>CCDS44778.1 NTM gene_id:50863|Hs108|chr11 (316 aa) initn: 2111 init1: 2111 opt: 2111 Z-score: 1540.8 bits: 293.3 E(32554): 1.7e-79 Smith-Waterman score: 2111; 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CCDS29 GEEEYLEILGITREQSGKYECKAANEVSSADVKQVKVTVNYPPTITESKSNEATTGRQAS 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 LQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGKKGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVASNK :.:::::::. .:.::.:: : :.. .:..... :.: ::.:. ::::::::.:: CCDS29 LKCEASAVPAPDFEWYRDDTR-INSANGLEIKSTEGQSSLTVTNVTEEHYGNYTCVAANK 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE6 LGHTNASIMLFGETVL :: ::::..:: CCDS29 LGVTNASLVLFRPGSVRGINGSISLAVPLWLLAASLLCLLSKC 300 310 320 330 >>CCDS661.1 NEGR1 gene_id:257194|Hs108|chr1 (354 aa) initn: 1037 init1: 606 opt: 1068 Z-score: 792.1 bits: 154.9 E(32554): 8.4e-38 Smith-Waterman score: 1068; 51.2% identity (80.1% similar) in 301 aa overlap (11-310:16-312) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGVCGYLFLPWKCLVVVSLRLLFLVPTGVPVRSGDATFP-KAMDNVTVRQGESAT : :..: : : :.:. .:. . .. :: :.::. ::.:..:. 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CCDS46 HQPYTTQVYLIVHVPARIVNISSPVTVNEGGNVNLLCLAVGRPEPTVTWRQLRD---GFT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE6 SEDEYLEIQGITREQSGDYECSASNDV-AAPVVRRVKVTVNYPPYISEAKGTGVPVGQKG :: : :::. : : :.:.::: . : : .:: ::: ::::::: :... .. . .:. . CCDS46 SEGEILEISDIQRGQAGEYECVTHNGVNSAPDSRRVLVTVNYPPTITDVTSARTALGRAA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TLQCEASAVPSAEFQWYKDDKRLIEGK-KGVKVENRPFLSKLIFFNVSEHDYGNYTCVAS :.::: ::: :.:::::::. : : .:.::... : :.: ::: . :::::: :. CCDS46 LLRCEAMAVPPADFQWYKDDRLLSSGTAEGLKVQTERTRSMLLFANVSARHYGNYTCRAA 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 NKLGHTNASIMLFGETVL :.:: ..::. :. CCDS46 NRLGASSASMRLLRPGSLENSAPRPPGLLALLSALGWLWWRM 300 310 320 330 316 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 14:56:37 2016 done: Tue Nov 8 14:56:37 2016 Total Scan time: 1.860 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]