Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB7735
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7735, 436 aa
1>>>pF1KB7735 436 - 436 aa - 436 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8496+/-0.000854; mu= 9.0756+/- 0.052
mean_var=227.4445+/-46.814, 0's: 0 Z-trim(114.6): 53 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.085043
statistics sampled from 15094 (15144) to 15094 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.788), E-opt: 0.2 (0.465), width: 16
Scan time: 3.100
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8431.1 POU2F3 gene_id:25833|Hs108|chr11 ( 436) 2932 372.2 5.5e-103
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CCDS56095.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 479) 1071 144.0 3.1e-34
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CCDS33035.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 463) 934 127.1 3.5e-29
CCDS58665.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 ( 400) 924 125.8 7.5e-29
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CCDS5040.1 POU3F2 gene_id:5454|Hs108|chr6 ( 443) 690 97.2 3.5e-20
CCDS33265.1 POU3F3 gene_id:5455|Hs108|chr2 ( 500) 670 94.8 2.1e-19
CCDS14450.1 POU3F4 gene_id:5456|Hs108|chrX ( 361) 666 94.1 2.4e-19
CCDS34391.1 POU5F1 gene_id:5460|Hs108|chr6 ( 360) 554 80.4 3.2e-15
CCDS34074.1 POU4F2 gene_id:5458|Hs108|chr4 ( 409) 542 79.0 9.8e-15
CCDS55274.1 POU5F1B gene_id:5462|Hs108|chr8 ( 359) 521 76.3 5.3e-14
CCDS2919.1 POU1F1 gene_id:5449|Hs108|chr3 ( 291) 515 75.5 7.7e-14
CCDS46873.1 POU1F1 gene_id:5449|Hs108|chr3 ( 317) 515 75.5 8.2e-14
CCDS4281.1 POU4F3 gene_id:5459|Hs108|chr5 ( 338) 492 72.7 6e-13
CCDS31996.1 POU4F1 gene_id:5457|Hs108|chr13 ( 419) 481 71.5 1.8e-12
CCDS55103.1 POU6F2 gene_id:11281|Hs108|chr7 ( 655) 471 70.5 5.6e-12
CCDS31803.1 POU6F1 gene_id:5463|Hs108|chr12 ( 301) 447 67.2 2.6e-11
CCDS47398.2 POU5F1 gene_id:5460|Hs108|chr6 ( 190) 438 65.8 4.1e-11
CCDS81691.1 POU6F1 gene_id:5463|Hs108|chr12 ( 611) 447 67.5 4.1e-11
>>CCDS8431.1 POU2F3 gene_id:25833|Hs108|chr11 (436 aa)
initn: 2932 init1: 2932 opt: 2932 Z-score: 1962.4 bits: 372.2 E(32554): 5.5e-103
Smith-Waterman score: 2932; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVNLESMHTDIKMSGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKTEDLSDSLQQTLSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 MVNLESMHTDIKMSGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKTEDLSDSLQQTLSH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RPCHLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLHPLQQLVLVPGHLQSVSQFLLSQTQPGQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 RPCHLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLHPLQQLVLVPGHLQSVSQFLLSQTQPGQQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GLQPNLLPFPQQQSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPSSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GLQPNLLPFPQQQSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPSSG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLSEVFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 NMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLSEVFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVATPIKPPVYNSRLVSPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 QDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVATPIKPPVYNSRLVSPS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GSLGPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSASSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS84 GSLGPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSASSF
370 380 390 400 410 420
430
pF1KB7 NSSGSWYRWNHSTYLH
::::::::::::::::
CCDS84 NSSGSWYRWNHSTYLH
430
>>CCDS58190.1 POU2F3 gene_id:25833|Hs108|chr11 (438 aa)
initn: 2875 init1: 2875 opt: 2875 Z-score: 1924.6 bits: 365.2 E(32554): 7e-101
Smith-Waterman score: 2875; 100.0% identity (100.0% similar) in 427 aa overlap (10-436:12-438)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVNLESMHTDIKMSGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKTEDLSDSLQQTL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MESPRTAKGGRDIKMSGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKTEDLSDSLQQTL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SHRPCHLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLHPLQQLVLVPGHLQSVSQFLLSQTQPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHRPCHLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLHPLQQLVLVPGHLQSVSQFLLSQTQPG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QQGLQPNLLPFPQQQSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QQGLQPNLLPFPQQQSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLS
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLSEVFGRKRKKRTSIETNIRLTLEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLSEVFGRKRKKRTSIETNIRLTLEK
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVATPIKPPVYNSRLVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVATPIKPPVYNSRLVS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 PSGSLGPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PSGSLGPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSAS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 SFNSSGSWYRWNHSTYLH
::::::::::::::::::
CCDS58 SFNSSGSWYRWNHSTYLH
430
>>CCDS56094.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 (467 aa)
initn: 637 init1: 530 opt: 1071 Z-score: 728.1 bits: 143.9 E(32554): 3.1e-34
Smith-Waterman score: 1195; 50.7% identity (68.1% similar) in 448 aa overlap (6-432:28-455)
10 20 30
pF1KB7 MVNLESMHTDIKMSGDVADSTDARSTLS--QVEPGNDR
: ::: . .: .. . .. : .: : .
CCDS56 MVHSSMGAPEIRMSKPLEAEKQGLDSPSEHTDTERNGPDTNHQNPQNKTSPFSVSPTGP-
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 NGLDFNRQIKTEDLS-DSLQQT-LSHRPC--HLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLH
. .::.:: : :: . : .: :: :. :..:.:..: :. .:
CCDS56 -----STKIKAEDPSGDSAPAAPLPPQPAQPHLPQAQLMLTGSQLAG-------DIQQLL
60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KB7 PLQQLVLVPGH-LQSVSQFLLSQTQPGQQGL--QPNLLPFPQQQSG-LLLPQTGPGLASQ
:::::::::: :: .:::: :.: .: :: :::. .::: .: :: : :: .:
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110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 AFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFT
: .: :: .::: : : :: : . .:::::::::.::.::::::::::::
CCDS56 AVTRPTLP----DPHLSHPQ--P-PKCLEPPSHPEEPSDLEELEQFARTFKQRRIKLGFT
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :. .:
CCDS56 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAETMSVDSSLPSP
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 S--SYPSLSE--VFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEV
. : :::. . ::.::::::::::.:..::: : : ::.:::: .::::: :::::
CCDS56 NQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKPTSEEILLIAEQLHMEKEV
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
pF1KB7 VRVWFCNRRQKEKRIN-CPVA----TPIKPPVYNSRLVSPSGSLGPLSVPPVHSTMPGTV
.::::::::::::::: : .: .: :: :. ..:.:.:. : : . . :.. ::
CCDS56 IRVWFCNRRQKEKRINPCSAAPMLPSPGKPASYSPHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTV
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 TSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSA--SSFNSSGSWYRWNHSTYLH
:. : .. .:: ..: ... .: :: .:. .. ::.. . .::
CCDS56 TTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGGGAAPPLNSIPSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLS
410 420 430 440 450 460
CCDS56 GLNPSTG
>>CCDS56095.1 POU2F2 gene_id:5452|Hs108|chr19 (479 aa)
initn: 637 init1: 530 opt: 1071 Z-score: 728.0 bits: 144.0 E(32554): 3.1e-34
Smith-Waterman score: 1195; 50.7% identity (68.1% similar) in 448 aa overlap (6-432:28-455)
10 20 30
pF1KB7 MVNLESMHTDIKMSGDVADSTDARSTLS--QVEPGNDR
: ::: . .: .. . .. : .: : .
CCDS56 MVHSSMGAPEIRMSKPLEAEKQGLDSPSEHTDTERNGPDTNHQNPQNKTSPFSVSPTGP-
10 20 30 40 50
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 NGLDFNRQIKTEDLS-DSLQQT-LSHRPC--HLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLH
. .::.:: : :: . : .: :: :. :..:.:..: :. .:
CCDS56 -----STKIKAEDPSGDSAPAAPLPPQPAQPHLPQAQLMLTGSQLAG-------DIQQLL
60 70 80 90 100
100 110 120 130 140
pF1KB7 PLQQLVLVPGH-LQSVSQFLLSQTQPGQQGL--QPNLLPFPQQQSG-LLLPQTGPGLASQ
:::::::::: :: .:::: :.: .: :: :::. .::: .: :: : :: .:
CCDS56 QLQQLVLVPGHHLQPPAQFLLPQAQQSQPGLLPTPNLFQLPQQTQGALLTSQPRAGLPTQ
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 AFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFT
: .: :: .::: : : :: : . .:::::::::.::.::::::::::::
CCDS56 AVTRPTLP----DPHLSHPQ--P-PKCLEPPSHPEEPSDLEELEQFARTFKQRRIKLGFT
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :. .:
CCDS56 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAETMSVDSSLPSP
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 S--SYPSLSE--VFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEV
. : :::. . ::.::::::::::.:..::: : : ::.:::: .::::: :::::
CCDS56 NQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKPTSEEILLIAEQLHMEKEV
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370
pF1KB7 VRVWFCNRRQKEKRIN-CPVA----TPIKPPVYNSRLVSPSGSLGPLSVPPVHSTMPGTV
.::::::::::::::: : .: .: :: :. ..:.:.:. : : . . :.. ::
CCDS56 IRVWFCNRRQKEKRINPCSAAPMLPSPGKPASYSPHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTV
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 TSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSA--SSFNSSGSWYRWNHSTYLH
:. : .. .:: ..: ... .: :: .:. .. ::.. . .::
CCDS56 TTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGGGAAPPLNSIPSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLS
410 420 430 440 450 460
CCDS56 GLNPSTGPGLWWNPAPYQP
470
>>CCDS55655.1 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 (703 aa)
initn: 716 init1: 527 opt: 1033 Z-score: 700.8 bits: 139.5 E(32554): 1e-32
Smith-Waterman score: 1043; 49.5% identity (69.9% similar) in 412 aa overlap (41-425:91-495)
20 30 40 50 60
pF1KB7 IKMSGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKT-EDLSDSLQQTL-SHRPC---HL
.: : :. :. .:: : . :..: .
CCDS55 AISTAQAQAFLGHLHQVQLAGTSLQAAAQSLNVQSKSNEESGDSQQPSQPSQQPSVQAAI
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLH-PLQQLVLV-PGHLQSVSQFLLSQTQPGQQGL-
: :..:.:..: . . :.. . . :::.::: : . .::..::: :::::
CCDS55 PQTQLMLAGGQITG-DLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQGQQGLL
130 140 150 160 170
130 140 150 160 170
pF1KB7 -QPNLLP-FPQQ-QSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLE--PHLEASQHLPVPKHLP
::: .::: :..:: : . :.:: :. : .. : : .::..
CCDS55 QAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQ----PATPTRTIAATPIQTLPQSQSTPKRI-
180 190 200 210 220 230
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNL
.. . .:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DTPSLEEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNL
240 250 260 270 280 290
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 SFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLS-EVFGRKRKKRTSIETNIRLTL
::::::::::::::::::::. :: :.:.::. : . : ..:.::::::::::::..:
CCDS55 SFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETNIRVAL
300 310 320 330 340 350
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 EKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVA-----TPIKPPV
:: : .: ::.::::.:::.::.:::::.::::::::::::::: : . .::: .
CCDS55 EKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSPIKA-I
360 370 380 390 400 410
360 370 380 390 400
pF1KB7 YNS--RLVSPSGSL------GPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSP
. : ::. . :: :.: :: ..::. :... :. . . ...:
CCDS55 FPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATVISTAP
420 430 440 450 460 470
410 420 430
pF1KB7 TASQNNSKAAVNSASSFNSSGSWYRWNHSTYLH
::. .. ... . : ..: :
CCDS55 PASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASGLQTAA
480 490 500 510 520 530
>>CCDS55656.1 POU2F1 gene_id:5451|Hs108|chr1 (755 aa)
initn: 723 init1: 527 opt: 1000 Z-score: 678.5 bits: 135.5 E(32554): 1.8e-31
Smith-Waterman score: 1015; 48.4% identity (67.6% similar) in 417 aa overlap (44-425:139-547)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 SGDVADSTDARSTLSQVEPGNDRNGLDFNRQIKTEDLSDSLQQTLSHRPCHLSQGPAMMS
: ... :. ..:: : : . : : .:
CCDS55 IPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQH-SASQQHSAAG-ATIS
110 120 130 140 150 160
80 90 100 110
pF1KB7 GNQMSGLNASP-------CQDMASLHPLQQ-------LVLV-PGHLQSVSQFLLSQTQPG
.. . .. : ::. .:. ::: .::: : . .::..::: :
CCDS55 ASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQG
170 180 190 200 210 220
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QQGL--QPNLLP-FPQQ-QSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLE--PHLEASQHLPV
:::: ::: .::: :..:: : . :.:: :. : .. : : .
CCDS55 QQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQ----PATPTRTIAATPIQTLPQSQST
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRF
::.. . . .:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PKRIDTPS-LEEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRF
290 300 310 320 330 340
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLS-EVFGRKRKKRTSIETN
:::::::::::::::::::::::::. :: :.:.::. : . : ..:.::::::::::
CCDS55 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETN
350 360 370 380 390 400
300 310 320 330 340
pF1KB7 IRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVA-----TP
::..::: : .: ::.::::.:::.::.:::::.::::::::::::::: : . .:
CCDS55 IRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSP
410 420 430 440 450 460
350 360 370 380 390
pF1KB7 IKPPVYNS--RLVSPSGSL------GPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGL
:: .. : ::. . :: :.: :: ..::. :... :. . .
CCDS55 IKA-IFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATV
470 480 490 500 510 520
400 410 420 430
pF1KB7 HASSPTASQNNSKAAVNSASSFNSSGSWYRWNHSTYLH
...: ::. .. ... . : ..: :
CCDS55 ISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASG
530 540 550 560 570 580
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20 30 40 50 60 70
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: ... :. ..:: : : . : : .:
CCDS12 IPQTQLMLAGGQITGLTLTPAQQQLLLQQAQAQAQLLAAAVQQH-SASQQHSAAG-ATIS
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pF1KB7 GNQMSGLNASP-------CQDMASLHPLQQ-------LVLV-PGHLQSVSQFLLSQTQPG
.. . .. : ::. .:. ::: .::: : . .::..::: :
CCDS12 ASAATPMTQIPLSQPIQIAQDLQQLQQLQQQNLNLQQFVLVHPTTNLQPAQFIISQTPQG
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QQGL--QPNLLP-FPQQ-QSGLLLPQTGPGLASQAFGHPGLPGSSLE--PHLEASQHLPV
:::: ::: .::: :..:: : . :.:: :. : .. : : .
CCDS12 QQGLLQAQNLLTQLPQQSQANLLQSQPSITLTSQ----PATPTRTIAATPIQTLPQSQST
240 250 260 270 280 290
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRF
::.. . . .:::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PKRIDTPS-LEEPSDLEELEQFAKTFKQRRIKLGFTQGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRF
300 310 320 330 340 350
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTPSSYPSLS-EVFGRKRKKRTSIETN
:::::::::::::::::::::::::. :: :.:.::. : . : ..:.::::::::::
CCDS12 EALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAENLSSDSSLSSPSALNSPGIEGLSRRRKKRTSIETN
360 370 380 390 400 410
300 310 320 330 340
pF1KB7 IRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVWFCNRRQKEKRINCPVA-----TP
::..::: : .: ::.::::.:::.::.:::::.::::::::::::::: : . .:
CCDS12 IRVALEKSFLENQKPTSEEITMIADQLNMEKEVIRVWFCNRRQKEKRINPPSSGGTSSSP
420 430 440 450 460 470
350 360 370 380 390
pF1KB7 IKPPVYNS--RLVSPSGSL------GPLSVPPVHSTMPGTVTSSCSPGNNSRPSSPGSGL
:: .. : ::. . :: :.: :: ..::. :... :. . .
CCDS12 IKA-IFPSPTSLVATTPSLVTSSAATTLTVSPVLPLTSAAVTNLSVTGTSDTTSNNTATV
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430
pF1KB7 HASSPTASQNNSKAAVNSASSFNSSGSWYRWNHSTYLH
...: ::. .. ... . : ..: :
CCDS12 ISTAPPASSAVTSPSLSPSPSASASTSEASSASETSTTQTTSTPLSSPLGTSQVMVTASG
540 550 560 570 580 590
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10 20 30
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: ::: . .: .. . .. : .: : .
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40 50 60 70 80 90
pF1KB7 NGLDFNRQIKTEDLS-DSLQQT-LSHRPC--HLSQGPAMMSGNQMSGLNASPCQDMASLH
. .::.:: : :: . : .: :: :. :..:.:..: :. .:
CCDS33 -----STKIKAEDPSGDSAPAAPLPPQPAQPHLPQAQLMLTGSQLAG-------DIQQLL
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:::::::::: :: .:::: :.: .: :: :::. .::: .: :: : :: .:
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150 160 170 180 190 200
pF1KB7 AFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFT
: . ::: :.: : .:::::::::.::.::::::::::::
CCDS33 -------PPKCLEP----------PSH-P-----EEPSDLEELEQFARTFKQRRIKLGFT
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210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :. .:
CCDS33 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAETMSVDSSLPSP
210 220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 S--SYPSLSE--VFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEV
. : :::. . ::.::::::::::.:..::: : : ::.:::: .::::: :::::
CCDS33 NQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKPTSEEILLIAEQLHMEKEV
270 280 290 300 310 320
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pF1KB7 VRVWFCNRRQKEKRIN-CPVA----TPIKPPVYNSRLVSPSGSLGPLSVPPVHSTMPGTV
.::::::::::::::: : .: .: :: :. ..:.:.:. : : . . :.. ::
CCDS33 IRVWFCNRRQKEKRINPCSAAPMLPSPGKPASYSPHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTV
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 TSSCSPGNNSRPSSPGSGLHASSPTASQNNSKAAVNSA--SSFNSSGSWYRWNHSTYLH
:. : .. .:: ..: ... .: :: .:. .. ::.. . .::
CCDS33 TTLSSAVGTLHPSRTAGGGGGGGGAAPPLNSIPSVTPPPPATTNSTNPSPQGSHSAIGLS
390 400 410 420 430 440
CCDS33 GLNPSTGPGLWWNPAPYQP
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10 20 30
pF1KB7 MVNLESMHTDIKMSGDVADSTDARSTLS--QVEPGNDR
: ::: . .: .. . .. : .: : .
CCDS58 MVHSSMGAPEIRMSKPLEAEKQGLDSPSEHTDTERNGPDTNHQNPQNKTSPFSVSPTGP-
10 20 30 40 50
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. .::.:: : :: . : .: :: :. :..:.:..: :. .:
CCDS58 -----STKIKAEDPSGDSAPAAPLPPQPAQPHLPQAQLMLTGSQLAG-------DIQQLL
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CCDS58 QLQQLVLVPGHHLQPPAQFLLPQAQQSQPGLLPTPNLFQLPQQTQGALLTSQPRAGLPTQ
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 AFGHPGLPGSSLEPHLEASQHLPVPKHLPSSGGADEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFT
: . ::: :.: : .:::::::::.::.::::::::::::
CCDS58 -------PPKCLEP----------PSH-P-----EEPSDLEELEQFARTFKQRRIKLGFT
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pF1KB7 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. : :. .:
CCDS58 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAETMSVDSSLPSP
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pF1KB7 S--SYPSLSE--VFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEV
. : :::. . ::.::::::::::.:..::: : : ::.:::: .::::: :::::
CCDS58 NQLSSPSLGFDGLPGRRRKKRTSIETNVRFALEKSFLANQKPTSEEILLIAEQLHMEKEV
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pF1KB7 VRVWFCNRRQKEKRIN-CPVA----TPIKPPVYNSRLVSPSGSLGPLSVPPVHSTMPGTV
.::::::::::::::: : .: .: :: :. ..:.:.:. : : . . :.. :.
CCDS58 IRVWFCNRRQKEKRINPCSAAPMLPSPGKPASYSPHMVTPQGGAGTLPLSQASSSLSTTA
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.
CCDS58 QTPALKAATRLSACQA
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pF1KB7 LSQTQPGQQGLQPNLLPFPQQQSGLLLPQTGPGL--ASQAFGHPGLPGSSLEPHLEASQH
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CCDS30 QPLGLYAQAAYPGGGGGGLAGMLAAGGGGAGPGLHHALHEDGHEAQLEPSPPPHLGAHGH
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170 180 190 200
pF1KB7 L----------PVPKHL-PSSGGA----------DEPSDLEELEKFAKTFKQRRIKLGFT
. :: :..::. : ::. ..::.::: :::::::::::
CCDS30 AHGHAHAGGLHAAAAHLHPGAGGGGSSVGEHSDEDAPSS-DDLEQFAKQFKQRRIKLGFT
220 230 240 250 260 270
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 QGDVGLAMGKLYGNDFSQTTISRFEALNLSFKNMCKLKPLLEKWLNDAESSPSDPSVSTP
:.:::::.: :::: :::::: :::::.:::::::::::::.:::.. .: : ..:
CCDS30 QADVGLALGTLYGNVFSQTTICRFEALQLSFKNMCKLKPLLNKWLEE-----TDSSSGSP
280 290 300 310 320
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 SSYPSLSEVFGRKRKKRTSIETNIRLTLEKRFQDNPKPSSEEISMIAEQLSMEKEVVRVW
.. ... :::::::::::.... .::..: ::::..::. .:..:..::::::::
CCDS30 TNLDKIAAQ-GRKRKKRTSIEVGVKGALESHFLKCPKPSAHEITGLADSLQLEKEVVRVW
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330 340 350 360 370
pF1KB7 FCNRRQKEKRINCPVATPIKPP---VYNSRLVSPSGS-LGPLSVPPV----------HST
::::::::::.. :.: .:: :: ..:.:. .: :.:: : :
CCDS30 FCNRRQKEKRMT-PAAGAGHPPMDDVYAPGELGPGGGGASPPSAPPPPPPAALHHHHHHT
390 400 410 420 430 440
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.::.:
CCDS30 LPGSVQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]