FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3442, 1321 aa 1>>>pF1KE3442 1321 - 1321 aa - 1321 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.0425+/-0.00114; mu= -5.9793+/- 0.069 mean_var=404.6475+/-83.701, 0's: 0 Z-trim(115.1): 622 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.063758 statistics sampled from 15026 (15706) to 15026 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.482), width: 16 Scan time: 4.030 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 9002 843.2 0 CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 4291 409.9 2.2e-113 CCDS8347.1 SIK2 gene_id:23235|Hs108|chr11 ( 926) 1558 158.4 8.3e-38 CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 1374 141.4 9e-33 CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 1374 141.4 9e-33 CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 1267 131.5 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:::::.:::::::. :.:: CCDS83 KLGRHRITKTEVAIKIIDKSQLDAVNLEKIYREVQIMKMLDHPHIIKLYQVMETKSMLYL 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 VTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDANL :::::..:::::.:. :::. :.:::::: ::..:: .:: :.:::::::::::::: :. CCDS83 VTEYAKNGEIFDYLANHGRLNESEARRKFWQILSAVDYCHGRKIVHRDLKAENLLLDNNM 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 NIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCGA :::::::::.:.: :.:: ::::::::::::.:::..:.::..::::.::::::::::: CCDS83 NIKIADFGFGNFFKSGELLATWCGSPPYAAPEVFEGQQYEGPQLDIWSMGVVLYVLVCGA 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 LPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKLG ::::: :: :: ::: :.::::.::: .::::::.::::::.:::.. :: .:::: . CCDS83 LPFDGPTLPILRQRVLEGRFRIPYFMSEDCEHLIRRMLVLDPSKRLTIAQIKEHKWMLI- 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 DADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYSAIYS . .: . :. ..: .. .::.:: :...:.:...:..::.. .:.:..::: CCDS83 --EVPVQRPVLYPQEQENEPSIGEFNEQVLRLMHSLGIDQQKTIESLQNKSYNHFAAIYF 280 290 300 310 320 330 390 400 410 420 430 pF1KE3 LLCDRHKRHKT-----LRLGALPSMPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLIN--- :: .: : :.. :: . : ..: :. . .:. .: ... :...:. CCDS83 LLVERLKSHRSSFPVEQRLDGRQRRPSTIAEQTVA--KAQTVGLPVTMHSPNMRLLRSAL 340 350 360 370 380 440 450 460 470 pF1KE3 -PENQIVE----PDGTLNLDSDEGEE--------------PSPEALVRYLSMRRHTVGVA :. . :: : . . .. :: : : .::: ... CCDS83 LPQASNVEAFSFPASGCQAEAAFMEEECVDTPKVNGCLLDPVPPVLVRKGC---QSLPSN 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 pF1KE3 DPRTEVMEDLQKLLPGFPGVNPQAPF--LQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQSL .: . : :. : .: : .: . . . :.: . : . : :. CCDS83 MMETSIDEGLET--EGEAEEDPAHAFEAFQSTRSGQRRHTLSEVTNQLVVMPGAGKIFSM 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 pF1KE3 LQPPTLQLLNG---MGPLGRRASDGGANIQLHAQQLLKRP--RGPSPLVTMTPAVPAVTP . :.:. ... :: . : . : .:. .: ..: : ::.... :. ::. CCDS83 NDSPSLDSVDSEYDMGSVQRDLNFLEDNPSLKDIMLANQPSPRMTSPFISLRPTNPAM-- 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 VDEESSDGEPDQEAVQSSTYKDSNTLHLPTERFSPVRRFSDGAAS--IQAFKAHLEKMGN .:..:. . : . :. : :: :: . . : ::. ::.... CCDS83 ------------QALSSQKREVHN--RSPVS-FREGRRASDTSLTQGIVAFRQHLQNLAR 570 580 590 600 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 NSSIKQLQQECEQLQKMYGGQIDERTLEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSICPPQPS ...: .:.. . : .. : . : . : . : .. .... ::: . : : . CCDS83 TKGILELNK-VQLLYEQIGPEADPNLAPAAPQLQDLASSCPQEEVSQQQESVSTLPASVH 610 620 630 640 650 660 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 PPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQPHGAAS : :. . : :.::. :: . . .:. . :: ..: : . CCDS83 PQLSPRQSLETQYLQHRLQK----PSLLSKAQNTCQLY---CKEPPRSLEQQLQEHRLQQ 670 680 690 700 710 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 SSQF-QGLPSRSAIFQQ-QPENCSSP-PNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLSNM . : : . .: :.: : . : : :. : .. : :::. : .. . . CCDS83 KRLFLQKQSQLQAYFNQMQIAESSYPQPSQQLPLPRQETPPPSQQAP-----PFSLTQPL 720 730 740 750 760 770 830 840 850 860 870 pF1KE3 PGTAAGSSGRGISISPSAGQMQMQHRTNLMATLSYGHR---PLSKQLSADSAEAHSLNVN . :: . .. :: .:.: .. : .: : : :: ::. .. CCDS83 SPVLEPSS-EQMQYSPFLSQYQEMQLQPLPST--SGPRAAPPLPTQLQQQQPPPPPPP-- 780 790 800 810 820 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 RFSPANYDQAHLHPHLFSDQSRGSPSSYSPSTGVGFSPTQALKVPPLDQF----PTFP-- : : : :: :. ::. ::. .: : : .: : : CCDS83 --PPPRQPGAAPAPLQFSYQTCELPSAASPAPDYP-TPCQ-YPVDGAQQSDLTGPDCPRS 830 840 850 860 870 880 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 PSAHQQPPHYTTSALQQALLSPTPPDYTRHQQVPHILQGLLSPRHSLTGHSDIRLPPTEF :. .. : : ::.. CCDS83 PGLQEAPSSYDPLALSELPGLFDCEMLDAVDPQHNGYVLVN 890 900 910 920 >>CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|chr21 (783 aa) initn: 1325 init1: 1258 opt: 1374 Z-score: 701.8 bits: 141.4 E(32554): 9e-33 Smith-Waterman score: 1407; 37.5% identity (62.5% similar) in 751 aa overlap (51-760:11-731) 30 40 50 60 70 pF1KE3 GPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPM-PARIGYYEIDRTIGKGNFAV :: ..: . : :.:.:.:.::.::::::: CCDS82 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAV 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 VKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIY :: : : :::..:::::::::.:: ::.::.::::.::.: :::::.:::::::. :.: CCDS82 VKLARHRVTKTQVAIKIIDKTRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLY 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 LVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDAN .:::.:..::.::.:...:...:.:::.:: ::..:: .:: ..:::::::.::::::.: CCDS82 IVTEFAKNGEMFDYLTSNGHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGN 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 LNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCG ..::.:::::.:.. :. :.::::::::::::.::::::.::..::::::::::::::: CCDS82 MDIKLADFGFGNFYKSGEPLSTWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCG 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 ALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKL .::::: .: .:: ::: :.:::::::: .:: :::.:::.:: .:... :: .:.::. CCDS82 SLPFDGPNLPTLRQRVLEGRFRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMR- 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 GDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPL---NEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYS :.: . : .. . .. : .:..: :. .:.:...:..::....:.:.. CCDS82 --AEPCLPG--PACPAFSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFA 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 AIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPS---MPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINP ::: :: .: :.... . : :. .:: . . .... : : . . : :. : CCDS82 AIYYLLLERLKEYRNAQC-ARPGPARQPRPRSSDLS-GLEVPQEGLSTDPFRPA--LLCP 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 ENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGFPGV . : . ...:. . : : : .. . :: :: .: : .. CCDS82 QPQTLV-QSVLQAEMDC-ELQSSLQWPLFFPVDASCSGVFRPRPVSPSSL--LDTAISEE 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 NPQAPFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQ-SLLQPPTLQLLNGMGPLGRRASD :.: :. .. .. :: .. . : . . : : : . . . .... CCDS82 ARQGPGLEEEQDT---QESLPSSTGRRHTLAEVSTRLSPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTS 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 GGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESS-DGEPDQEAVQSSTYKDSNT . . . . :. : : : : . . : .:: : : . : .. ... CCDS82 SDSCLTFSAS---KSPAGLSGTPATQGLLGACSPVRLASPFLGSQSATPVLQAQGGLGGA 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 pF1KE3 LHLPTERFSPVRRFSDGAAS--IQAFKAHLEK-------MGNNSSIKQL-QQECE----- . ::. :. :: :: . . ..::. .:.: .: :. :: : .: :. CCDS82 VLLPVS-FQEGRRASDTSLTQGLKAFRQQLRKTTRTKGFLGLNK-IKGLARQVCQVPASR 570 580 590 600 610 660 670 680 690 pF1KE3 -------------QLQKMYGGQIDERT----LEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSIC : ..:: : ::.. .:. : : ::: ... CCDS82 ASRGGLSPFHAPAQSPGLHGGAAGSREGWSLLEEVLEQQRLLQL-QHHPAAAPGCSQAP- 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 PPQPSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQP : :.: . : :.. : . : ::: . : . :: .. ... CCDS82 QPAPAPFVIAPCDGPGAAPLPSTLLTSGLPLLPPP-------LLQTGASPVASAAQLLDT 680 690 700 710 720 730 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 HGAASSSQFQGLPSRSAIFQQQPENCSSPPNVALTCLGMQQPAQSQQVTIQVQEPVDMLS : CCDS82 HLHIGTGPTALPAVPPPRLARLAPGCEPLGLLQGDCEMEDLMPCSLGTFVLVQ 740 750 760 770 780 >>CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 (783 aa) initn: 1325 init1: 1258 opt: 1374 Z-score: 701.8 bits: 141.4 E(32554): 9e-33 Smith-Waterman score: 1407; 37.5% identity (62.5% similar) in 751 aa overlap (51-760:11-731) 30 40 50 60 70 pF1KE3 GPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPM-PARIGYYEIDRTIGKGNFAV :: ..: . : :.:.:.:.::.::::::: CCDS33 MVIMSEFSADPAGQGQGQQKPLRVGFYDIERTLGKGNFAV 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 VKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQVMETERMIY :: : : :::..:::::::::.:: ::.::.::::.::.: :::::.:::::::. :.: CCDS33 VKLARHRVTKTQVAIKIIDKTRLDSSNLEKIYREVQLMKLLNHPHIIKLYQVMETKDMLY 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 LVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKAENLLLDAN .:::.:..::.::.:...:...:.:::.:: ::..:: .:: ..:::::::.::::::.: CCDS33 IVTEFAKNGEMFDYLTSNGHLSENEARKKFWQILSAVEYCHDHHIVHRDLKTENLLLDGN 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 LNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGVVLYVLVCG ..::.:::::.:.. :. :.::::::::::::.::::::.::..::::::::::::::: CCDS33 MDIKLADFGFGNFYKSGEPLSTWCGSPPYAAPEVFEGKEYEGPQLDIWSLGVVLYVLVCG 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 ALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQICKHKWMKL .::::: .: .:: ::: :.:::::::: .:: :::.:::.:: .:... :: .:.::. CCDS33 SLPFDGPNLPTLRQRVLEGRFRIPFFMSQDCESLIRRMLVVDPARRITIAQIRQHRWMR- 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 GDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPL---NEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDAYDHYS :.: . : .. . .. : .:..: :. .:.:...:..::....:.:.. CCDS33 --AEPCLPG--PACPAFSAHSYTSNLGDYDEQALGIMQTLGVDRQRTVESLQNSSYNHFA 280 290 300 310 320 330 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 AIYSLLCDRHKRHKTLRLGALPS---MPRALAFQAPVNIQAEQAGTAMNISVPQVQLINP ::: :: .: :.... . : :. .:: . . .... : : . . : :. : CCDS33 AIYYLLLERLKEYRNAQC-ARPGPARQPRPRSSDLS-GLEVPQEGLSTDPFRPA--LLCP 340 350 360 370 380 390 440 450 460 470 480 490 pF1KE3 ENQIVEPDGTLNLDSDEGEEPSPEALVRYLSMRRHTVGVADPRTEVMEDLQKLLPGFPGV . : . ...:. . : : : .. . :: :: .: : .. CCDS33 QPQTLV-QSVLQAEMDC-ELQSSLQWPLFFPVDASCSGVFRPRPVSPSSL--LDTAISEE 400 410 420 430 440 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 NPQAPFLQVAPNVNFMHNLLPMQNLQPTGQLEYKEQ-SLLQPPTLQLLNGMGPLGRRASD :.: :. .. .. :: .. . : . . : : : . . . .... CCDS33 ARQGPGLEEEQDT---QESLPSSTGRRHTLAEVSTRLSPLTAPCIVVSPSTTASPAEGTS 450 460 470 480 490 500 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 GGANIQLHAQQLLKRPRGPSPLVTMTPAVPAVTPVDEESS-DGEPDQEAVQSSTYKDSNT . . . . :. : : : : . . : .:: : : . : .. ... CCDS33 SDSCLTFSAS---KSPAGLSGTPATQGLLGACSPVRLASPFLGSQSATPVLQAQGGLGGA 510 520 530 540 550 560 620 630 640 650 pF1KE3 LHLPTERFSPVRRFSDGAAS--IQAFKAHLEK-------MGNNSSIKQL-QQECE----- . ::. :. :: :: . . ..::. .:.: .: :. :: : .: :. CCDS33 VLLPVS-FQEGRRASDTSLTQGLKAFRQQLRKTTRTKGFLGLNK-IKGLARQVCQAPASR 570 580 590 600 610 660 670 680 690 pF1KE3 -------------QLQKMYGGQIDERT----LEKTQQQHMLYQQEQHHQILQQQIQDSIC : ..:: : ::.. .:. : : ::: ... CCDS33 ASRGGLSPFHAPAQSPGLHGGAAGSREGWSLLEEVLEQQRLLQL-QHHPAAAPGCSQAP- 620 630 640 650 660 670 700 710 720 730 740 750 pF1KE3 PPQPSPPLQAACENQPALLTHQLQRLRIQPSSPPPNHPNNHLFRQPSNSPPPMSSAMIQP : :.: . : :.. : . : ::: . : . :: .. ... 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CCDS55 TSTADSDLKEDGISSRKSSGSAVGGKGIAPASPMLGNASNPNKADIPERKKSSTVPSSNT 430 440 450 460 470 480 >>CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 (709 aa) initn: 1257 init1: 1223 opt: 1266 Z-score: 648.7 bits: 131.5 E(32554): 8.2e-30 Smith-Waterman score: 1266; 56.3% identity (79.8% similar) in 341 aa overlap (42-382:29-361) 20 30 40 50 60 70 pF1KE3 AAGAGTGGAGPAGRLLPPPAPGSPAAPAAVSPAAGQPRPPAPASRGPMPARIGYYEIDRT : ... : :. . .:: :.. .: CCDS53 MSSARTPLPTLNERDTEQPTLGHLDSKPSSKSNMIRGRNSATSADEQPHIGNYRLLKT 10 20 30 40 50 80 90 100 110 120 130 pF1KE3 IGKGNFAVVKRATHLVTKAKVAIKIIDKTQLDEENLKKIFREVQIMKMLCHPHIIRLYQV ::::::: :: : :..: .::.::::::::. .:.:.::::.:::.: ::.:..:..: CCDS53 IGKGNFAKVKLARHILTGKEVAVKIIDKTQLNSSSLQKLFREVRIMKVLNHPNIVKLFEV 60 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 190 pF1KE3 METERMIYLVTEYASGGEIFDHLVAHGRMAEKEARRKFKQIVTAVYFCHCRNIVHRDLKA .:::. .::: :::::::.::.::::::: ::::: ::.:::.:: .:: . :::::::: CCDS53 IETEKTLYLVMEYASGGEVFDYLVAHGRMKEKEARAKFRQIVSAVQYCHQKFIVHRDLKA 120 130 140 150 160 170 200 210 220 230 240 250 pF1KE3 ENLLLDANLNIKIADFGFSNLFTPGQLLKTWCGSPPYAAPELFEGKEYDGPKVDIWSLGV :::::::..::::::::::: :: :. : :.::::::::::::.::.::::.::.::::: CCDS53 ENLLLDADMNIKIADFGFSNEFTFGNKLDTFCGSPPYAAPELFQGKKYDGPEVDVWSLGV 180 190 200 210 220 230 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 VLYVLVCGALPFDGSTLQNLRARVLSGKFRIPFFMSTECEHLIRHMLVLDPNKRLSMEQI .::.:: :.:::::..:..:: ::: ::.::::.:::.::.:....:.:.:.:: ..::: CCDS53 ILYTLVSGSLPFDGQNLKELRERVLRGKYRIPFYMSTDCENLLKKFLILNPSKRGTLEQI 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 370 pF1KE3 CKHKWMKLGDADPNFDRLIAECQQLKEERQVDPLNEDVLLAMEDMGLDKEQTLQSLRSDA : .::..: : :.: . : . . :: .....: : .:. .:: .. 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